1株携带质粒介导喹诺酮耐药基因qnrS1和qepA1的多耐药沙门菌的基因特点分析

目的分析一株多重耐药沙门菌SM846的遗传背景,研究其对喹诺酮耐药的机制。方法测定SM846对14种药物的最小抑菌浓度(minimal inhibitoryconcentration,MIC)。用三代测序技术对菌株进行全基因组测序,根据耐药数据库注释SM846序列中的耐药基因。使用NCBI的BLAST工具搜索与耐药质粒相似的序列,并进行生物信息学分析。结果SM846对14种测试抗生素中的12种表现出耐药,包括喹诺酮类抗生素萘啶酸和环丙沙星。SM846包含1条染色体和1条质粒。染色体序列不含可导致耐药的基因和突变,质粒携带13个耐药基因,包括喹诺酮类耐药基因qepA1和qnrS1。qepA1和qnrS1位于质粒内部的可移动原件I类整合子上。13条相似质粒的分析表明中国分离的此型别的质粒耐药性强于美国和加拿大分离的。结论QnrS1和qepA1基因通过IS6和可移动元件整合到质粒的I类整合子上,说明SM846可能迫于抗生素压力通过获得耐药基因来快速适应环境。中国分离菌株的耐药性强,地区间的耐药情况差异,尤其是与不发达国家之间的差异提示我们应当继续监测各地区的耐药表现型,以制定本地的耐药控制策略。

耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌IS2-qnrS1的分子流行病学特征

目的 探究耐碳青霉烯类高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)IS2-qnrS1的分子流行病学特征。方法 收集南昌大学第一附属医院2018年1月-2019年6月分离的非重复CR-hvKP 96株。聚合酶链式反应(PCR)检测毒力和耐药基因,PCR连锁检测IS2与qnrS1,脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)分析分子流行病学特征,血清抗性和生物膜试验分析毒力特征。结果 96株CR-hvKP菌中,IS2-qnrS1检出率为83.33%(80/96),mrkD、terW、silS和iutA基因携带率均>80.00%,IS2-qnrS1阳性CR-hvKP菌株均为K64荚膜血清型;所有菌株均表现出多药耐药,其中氟喹诺酮类耐药率为100.00%(80/80),且耐药基因qnrS1和KPC-2携带率均为100.00%,高于阴性组(P<0.001);临床资料表明:62.50%(50/80)患者来自重症监护室(ICU),12.50%(10/80)曾入住过ICU,标本来源以痰液(42.50%,34/80)和血液(30.00%,24/80)为主。PFGE和MLST数据显示,IS2-qnrS1阳性CR-hvKP菌具有克隆相关性,均属于ST11型-B克隆组。IS2-qnrS1阳性CR-hvKP菌中,42.50%(34/80)表现血清耐受。结论 IS2-qnrS1在医院CR-hvKP菌中存在克隆传播,均为ST11型-B克隆组,且携带多种毒力基因和耐药基因,呈现出较强血清耐受,应积极地防控IS2-qnrS1型CR-hvKP菌株感染,控制其传播。