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栀子及其近缘茜草科植物、混伪品的rDNA-ITS2序列分析 被引量:4
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作者 黄易 唐灿 +4 位作者 傅俊江 成竞梁 张春 刘芳 何峰 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1709-1715,共7页
目的:利用r DNA-内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品进行快速鉴定。方法:对研究材料ITS2片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,... 目的:利用r DNA-内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品进行快速鉴定。方法:对研究材料ITS2片段进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,序列变异位点采用PAUP 4.0b10进行统计分析,利用MEGA 5.0软件进行数据分析,并构建邻接(NJ)树,再利用已建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果:对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品ITS2序列长度为201~235 bp,系统发育树上显示不同来源的样本根据亲缘关系的远近各聚一支,表现出单系性;而同时又与混伪品明显分开。比较ITS2二级结构发现,栀子及其近缘茜草科植物、混伪品在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异。结论:r DNAITS2可以方便快捷地鉴定栀子及其近缘茜草科植物、混伪品。 展开更多
关键词 栀子 茜草科 rdna-its2 DNA内转录间隔区 药材DNA鉴定 二级结构 植物分子鉴定 基因检测
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羊羔美酒大曲中乳酸菌多样性及分子鉴定 被引量:6
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作者 李艳 董振玲 +1 位作者 李佳 牟德华 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第13期167-171,共5页
目的:分离和鉴定羊羔美酒大曲中的乳酸菌,探寻其菌群多样性,为酿酒工艺条件改进提供参考。方法:将酒曲进行梯度稀释、富集培养、平板画线等分离纯化,获取乳酸菌单菌落。采用菌落特征和个体形态特征结合的方法进行乳酸菌形态鉴定。乳酸... 目的:分离和鉴定羊羔美酒大曲中的乳酸菌,探寻其菌群多样性,为酿酒工艺条件改进提供参考。方法:将酒曲进行梯度稀释、富集培养、平板画线等分离纯化,获取乳酸菌单菌落。采用菌落特征和个体形态特征结合的方法进行乳酸菌形态鉴定。乳酸菌的分子鉴定采用重复序列聚合酶链式反应(repetitive sequence-based polymerase chain reaction,Rep-PCR)技术和16S r DNA序列分析法。结果:从羊羔美酒大曲中共得到65株乳酸菌,形态学分为9类。用Rep-PCR技术在75%的相似性上将其区分为5类,经基因序列分析,鉴定为分属于4个属的乳酸菌,分别为:片球菌属(Pediococcus)、明串珠菌属(Leuconostoc)、乳杆菌属(Lactobacillus)、肠球菌属(Enterococcus)。结论:传统微生物分离技术与现代分子鉴定技术相结合,可快速准确鉴定出羊羔美酒大曲中乳酸菌的菌群组成和多样性。 展开更多
关键词 羊羔美酒大曲 乳酸菌 分子鉴定 重复序列聚合酶链式反应 16S rDNA序列分析
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狗尾草叶瘟病病原的分子鉴定及其对14种杀菌剂的敏感性测定 被引量:1
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作者 周锋 范玉闯 +7 位作者 马亚辉 王金叶 胡明城 张明慧 翟凤艳 刘鸣韬 张伟丽 杨蕊 《河北农业科学》 2020年第5期71-74,共4页
研究狗尾草叶瘟病的病原,并筛选对该病原菌具有较高活性的杀菌剂,对进一步认识该病害及指导其化学防治具有重要意义。采用rDNA-ITS通用引物PCR扩增的分子检测方法,对狗尾草叶瘟病病原进行了鉴定;并采用室内生长速率法,测定了14种杀菌剂... 研究狗尾草叶瘟病的病原,并筛选对该病原菌具有较高活性的杀菌剂,对进一步认识该病害及指导其化学防治具有重要意义。采用rDNA-ITS通用引物PCR扩增的分子检测方法,对狗尾草叶瘟病病原进行了鉴定;并采用室内生长速率法,测定了14种杀菌剂对该病原菌的毒力。结果表明:该狗尾草叶瘟病病原菌为Pyricularia oryzae。该病原菌已对多菌灵产生了较低水平的抗药性,EC50为3.2196μg/mL;对其他13种杀菌剂均具有较高的敏感性,EC50为0.0067~0.6559μg/mL,抑菌活性顺序为嘧菌环胺>咯菌腈>咪鲜胺>氟碇胺>戊唑醇>吡唑醚菌酯>苯醚甲环唑>醚菌酯>腐霉利>氟吡菌酰胺>嘧菌酯>啶酰菌胺>菌核净。除多菌灵外,其他13种杀菌剂均可以作为由P.oryzae引起的狗尾草叶瘟病化学防治的候选药剂。 展开更多
关键词 狗尾草叶瘟病 rdna-its分子鉴定 稻梨孢菌 杀菌剂 敏感性测定
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三亚托鲁巴姆茄子嫁接苗病株病原菌分子鉴定及室内药效测定 被引量:6
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作者 罗宏伟 张英樊 +3 位作者 戴耀 马华彬 陈乾松 王沛政 《海南热带海洋学院学报》 2018年第2期84-88,共5页
托鲁巴姆茄子嫁接苗是生产上最好的抗病品种之一,目前三亚托鲁巴姆茄子嫁接苗田间感病严重,严重影响茄子的产量和品质.本研究通过从三亚托鲁巴姆茄子嫁接苗病株分离得到的菌株,经16S rDNA序列分析鉴定,确定该病菌是由茄科雷尔氏菌(Ralst... 托鲁巴姆茄子嫁接苗是生产上最好的抗病品种之一,目前三亚托鲁巴姆茄子嫁接苗田间感病严重,严重影响茄子的产量和品质.本研究通过从三亚托鲁巴姆茄子嫁接苗病株分离得到的菌株,经16S rDNA序列分析鉴定,确定该病菌是由茄科雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)引起.进化树构建结果显示三亚茄科雷尔氏菌测序序列与随机下载来不同类型的茄科雷尔氏菌均不能归为一类.在试验所选择的化学药剂室内试验筛选中,啶氧菌酯、四霉素、中生霉素、农用硫酸链霉素等四种药剂表现效果很好,其中三种为抗生素.该研究结果为当地田间茄子青枯病防治提供了参考. 展开更多
关键词 茄子 青枯病 分子鉴定 药效测定
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巴戟天中环烯醚萜苷和蒽醌在电喷雾离子源负离子模式下的质谱裂解行为 被引量:9
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作者 赵祥升 杨美华 +1 位作者 吴海峰 舒晓燕 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期342-350,共9页
利用电喷雾-四极杆-飞行时间串联质谱(ESI-Q-TOF MS/MS)技术,在负离子模式下,探讨巴戟天中4种环烯醚萜苷和2种蒽醌成分的质谱裂解途径。通过[M-H]-获得化合物的相对分子质量信息,进一步对[M-H]-进行碰撞诱导解离,获得相应化合物的裂解... 利用电喷雾-四极杆-飞行时间串联质谱(ESI-Q-TOF MS/MS)技术,在负离子模式下,探讨巴戟天中4种环烯醚萜苷和2种蒽醌成分的质谱裂解途径。通过[M-H]-获得化合物的相对分子质量信息,进一步对[M-H]-进行碰撞诱导解离,获得相应化合物的裂解途径。结果表明,环烯醚萜苷主要的裂解途径是首先脱去母环上的功能基团,如中性丢失H_2O、CO_2、CH_3COOH和糖单元等部分;其次是二氢吡喃环和糖环的断裂,m/z113、101为环烯醚萜苷母环断裂的特征碎片离子。蒽醌类化合物的裂解行为是连续失去CO,也可以失去CO_2。这些质谱裂解行为的研究有助于环烯醚萜苷和蒽醌类化合物的结构解析,也可为其他同类化合物的鉴定提供依据。 展开更多
关键词 巴戟天 电喷雾-四极杆-飞行时间串联质谱(ESI-Q-TOFMS/MS)环烯醚萜苷 蒽醌 裂解行为
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