Ras GAP作用下ras P21水解GTP的计算机模拟分析

利用PDB(brookhavenproteindatabank)文库提供的晶体结构数据 ,从大分子的计算机三维模拟分析入手 ,分析了rasP2 1在RasGAP(GTPase activatingproteinofRAS)作用下水解GTP的具体机制。对rasP2 1核苷酸结合口袋的微环境和rasP2 1在GTP水解过程中的结构变化进行了讨论。在分析rasP2 1空间三维结构的基础上 ,分析了催化水解过程中RasGAP的变化。讨论了对于RasGAP和rasP2 1的结合定位以及对水解过程中rasP2 1的Switch1的构象变化起重要作用的Lys94 9手指结构 ,并给出了rasP2 1在RasGAP催化下水解GTP的一个模型 。