磁共振T1rho序列、T2 mapping技术在膝关节早期软骨退变早期诊断中的评估价值

目的探讨磁共振T1rho序列、T2 mapping技术在膝关节早期软骨退变早期诊断中的评估价值。方法选取2020年1月至2022年11月在我院治疗的110例膝关节早期软骨退变患者(观察组),按照疾病严重程度分为轻度退变组及重度退变组,另选取同期在我院进行体检的64例健康者为对照组,受试者均行磁共振T1rho序列、T2 mapping技术扫描,测量受试者T2值及T1ρ值,探讨磁共振T1rho序列、T2 mapping技术在膝关节早期软骨退变早期诊断中的评估价值。结果观察组股骨外侧面、股骨内侧面、胫骨外侧面、胫骨内侧面、髋骨面T2值均明显高于对照组(P<0.05),重度退变亚组患者股骨外侧面、股骨内侧面、胫骨外侧面、胫骨内侧面、髋骨面T2值显著高于轻度退变者(P<0.05);观察组股骨内踝负重区、股骨内踝非负重区、股骨外踝负重区、股骨外踝非负重区、胫骨外侧平台区、胫骨内侧平台区、髌后软骨区磁共振T1ρ值明显高于对照组(P<0.05),重度退变亚组患者股骨内踝负重区、股骨内踝非负重区、股骨外踝负重区、股骨外踝非负重区、胫骨外侧平台区、胫骨内侧平台区、髌后软骨区磁共振T1ρ值明显高于轻度退变亚组患者(P<0.05);磁共振T1rho序列在膝关节早期软骨退变中早期诊断及严重程度评估中的的诊断ROC值及特异度明显高于T2 mapping技术(P<0.05),但后者具有更高的敏感度(P<0.05)。结论磁共振T1rho序列、T2 mapping技术均能有效反映膝关节早期软骨退变中软骨组织学成分变化情况,还可为膝关节软骨退变严重程度评估提供客观依据,二者具有一定互补价值。

赤眼鳟LGP2序列结构、组织表达及与MDA5互作特征

为探究赤眼鳟遗传学和生理学实验室蛋白2(laboratory of genetics and physiology 2,LGP2)的功能特征及抗草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)育种参考潜力,实验克隆获得了2940 bp的赤眼鳟lgp2(Sclgp2)全长cDNA和721 bp的5′端上游序列。Sclgp2 cDNA编码680个氨基酸,包含DEXDc(DExD/H-box helicase domain)、HELICc(helicase superfamily C-terminal domain)和CTD(C-terminal regulatory domain)结构域;其5′端上游序列含有MafB(muscle aponeurosis fibromatosis B)和IRF3(interferon regulatory factor 3)等转录因子结合位点。不同物种LGP2的功能结构域、磷酸化修饰位点数具有相似性,同时也存在结构域排布位置及序列的差异。赤眼鳟和草鱼lgp2 cDNA序列比较初步发现2个位于RNA结合功能区的GCRV抗性关联位点。系统进化分析显示,赤眼鳟LGP2先与草鱼、鲫和青鱼聚在一起,再与鲤科鱼类等聚为一大支。荧光定量表达分析显示,赤眼鳟脾脏中sclgp2表达水平显著高于其他组织,肌肉、心脏中表达量次之,而肠中表达量最低。GCRV感染后,肝脏中ifn1表达水平在24~72 h显著下降,其他组织sclgp2和ifn1表达水平未有显著变化。相关性分析结果显示,赤眼鳟肌肉sclgp2与ifn1表达水平呈极显著正相关(0.999)。酵母双杂交互作检测发现,赤眼鳟LGP2与MDA5存在弱相互作用,而其DEXDc(1~201 aa)、HELICc(390~476 aa)以及CTD(553~668 aa)结构域与MDA5无互作。该研究成功获得了sclgp2全长cDNA及5′端上游序列,明确了其序列结构、免疫表达及与MDA5的互作特征,为赤眼鳟LGP2免疫功能属性研究奠定了基础,并为草鱼抗GCRV育种提供了参考。

上皮细胞转化序列2通过调控p33生长抑制因子1表达影响食管鳞状细胞癌细胞的体外转移活性

目的探讨上皮细胞转化序列2(ECT2)与p33生长抑制因子1(p33ING1)的表达水平对食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞转移活性的影响。方法采用免疫组织化学法和免疫印迹法检测食管鳞癌组织和癌旁组织中ECT2和p33ING1的表达情况。将人食管鳞癌细胞系KYSE140细胞分为4组:空白组、阴性对照组(pcDNA 3.1 NC)组、过表达组(pcDNA 3.1 ECT2)和抑制表达组(si ECT2)。采用MTT法和细胞集落形成实验研究细胞的增殖和生长能力,Transwell实验和划痕实验研究细胞的侵袭和迁移能力,并用流式细胞术检测细胞凋亡率和细胞周期,Western blotting检测ECT2对p33ING1蛋白的影响。结果在食管鳞癌组织中ECT2表达增加,p33ING1表达降低。过表达ECT2能够显著增加KYSE140细胞的生长、集落形成、迁移以及侵袭能力,并能降低KYSE140细胞的凋亡率和p33ING1的表达;此外,抑制ECT2表达后能够逆转上述变化。结论ECT2高表达能够促进食管鳞癌KYSE140细胞的生长、转移,并抑制其凋亡,其机制可能与ECT2能够抑制p33ING1表达相关。

鸡皮刺螨羧酸酯酶2基因克隆、序列分析及其表达特征研究

【目的】克隆鸡皮刺螨(Dermanyssus gallinae)羧酸酯酶2(CarE2)基因CDS区序列并进行生物信息学分析,同时检测其在鸡皮刺螨中的表达特征,以探究CarE2基因在鸡皮刺螨代谢抗性形成及发展中的作用。【方法】试验选择50只成年鸡皮刺螨雌螨,利用PCR扩增CarE2基因CDS区序列并测序,对其编码氨基酸序列进行多序列比对及系统进化树构建,通过生物信息学在线软件预测CarE2蛋白的理化性质及结构功能,并采用实时荧光定量PCR检测CarE2基因在鸡皮刺螨不同发育阶段及不同抗性品系中的表达模式,同时分析高效氯氰菊酯对鸡皮刺螨敏感品系和高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因的诱导效应。【结果】鸡皮刺螨CarE2基因CDS区序列全长1665 bp,编码554个氨基酸。多序列比对结果显示,CarE2基因氨基酸序列具有高度保守的催化三联体(Ser-Glu-His)和五肽基序(Gly-X-Ser-X-Gly)。系统进化树结果表明,鸡皮刺螨CarE2与黑腹果蝇亲缘关系相近,共同划分为表皮酯酶分支。生物信息学分析结果显示,CarE2蛋白属于稳定的亲水蛋白,存在信号肽切割位点,且具有糖基化位点和多个磷酸化修饰位点,但不具有跨膜结构;CarE2蛋白二级结构以无规则卷曲为主,三级结构预测结果与二级结构一致。实时荧光定量PCR检测结果显示,CarE2基因在鸡皮刺螨若螨时期表达量最高,显著高于其他时期(P<0.05),成螨期表达量次之,在卵和幼螨时期的表达量相对较低;鸡皮刺螨高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因的相对表达量是敏感品系的2.78倍;经高效氯氰菊酯胁迫处理后,鸡皮刺螨敏感品系中CarE2基因表达量与对照组相比差异不显著(P>0.05),而高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因表达量与对照组相比显著升高(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆鸡皮刺螨CarE2基因CDS区序列,其在鸡皮刺螨各发育阶段均有表达,且在高效氯氰菊酯抗性品系中过量表达。经高效氯氰菊酯处理后CarE2基因表达量显著上调,推测CarE2基因参与鸡皮刺螨对高效氯氰菊酯的羧酸酯酶解毒代谢抗性。

磁共振集合序列与T2mapping序列在慢性冈上肌腱炎定量评估中的价值研究

目的探讨磁共振集合序列(magnetic resonance image compilation,MAGiC)与T2mapping序列在慢性冈上肌腱炎中的诊断价值,并比较两者在冈上肌腱扫描中的图像质量,以及两序列的T2值在冈上肌腱不同亚区的相关性。材料与方法回顾性收集2022年10月至2024年1月本院慢性冈上肌腱炎的患者30例(肌腱炎组)及健康体检者26例(对照组),均进行了常规MRI、T2mapping序列和MAGiC序列扫描。由两名放射科医生根据冈上肌腱走行将其分为外侧、中间、内侧亚区,并在MAGiC序列及T2mapping序列上测量不同亚区定量值。对比T2mapping序列第一回波图像与MAGiC T2WI的图像质量,并测量信号噪声比(signal to noise ratio,SNR)、对比噪声比(contrast to noise ratio,CNR)。采用Mann-Whitney U检验分析肌腱炎组与对照组在不同亚区各定量参数的差异以及两序列的图像质量。绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线并计算曲线下面积(area under the curve,AUC),评价其对慢性冈上肌腱炎的诊断效能。对T2mapping序列与MAGiC序列测得的不同亚区T2值采用Pearson相关分析评价相关性。结果MAGiC序列重建图像MAGiC T2WI与T2mapping序列第一回波图像质量主观评分差异无统计学意义(Z=-1.535,P>0.05);MAGiC T2WI图像的CNR高于T2mapping序列第一回波图像[15.45(12.76,20.46)vs.9.94(8.74,12.23)],差异有统计学意义(Z=-2.473,P<0.001),而MAGiC T2WI图像的SNR低于T2mapping序列第一回波图像[2.49(2.16,2.71)vs.5.82(5.16,7.44)],差异有统计学意义(Z=-0.609,P<0.001);MAGiC序列与T2mapping序列的T2值在肌腱炎组外侧亚区、内侧亚区均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);MAGiC序列的T1值在肌腱炎组外侧亚区高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。外侧亚区T2mapping T2值、MAGiC T1、T2值诊断冈上肌腱炎的AUC分别为0.822、0.663、0.799;内侧亚区T2mapping T2值、MAGiC T2值诊断冈上肌腱炎的AUC分别为0.711、0.762。MAGiC序列T2值与T2mapping T2值在冈上肌腱外侧亚区、中间亚区、内侧亚区呈正相关(相关系数分别为0.736、0.437、0.464)。结论MAGiC定量图谱的T1、T2值与T2mapping T2值能够有效评估冈上肌腱内部成分的异质性,反映慢性冈上肌腱炎与正常肌腱内部成分的差异及肌腱自身的区域性差异,可为临床对冈上肌腱变性提供量化的客观依据。

2023年黑龙江地区某鹅场鹅星状病毒分离鉴定及ORF2基因序列分析

为调查2023年黑龙江地区某鹅场中鹅星状病毒(goose astrovirus,GoAstV)的感染及遗传进化情况,采集发病鹅的内脏组织样品进行RT-PCR检测,检测阳性样本通过鹅胚接种进行病毒分离,并利用RT-PCR以及电镜进行鉴定,利用二代测序技术进行分离毒株的全基因组测序,运用MEGA6软件对ORF2基因进行遗传进化分析。结果显示,在15份样品中,GoAstV的阳性率为6.67%(1/15)。阳性样本处理后接种鹅胚进行病毒分离,盲传至第5代时,尿囊膜增厚,出现尿酸盐沉积,鹅胚在120 h内死亡率达到83.33%(20/24),死亡鹅胚尿囊液进行GoAstV RT-PCR检测,结果为阳性。电镜观察结果显示,可观察到30 nm左右的病毒粒子。提取第5代病毒尿囊液RNA进行全基因组测序,并对该毒株ORF2基因进行同源性分析和系统发育进化树分析,结果显示,鉴定的毒株与其他GoAstV的ORF2基因核苷酸同源性为54.7%到96.6%,与GoAstV LYG2株的核苷酸同源性最高,为96.6%,而其与GoAstV FLX株差异较大,为54.7%。系统发育进化树结果显示,试验鉴定的毒株属于GoAstV G2型,与火鸡星状病毒遗传关系较近。研究对黑龙江地区某鹅场GoAstV进行分离鉴定并对ORF2基因进行序列分析,为黑龙江省GoAstV遗传进化及其分子流行病学调查研究提供了基础数据。

基于ITS2序列及其二级结构对矩镰荚苜蓿和近缘种的分子鉴定

为准确鉴定矩镰荚苜蓿(Medicagoarchiducis-nicolai)及其近缘种花苜蓿(M.ruthenica)、阔荚苜蓿(M.platycarpos)和毛荚苜蓿(M.edgeworthii),利用DNA条形码技术对4个物种的ITS2序列进行注释、比对、检验,计算种内种间遗传距离,邻接法(neighbor-joining, NJ)构建系统发育树,通过RNAfoldwebserver预测4个近缘种的ITS2二级结构。结果显示,矩镰荚苜蓿及其近缘种的ITS2序列长度为220~221 bp,稳定性好;种间遗传距离(0.004 55~0.022 73)明显大于种内遗传距离(均为0),存在明显的“BarcodingGap”区域;NJ系统发育树显示,毛荚苜蓿聚为一支,矩镰荚苜蓿、花苜蓿和阔荚苜蓿聚为另一支,然后矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿又各自形成单系;在二级结构中,矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿、毛荚苜蓿存在明显差异,但与花苜蓿极为相似,难以区分。分析表明:除花苜蓿外,以ITS2序列作为条形码并辅以二级结构,可以达到对矩镰荚苜蓿、阔荚苜蓿和毛荚苜蓿准确、快速鉴定的目的。

栉孔扇贝Tssk2基因的序列特征及表达分析

为研究栉孔扇贝(Chlamys farreri)睾丸特异性丝氨酸/苏氨酸激酶2基因Tssk 2的序列和表达模式,利用荧光定量PCR及生物信息学分析研究了该基因的序列特征、各组织表达和性腺周期表达,结果显示该基因CDS为723 bp,编码240个氨基酸;进化树显示,栉孔扇贝Tssk2蛋白的进化地位与生物学分类地位一致;栉孔扇贝Tssk2具有Tssk家族的S_TKc保守结构域,含丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性区域(VIb区域)和ATP结合区,但ATP结合区域缺少Ⅰ子域。Tssk 2在栉孔扇贝各组织和性腺发育周期中的表达显示,精巢是Tssk 2表达量最高的组织,尤其是成熟期精巢中表达量最高,推测Tssk 2在成熟精巢中发挥重要作用,或与精子的成熟相关。

颅内海绵状血管瘤MRI-SWI T1WI T2FLAIR增强序列检查特征比较观察

目的:探讨磁共振敏感加权成像(MRI-SWI)、磁共振T1加权成像(T1WI)、T2加权成像(T2WI)、T2液体衰减反转恢复序列(T2FLAIR)在诊断颅内海绵状血管瘤中的应用价值。方法:选取延安大学附属医院2019年3月至2023年3月初步诊断怀疑为颅内海绵状血管瘤患者153例作为研究对象,所有患者均在手术前完成了MRI检查,包括MRI-SWI、T1WI、T2WI、T2FLAIR检查,以手术病理学检查结果作为金标准,计算各种MRI检查方式对于诊断颅内海绵状血管瘤的价值。结果:MRI-SWI正确诊断97例海绵状血管瘤患者,共计准确检出病灶数量177个,T1WI正确诊断72例海绵状血管瘤患者,共计准确检出病灶数量121个,T2WI正确诊断77例海绵状血管瘤患者,共计准确检出病灶数量132个,T2FLAIR正确诊断82例海绵状血管瘤患者,共计准确检出病灶数量143个,MRI-SWI对海绵状血管瘤病灶的检出率高于T1WI、T2WI、T2FLAIR(χ^(2)=28.698、P<0.05,χ^(2)=22.299、P<0.05,χ^(2)=16.257、P<0.05);T2FLAIR对海绵状血管瘤病灶的检出率高于T1WI(χ^(2)=7.211、P<0.05);T1WI、T2WI对海绵状血管瘤病灶的检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.676、P>0.05);T2FLAIR、T2WI对海绵状血管瘤病灶的检出率差异无统计学意义(χ^(2)=1.972、P>0.05);T1WI海绵状血管瘤病灶主要表现为混杂信号(43.80%)、其次为低信号(30.58%);T2WI海绵状血管瘤病灶主要表现为混杂信号(49.24%),主要特征为病灶中央呈点状或网格状高信号,周围边缘低信号,称之为“铁环征”,其次为低信号(35.61%);T2FLAIR海绵状血管瘤病灶主要表现为类圆形或者圆形的混杂信号(58.33%),病灶内部显示为爆米花或者网格状,其次为低信号(34.09%);MRI-SWI海绵状血管瘤病灶主要表现为低信号(95.48%),主要显示病灶的周围含铁血黄素区域及瘤体,病灶周边及内部显示片状或点状低信号;T1WI、T2WI、T2FLAIR、MRI-SWI鉴别诊断海绵状血管瘤患者的灵敏度分别为74.23%、79.38%、84.54%、100%,特异度分别为85.71%、83.93%、78.57%、94.64%。结论:颅内海绵状血管瘤患者在接受MRI检查的情况下,MRI-SWI序列较T1WI、T2WI、T2FLAIR序列具有更高的诊断价值。

特异AT序列结合蛋白2、基质金属蛋白酶-10在结直肠癌组织中的表达及其与病理分期、生存期的相关性

目的:分析特异AT序列结合蛋白2(SATB2)、基质金属蛋白酶-10(MMP-10)在结直肠癌组织中的表达及其与病理分期、生存期的相关性。方法:选取53例胃癌患者为研究对象,手术获取肿瘤组织和癌旁组织标本,采用免疫组化法检测SATB2、MMP-10在标本中的表达水平,并其表达与病理特征、生存期的相关性。结果:结直肠癌组织中SATB2阳性表达率为60.38%低于癌旁组织的79.25%、MMP-10的阳性表达率为54.72%高于癌旁组织的18.87%(P<0.05);SATB2、MMP-10在不同肿瘤大小、不同肿瘤分化程度、淋巴结转移有无、不同TNM分期中的阳性表达率存在统计学差异(均P<0.05);经多因素Logistic回归分析显示,肿瘤大小、肿瘤分化程度、淋巴结转移、TNM分期均为SATB2、MMP-10表达的影响因素(均P<0.05);SATB2阳性表达患者累积生存率高于SATB2阴性表达患者,MMP-10阳性表达患者累积生存率低于MMP-10阴性表达患者(均P<0.05)。结论:结直肠癌组织中的SATB2阳性表达率低、MMP-10阳性表达率较高,且上述因子表达与患者病理特征存在明显关联,同时SATB2阴性表达、MMP-10阳性表达代表患者预后较差。

时间序列哨兵2号影像水稻品种遥感分类潜力评估

以时间序列哨兵2号遥感影像为数据源,选择友谊农场第四管理区为研究区,使用随机森林分类方法生成制作了水稻品种遥感分类图,精度达到70%以上,满足农场和农户对于精细水稻田间管理的工作要求。

T_(2)WI-FLAIR增强序列在胶质瘤中的诊断价值

目的研究T_(2)加权成像液体衰减反转恢复(T_(2)WI-FLAIR)增强序列在胶质瘤中诊断价值。方法选择2021年10月至2023年7月确诊的胶质瘤患者104例,其中男性26例,女性78例;年龄28~49岁,平均年龄40.21岁;身体质量指数(BMI)23.12~26.78 kg/m^(2),平均BMI 24.35 kg/m^(2);病程1~3年,平均病程1.67年;Ⅰ~Ⅱ级患者57例,Ⅲ~Ⅳ级患者47例。将其分为2组,Ⅰ~Ⅱ级患者为对照组共57例,Ⅲ~Ⅳ级患者为研究组共47例,比较不同级别肿瘤的信号特征、T_(2)WI-FLAIR增强序列诊断分级与金标准诊断分级的一致性及T_(2)WI-FLAIR增强序列对胶质瘤的分级诊断效能。结果两组研究对象T_(1)WI增强序列、T_(2)WI-FLAIR平扫序列及T_(2)WI-FLAIR增强序列下信号特征的差异存在统计学意义(P<0.05);T_(2)WI-FLAIR增强序列诊断胶质瘤分级中Kappa值最高(Kappa=0.769),与手术病理诊断的一致性较强;T_(2)WI-FLAIR增强序列对胶质瘤诊断分级的灵敏度(89.4%vs 70.2%、74.5%)高于T1WI增强序列、T2WI-FLAIR平扫序列(P<0.05)。结论将T_(2)WI-FLAIR增强序列应用于胶质瘤的影像诊断,可显著增强胶质瘤的诊断分级灵敏度,建议临床推广。

磁共振DWI序列联合T2WI压脂序列对肛瘘的诊断价值

目的:研究肛瘘患者行磁共振DWI序列+T2WI压脂序列诊断的效果。方法:数据取自本院2021年1月1日至2022年12月31日收治122例肛瘘患者,均行磁共振检查的DWI序列、T2WI压脂序列扫描,以病理结果为“金标准”,分析诊断结果。结果:DWI序列的确诊率为83.50%(86/103),T2WI压脂序列的确诊率为88.35%(91/103),联合扫描确诊率为97.09%(100/103),较单一扫描,联合扫描的诊断确诊率更高;P<0.05(具统计学意义)。结论:磁共振DWI序列+T2WI压脂序列诊断肛瘘可提高准确性、诊断效能,清晰显示内、外瘘口,为术前诊疗提供数据、值得推广。

磁共振T_(2)WI序列影像组学模型对特殊部位异位妊娠的诊断价值

目的构建磁共振成像(MRI)T_(2)WI序列影像组学模型,并探究其在特殊部位异位妊娠中的诊断价值。方法选取于本院2018年2月-2023年2月就诊的异位妊娠患者258例,按照2:1的比例将所有患者分为训练集(n=186)和验证集(n=72)。根据组织病理学结果将训练集患者分为特殊部位异位妊娠组(n=102)和非特殊部位异位妊娠组(n=84)。多因素Logistics回归分析特殊部位异位妊娠发生的独立影响因素。单因素方差分析和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归降维MRI T_(2)WI序列影像组学特征,构建影像组学特征与临床特征联合模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)、HosmerLemeshow检验和校准曲线评价联合模型预测能力,采用临床决策曲线(DCA)评估其临床意义。结果MRI在异位妊娠患者中确诊特殊部位异位妊娠的准确度为79.07%、特异度为80.29%、灵敏度为77.69%、阳性预测值(PPV)为77.69%、阴性预测值(NPV)为80.29%。非特殊部位异位妊娠与特殊部位异位妊娠相比,人工流产次数、异位妊娠史、β-hCG比值、子宫内膜厚度、MRI特殊部位异位妊娠诊断结果差异显著(P<0.05)。多因素Logistics回归分析结果显示,β-hCG低比值、人工流产高频次数、有异位妊娠史、子宫内膜薄、MRI特殊部位异位妊娠诊断结果阳性是特殊部位异位妊娠与非特殊部位异位妊娠的独立影响因素。将单因素方差分析和LASSO回归降维后获得9个具有代表性的影像组学特征和临床特征构成联合模型AUC在训练集联合模型、影像组学评分模型和临床预测模型中分别为0.837、0.741、0.717,在验证集中分别为0.816、0.752、0.705,联合模型AUC最高,具有更佳的预测能力(P<0.05)。Hosmer-Lemeshow检验结果显示,联合模型预测数据与实际观察数据之间差异无统计学意义(P=0.146,0.102)。校准曲线显示联合模型在验证集和训练集中,预测值与观察值具有良好的一致型。DCA曲线显示,联合模型与影像组学评分模型在很大风险阈值范围内具有较高的预测价值。结论MRI T_(2)WI序列影像组学模型在预测特殊部位异位妊娠中准确度高,具有很好的临床参考价值。

泉州“过饥草”类植物的种类调查与ITS2序列分析

目的 采集与鉴定泉州民间一类保胃药用植物“过饥草”(闽南语KèKi Chháu),并选用内转录间隔区2(Internal Transcribed Spacer 2,ITS2)序列作为条形码进行分析。方法 采集泉州区域内“过饥草”类植物样本,经传统形态学鉴定后,提取基因组DNA,测序各样本的ITS和ITS2区域。根据ITS2序列计算各样本间的遗传距离,构建邻接法系统进化树,并预测ITS2序列的二级结构,比较各个ITS2序列二级结构的差异。结果 获取了全部样本的ITS2序列,并将14株采集样本分属于8种植物。而基于ITS2序列的系统进化分析、二级结构比对分析与其形态学鉴定结果一致,可明显区分“过饥草”类植物的物种差异。结论 共梳理出8种“过饥草”类药用植物的物种信息,且ITS2序列可作为鉴别该类民间药用植物的有效条形码。

1.5TMRIT2Mapping序列对膝关节早期骨性关节炎患者软骨变性的量化分析研究

探究1.5特斯拉磁共振成像T2定量图谱技术在评估膝部初始阶段骨关节炎病人软骨退变方面的定量研究。方法 筛选了从2023年1月至2023年12月间,我所接纳的60位初期膝关节骨关节炎伴软骨退变的病患作为研究的焦点,将其中30位定为实验组,并择取30位膝关节功能完好的健康人壍作比较组,均为两组患者进行1.5T MRI T2Mapping序列成像检查,为实验组患者进行关节镜检查作为金标准,观察实验组患者的检出率,测量实验组患者与对照组患者关节各区域软骨平均T2值。结果 实验组病人发现率达到95%,与诊断的黄金法则比较并未显现统计上的显著差异(p值超过0.05),而且该组病人关节内各分区的软骨平均T2值明显高出对照组,两组对比差明显,具有统计学意义(p<0.05)。结论 关节镜下初期骨关节炎的膝关节软骨退变,可以通过1.5特斯拉磁共振成像T2映射技术进行早期的诊断性检测,具有使用价值。

2型糖尿病合并感染患者肺炎克雷伯菌分布及预后影响因素分析

目的:探讨2型糖尿病(T2DM)合并感染患者肺炎克雷伯菌(KP)分布及预后影响因素分析。方法:选择226例T2DM患者为研究对象,根据是否合并KP感染分为未感染组(n=170)和感染组(n=56),分析T2DM患者感染的危险因素。收集T2DM合并感染患者KP标本,记录标本来源并进行菌种鉴定和药敏试验,并对所有菌株进行多位点序列(MLST)分型,记录预后情况。结果:基础疾病、抗生素使用、侵入性操作、血清白蛋白(ALB)、糖化血红蛋白(HbA1c)、空腹血糖(FPG)为影响T2DM发生感染的危险因素(均P<0.05)。T2DM合并感染患者体内分离56株肺炎克雷伯菌,肺炎克雷伯菌在痰液中的占比最高为44.62%,其次为尿液19.64%,血液中占比16.07%,脓液中占比12.5%,其他标本占比7.14%。56株KP总耐药率最高为氨苄西林,最低为亚胺培南,痰液标本中KP对头孢呋辛、头孢哌酮、庆大霉素耐药率高于非痰液标本,非痰液标本中KP对头孢他啶高于痰液标本(均P<0.05)。56株肺炎克雷伯菌MLST分型共发现42个ST型,ST-20型、36型、65型、347型、660型各2株,分别占3.57%,23型4株占7.14%,ST-17、25、29、35、37、45、86、189、208、211、218、322、355、412、490、519、557、595、726、776、1049、1092、1103、1319、1569、1916、2059、3014、3140、3536、4023、4194、4262、4412、4857型各1株,分别占1.78%,其他ST型7株占比12.5%。56例T2DM合并KP感染患者预后良好患者52例,预后不良患者4例,预后良好率为92.86%。结论:T2DM合并感染患者KP主要分布在痰液和尿液中,基础疾病、抗生素使用、侵入性操作、ALB、HbA1c、FPG是影响KP感染发生危险因素,T2DM合并KP感染患者根据药敏结果选择用药,有利于患者预后。

2022至2023年吉林省甲型H3N2流感病毒的分子特征分析

目的通过对2022至2023年甲型H3N2流感病毒HA和NA基因特征分析,为吉林省H3N2流感病毒防控提供科学依据。方法随机选取2022至2023年吉林省23株H3N2流感病毒,对HA和NA基因进行序列同源性、基因进化特征、基因位点氨基酸变异分析。结果HA、NA基因核苷酸序列种系进化树显示:23株甲型H3N2流感毒株全部属于3C.2a分支,其中4株为3C.2a1b.2a.1a分支,与2021至2022年推荐的疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020在一个分支上;19株为3C.2a1b.2a.2a分支,与2022至2023年推荐的疫苗株A/Darwin/6/2021在一个分支上。与WHO推荐的2022至2023年北半球疫苗株A/Darwin/6/2021、A/Darwin/9/2021相比,4株甲型H3N2流感病毒HA蛋白氨基酸序列均发生了9个氨基酸位点变异,分别为I48T、S156H、N159Y、I160T、Q164L、K171N、D186S、N190D、S198P;HA蛋白抗原决定簇的氨基酸5处发生替换,分别为S156H、N159Y、I160T、D186S、N190D。19株甲型H3N2流感病毒HA基因蛋白氨基酸序列均发生了7个氨基酸位点变异,分别为G/D53N、N96S、N122D、I140K、I192F、I223V、N378S,除A/吉林船营/1615/2023(H3)外,其他18株均发生了E50K氨基酸位点变异;HA蛋白抗原决定簇的氨基酸4处发生替换,A区(N122D)B区(I192F)C区(E50K、G/D53N)。结论与WHO推荐的2022至2023年北半球疫苗株A/Darwin/6/2021、A/Darwin/9/2021相比,19株甲型H3N2流感病毒在HA蛋白抗原决定簇的氨基酸4处发生替换,分别是N122D、I192F、E50K、G/D53N,HA发生了抗原漂移。23株H3N2流感病毒NA基因存在12个氨基酸位点变异,但在NA酶活性催化位点和辅助位点均未发生变异,但有3株H3N2流感病毒存在S331G变异,与耐药变异S331R发生在同一位点上,应引起重视。

基于ITS2序列的球兰属植物种间鉴定研究

目的:利用ITS2序列对球兰属植物进行DNA分子鉴定,为其物种鉴定和遗传多样性研究寻求新路径。方法:提取80份球兰样品的DNA,通过PCR扩增ITS2序列并测序,预测其ITS2二级结构。运用MEGA6.0等软件构建邻接(NJ)系统发育树,计算各类别遗传距离。通过叶片形态学特征对其聚类结果进行验证。结果:80份球兰属植物ITS2序列长度约为250 bp,样品CG含量在60.44%~72.88%之间,平均CG含量为68.12%。种内恒定位点数为32,变异位点数为217。NJ系统发育树中80份样品可聚类为11类。序列总体平均遗传距离为0.171,对80份球兰样品的鉴别成功率约为81.25%,结合ITS2序列二级结构可直观地将大部分球兰属植物区分。基于ITS2序列的NJ进化树可阐述球兰属植物的种间关系,聚为一类的球兰属植物叶片颜色和叶形较为相似,也在一定程度上验证了聚类树构建的合理性。结论:ITS2序列可作为解决球兰属植物物种鉴定难题的有效方法。

Kozak序列引导的表达兔出血症病毒2型VP60蛋白重组腺病毒的构建及鉴定

【目的】试验旨在以复制缺陷型人5型腺病毒(Ad5)为载体,构建Kozak序列引导的表达兔出血症病毒2型(RHDV2)VP60蛋白的重组腺病毒,为RHDV2新型疫苗研究提供依据。【方法】修饰、合成带有Kozak序列的VP 60基因序列,将其与腺病毒穿梭质粒进行重组,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,构建重组腺病毒穿梭质粒,并利用酶切与测序对重组腺病毒穿梭质粒进行鉴定;采用Ad Max腺病毒包装系统,基于HEK293细胞进行穿梭质粒与腺病毒骨架质粒的定点同源重组,构建重组腺病毒Ad5-RHDV2-VP60并感染HEK293细胞,通过RT-PCR、Western blotting及间接免疫荧光试验(IFA)对重组腺病毒进行表达验证;利用Reed-Muench方法测定重组腺病毒的病毒滴度。【结果】重组腺病毒穿梭质粒酶切鉴定结果可见2条大小分别为3895和1752 bp的条带,测序比对结果显示,其与GenBank中公布的相应序列相似性>99%,表明穿梭质粒构建成功。RT-PCR结果可见大小约为515 bp的特异性条带;Western blotting结果显示,大小约为60 ku的VP60蛋白特异性条带;IFA观察结果显示,感染重组腺病毒的HEK293细胞产生了绿色荧光,表明重组病毒能在HEK293细胞中表达VP60蛋白,且该蛋白具有良好的抗原性;病毒滴度测定结果显示,初代重组腺病毒的TCID_(50)为10^(5.5)/0.1 mL。【结论】本试验构建了含RHDV2 VP 60基因的重组腺病毒,并成功表达了RHDV2 VP60蛋白,为进一步研究开发RHDV2疫苗提供了病毒模型。