粪便23S rRNA基因检测判断幽门螺杆菌感染及克拉霉素耐药性的临床价值

目的探讨粪便23S rRNA基因检测判断幽门螺杆菌(Hp)感染以及克拉霉素耐药性的临床价值。方法选取2018年1至12月因上消化道疾病于杭州市萧山区第一人民医院就诊、13C呼气试验阳性的患者86例,同时行胃黏膜组织培养联合药敏试验以及粪便23S rRNA基因检测,对比两种方法的Hp阳性率以及对克拉霉素的耐药情况。粪便23S rRNA基因检测的假阴性样本予以16S rRNA高通量测序进行验证。结果粪便23S rRNA基因检测阳性率为79.07%(68/86),显著高于胃黏膜组织培养阳性率65.12%(56/86)(P<0.05)。药敏试验克拉霉素耐药率为23.21%(13/56),低于粪便23S rRNA基因检测克拉霉素耐药率32.35%(22/68)。与胃黏膜组织培养相比,粪便23S rRNA基因检测检出Hp阳性的灵敏度为96.43%(54/56),特异度为53.33%(16/30),对克拉霉素耐药的灵敏度为92.31%(12/13),特异度为78.05%(32/41),与药敏结果一致率为81.48%(44/54),Kappa值为0.581,提示一致性强度中等。结论粪便23S rRNA基因检测具有较高的Hp阳性率和克拉霉素耐药灵敏度,可用于胃镜检查不耐受或13C呼气试验阳性胃黏膜组织培养阴性患者的Hp检测。

奶牛临床型乳房炎Corynebacterium phoceense的分离鉴定及药敏试验

对太原市某奶牛场临床型乳房炎病牛进行病原菌的分离鉴定及药敏试验,以期了解主要的病原菌及其药物敏感性,为该场乳房炎的防控提供参考依据。本研究采用病原菌分离培养、16S rRNA基因的PCR扩增及序列分析、16联牛乳房炎病原菌核酸qPCR-荧光探针法鉴定了该牧场4头患病牛的9份乳样,并用纸片法对分离菌株进行了药敏试验。结果表明,共分离出8株细菌,包括Corynebacterium phoceense 5株(62.5%)、气球菌1株、链球菌1株和嗜冷杆菌1株,这些菌属对环丙沙星、庆大霉素、阿莫西林拉维酸钾、利福平、多西环素、头孢噻呋均为高度敏感,而对氨曲南、磺胺异恶唑有一定耐药性;同时,通过TaqMan探针实时荧光PCR筛选出2种弱阳性菌属和6种疑似菌属,但是病原菌含量均不高,且大多为环境条件性致病菌。研究结果说明分离培养的方法不能全面地反映引起乳房炎的病原菌感染状况。所以在生产中须借助分子生物学方法进行综合检测分析。该试验也初步判定Corynebacterium phoceense可能是引起乳房炎的主要致病菌之一。

培土清心方对特应性皮炎儿童肠道菌群的影响

目的通过高通量测序手段检测比较特应性皮炎(AD)患儿与健康对照儿童肠道菌群结构差异,并对比培土清心方干预前后对AD患儿的临床疗效及肠道菌群的改变情况,初步探索培土清心方对肠道菌群的影响。方法共纳入60例受试者(实验组、健康对照组各30例),实验组分别在口服培土清心方0周(AD.0W)、4周(AD.4W)进行SCORAD评分并采集粪便样品,对照组在0周时采集粪便样品,统一对粪便样品进行16S rRNA基因测序检测。结果实验组用药4周(AD.4W)SCORD评分降低,差异有统计学意义(P<0.05)。肠道菌群测序结果:①Alpha多样性:AD.0W组>AD.4W组>健康对照组(P>0.05)。②差异菌门水平:Firmicutes(厚壁菌门)相对丰度:AD.0W组<健康对照组<AD.4W组(P>0.05);Bacteroidetes(拟杆菌门)相对丰度:AD.4W组<健康对照组<AD.0W组(P>0.05);Faecalibacterium(柔嫩梭菌属)相对丰度:AD.0W组<AD.4W组<健康对照组,差异有统计学意义(P=0.00<0.05)。结论特应性皮炎儿童和健康儿童肠道菌群多样性方面无差异,柔嫩梭菌属为健康人优势菌属;培土清心方可改善AD患儿病情,对肠道菌群多样性无明显影响,其可能通过上调厚壁菌门、柔嫩梭菌属,下调拟杆菌门丰度来达到减轻肠道炎症、改善AD的作用。