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鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因的克隆与序列分析
被引量:
9
1
作者
张际峰
汪承润
+1 位作者
王顺昌
王春花
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期87-92,共6页
本文利用多对引物,扩增并测定出鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因部分序列,其长度均为1206bp,其中太湖新银鱼与大银鱼基因序列完全相同.将3种经济鱼类与GenBank中10种脊椎动物及头索动物文昌鱼的18S rRNA基因同源序列进行比对分析...
本文利用多对引物,扩增并测定出鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因部分序列,其长度均为1206bp,其中太湖新银鱼与大银鱼基因序列完全相同.将3种经济鱼类与GenBank中10种脊椎动物及头索动物文昌鱼的18S rRNA基因同源序列进行比对分析,计算出序列碱基组成、序列间差异百分比和转换/颠换数值.基于18S rRNA基因序列,利用NJ法、ML法和BI法3种聚类方法,以文昌鱼为外群,构建13种脊椎动物的分子系统树,3种方法获得拓扑学结构一致的系统树.系统树包括3大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的2个物种,另一支为5种硬骨鱼类.结果表明:鸟类与哺乳类亲缘关系较近,而胡瓜鱼目与鲑形目亲缘关系近于鲱形目.此外,本文还讨论了脊椎动物18S rRNA基因的序列特征.
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关键词
鲥鱼
太湖新银鱼
大银鱼
18S
rrna基闲
系统分析
原文传递
题名
鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因的克隆与序列分析
被引量:
9
1
作者
张际峰
汪承润
王顺昌
王春花
机构
淮南师范学院生命科学系
出处
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期87-92,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(20877032)
安徽省教育厅自然科学研究项目(KJ2009B268Z)
文摘
本文利用多对引物,扩增并测定出鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因部分序列,其长度均为1206bp,其中太湖新银鱼与大银鱼基因序列完全相同.将3种经济鱼类与GenBank中10种脊椎动物及头索动物文昌鱼的18S rRNA基因同源序列进行比对分析,计算出序列碱基组成、序列间差异百分比和转换/颠换数值.基于18S rRNA基因序列,利用NJ法、ML法和BI法3种聚类方法,以文昌鱼为外群,构建13种脊椎动物的分子系统树,3种方法获得拓扑学结构一致的系统树.系统树包括3大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的2个物种,另一支为5种硬骨鱼类.结果表明:鸟类与哺乳类亲缘关系较近,而胡瓜鱼目与鲑形目亲缘关系近于鲱形目.此外,本文还讨论了脊椎动物18S rRNA基因的序列特征.
关键词
鲥鱼
太湖新银鱼
大银鱼
18S
rrna基闲
系统分析
Keywords
Tenualosa reevesii
Neosalanx taihuensis
Protosalanx hyalocranius
18S
rrna
gene phylogenetic analysis
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因的克隆与序列分析
张际峰
汪承润
王顺昌
王春花
《武汉大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010
9
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