矩阵热转移技术鉴定有机酸类代谢物的结合蛋白质

有机酸类代谢物在表观遗传、肿瘤发生和发展以及细胞内信号转导等方面发挥着重要作用,对这类代谢物在体内的结合蛋白质进行鉴定,将有助于从分子学层面理解和揭示它们的功能。本研究采用矩阵热转移技术(mTSA),在HeLa细胞裂解液中系统鉴定了3种有机酸类代谢物(琥珀酸、富马酸和乳酸)的结合蛋白质。首先,向细胞裂解液中加入一系列不同浓度的琥珀酸、富马酸或乳酸,在52℃下加热3 min,离心并收集上清蛋白质,进行酶解及后续质谱分析。在数据非依赖性采集(DIA)模式下,本研究在琥珀酸、富马酸和乳酸的mTSA实验中分别鉴定到5870、5744和5816个蛋白质;通过对蛋白质热稳定性的显著性差异值(p)和皮尔森相关系数平方值(R^(2))进行考察,该研究鉴定到了多个高可信度的有机酸类代谢物结合蛋白质。此外本研究发现,虽然富马酸和琥珀酸均能够与α-酮戊二酸依赖的双加氧酶(FTO)结合,但琥珀酸是FTO更强的竞争性抑制剂。除此之外,本研究还鉴定到了两个先前未曾报道过的乳酸结合蛋白质,即鸟氨酸转氨酶(OAT)和3-巯基丙酮酸硫转移酶(MPST),并通过溶剂诱导沉淀技术(SIP)和两种数据检验方法证明了其可信度;同时,OAT和MPST的发现有助于揭示乳酸在氨基酸合成和细胞内氧化还原平衡调节方面的重要作用。

发现一种能干扰Ras蛋白质的肽类抑制剂

据Patqiri A 2011年7月17日（Nat Chem Biol,2011 Jul 17.[Epub ahead of print]）报道,一种能干扰Ras蛋白质活性和信号的肽类抑制剂被合成。Ras蛋白质是细胞中许多生长促进通道的中心组分,在癌症和其他疾病中,这种蛋白质高度活跃。抑制或中止 Ras蛋白质活性的战略令人难以捉摸，但这种方法能有益于多种疾病的治疗。

克罗恩病的糖、脂类和蛋白质代谢异常

炎症性肠病(inflammatory bowel diseases,IBD)包括克罗恩病(Crohn's disease,CD)和溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC),其威胁着人类的健康.他起因不适当的免疫应答、遗传易感个体及共生的微生物抗原,并可被特定的环境因素所诱发.本文主要综述了CD的糖、脂类及蛋白质代谢异常及代谢组学平台在揭示CD生物学标志和发病机制中的意义.

红景天皂苷对雌性大鼠蛋白质和脂肪代谢的影响

目的 :探讨红景天皂苷对蛋白质及脂肪代谢的影响。方法 :用高脂肪饲料和基础饲料喂养Wistar大鼠 ,测定蛋白质消化率、生物价、脂肪消化率和血脂。结果 :红景天皂苷能够降低实验动物对蛋白质和脂肪的消化吸收率、蛋白质生物价以及高脂膳食动物的血脂。结论

革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.)的基因组和蛋白组研究

从西藏墨脱嘎隆拉山海拔3000m土壤中分离出一株革兰氏阳性类芽孢杆菌(Paenibacillus sp.),用Illumina Hiseq测序平台进行全基因组测序以及通过Prokka1.14.6软件进行基因组注释。结合antiSMASH 7.0和BAGEL 4分析Paenibacillus sp.基因组预测次级代谢产物生物合成基因簇。为了验证代谢产物路径,用不同破碎方法提取菌株全蛋白,通过蛋白质组质谱技术进行分析,结合不同蛋白质组分析软件,共鉴定了3383个蛋白质。通过同源比对,提取的蛋白质中可以检测到套索肽生物合成基因簇中依赖ATP半胱氨酸蛋白酶N端区域B1和ABC转运器。同时,用BAGEL4软件blastp功能从NCBI数据库中获取Paenibacillus sp.基因组中潜在完整的套索肽生物合成基因簇。

糖、脂类、蛋白质和核酸的代谢及相互关系

糖、脂类、蛋白质和核酸的代谢及相互关系杨广笑研究糖、脂类、蛋白质和核酸这四大类物质的代谢是生物化学的重要内容，也是尝习的难点。一般生物化学教材均按顺序对这四大类物质的代谢分章节逐一介绍，但这仅仅是为了叙述方便。事实上，生物有机体的新陈代谢是一个完整的...

蛋白质类可食性涂膜保鲜果蔬技术的研究进展

近年来,可食性涂膜保鲜技术因其成本低廉、安全无毒、保鲜效果良好而备受关注且得到广泛的研究和应用。果蔬含有丰富的碳水化合物、维生素、矿物质和膳食纤维,是保证人类膳食营养均衡的必要物质,且在保障人体健康上发挥着重要作用。然而,大多数果蔬经采摘后仍进行旺盛的呼吸代谢,运输及常温贮存过程中易被霉菌、细菌等感染而发生腐败变质,失去其原有食用价值且造成巨大经济损失。目前,果蔬的保鲜方法主要有低温贮藏、

蛋白质及胆固醇对大鼠钙磷代谢的影响

目的研究蛋白质和胆固醇对大鼠钙、磷、镁代谢的影响。方法Wistar雌性断乳大鼠,经喂含有1%胆固醇的预备饲料1周后,以2×2析因分析设计,分为大豆蛋白组、大豆蛋白+胆固醇组、酪蛋白组和酪蛋白+胆固醇组。实验结束前收集3d尿和粪便,实验结束后测定尿、粪便及各脏器中钙、磷、镁的含量。结果蛋白质和胆固醇两因素对大鼠尿量、尿磷和骨钙均有明显影响。在测定的其他多数代谢指标中,胆固醇的影响作用明显强于蛋白质。结论胆固醇对大鼠钙、磷、镁的代谢及尿pH值、尿量、粪重等均有明显影响,适量摄入胆固醇对健康具有十分重要的意义。

专用肠内营养制剂对急性坏死性胰腺炎大鼠蛋白质代谢的影响

目的观察专用肠内营养制剂（EN-S）对ANP大鼠蛋白质代谢的调节作用。方法应用3.8%牛磺胆酸钠逆行胆胰管注射制备32只ANP模型大鼠,分为对照组、EN-S组、EN组和PN组4组,各8只。营养各组于造模后12h分别给予EN-S、EN和PN制剂。检测各组制模后12h、24h、48h的血淀粉酶,观察胰腺组织的病理改变,以及第7天大鼠体重、血浆氨基酸谱和血清白蛋白含量。结果制模后第7天,EN-S组大鼠体重、血清白蛋白、血浆天门冬氨酸（Asp）、蛋氨酸（Met）和赖氨酸（Lys）显著高于普通EN组（P〈0.05）。EN-S组与PN组的体重、血清白蛋白、氨基酸谱整体构成无显著性差异。结论EN-S制剂能够改善ANP大鼠的蛋白质代谢,有助于整体情况的改善。

RASSF1A及p53蛋白在胃黏膜病变中的表达及意义

Ras相关区域家族1A（RASSF1A）是新近发现的候选抑癌基因,其表达与肿瘤的发生、发展和预后密切相关,与p53基因的相关性也日益受到广大学者的关注。本研究检测胃癌及相应正常组织中RASSF1A与p53蛋白的表达情况,以分析RASSF1A与p53在胃癌发生、发展中的作用。

蛋白质类泛素化研究

细胞内蛋白质代谢的平衡对于维持正常细胞的生理功能起着至关重要的调节作用。在正常细胞内，数万种蛋白质的精确合成和降解形成了蛋白质代谢的动态平衡。泛素蛋白酶体系统（Ubiquitin—Proteasome System，UPS）是负责细胞内环境蛋白质代谢稳定的主要清理系统，通过控制细胞内80％～90％的蛋白质的降解，进而调控一系列关键生理过程.

基于生物质谱的蛋白质定量技术及其在药代动力学研究中的应用

蛋白质定量技术是指对细胞、组织以至整体生物体内的蛋白质表达水平进行全谱定量分析的手段,其在生物过程机制的探索、生物标志物和药物作用靶标的发现及验证等过程中发挥着重要作用。新兴生物质谱技术和数据采集方法的发展为蛋白质定量提供了先进的技术平台,促使了蛋白质研究逐渐从简单定性转变为精确定量。本文综述了基于生物质谱的蛋白分子定量策略及方法,评述了不同方法的特点和适用范围,并阐述了其在药物代谢动力学研究领域,如药物转运体、药物代谢酶的定量和多肽及蛋白类药物的药代动力学研究等方面的应用,为传统的药代动力学研究提供了新的思路与方法。

不同低蛋白日粮下甜菜碱对三元育肥猪脂类代谢的影响

【目的】研究低蛋白日粮中不同蛋白质水平与甜菜碱水平对三元育肥猪脂类代谢的影响.【方法】选取150头3月龄左右、体质量相近(49±4.04)kg的‘杜大长’三元杂交育肥猪,随机分为10组,对照组饲喂基础日粮(15%蛋白质,无甜菜碱),其余组别按照3×3双因素试验设计,设3个蛋白质水平(13%,14%,15%)和3个甜菜碱水平(0.10%,0.15%,0.20%),分别饲喂9种不同的试验日粮.饲喂试验开始前与结束后每组分别随机抽取5头试验猪前腔静脉采集抗凝血样,分离血清,日立全自动生化分析仪测定血清中TG,TC,HDL-C,LDL-C含量,SPSS23.0软件进行统计学处理与分析.【结果】日粮中蛋白质与甜菜碱水平对三元育肥猪血清中TG,TC,HDL-C,LDL-C含量均具有极显著影响(P<0.01);蛋白质与甜菜碱间的交互作用对血清中TG、LDL-C含量具有极显著影响(P<0.01,|r|>0.3);蛋白质与TC、HDL-C间存在极显著的强正相关性(P<0.01,|r|>0.3),甜菜碱与TC,LDL-C间存在极显著的强正相关性(P<0.01,|r|>0.3).【结论】14%蛋白质水平下,TG、LDL-C含量极显著降低(P<0.01),HDL-C含量极显著升高(P<0.01),有利于试验猪健康生长;0.15%甜菜碱水平下,TG,LDL-C含量极显著降低(P<0.01),HDL-C含量极显著升高(P<0.01),为最适添加量;蛋白质与甜菜碱间可能存在干扰效应.

桦菌芝多糖对HepA小鼠抑瘤率、HepA瘤细胞N-ras蛋白表达、SDS-PAGE血清蛋白组分的影响

目的:观察桦菌芝多糖对移植型腹水型肝癌(HepA)小鼠抑瘤率、HepA瘤细胞N-ras蛋白表达、SDS-PAGE血清蛋白组分的影响,为桦菌芝多糖抑瘤作用机制的揭示及临床应用提供实验依据。方法:将完整的肿瘤组织称重,计算抑瘤率;用SP免疫组化染色技术及多媒体彩色病理图文分析系统测定HepA瘤细胞中Ras蛋白的表达;通过十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳法,观察桦菌芝多糖对HepA瘤血清蛋白组分的影响。结果:桦菌芝多糖对HepA小鼠抑瘤率为39.75%;桦菌芝多糖组、猪苓多糖组Ras蛋白的表达量均明显低于阴性对照组(P<0.05);桦菌芝多糖对HepA小鼠血清蛋白组分有影响,在加样量相等的情况下,可使荷瘤阴性对照组与正常组比较在分子量140000处的特异深染组分变浅,并与正常组相近,说明桦菌芝多糖对此改变有恢复作用。结论:桦菌芝多糖对小鼠HepA瘤有明显的抑瘤效应,可降低Ras蛋白的表达,抑制HepA瘤细胞的增殖,使HepA小鼠血清异常蛋白组分(Mr140000)减少并趋于正常。

25-羟维生素D、铁蛋白与代谢相关脂肪性肝病及FIB-4指数的相关性分析

目的探讨血清25-羟维生素D[25(OH)D]和铁蛋白(SF)水平与代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)及FIB-4指数的相关性。方法回顾性分析2020年8月—2021年12月在武汉市汉口医院消化内科住院的595例患者临床资料。比较MAFLD患者(242例)与非MAFLD患者(353例)临床特征的差异。比较不同25(OH)D水平组MAFLD患病率及SF水平的差异。非正态分布的计量资料两组间比较采用Mann-Whitney U检验。计数资料组间比较采用χ^(2)检验。采用Spearman相关性分析不同人群中血清25(OH)D与SF的相关性。采用二元Logistic回归分析25(OH)D和SF与MAFLD患病风险及FIB-4指数的关系。通过受试者工作特征曲线(ROC曲线)评估25(OH)D和SF预测MAFLD合并肝纤维化的诊断价值。结果与非MAFLD患者相比,MAFLD患者血清25(OH)D水平[15.35(11.26~20.02)vs 21.71(15.39~27.84)]明显降低,而SF水平[365.50(251.75~525.00)vs 205.00(112.50~275.00)]明显升高(Z值分别为-9.761、-13.317,P值均<0.05)。随着血清25(OH)D水平的降低,MAFLD患病率呈升高趋势,SF水平亦呈升高趋势(Z=75.512,P<0.05)。MAFLD患者中血清25(OH)D水平与SF存在显著负相关(r=-0.460,P<0.05)。Logistic回归分析结果显示,血清25(OH)D降低(OR=0.934,95%CI:0.879~0.992,P=0.028)和SF升高(OR=1.009,95%CI:1.006~1.013,P<0.001)是MAFLD的独立危险因素,而且25(OH)D降低还是MAFLD患者FIB-4指数升高(>2.67)的独立危险因素(OR=0.852,95%CI:0.752~0.965,P=0.012)。ROC曲线分析显示,血清25(OH)D、SF及二者联合预测MAFLD患者FIB-4指数升高(>2.67)的曲线下面积分别为0.793、0.829和0.851(P值均<0.05)。结论血清25(OH)D与SF存在负相关,血清25(OH)D降低和SF升高与MAFLD患病风险及FIB-4指数升高相关,血清25(OH)D和SF水平对预测MAFLD患者合并肝纤维化具有一定的临床价值。

再生蛋白质组学研究进展的力作——介绍《动物组织器官再生的比较蛋白组学研究》

由郑州大学出版社出版发行的《动物组织器官再生的比较蛋白质组学研究》一书是国家新闻出版广电总局“十三五”规划重点项目,获得国家出版基金资助。全书以大鼠肝再生以及分布于我国的蝾螈(Orientalis)断肢再生、三角涡虫(Japonica)头尾再生为研究对象,检测和分析了再生相关蛋白在动物组织器官中再生的生理、生化作用,包括细胞生长、细胞发育、细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、细胞的物质运输、细胞迁移、糖类代谢、脂类代谢、氨基酸代谢、蛋白质代谢、核酸代谢、有机酸代谢、维生素、辅助因子代谢、激素代谢、一氧化碳代谢、生物氧化及活性氧代谢,论述了细胞内环境的稳定、对刺激的反应、免疫反应、凝血反应、炎症反应、自噬反应等,以及调节这些生理生化活动的信号通路活性。

不同质量蛋白质对肾损害大鼠钙平衡的影响

目的:研究大豆蛋白对肾损害大鼠钙平衡的影响。方法:选择3月龄健康雄性SD大鼠40只,按体质量从小到大排序采用完全随机化原则分为4组,每组10只。标准饲料对照组:喂食含有14%酪蛋白饲料;大豆蛋白饲料组:喂食含有14%大豆分离蛋白饲料;混合饲料I组:喂食含有7%酪蛋白加7%大豆分离蛋白饲料;混合饲料II组:喂食含有7%酪蛋白加14%大豆分离蛋白饲料。实验期用腺嘌呤灌胃共21天建立肾损害大鼠模型,各组大鼠喂养相应饲料6周。测量指标:钙摄入量、尿钙、粪钙、血肌酐、尿素、白蛋白、钙、磷,骨钙。结果:大豆蛋白饲料组和混合饲料I组实验检测项目无明显统计学差异,与另外两组相比,血肌酐、尿素、磷低,血钙、钙表观吸收率、钙储留量和骨钙高,差异有统计学意义(P<0·05)。结论:蛋白质含量水平在14%条件下,含大豆蛋白的饲料更有助于促进钙平衡。

木薯品种(系)类胡萝卜素代谢相关基因和蛋白表达水平分析

以白心木薯华南6068、华南9号、紫叶黄心木薯BGM019和粉红木薯Mirasol为材料,探究木薯块根膨大期和成熟期与类胡萝卜素代谢通路相关的14个基因和4种蛋白质表达水平变化。用HPLC检测块根β-胡萝卜素含量的变化,分别用qRT-PCR和Western blot方法对类胡萝卜素代谢通路相关基因和蛋白酶的表达水平进行分析。以华南6068为对照,研究结果表明:华南9号和紫叶黄心木薯BGM019成熟期中的类胡萝卜素合成途径关键基因PSY2、LCYB基因显著高于膨大期,而降解相关的关键基因CCD1、NCED3在成熟期的表达量显著低于膨大期(P<0.05)。粉红木薯Mirasol成熟期中PSY2、LCYB的显著下调与CCD1、NCED3的显著上调(P<0.05)是造成β-胡萝卜素含量差异的原因之一。通过分析不同木薯品种(系)在膨大期和成熟期块根类胡萝卜素代谢途径相关基因的表达水平,有助于解析β-胡萝卜素积累的分子机理。此外,Western blot结果显示抗坏血酸过氧化物酶、谷胱甘肽还原酶、超氧化物歧化酶和HSP70虽然和块根类胡萝卜素代谢途径没有直接关联,但它们在木薯膨大期和成熟期块根表达水平有显著差异(P<0.05)。