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Real-time PCR与RT-PCR检测儿童人偏肺病毒 被引量:1
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作者 郭鑫 崔玉霞 +1 位作者 诸葛姝芮 刘兴梅 《贵阳医学院学报》 CAS 2015年第8期834-837,840,共5页
目的:比较荧光定量PCR(real-time PCR)与普通反转录酶-聚合酶链锁反应(RT-PCR)对人偏肺病毒(hMPV)的检测价值。方法:Real-time PCR和RT-PCR同时对500例急性下呼吸道感染(ALRTI)患儿鼻咽部分泌物进行h MPV检测,分析两种方法的特异性和灵... 目的:比较荧光定量PCR(real-time PCR)与普通反转录酶-聚合酶链锁反应(RT-PCR)对人偏肺病毒(hMPV)的检测价值。方法:Real-time PCR和RT-PCR同时对500例急性下呼吸道感染(ALRTI)患儿鼻咽部分泌物进行h MPV检测,分析两种方法的特异性和灵敏性。结果:Real-time PCR和RT-PCR的检出率分别为16%及9.8%,RT-PCR与Real-time PCR比较,灵敏度为31.3%(25/80),特异度为94.3%(396/420)。结论:Real-time PCR检测hMPV敏感性高于RT-PCR,是临床检测儿童鼻咽部分泌物h MPV感染的有效的方法。 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR 逆转录聚合酶链反应 儿童 感染 人偏肺病毒
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2009年至2013年萍乡市流感病例样本real-time RT-PCR结果分析 被引量:3
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作者 邓兰 李晶鑫 +3 位作者 钟知情 张春芝 谢荣福 朱金华 《实验与检验医学》 CAS 2014年第5期511-513,共3页
目的通过对萍乡市历年流感样病例的病毒核酸检测结果分析,了解当地流感疫情状况,分析当地流感发病趋势,为预防和控制流感流行提供科学论证凭据。方法萍乡市人民医院为国家流感样病例监测哨点医院,对符合流感样病例定义的病例收集相关信... 目的通过对萍乡市历年流感样病例的病毒核酸检测结果分析,了解当地流感疫情状况,分析当地流感发病趋势,为预防和控制流感流行提供科学论证凭据。方法萍乡市人民医院为国家流感样病例监测哨点医院,对符合流感样病例定义的病例收集相关信息,采集咽拭子标本,采用实时荧光逆转录聚合酶链反应法(real-time RT-PCR)对标本进行流感病毒核酸检测,并进行统计分析。结果萍乡市流感病毒核酸阳性率22.09%,其中2009年阳性率59.75%最高,之后呈下降趋势。新甲型H1N1流感病毒和乙型流感病毒阳性数接近,构成比分为33.74%和30.89%。新甲型H1N1共检出阳性166例,其中2009年9-12月检出阳性143例,2009年11月为最高峰,阳性率达到(75/143)52.45%,2010年以后有少量病例发现。乙型和季H3流感检出阳性数逐年增加。男、女流感核酸阳性检出率分别为23.19%(291/1255)和20.68%(201/972)。年龄分5个组统计分析,阳性率分别是37.25%、30.59%、19.40%、18.69%和13.00%。结论萍乡市流感病例核酸阳性以新甲型H1N1和乙型为主;季H3流感病例核酸阳性有所增加,且新甲型H1N1在2009年12月后得到有效控制,流感病毒易感染人群以学龄儿童和青少年为主,性别无差异。 展开更多
关键词 流感病毒 实时荧光逆转录聚合酶链反应法 病毒分型
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复合探针实时荧光RT-PCR法检测小儿上呼吸道感染甲型流感病毒的价值 被引量:1
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作者 杨彬彬 陈秋虾 郭丽清 《中国医药指南》 2024年第15期103-105,共3页
目的 分析小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测的临床价值。方法选择2023年1月至2023年12月流感监测信息系统两家监测点上呼吸道感染甲型流感病毒感染的患儿80例监测标本进行回顾性分析... 目的 分析小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测的临床价值。方法选择2023年1月至2023年12月流感监测信息系统两家监测点上呼吸道感染甲型流感病毒感染的患儿80例监测标本进行回顾性分析,均开展复合探针实时荧光RT-PCR法检测,分析其诊断价值。结果 根据监测标本最终诊断结果显示,阳性标本68例、阴性标本12例。经复合探针实时荧光RT-PCR法检出67例,检出率为83.75%,敏感度为95.59%、特异度为83.33%、准确度为93.75%、阳性结果预测值为97.01%、阴性结果预测值为76.92%;批间批内变异系数均小于5%。结论 小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光RT-PCR技术具有较高的敏感度、特异度及准确度,且检查结果快速,可为小儿上呼吸道感染甲型流感病变提供可靠的诊断,有利于制订合理的治疗方案。 展开更多
关键词 复合探针 上呼吸道感染 实时荧光反转录聚合酶链反应 甲型流感病毒
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帕利亚姆病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 杨恒 李占鸿 +5 位作者 宋子昂 高林 李卓然 廖德芳 肖雷 李华春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期395-400,共6页
本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,... 本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,对方法的特异性、灵敏性与重复性进行评估;以我国分离的28株PALV和90份核酸阳性血液样本评估检测方法的可靠性;利用建立的方法对采集库蠓样本中携带的PALV进行血清型鉴定。结果显示,建立的PALV血清型qRT-PCR检测方法具有良好的特异性与灵敏性,可检出核酸拷贝数下限在22至28 copies·μL^(-1)。对28株PALV的qRT-PCR检测结果与病毒测序鉴定结果一致;对PALV不同感染阶段哨兵动物血液(90份)中的qRT-PCR鉴定结果与分离病毒的血清型鉴定结果一致;建立的方法可准确鉴定库蠓中携带PALV的血清型。本研究建立的PALV血清型qRT-PCR定型方法具有良好的特异强、敏感性与重复性,可用于PALV感染动物与媒介中PALV血清型的鉴定,具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 帕利亚姆病毒 血清型鉴定 实时荧光定量rt-pcr 检测方法
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Sequence Analysis and Quantitative Detection of Norwalk-like Viruses in Cultured Oysters of China
5
作者 WANG Jun TANG Qingjuan +3 位作者 YUE Zhiqin LI Zhaojie ZHANG Jin XUE Changhu 《Journal of Ocean University of China》 SCIE CAS 2008年第2期223-227,共5页
We isolated 4 Norwalk-like viruses (NLVs) contaminated oysters from 33 Chinese oysters collected from local commercial sources of Shandong Province. After amplification of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) r... We isolated 4 Norwalk-like viruses (NLVs) contaminated oysters from 33 Chinese oysters collected from local commercial sources of Shandong Province. After amplification of the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) region of NLVs genomes with RT-PCR, the open reading frame 1 (ORF 1) of the RdRp was sequenced and subjected to multiple-sequence alignment. The results showed that NLVs in the four isolates belong to genogroup Ⅱ. The sequence comparison showed that the similarity between four Chinese oyster isolates were higher than 99.0%, which indicated that NLVs prevalent in close areas have high homogeneity in genome sequences. In addition, the most conserved sequences between diverse NLVs were used to design primers and TaqMan probes, then the real-time quantitative PCR assay was performed. According to the standard curve of GII NLVs, the original amounts (copies) of NLVs in positive patient's fecal isolate, positive Japanese oyster isolate, and the Chinese oyster isolate were 8.9× 10^8, 1.25× 10^8 and 4.7× 10^1 respectively. The detecting limit of NLVs was 1 × 10^1 copies. This study will be helpful for routine diagnosis of NLVs pathogens in foods and thus for avoiding food poisoning in the future. 展开更多
关键词 OYSTERS Norwalk-like viruses (NLVs) reverse transcription polymerase chain reaction rt-pcr sequence analysis real time quantitative PCR
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基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法的建立 被引量:1
6
作者 李浪 古莉冰 +6 位作者 朱丽 何建安 叶颖 张然 李华文 李福缘 顾大勇 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第3期358-364,共7页
目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果... 目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果5种样本检测限分别为血清103 PFU/mL,尿、咽拭子和唾液102 PFU/mL,全血104 PFU/mL,标准曲线的拟合优度的可决系数均在0.98以上,扩增效率均在90%~110%;寨卡病毒核酸成功扩增,非寨卡病毒核酸均未能扩增;尿、全血和唾液样本的重复性实验中106 PFU/mL和102 PFU/mL两个浓度的6个重复Ct值的变异系数均<5%。该研究建立的直扩RT-PCR技术的寨卡病毒检测方法与常规RT-PCR技术的检测结果一致,8个寨卡病毒样本,均只检测出2个血清样本,其余62个非寨卡病毒样本及12个阴性样本均未得到扩增。结论成功建立基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法,该方法简便快捷且灵敏度高、特异度强。 展开更多
关键词 寨卡病毒 直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应技术 DNA聚合酶
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实时定量RT-PCR的原理及方法 被引量:34
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作者 阳成波 印遇龙 +3 位作者 黄瑞林 李铁军 单计光 唐志如 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第S1期145-150,共6页
实时定量RT-PCR广泛应用于定量检测mRAN表达水平,为基础研究、分子药物学和生物技术研究提供了一种有力的方法。该法具有易操作、高通量、敏感性高和特异性强的特点,随着新酶、新探针和新仪器的发展而得到快速的发展。本文将对实时定量R... 实时定量RT-PCR广泛应用于定量检测mRAN表达水平,为基础研究、分子药物学和生物技术研究提供了一种有力的方法。该法具有易操作、高通量、敏感性高和特异性强的特点,随着新酶、新探针和新仪器的发展而得到快速的发展。本文将对实时定量RT-PCR的定量原理、仪器应用、探针种类的研究进展以及细胞因子mRNA表达水平检测上的应用作一综述。 展开更多
关键词 细胞因子 定量 实时定量rt-pcr
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实时荧光定量RT-PCR分析非小细胞肺癌SATB1的表达和临床病理意义 被引量:32
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作者 周来勇 刘芳 +3 位作者 童健 陈群请 张福伟 郭琳琅 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期534-537,共4页
目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组... 目的检测非小细胞肺癌组织中SATB1 mRNA的表达,探讨SATB1表达与非小细胞肺癌发生、发展的关系及其临床病理意义。方法用TRIZOL提取非小细胞肺癌组织和正常肺组织总RNA后,将其反转录为cDNA,以实时荧光定量RT-PCR方法检测非小细胞肺癌组织及正常肺组织中SATB1 mRNA的表达,分析SATB1基因表达与临床病理参数的相关性。结果癌组织中SATB1 mRNA表达量为正常组织13倍,两者差异显著(P<0.001),其中有、无转移组分别为正常组织23.63倍和5.57倍。结论SATB1 mRNA的表达水平可能与非小细胞肺癌发生发展及淋巴转移有关,有望成为判断非小细胞肺癌预后的一个指标。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 SATB1 mRNA 实时荧光定量rt-pcr
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猪嵴病毒实时荧光定量RT-PCR方法的建立 被引量:9
9
作者 修金生 陈小权 +1 位作者 王斌 李涛 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期922-926,共5页
目的本研究根据GenBank中登录猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)株的3D蛋白序列基因特征,设计特异性引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PKV的实时荧光定量RT-PCR方法。结果该方法检测PKV的3D基因在6.42×102~6.42×108拷贝/μL范围... 目的本研究根据GenBank中登录猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)株的3D蛋白序列基因特征,设计特异性引物,建立基于SYBR GreenⅠ检测PKV的实时荧光定量RT-PCR方法。结果该方法检测PKV的3D基因在6.42×102~6.42×108拷贝/μL范围内有很好的线性关系,其扩增相关系数为0.999,扩增效率为100%,扩增产物的融解曲线分析只出现1个单特异峰,融解温度为(84.94±0.24)℃,对传染性胃肠炎病毒、猪轮状病毒、猪圆环病毒、猪繁殖与呼吸综合症病毒、猪伪狂犬病毒、猪瘟病毒均检测不到荧光信号,特异性强。所建立实时荧光定量RT-PCR方法组内变异系数为0.26%~1.14%,组间变异系数0.63%~1.79%,重复性好。结论本方法的建立为PKV的早期诊断及定量分析PKV感染水平和确定感染靶器官提供新的检测方法。 展开更多
关键词 猪嵴病毒 SYBR GreenⅠ 实时荧光定量rt-pcr
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定量RT-PCR检测雌二醇诱导的青鳉鱼基因表达 被引量:6
10
作者 侯彦峰 张照斌 +1 位作者 胡建英 范光丽 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期599-602,共4页
采用实时定量RT-PCR(Q-RT-PCR)方法,对暴露60d雌二醇的雄性青鳉鱼肝脏内卵黄蛋白原(VTG)和卵壳前体蛋白(CHG)基因表达进行研究.结果表明,0.1,1.0,10.0,100.0ng/L的雌二醇使肝脏内VTG-I,VTG-II,CHG-L和CHG-H基因表达被显著诱导.其中VTG-... 采用实时定量RT-PCR(Q-RT-PCR)方法,对暴露60d雌二醇的雄性青鳉鱼肝脏内卵黄蛋白原(VTG)和卵壳前体蛋白(CHG)基因表达进行研究.结果表明,0.1,1.0,10.0,100.0ng/L的雌二醇使肝脏内VTG-I,VTG-II,CHG-L和CHG-H基因表达被显著诱导.其中VTG-I显示出较好的剂量—效应关系,是较为理想的生物标记物基因.在0.1ng/L雌二醇暴露组中,VTG-I和VTG-II的表达量均显著高于对照组(P<0.05),表明本方法具有检测环境中低剂量雌二醇暴露的潜力. 展开更多
关键词 雌二醇 青鳉亭鱼 生物标志物 实时定量rt-pcr 卵黄蛋白原 卵壳前体蛋白
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水稻GA20ox-2基因mRNA的TaqMan荧光定量RT-PCR检测 被引量:4
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作者 高东 何霞红 +2 位作者 王云月 李成云 朱有勇 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期309-314,共6页
成功建立了一项基于TaqMan实时荧光定量的RT-PCR技术,定量分析水稻半矮化关键基因之一GA20ox-2转录水平。该技术体系中重组质粒标准品的制备方法具有很好的实用性;质粒标准品对基因GA20ox-2表达的实时定量准确、可靠、便捷。标准曲线表... 成功建立了一项基于TaqMan实时荧光定量的RT-PCR技术,定量分析水稻半矮化关键基因之一GA20ox-2转录水平。该技术体系中重组质粒标准品的制备方法具有很好的实用性;质粒标准品对基因GA20ox-2表达的实时定量准确、可靠、便捷。标准曲线表明,所建立的GA20ox-2基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,特异性好,灵敏度高,可达102拷贝;线性范围广,可达102~107拷贝;扩增效率高(E=100.3%);稳定性、重复性好,可靠性高,批内和批间变异系数仅分别为0.12%~0.31%和0.21%~0.34%;循环阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系(r=0.999),可对GA20ox-2基因表达进行准确实时定量。 展开更多
关键词 水稻 矮秆基因 基因表达 实时定量 逆转录-聚合酶链式反应 探针
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实时荧光RT-PCR在人感染H7N9禽流感病毒检测中的应用 被引量:11
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作者 华哲云 褚维 +3 位作者 宋黎黎 王宇 高淑娜 劳宝法 《检验医学》 CAS 2013年第9期755-757,共3页
目的评估实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测H7N9禽流感病毒的应用效果,为人感染H7N9禽流感监测和防控提供可靠的实验室检测数据。方法采集各级医疗单位人感染H7N9禽流感监测及可疑病例标本137例,同时使用4种实时荧光RT-PCR试剂分... 目的评估实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测H7N9禽流感病毒的应用效果,为人感染H7N9禽流感监测和防控提供可靠的实验室检测数据。方法采集各级医疗单位人感染H7N9禽流感监测及可疑病例标本137例,同时使用4种实时荧光RT-PCR试剂分别检测上呼吸道标本和下呼吸道标本中H7N9禽流感病毒核酸。结果 H7N9禽流感病毒核酸阳性率为3.65%(5/137);H7N9禽流感病毒核酸阳性标本中上呼吸道标本检出率为60%(3/5),下呼吸道标本检出率为100%(3/3)。4种试剂符合率为100%。结论实时荧光RT-PCR能有效检出H7N9禽流感病毒核酸,检测下呼吸道标本有助于提高阳性检出率。 展开更多
关键词 H7N9禽流感病毒 人类感染 实时荧光逆转录聚合酶链反应 下呼吸道标本
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诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR的研究 被引量:4
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作者 谭翰清 郭赐贶 +5 位作者 谭海芳 陈华 程洁萍 林凤 孔秀珍 丁丽娜 《热带医学杂志》 CAS 2008年第10期1030-1033,1040,共5页
目的建立诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏的检测方法,为疾病预防控制提供可靠的依据。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅰ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立一步法实时荧光RT-PCR快速... 目的建立诺如病毒遗传组I型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏的检测方法,为疾病预防控制提供可靠的依据。方法根据GenBank诺如病毒遗传组Ⅰ型代表株保守序列设计特异引物对和TaqMan-MGB探针,建立一步法实时荧光RT-PCR快速检测反应体系,优化反应条件,评价反应体系的灵敏度、特异性、重复性,并与常规RT-PCR比较。结果诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR检测时限短,仅1h就出结果,与轮状病毒、腺病毒、星状病毒、甲肝病毒、诺如病毒遗传组Ⅱ型无交叉反应,最低检出下限为100拷贝/反应,比常规RT-PCR灵敏100倍,5份浓度不同的诺如病毒遗传组Ⅰ型标本重复检测5次,平均Ct值变异系数范围为0.39%~1.02%。结论诺如病毒遗传组Ⅰ型TaqMan-MGB探针实时荧光RT-PCR快速、特异、灵敏、重复性好,可应用于突发公共卫生应急检测和诺如病毒遗传组Ⅰ型监测,提高快速检测能力。 展开更多
关键词 人类杯状病毒 诺如病毒 实时荧光PCR 逆转录PCR
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实时RT-PCR检测人端粒酶逆转录酶mRNA用于乳腺癌鉴别诊断及与c-Myc基因的相关性 被引量:3
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作者 唐峰 陈忠清 +5 位作者 包芸 朱腾芳 王虹 朱虹光 许祖德 胡锡琪 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期727-731,共5页
目的探讨定量检测人端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA在乳腺癌鉴别诊断中的价值,并观察原癌基因c-Myc与hTERT mRNA表达的关系。方法收集癌旁正常乳腺组织、乳腺普通型导管增生、不典型导管增生、导管原位癌、浸润性导管癌病例,采用实时荧光定... 目的探讨定量检测人端粒酶逆转录酶(hTERT)mRNA在乳腺癌鉴别诊断中的价值,并观察原癌基因c-Myc与hTERT mRNA表达的关系。方法收集癌旁正常乳腺组织、乳腺普通型导管增生、不典型导管增生、导管原位癌、浸润性导管癌病例,采用实时荧光定量RT-PCR技术(Real-ti me RT-PCR)定量检测hTERT和c-Myc基因的转录水平。结果以NhTERT=10为临界值,所有正常组织和良性病变NhTERT值均小于临界值,而hTERT基因转录升高的导管原位癌及浸润性导管癌其NhTERT值均大于此临界值。显示hTERT和c-Myc基因转录水平呈正相关(γ=0.7395,P<0.01)。结论实时荧光定量PCR技术检测hTERT基因表达具有高敏感性和特异性,能为常规病理学诊断提供客观的参考指标,从而提高乳腺不典型导管增生与导管原位癌鉴别诊断的准确性。原癌基因c-Myc转录水平上调可能与乳腺癌hTERT基因转录激活有关。 展开更多
关键词 乳腺癌 端粒酶 实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应 人端粒酶逆转录酶 C-MYC原癌基因
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大鼠TGF-β1 mRNA表达水平的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法的建立 被引量:12
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作者 陈英剑 胡成进 赵苗青 《中国实验诊断学》 2005年第2期279-281,共3页
目的 建立检测大鼠TGF- β1mRNA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT- PCR方法。方法 摸索SYBRGreenⅠ工作液的配制方法,筛选PCR反应液,优化反应中引物和MgCl2 的浓度,以actin为对照,建立大鼠TGF -β1mR NA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量... 目的 建立检测大鼠TGF- β1mRNA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT- PCR方法。方法 摸索SYBRGreenⅠ工作液的配制方法,筛选PCR反应液,优化反应中引物和MgCl2 的浓度,以actin为对照,建立大鼠TGF -β1mR NA表达水平的SYBRGreenⅠ荧光定量RT PCR方法并检测大鼠肾皮质TGF -β1mRNA表达水平。结果 SYBRGreenⅠ工作液,4 0倍水溶液稳定性好,最佳反应稀释度为1∶1 0 0 0 0。大鼠TGF β1表达水平的SYBRGreen荧光定量PCR方法,TGF- β1和actin的最佳MgCl2 反应浓度分别为2 5mM和3 5mM ,引物浓度分别为0 . 8μM和0. 5μM ,特异扩增产物的熔解温度分别为88 1和88 .6℃,因此选择在85℃时收集荧光信号。正常大鼠TGF- β1的Ct值在2 9 0 3,actin的Ct值在2 4 .86 ,扩增效率分别为0 . 995和1 . 0 8。结论 通过优化反应条件和特异性分析,成功地建立了特异、敏感的大鼠TGF- β1mRNASYBRGreenⅠ荧光定量RT PCR。SYBRGreenⅠ荧光定量PCR快速、敏感、特异、经济,可以满足临床和科研的需要。 展开更多
关键词 TGF-β1 mRNA SYBR Green 荧光定量rt-pcr
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细胞培养结合实时荧光RT-PCR法快速检测甲肝病毒滴度的研究 被引量:3
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作者 徐晓霞 夏青娟 +5 位作者 徐艳玲 岳立广 惠琦 褚东林 曹玉婷 刘令九 《微生物学免疫学进展》 2014年第4期7-10,共4页
目的建立一种细胞培养与实时荧光RT-PCR相结合的快速检测甲肝病毒滴度的方法。方法根据甲肝病毒(HAV)L-A-1株5'端基因组序列,设计了2条基因特异性引物及一条探针,建立实时荧光RT-PCR法,结合细胞培养检测甲肝病毒滴度,并与ELISA检测... 目的建立一种细胞培养与实时荧光RT-PCR相结合的快速检测甲肝病毒滴度的方法。方法根据甲肝病毒(HAV)L-A-1株5'端基因组序列,设计了2条基因特异性引物及一条探针,建立实时荧光RT-PCR法,结合细胞培养检测甲肝病毒滴度,并与ELISA检测法进行比较。结果实验中建立的方法能特异检测甲肝病毒,细胞培养8d检测病毒滴度为lg107.0CCID50/mL。同一样本重复检测3次,批内样本Ct值的变异系数最大为0.89%,批间样本Ct值变异系数最大为1.66%。建立的细胞培养结合实时荧光RT-PCR法(细胞培养8 d)与细胞培养ELISA法(细胞培养28 d)检测甲肝病毒滴度结果差异无统计学意义(P>0.05)。结论该方法具有快速、灵敏、特异等优点,应用于疫苗常规检测有良好前景。 展开更多
关键词 甲型肝炎病毒 细胞培养 实时荧光rt-pcr ELISA
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用裂解法获得有核细胞进行实时定量RT-PCR的可行性研究 被引量:1
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作者 李玲娣 秦亚溱 +1 位作者 李金兰 刘艳荣 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2011年第2期477-479,共3页
本研究比较裂解法获得的有核细胞与分层法获得的单个核细胞进行实时定量RT-PCR(RQ-PCR)的结果之间是否存在差异性。14例白血病患者(AML-M2 7例,APL 1例,AML M4Eo 1例,AML M4 1例,AML M6 1例,CML 3例)的骨髓标本,分别分成两等份,并分别... 本研究比较裂解法获得的有核细胞与分层法获得的单个核细胞进行实时定量RT-PCR(RQ-PCR)的结果之间是否存在差异性。14例白血病患者(AML-M2 7例,APL 1例,AML M4Eo 1例,AML M4 1例,AML M6 1例,CML 3例)的骨髓标本,分别分成两等份,并分别采用分层法和裂解法获得细胞提取RNA进行实时定量RT-PCR,均检测ABL内参基因,并分别检测3份BCR-ABL(P210)、6份AML-ETO、1份CBFβ-MHY11、5份WT1及6份PRAME mRNA水平。结果显示:①28份样本ABL的拷贝数均>3×104,14对标本之间的内参基因ABL拷贝数没有显著性差异(p>0.05),因此两种方法均能保证RQ-PCR足够的敏感性。②14对标本检测的各目的基因mRNA水平亦没有显著性差异(p>0.05),说明两种方法最终得到的mRNA表达水平基本一致,对RQ-PCR结果没有影响。结论:采用裂解法获得有核细胞提取RNA是一种可行的方法,适用于同时提取大量标本RNA并进行RQ-PCR测定白血病特异基因的临床常规检测中。 展开更多
关键词 裂解法 分层法 实时定量rt-pcr
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实时荧光定量RT-PCR法检测TNF-α mRNA基因表达 被引量:3
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作者 陈晓 王宇学 《现代检验医学杂志》 CAS 2006年第4期13-15,共3页
目的建立实时荧光定量反转录聚合酶链反应(reverse transcription po lym erase cha in reaction,RT-PCR)法检测TNF-α基因mRNA表达。方法用T-A克隆技术构建含TNF基因的载体作为标准模板,采用荧光T aqm an方法及探针标记技术,建立实时... 目的建立实时荧光定量反转录聚合酶链反应(reverse transcription po lym erase cha in reaction,RT-PCR)法检测TNF-α基因mRNA表达。方法用T-A克隆技术构建含TNF基因的载体作为标准模板,采用荧光T aqm an方法及探针标记技术,建立实时荧光定量RT-PCR方法,制备标准曲线,检测肿瘤患者与正常人外周血单个核细胞的TNF-αmRNA表达水平变化,并与半定量RT-PCR检测结果进行比较。结果实时荧光定量RT-PCR检测肿瘤患者外周血单个核细胞TNF-αmRNA表达明显高于正常人,且半定量RT-PCR结果显示TNF-α出现类似的变化趋势。结论所建立的实时荧光定量RT-PCR用于检测TNF-αmRNA表达,结果用拷贝数表示,比半定量RT-PCR更灵敏、准确。 展开更多
关键词 实时荧光定量 反转录聚合酶链反应 TNF—α基因
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实时荧光定量RT-PCR检测肝细胞肝癌中B-myb的表达及其临床意义 被引量:1
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作者 吴华 曹骥 +7 位作者 杨春 李丽萍 欧超 潘南海 段小娴 李瑗 苏建家 岳惠芬 《广西医学》 CAS 2007年第11期1663-1666,共4页
目的建立B-myb mRNA表达量检测的实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测肝细胞肝癌(HCC)中B-myb的表达并分析其临床意义。方法用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测70例HCC患者癌组织、癌旁肝组织及18例正常肝组织中B-myb mRNA的表... 目的建立B-myb mRNA表达量检测的实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)系统,检测肝细胞肝癌(HCC)中B-myb的表达并分析其临床意义。方法用实时荧光定量聚合酶链反应技术检测70例HCC患者癌组织、癌旁肝组织及18例正常肝组织中B-myb mRNA的表达情况。结果B-myb mRNA在肝癌组织(0.0375±0.0168)及癌旁肝组织(0.0353±0.0128)中的表达水平明显高于在正常肝组织(0.0265±0.0099)中的表达水平(P<0.05),而在肝癌组织及癌旁肝组织中的表达水平差异无统计学意义(P>0.05)。B-myb在人肝癌组织中的表达与临床分期、肝外转移及术后复发明显有关,而与门静脉癌栓、肿瘤个数、肿瘤直径、血清AFP水平及分化程度无明显关系。结论该方法克服了传统PCR只能定性检测而不能定量检测的缺点,为研究B-myb在HCC中的表达提供了定量方法。B-myb可能与肝癌的发生、发展有关。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 B-MYB 实时荧光定量聚合酶链反应
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实时荧光定量RT-PCR与ELISA检测孕妇血清风疹病毒的比较分析 被引量:2
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作者 赵立红 《泰山医学院学报》 CAS 2011年第5期358-360,共3页
目的应用TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术定量检测孕妇血清标本中风疹病毒RNA,并与ELISA法比较其敏感度与特异度,为孕妇早期风疹病毒检测提供迅速准确的方法。方法收集126例已确诊风疹病毒阳性孕妇血清标本与107例女性健康查体者血清标本... 目的应用TaqMan实时荧光定量RT-PCR技术定量检测孕妇血清标本中风疹病毒RNA,并与ELISA法比较其敏感度与特异度,为孕妇早期风疹病毒检测提供迅速准确的方法。方法收集126例已确诊风疹病毒阳性孕妇血清标本与107例女性健康查体者血清标本,同时进行实时荧光定量RT-PCR核酸检测与风疹病毒ELISA法IgM抗体检测,比较两种方法的敏感度与特异度。结果以细胞培养法为金标准,实时荧光定量RT-PCR法敏感度为92.9%,特异度为98.1%。ELISA IgM抗体法的敏感度和特异度分别为97.6%,86.9%。两种方法的敏感度无显著性差异(p>0.05),实时荧光定量RT-PCR法的特异度明显高于ELISA IgM抗体法(p<0.01)。结论实时荧光定量RT-PCR简便快捷、敏感性高、特异性高、定量准确,在临床风疹病毒基因检测中具有很大的应用潜力。 展开更多
关键词 风疹病毒 核酸 逆转录-聚合酶链反应 荧光定量聚合酶链反应 酶联免疫吸附测定 免疫球蛋白M
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