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双标准曲线相对定量PCR试验原理与方法 被引量:66
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作者 徐丽华 刘春雷 +4 位作者 常玉梅 梁利群 刘金亮 高国强 韩启霞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期70-75,共6页
实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁... 实时荧光定量PCR(FQ-PCR)是一种准确有效的核酸定量分析技术,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点,并随新定量PCR仪及新操作方法的发展而得到广泛应用,但是,定量PCR的高敏感性特点使得实验操作严格而繁琐。阐述了一种改进的相对定量方法——双标准曲线法的试验原理和特点,描述了定量PCR体系的优化方式,探讨了试验误差分析方法及试验操作技巧,并就试验数据的处理方法进行讨论。试验证明,双标准曲线法是一种经济、简单而准确的定量方法。 展开更多
关键词 双标准曲线法 相对定量pcr 荧光扩增曲线 试验误差分析 归一化值
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值评估 被引量:7
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作者 包晶晶 宋怡蒙 +4 位作者 贺文从 刘春法 刘东鑫 赵雁林 高飞 《内蒙古民族大学学报(自然科学版)》 2020年第2期147-153,共7页
目的:分析评价荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药耐药性的临床应用价值.方法:收集2013年黑龙江省耐药监测结核分枝杆菌临床分离株215例,运用荧光PCR熔解曲线法检测其对异烟肼、利福平、氟... 目的:分析评价荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药耐药性的临床应用价值.方法:收集2013年黑龙江省耐药监测结核分枝杆菌临床分离株215例,运用荧光PCR熔解曲线法检测其对异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药物的耐药性,以微孔板药敏试验结果为金标准,评估熔解曲线快速检测耐药的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率.结果:荧光PCR熔解曲线法检测利福平的灵敏度90.9%(20/22)、特异度95.85%(185/193)、阳性预测值71.42%(20/28)、阴性预测值98.93(185/187)、符合率95.34%(205/215);检测异烟肼的灵敏度为83.33%(35/42)、特异度91.9%(159/173)、阳性预测值71.42%(35/49)、阴性预测值95.78%(159/166)、符合率90.23%(194/215);检测氧氟沙星的灵敏度为90%(9/10)、特异度100%(205/205)、阳性预测值100%(9/9)、阴性预测值99.51%(205/206)、符合率99.53%(214/215);检测莫西沙星的灵敏度为88.88%(8/9)、特异度100%(206/206)、阳性预测值100%(8/8)、阴性预测值99.51%(206/207)、符合率99.51%(214/215);检测阿米卡星的灵敏度100%(3/3)、特异度100%(212/212)、阳性预测值100%(3/3)、阴性预测值100%(212/212)、符合率100%(215/215);检测卡那霉素的灵敏度80%(4/5)、特异度100%(210/210)、阳性预测值100%(4/4)、阴性预测值99.52%(210/211)、符合率99.53%(214/215).结论:荧光PCR熔解曲线技术检测结核分枝杆菌对异烟肼、利福平、氟喹诺酮类、注射类二线药的耐药性有较好的灵敏性、特异性,检测时间短,可用于辅助耐药结核分枝杆菌快速诊断筛查. 展开更多
关键词 分枝杆菌 荧光pcr熔解曲线法 耐药突变 异烟肼 利福平 氟喹诺酮类 注射类二线药
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荧光PCR熔解曲线法在结核分枝杆菌耐药基因检测中的应用 被引量:2
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作者 李媛媛 苏东栋 《中国实用医药》 2021年第9期210-212,共3页
目的探讨气管镜刷检物实时荧光PCR熔解曲线耐药法检测对复治结核病耐药早期诊断的价值,同时根据支气管刷检深部痰液结核菌耐药检测结果,进一步分析指导可疑耐药结核病治疗,规范临床合理用药,为耐药结核病的诊断及治疗提供科学依据。方... 目的探讨气管镜刷检物实时荧光PCR熔解曲线耐药法检测对复治结核病耐药早期诊断的价值,同时根据支气管刷检深部痰液结核菌耐药检测结果,进一步分析指导可疑耐药结核病治疗,规范临床合理用药,为耐药结核病的诊断及治疗提供科学依据。方法纳入160例结核分枝杆菌(MTB)患者为本研究对象。每例患者采用同一标本进行绝对浓度法和熔解曲线法耐药基因检测,观察熔解曲线法对利福平、异烟肼的检测敏感度、特异度、准确度。结果同一标本应用两种方法检测时,绝对浓度法检出利福平21例耐药,139例敏感;检出异烟肼68例耐药,92例敏感。熔解曲线法检出利福平17例耐药,139例敏感,4例未检出结果;检出异烟肼61例耐药,99例敏感。熔解曲线法对利福平的检测准确度为96.15%、敏感度为87.50%、特异度为98.39%;对异烟腓的检测准确度为95.00%、敏感度为88.57%、特异度为96.80%。两种检验方法对利福平及异烟肼的耐药及敏感率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论荧光PCR熔解曲线法能够快速检测出MTB对药物的耐药基因检测,而且有良好的敏感度和特异度,有效节约时间、安全高效,是临床检验及诊治耐药结核的有效手段。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 结核分枝杆菌 利福平 异烟肼 耐药情况 敏感度 特异性
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多重不对称PCR探针熔解曲线法在一管中检测多个肥胖易感基因方法的建立
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作者 李勇 鲁晶晶 +1 位作者 李炳君 殷佳伟 《江苏预防医学》 CAS 2021年第4期396-399,共4页
目的针对中国人群4个常见的肥胖易感基因位点(FTO基因rs1421085位点、APOA5基因rs662799位点、FABP2基因rs1799883位点、ADRB3基因rs4994位点),建立一种方便、精准、低成本的检测方法。方法结合前期研究中发现的与中国人群肥胖密切相关... 目的针对中国人群4个常见的肥胖易感基因位点(FTO基因rs1421085位点、APOA5基因rs662799位点、FABP2基因rs1799883位点、ADRB3基因rs4994位点),建立一种方便、精准、低成本的检测方法。方法结合前期研究中发现的与中国人群肥胖密切相关的4个基因位点,设计引物对、荧光探针以及对应等位基因的靶序列,通过熔解曲线法,验证荧光探针与对应等位基因的靶序列的工作效果,确认不同基因型的熔解温度。采用PCR-Sanger测序法为金标准,对收集的人唾液样本进行检测,选取12个基因型的样本,开发多重不对称PCR荧光探针熔解曲线法进行检测。随后,使用多重不对称PCR探针熔解曲线法与PCR-Sanger测序法分别对200例志愿者的唾液样本进行基因分型检测,比较两种方法的结果与优缺点。结果多重不对称PCR探针熔解曲线法可以在一管中同时对4个常见的肥胖易感基因位点进行检测,准确度与PCR-Sanger测序法相同,且与PCR-Sanger测序法需有扩增、电泳、纯化、s测序的复杂步骤相比,可在一管中一次完成检测,操作更为便捷,且成本更加节省。结论本研究建立了一种针对4个常见肥胖易感基因位点的方便、精准、低成本的基因分型方法,为人群肥胖易感基因的批量筛查提供了一种有效的检测手段。 展开更多
关键词 多重不对称pcr探针熔解曲线法 肥胖易感基因 一管法
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微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法在耳聋基因筛查中的比较分析
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作者 曹国梅 张陆岩 +1 位作者 黄春红 朱子成 《医学理论与实践》 2022年第12期2008-2011,共4页
目的:观察微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法应用于新生儿耳聋基因筛查的效果,分析两种新生儿耳聋基因筛查方法的临床诊断价值。方法:选取20例干血斑样本(结果已知),分别使用微阵列芯片法、荧光PCR熔解曲线法进行筛查,验证两种筛查方法... 目的:观察微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法应用于新生儿耳聋基因筛查的效果,分析两种新生儿耳聋基因筛查方法的临床诊断价值。方法:选取20例干血斑样本(结果已知),分别使用微阵列芯片法、荧光PCR熔解曲线法进行筛查,验证两种筛查方法的准确性、重复性以及检出限。结果:微阵列芯片法的准确率为100%,重复检测结果与临床已知结果相吻合,核酸浓度稀释到检测下限后的检测结果与已知结果的符合率为100%,满足临床基因筛查的需要。荧光PCR熔解曲线法的准确性验证结果为100%,重复性验证显示各通道Tm值的变异系数(CV)均≤5%,检出限样本的检测结果与已知结果吻合,符合临床筛查要求。结论:在新生儿耳聋基因筛查中,微阵列芯片法与荧光PCR熔解曲线法均能够满足临床筛查的需要,临床应用时可根据实际条件合理选取检测方法。 展开更多
关键词 耳聋 基因筛查 荧光pcr熔解曲线法 微阵列芯片法
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四种不同的检测技术对活动性肺结核诊断的效果评估
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作者 曹烜标 王燕茹 +1 位作者 洪丽娟 黄莉苹 《检验医学与临床》 CAS 2024年第S02期61-65,共5页
目的研究BD960结核液体培养法、实时荧光定量PCR法(溶解曲线法)、抗酸染色、结核感染T细胞检测(T-SPOT.TB)对活动性肺结核患者诊断的效果评价。方法分析该院2021年4月-2022年4月住院及门诊104例肺结核患者以及50例随机对照,按照痰涂片... 目的研究BD960结核液体培养法、实时荧光定量PCR法(溶解曲线法)、抗酸染色、结核感染T细胞检测(T-SPOT.TB)对活动性肺结核患者诊断的效果评价。方法分析该院2021年4月-2022年4月住院及门诊104例肺结核患者以及50例随机对照,按照痰涂片找抗酸菌的结果将研究对象分为痰阳组和痰阴组,以临床最终诊断为标准,分析其MGIT960结核液体培养系统、实时荧光PCR(溶解曲线法)、抗酸染色、结核感染T细胞检测(T-SPOT.TB)对活动性肺结核诊断的效果评估。结果结核液体培养法对活动性结核的诊断效果最好,其灵敏度、特异度、准确度分别99.04%,100%,99.35%。痰涂片阳性组中,结核液体培养对活动性结核的诊断效果最好,其灵敏度、特异度均为100%。痰涂片阴性组中结核液体培养对活动性结核的诊断效果最好,其灵敏度、特异度分别为98.04%、100%。在活动性肺结核中预测抗酸染色阳性结果的ESAT6抗原、CFP10抗原最佳阈值为28.5、36.5,其灵敏度为79.6%、70.4%,特异度为80%、90%。结论MGIT960结核液体培养法对活动性肺结核的辅助诊断效果最好,在活动性肺结核患者中T-SPOT.TB结果对初筛抗酸染色阳性结果具有一定的预测价值。 展开更多
关键词 活动性肺结核 MGIT960结核液体培养 外周血结核感染T细胞检测 实时荧光pcr溶解曲线法
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不同检测方法在骨结核诊断中的应用效果比较 被引量:2
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作者 孙秀华 李莹 +1 位作者 孙娇 孙炳奇 《中国民康医学》 2020年第2期90-92,95,共4页
目的:比较利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF,简称"Xpert")、荧光PCR熔解曲线法及液体培养方法在骨结核诊断中的应用效果。方法:收集2017年1月至2018年12月期间166例疑似骨结核患者的脓液标本,分别进行... 目的:比较利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(Xpert MTB/RIF,简称"Xpert")、荧光PCR熔解曲线法及液体培养方法在骨结核诊断中的应用效果。方法:收集2017年1月至2018年12月期间166例疑似骨结核患者的脓液标本,分别进行分枝杆菌液体培养(MGIT960培养)、Xpert与荧光PCR熔解曲线法检测。以临床综合诊断为标准,对3种检测方法的敏感度和特异度进行比较分析;以液体药敏为金标准,评价Xpert和荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌利福平耐药的敏感度和特异度。结果:Xpert检测的敏感度分别高于荧光PCR熔解曲线法和MGIT960培养法,荧光PCR熔解曲线法的敏感度高于MGIT960培养法,差异有统计学意义(P<0.05);以MGIT960培养为标准,Xpert的敏感度高于荧光PCR熔解曲线法,差异有统计学意义(P<0.05);Xpert与荧光PCR熔解曲线法的特异度比较,差异无统计学意义(P>0.05);以液体药敏为金标准,Xpert和荧光PCR熔解曲线法检测利福平的敏感度和特异度均为80.0%和100%,两种方法与金标准进行一致性检验Kappa值均为0.872。结论:Xpert和荧光PCR熔解曲线法在骨结核诊断中的敏感性和特异度均优于液体培养方法,两种方法各有千秋,可根据实际情况选择。 展开更多
关键词 骨结核 Xpert MTB/RIF 荧光pcr熔解曲线法 液体培养
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上海地区幽门螺杆菌对克拉霉素耐药的相关基因检测 被引量:11
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作者 黄声雷 郭玮 +2 位作者 胡必杰 周春妹 潘柏申 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期548-552,共5页
目的通过荧光PCR熔解曲线方法直接检测临床样本中幽门螺杆菌(Hp)对克拉霉素耐药基因,了解上海地区Hp耐克拉霉素基因的分布特征,并为临床快速检测Hp对克拉霉素耐药性提供一种有效的方案。方法收集2017年9-12月复旦大学附属中山医院消化... 目的通过荧光PCR熔解曲线方法直接检测临床样本中幽门螺杆菌(Hp)对克拉霉素耐药基因,了解上海地区Hp耐克拉霉素基因的分布特征,并为临床快速检测Hp对克拉霉素耐药性提供一种有效的方案。方法收集2017年9-12月复旦大学附属中山医院消化科就诊并接受胃镜检查的快速尿素酶试验Hp阳性患者的胃黏膜组织标本80份,使用荧光PCR熔解曲线法直接检测黏膜样本中Hp种特异性23SrRNA的区域并对扩增的核酸进行荧光标记,通过检测荧光变化绘制其熔解曲线,以确定Hp的23SrRNA突变情况;采用DNA测序技术直接检测标本中Hp克拉霉素23SrRNA耐药基因突变位点。并对两种方法的结果进行Kappa检验统计学比较。结果80份胃黏膜组织标本使用荧光PCR熔解曲线法共检测69份Hp阳性,11份Hp阴性,阳性率为86.2%。在69份Hp阳性标本中24份标本存在23SrRNA第2142或2143位点的变异,突变率34.8%。使用DNA测序法共检测出64份Hp阳性,阳性率为80.0%。其中23例患者的标本检测到23SrDNA耐药基因的突变,突变率35.9%。两种方法检测Hp耐药基因突变的阳性符合率、阴性符合率和总符合率分别为87.0%、95.1%和92.2%,Kappa系数为0.829,两者一致性较好。结论上海地区克拉霉素耐药Hp菌株基因型以23SrRNA基因的A2143G突变占主导。荧光PCR熔解曲线法可直接检测胃黏膜活检组织中Hp及其23SrRNA突变基因,该方法结果准确可靠。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 克拉霉素耐药 荧光pcr熔解曲线法 DNA测序法 23SrRNA突变
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2种结核分枝杆菌耐药基因突变检测方法诊断利福平耐药结核病的评估研究 被引量:4
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作者 薛建昌 梁冰锋 +3 位作者 吴海峰 郑浩 孙志平 任哲 《遵义医科大学学报》 2020年第2期249-253,258,共6页
目的评价荧光定量PCR探针熔解曲线法(简称Melt PCR法)和Gene Xpert MTB/RIF技术(简称Xpert法),用于临床涂阳标本诊断利福平耐药结核病(Rifampicin resistant tuberculosis,RR-TB)的检测效能及应用价值。方法随机收集2016年2月至2018年6... 目的评价荧光定量PCR探针熔解曲线法(简称Melt PCR法)和Gene Xpert MTB/RIF技术(简称Xpert法),用于临床涂阳标本诊断利福平耐药结核病(Rifampicin resistant tuberculosis,RR-TB)的检测效能及应用价值。方法随机收集2016年2月至2018年6月在河北省胸科医院就诊肺结核患者结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)涂阳标本278例,应用传统的结核菌比例法药敏试验(对照检测方法)、Melt PCR法和Xpert法同时进行RR-TB情况的检测,分析Melt PCR法和Xpert法检测RR-TB的效能。结果3种方法同时对278例MTB阳性标本的利福平耐药进行检测,耐药检出结果差异无统计学意义(P>0.05)。与传统药敏试验结果相比,Melt PCR法和Xpert法的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、准确度和约登指数分别为97.96%、98.25%、92.31%、99.56%、98.20%、96.21%和95.92%、97.38%、88.68%、99.11%、97.12%、93.30%,Kappa值分别为0.940和0.904(P<0.05),均为高度一致。3种方法在痰液中的利福平耐药均显著高于支气管肺泡灌洗液,且差异具有统计学意义(P<0.05)。不同带菌量样本的利福平耐药检出结果差异无统计学意义(P>0.05)。结论Melt PCR法和Xpert法用于临床涂阳标本中检测RR-TB具有相似的高灵敏度和特异度等检测性能,可结合实际需求在耐多药结核病防治中推广和应用。 展开更多
关键词 比例法药敏试验 荧光定量pcr探针熔解曲线法 Gene Xpert MTB/RIF技术 肺结核 利福平 耐药
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中国西南三区216例儿童葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症基因型分布和临床特征分析 被引量:18
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作者 彭瑛 詹小亭 +2 位作者 邓正华 邓莹莹 温先勇 《广东医学》 CAS 2019年第13期1856-1860,共5页
目的了解葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症患者基因突变型在四川(川)、云南(滇)、贵州(黔)三地区的分布情况及临床特征,为该病的临床诊治提供实验室依据。方法对来自川滇黔疑似G6PD缺乏症的汉族患者450例(男342例,女108例),采用多色探... 目的了解葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症患者基因突变型在四川(川)、云南(滇)、贵州(黔)三地区的分布情况及临床特征,为该病的临床诊治提供实验室依据。方法对来自川滇黔疑似G6PD缺乏症的汉族患者450例(男342例,女108例),采用多色探针荧光PCR熔解曲线法进行G6PD基因型别检测,并分析基因突变类型与临床表型之间的关系。结果450例可疑样本中,检出215例(男172例,女43例)单基因突变和1例含1388G>A和1004C>A复合型突变。11种单基因突变型所占比例分别为:1388G>A型29.78%;1376G>T型24.65%;1024C>T型22.33%;95A>G型12.09%;871G>A型4.05%;392G>T型2.33%;517T>C型1.39%;487G>T型0.93%;1004C>A型0.93%;1387C>T型0.47%;1360C>T型0.47%。川、滇和黔三地优势基因均为1388G>A、1376G>T和1024C>T型。男女患儿前两位突变位点均为1388G>A(26.7%,41.9%)和1376G>T(26.2%,18.6%),1024C>T(25.0%)居男性患儿第3位,女性第3位则为95A>G(14.0%)。<1岁的患儿以1024C>T(28.0%)、1388G>A(25.6%)和1376G>T(25.0%)型为主,>1岁的患儿以1388G>A(43.1%)、1376G>T(23.5%)和95A>G(15.7%)为主。男性患儿酶活性明显低于女性患儿,各基因突变型在同一性别之间酶活性差异无统计学意义(F=0.680、1.629,P=0.666、0.177)。肝肿大、贫血、黄疸和尿色改变为主要的临床表现,不同基因型与临床表现之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论川、滇、黔三地区汉族人群中G6PD缺乏症患儿基因突变型以1388G>A、1376G>T和1024C>T为优势突变基因,呈多样化分布。突变型可能与性别和首次发病年龄有关,各突变型之间没有明显的临床表现和酶活性差异。 展开更多
关键词 G6PD缺乏症 基因突变 酶活性 多色探针荧光pcr熔解曲线法
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌对氟喹诺酮类耐药性的临床研究
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作者 秦娅莉 陈静 +4 位作者 李军 王明栋 欧维正 邱继瑶 彭燕清 《重庆医学》 CAS 2024年第16期2414-2420,共7页
目的评估荧光PCR熔解曲线法早期诊断结核病患者对氟喹诺酮类(FQs)耐药性的效能,分析FQs耐药情况及特征,为利福平耐药/耐多药结核病(RR/MDR-TB)、准广泛耐药结核病(pre-XDR-TB)规范诊断和选择合理治疗方案提供依据。方法收集2021年1月至2... 目的评估荧光PCR熔解曲线法早期诊断结核病患者对氟喹诺酮类(FQs)耐药性的效能,分析FQs耐药情况及特征,为利福平耐药/耐多药结核病(RR/MDR-TB)、准广泛耐药结核病(pre-XDR-TB)规范诊断和选择合理治疗方案提供依据。方法收集2021年1月至2022年8月贵阳市公共卫生救治中心1094例门诊和住院患者涂片阳性标本,行罗氏固体培养法、菌种鉴定,最终589例结核病患者均进行表型药敏试验与荧光PCR熔解曲线法,对利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、FQs耐药性进行检测;以表型药敏试验为标准,评估荧光PCR熔解曲线法的诊断效能,根据表型药敏试验结果分析患者FQs耐药情况和临床特征的关系。结果荧光PCR熔解曲线法检测结核病患者对FQs耐药性的灵敏度、特异度、符合率、Kappa值分别为91.30%、97.69%、96.94%、0.86,曲线下面积(AUC)为0.945,高于RFP、INH、EMB的0.924、0.923、0.850。RR/MDR-TB患者中FQs耐药率为22.80%,荧光PCR熔解曲线法检测患者对FQs耐药性的Kappa值为0.83,一致性较好,AUC为0.936。荧光PCR熔解曲线法检测不同细菌载量结核病患者对FQs耐药性的灵敏度、特异度、符合率差异均无统计学意义(P>0.05)。治疗类型、抗结核史、肺部空洞、MDR-TB与FQs耐药有关(P<0.05)。结论荧光PCR熔解曲线法对结核病患者FQs耐药性有较好的诊断效能。 展开更多
关键词 耐多药结核病 耐药性 荧光pcr熔解曲线法 氟喹诺酮类 准广泛耐药结核病
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鲁东南地区317681例新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症筛查及基因型调查 被引量:3
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作者 尹文东 夏飞燕 《系统医学》 2021年第14期105-107,共3页
目的调查鲁东南地区新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的患病率及基因突变类型。方法荧光分析法检测2016年5月—2017年12月在鲁东南地区出生的317681例新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性,对检测阳性标本,用多色探针荧光PCR熔解曲线法进行基... 目的调查鲁东南地区新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的患病率及基因突变类型。方法荧光分析法检测2016年5月—2017年12月在鲁东南地区出生的317681例新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性,对检测阳性标本,用多色探针荧光PCR熔解曲线法进行基因分型。结果荧光分析法检测出109例阳性患儿,患病率为0.343‰。男性患儿107例,患病率为0.337‰,女性患儿2例,患病率为0.063‰,男患儿的患病率显著高于女患儿。调查并获得患儿母亲的籍贯和民族:汉族母亲97例;壮族母亲4例;黎族和傣族母亲各2例;景颇族母亲1例;另有3例患儿母亲民族不明。山东籍母亲60例;广西籍母亲12例;云南籍母亲10例;广东籍母亲6例;缅甸、贵州和海南籍母亲各3例;江苏、河南、越南和四川籍母亲各2例;柬埔寨、泰国和福建籍母亲各1例。荧光PCR熔解曲线法检测出66例患儿的10种基因突变类型,分别是c.1388G>A、c.1376G>T、c.487G>A、c.1024C>T、c.95A>G、c.1360C>T、c.871G>A、c.592C>T、c.392G>T和c.1004C>A,其中1388G>A(25.8%)、c.1376G>T(21.2%)和c.487G>A(13.6%)是主要的突变类型。结论鲁东南地区G6PD缺乏症患病率较低,基因突变类型及比例有其自身特点,有必要建立本地区基因突变数据库。 展开更多
关键词 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症 基因突变 患病率 多色探针荧光pcr熔解曲线法
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Functional Analysis of Dunaliella salina Calmodulin Kinase Gene
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作者 Zhenyu XING Mingfang WANG +3 位作者 Xiangnan GAO Weiwei XU Yuting CONG Xiaojie CHAI 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2020年第2期10-13,20,共5页
[Objectives] This study was conducted to investigate the function of Dunaliella salina calmodulin kinase(CaM K) gene.[Methods] The sense and antisense gene fragments(223 bp) and spacer sequence(129 bp) of D.salina cal... [Objectives] This study was conducted to investigate the function of Dunaliella salina calmodulin kinase(CaM K) gene.[Methods] The sense and antisense gene fragments(223 bp) and spacer sequence(129 bp) of D.salina calmodulin kinase gene were cloned and inserted into the downstream part of the35 S promoter of the eukaryotic expression vector pM DCMGN-Cat.The siRNA expression system of CaM K gene was successfully constructed.The p CaM K-RNAi expression vector was transformed into D.salina cells by the LiA c/PEG-mediated method,giving transgenic D.salina.The expression of CaM K gene was then analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR.[Results]The expression of CaM K gene in the transgenic D.salina was significantly reduced,by 70% compared with the control group,suggesting that the expression of CaM K gene was significantly inhibited.The examination of the growth status of D.salina showed that D.salina cell division and proliferation were also affected.It is proved that CaM K gene has a positive regulation effect on the division and proliferation of D.salina cells.[Conclusions] The study provides important information for further elucidating the function and action mechanism of D.salina calmodulin kinase gene. 展开更多
关键词 DUNALIELLA SALINA CAMK RNAI LiAc/PEG-mediated method real-time fluorescence quantitative pcr
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PRNP基因SYBR GreenⅠ双标准曲线法荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:5
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作者 艾文娜 吴润 刁小龙 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1240-1245,共6页
为建立双标准曲线法荧光定量PCR检测方法,以PRNP为目标基因、β-actin为内参基因进行扩增,将扩增产物连入pMD18-T载体,获得阳性标准品进行定量扩增。并将MDV标准毒株MD5、疫苗株CV1988和1株野毒株接种CEF,收集不同日龄病变细胞以提取RNA... 为建立双标准曲线法荧光定量PCR检测方法,以PRNP为目标基因、β-actin为内参基因进行扩增,将扩增产物连入pMD18-T载体,获得阳性标准品进行定量扩增。并将MDV标准毒株MD5、疫苗株CV1988和1株野毒株接种CEF,收集不同日龄病变细胞以提取RNA,用以上方法进行扩增。把结果代入标准曲线公式进行计算,分析PRNP基因表达与MDV致瘤的相关性。结果显示,该方法能检测出的PRNP基因和β-actin基因的最低拷贝数为1×103,特异性和重复性较好。相对于对照组,接种3株毒株的PRNP的表达量都有明显的差异。表明MDV的感染对PRNP的表达量确实存在影响。据此推测PrPC对MDV的感染可能发挥着重要的生理功能。 展开更多
关键词 PRNP基因 双标准曲线法 实时荧光定量pcr
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荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌耐药性价值及耐药特征分析 被引量:2
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作者 徐丽霞 雷永良 +3 位作者 吴燕飞 王炜 赖聪娟 许河南 《中国卫生检验杂志》 CAS 2022年第11期1318-1321,共4页
目的 评价荧光PCR熔解曲线法(熔解曲线法)对结核分枝杆菌(MTB)耐药性检测价值。方法 采用熔解曲线法与传统液体药敏法同时检测156例临床分离培养MTB对抗结核药物利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)和氟喹诺酮类药物... 目的 评价荧光PCR熔解曲线法(熔解曲线法)对结核分枝杆菌(MTB)耐药性检测价值。方法 采用熔解曲线法与传统液体药敏法同时检测156例临床分离培养MTB对抗结核药物利福平(RFP)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)、链霉素(SM)和氟喹诺酮类药物耐药情况,并对2种检测方案结果进行比较。结果 与液体药敏检测相比,熔解曲线法对5种抗结核药物耐药性检测结果差异无统计学意义(P> 0.05),以液体药敏检测为金标准,熔解曲线法检测RFP、INH、EMB、SM以及氟喹诺酮类药物耐药性的灵敏度分别为100.00%、75.86%、61.54%、75.00%、90.00%,特异度分别为97.10%、95.28%、99.30%、96.21%、100.00%,Kappa值分别为0.885、0.721、0.707、0.724、0.944,表明2种检测方法一致性好。结论 荧光PCR熔解曲线法对抗结核药物RFP、INH、EMB、SM及氟喹诺酮类的耐药性与液体药敏法检测效果一致,灵敏度、特异度均较高,具有较好的临床应用价值。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 结核分枝杆菌 耐药性 突变特征
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高通量荧光PCR组合方法鉴定16种金黄色葡萄球菌肠毒素的方法建立及评估 被引量:3
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作者 左乐 姜尹祥 +4 位作者 石晓路 邱亚群 林一曼 江敏 扈庆华 《疾病监测》 CAS 2018年第9期753-757,共5页
目的建立一种高效、特异的荧光探针熔解曲线方法,用于鉴定16种金黄色葡萄球菌肠毒素。方法根据金黄色葡萄球菌肠毒素SEA~SEQ特异基因序列设计不同杂交连接探针,建立金黄色葡萄球菌肠毒素检测体系,评估其最低检出限、特异度、可重复性... 目的建立一种高效、特异的荧光探针熔解曲线方法,用于鉴定16种金黄色葡萄球菌肠毒素。方法根据金黄色葡萄球菌肠毒素SEA~SEQ特异基因序列设计不同杂交连接探针,建立金黄色葡萄球菌肠毒素检测体系,评估其最低检出限、特异度、可重复性等指标。与普通PCR方法比较,采用荧光探针熔解曲线方法对本实验室的158株食物中毒金黄色葡萄球菌进行检测,评估新方法的灵敏度和特异度。结果荧光探针熔解曲线方法最低检出限为0.80~2.15 ng/μl,特异度为100.0%,无交叉荧光信号产生,变异系数<1%。与普通PCR方法比较,新方法的灵敏度为95.4%,特异度为100.0%,Kappa值为0.88。结论荧光探针熔解曲线技术检测金黄色葡萄球菌肠毒素的方法可覆盖金黄色葡萄球菌16种肠毒素,具有快速、准确、特异性高的特点。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌肠毒素 荧光pcr 荧光探针熔解曲线方法
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Gen-XpertMTB/RIF和荧光PCR熔解曲线法在耐药结核病快速诊断中的意义 被引量:1
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作者 刘莉 张宁 +3 位作者 王科文 姚莎 杨康丽 马纪龙 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2022年第2期161-165,共5页
目的Gen-XpertMTB/RIF和荧光PCR熔解曲线法(MeltPro)在耐药结核病快速诊断中的意义。方法选取2019年1月至12月陕西省结核病防治院收治的TB患者850例,均行表型药敏和Gen-XpertMTB/RIF检测,对Gen-XpertMTB/RIF检测阳性样本中利福平(RFP)... 目的Gen-XpertMTB/RIF和荧光PCR熔解曲线法(MeltPro)在耐药结核病快速诊断中的意义。方法选取2019年1月至12月陕西省结核病防治院收治的TB患者850例,均行表型药敏和Gen-XpertMTB/RIF检测,对Gen-XpertMTB/RIF检测阳性样本中利福平(RFP)耐药患者行MeltPro。以药敏法为金标准,分析Gen-XpertMTB/RIF对TB患者RFP耐药的诊断价值、成本效果比(C/E)和检测时间;分析Gen-XpertMTB/RIF联合MeltPro对耐多药(MDR)和准广泛耐药(Pre-XDR)的诊断价值、C/E和检测时间。结果Gen-XpertMTB/RIF对TB患者RFP耐药的诊断准确率为94.59%(804/850)。Gen-XpertMTB/RIF和药敏法对TB初治和复治患者RFP耐药的诊断一致性均较好。Gen-XpertMTB/RIF联合MeltPro诊断TB患者MDR的准确率为98.71%(839/850),且和药敏法对TB初治和复治患者MDR的诊断一致性均较好。Gen-XpertMTB/RIF诊断RFP耐药的C/E和诊断时间均低于药敏法。Gen-XpertMTB/RIF联合MeltPro诊断MDR、Pre-XDR的C/E高于药敏法,诊断时间低于药敏法。结论Gen-XpertMTB/RIF应用于TB患者RFP耐药检测,Gen-XpertMTB/RIF联合MeltPro应用于TB患者MDR、Pre-XDR检测,与药敏法诊断一致性均较高,且能够明显缩短检测时间,为诊断和治疗耐药肺结核赢得时间,减少耐药结核菌的传播,降低耐药结核病的发生率。 展开更多
关键词 耐药肺结核 荧光pcr溶解曲线法 Gen-XpertMTB/RIF 表型药敏 成本效果比 快速诊断
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两种分子生物学方法检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性的价值
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作者 胡琴琴 陈芳芳 +5 位作者 许坦 肖园园 刘冰雪 陈影影 施旭东 李金龙 《热带医学杂志》 CAS 2024年第8期1089-1093,共5页
目的分析南京市结核分枝杆菌(MTB)的耐药情况,评价荧光PCR熔解曲线法和PCR-线性杂交酶显色法检测结核分枝杆菌对利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药的应用价值。方法回顾性分析2017年1月-2021年3月南京市公共卫生医疗中心荧光PCR熔解曲线法和... 目的分析南京市结核分枝杆菌(MTB)的耐药情况,评价荧光PCR熔解曲线法和PCR-线性杂交酶显色法检测结核分枝杆菌对利福平(RFP)和异烟肼(INH)耐药的应用价值。方法回顾性分析2017年1月-2021年3月南京市公共卫生医疗中心荧光PCR熔解曲线法和PCR-线性杂交酶显色法检测151份结核分枝杆菌临床分离株利福平和异烟肼耐药突变情况,以表型药敏试验结果为标准,评价以上2种分子生物学方法的诊断效能。结果151份结核分枝杆菌临床分离株中,6份为利福平单耐药株,9份为异烟肼单耐药株,43份为耐多药株。以表型药敏试验检测结果为标准,荧光PCR熔解曲线法检测利福平和异烟肼耐药性的敏感度、特异度、符合率以及κ值分别为100.00%和94.23%、96.08%和96.97%、97.35%和96.02%以及0.94和0.91。以表型药敏试验检测结果为标准,PCR-线性杂交酶显色法检测利福平和异烟肼耐药性的敏感度、特异度、符合率以及κ值分别为89.79%和86.54%、96.08%和94.12%、94.04%和93.38%以及0.86和0.85。对荧光PCR熔解曲线法和PCR-线性杂交酶显色法检测利福平和异烟肼耐药性结果进行比较,差异均无统计学意义(χ^(2)=0.182、0.114,P均>0.05)。结论荧光PCR熔解曲线法和PCR-线性杂交酶显色法在检测利福平和异烟肼耐药方面具有同等的诊断效能,与表型药敏试验一致性较好,且弥补了表型药敏试验检测低度耐药菌株突变的局限性,可以用于结核病的早期快速诊断,为临床及时准确进行抗结核治疗提供了依据。 展开更多
关键词 荧光pcr熔解曲线法 pcr-线性杂交酶显色法 结核分枝杆菌 利福平 异烟肼
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葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶及其基因突变的研究 被引量:12
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作者 郭静 田国力 +2 位作者 王燕敏 周卓 纪伟 《中华妇幼临床医学杂志(电子版)》 CAS 2020年第6期672-679,共8页
目的探讨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症新生儿G6PD与其基因突变情况。方法 2017年8月至2019年4月,在上海市儿童医院新生儿筛查中心进行G6PD缺乏症筛查的新生儿为105 766例,初筛G6PD缺乏症呈阳性患儿为217例,选择其中被召回进行G6PD... 目的探讨葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)缺乏症新生儿G6PD与其基因突变情况。方法 2017年8月至2019年4月,在上海市儿童医院新生儿筛查中心进行G6PD缺乏症筛查的新生儿为105 766例,初筛G6PD缺乏症呈阳性患儿为217例,选择其中被召回进行G6PD复筛和(或)基因检测的161例新生儿为研究对象。这161例新生儿均接受G6PD复筛,其中146例接受G6PD基因检测。同时对男性患儿及其母亲、女性患儿及其父母(将男性患儿母亲与女性患儿父母统称为患儿家系成员)进行G6PD活性和基因检测,分析患儿及其家系成员G6PD活性、G6PD基因突变位点地域性分布特点,并分析G6PD活性与不同G6PD基因突变位点的关系。采用Mann-Whitney U检验或Kruskal-Wallis H秩和检验,对不同患儿与其家系成员的G6PD活性,以及不同G6PD基因突变位点患儿及其家系成员的G6PD活性进行比较。本研究研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并与患儿监护人签署临床研究知情同意书。结果 (1)本组联合实验室诊断和(或)基因诊断的结果,最终确诊的G6PD缺乏症新生儿为124例(经G6PD活性确诊为121例,G6PD基因检测确诊为113例,二者同时确诊为110例)。(2)经G6PD活性检测确诊为G6PD缺乏症的121例患儿中,男、女性患儿分别为103、18例。这121例患儿的G6PD活性为0.42 U/g血红蛋白(Hb)(0.35~0.67 U/g Hb),显著低于其家系成员的1.17 U/g Hb(0.91~1.42 U/g Hb),男性患儿G6PD活性为0.40 U/g Hb(0.32~0.53 U/g Hb),显著低于其母亲的1.12 U/g Hb(0.91~1.28 U/g Hb),女性患儿G6PD活性为1.16 U/g Hb(0.92~1.46 U/g Hb),显著低于其父母的1.74 U/g Hb(0.69~2.80 U/g Hb),并且上述差异均有统计学意义(Z=-9.981、-10.832、-2.021,P<0.001、<0.001、=0.043)。(3)本组161例受试儿中,共计146例患儿及其185例家系成员进行G6PD基因检测的结果显示,227例(113例患儿与114例患儿家系成员)携带G6PD基因突变,其中3例为复合型突变,共计检出230个G6PD基因突变位点,前4位为1376G>T、1388G>A、95A>G、1024C>T,占77.8%(179/230)。227例G6PD基因突变携带者的祖籍为福建省、广西壮族自治区、广东省、江西省、四川省及其他地区者分别为43、39、35、34、 30与46例,其前2位G6PD基因突变位点分别为1376G>T与1388G>A,1388G>A与1376G>T,871G>A与1024C>T,1388G>A与871G>A,1024C>T与1376G>T,以及1376G>T与1388G>A。(4)本组前4位G6PD基因突变位点(1376G>T、1388G>A、95A>G、1024C>T)携带者的G6PD活性比较,差异无统计学意义(χ~2=7.642,P=0.061)。结论 G6PD活性检测和G6PD基因检测,对G6PD缺乏症患儿都具有诊断意义。G6PD缺乏症患儿及其家系成员G6PD基因突变位点分布具有地域性特点,其G6PD基因突变位点与G6PD活性无明显相关性,临床不能以该病患儿G6PD基因突变位点推测其G6PD活性。 展开更多
关键词 葡糖磷酸脱氢酶缺乏 新生儿筛查 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症 聚合酶链反应 荧光定量pcr 荧光pcr熔解曲线法 地域性分布 婴儿 新生
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