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Study of real-time LWD data visual interpretation and geo-steering technology 被引量:6
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作者 Shao Cairui Zhang Fuming +4 位作者 Chen Guoxing Ji Jiaqi Hou Qinggong Tang Jianhong Cao Xianjun 《Petroleum Science》 SCIE CAS CSCD 2013年第4期477-485,共9页
LWD(logging while drilling) data has been used to explore complex subtle reservoirs by realtime visual interpretation and geo-steering.The method comprises of computer communication,well log data processing,formatio... LWD(logging while drilling) data has been used to explore complex subtle reservoirs by realtime visual interpretation and geo-steering.The method comprises of computer communication,well log data processing,formation recognition,reservoir modeling and model updating in real time.We studied the key technologies related to real-time LWD data visual interpretation and geo-steering and developed computer software with Chinese intellectual property rights covering the following important aspects: 1) real-time computer communication of well site LWD data;2) visualization of geological model and borehole information;3) real-time interpretation of LWD data;4) real-time geological model updating and geo-steering technology.We use field application examples to demonstrate the feasibility and validity of the proposed technologies. 展开更多
关键词 LWD(logging while drilling) real-time visualIZATION INTERPRETATION geo-steering
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Current trends in three-dimensional visualization and real-time navigation as well as robot-assisted technologies in hepatobiliary surgery 被引量:11
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作者 Yun Wang Di Cao +3 位作者 Si-Lin Chen Yu-Mei Li Yun-Wen Zheng Nobuhiro Ohkohchi 《World Journal of Gastrointestinal Surgery》 SCIE 2021年第9期904-922,共19页
With the continuous development of digital medicine,minimally invasive precision and safety have become the primary development trends in hepatobiliary surgery.Due to the specificity and complexity of hepatobiliary su... With the continuous development of digital medicine,minimally invasive precision and safety have become the primary development trends in hepatobiliary surgery.Due to the specificity and complexity of hepatobiliary surgery,traditional preoperative imaging techniques such as computed tomography and magnetic resonance imaging cannot meet the need for identification of fine anatomical regions.Imaging-based three-dimensional(3D)reconstruction,virtual simulation of surgery and 3D printing optimize the surgical plan through preoperative assessment,improving the controllability and safety of intraoperative operations,and in difficult-to-reach areas of the posterior and superior liver,assistive robots reproduce the surgeon’s natural movements with stable cameras,reducing natural vibrations.Electromagnetic navigation in abdominal surgery solves the problem of conventional surgery still relying on direct visual observation or preoperative image assessment.We summarize and compare these recent trends in digital medical solutions for the future development and refinement of digital medicine in hepatobiliary surgery. 展开更多
关键词 Hepatobiliary surgery Three-dimensional visualization Three-dimensional printing Electromagnetic tracking real-time navigation Robot-assisted surgery
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鸽新城疫病毒可视化LAMP检测方法的建立与应用 被引量:1
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作者 唐艳荣 张小梅 +3 位作者 郭建立 曹院章 张海云 李壹 《中国家禽》 北大核心 2024年第3期120-124,共5页
为建立一种简便、快速,适用于基层检测鸽Ⅰ型副黏病毒的方法,研究针对鸽Ⅰ型副黏病毒全基因组保守序列,设计了1组可检测基因Ⅵ、Ⅶ、ⅩⅩ、ⅩⅪ型分离株的环介导等温扩增(LAMP)引物,通过优化反应条件及体系,建立鸽Ⅰ型副黏病毒可视化LAM... 为建立一种简便、快速,适用于基层检测鸽Ⅰ型副黏病毒的方法,研究针对鸽Ⅰ型副黏病毒全基因组保守序列,设计了1组可检测基因Ⅵ、Ⅶ、ⅩⅩ、ⅩⅪ型分离株的环介导等温扩增(LAMP)引物,通过优化反应条件及体系,建立鸽Ⅰ型副黏病毒可视化LAMP检测方法。结果显示:建立的鸽Ⅰ型副黏病毒可视化LAMP检测方法可检测基因Ⅵ、Ⅶ、ⅩⅩ、ⅩⅪ型鸽新城疫病毒,与H9亚型禽流感病毒、马立克病病毒、禽网状内皮组织增殖病病毒、小鹅瘟病毒以及禽白血病病毒以及新城疫病毒La Sota疫苗株均无交叉反应,最低检测限为10^(1)copies/μL。研究表明所建立的鸽Ⅰ型副黏病毒可视化LAMP检测方法快速、简便,特异性强,灵敏度高,可应用于基层快速检测鸽Ⅰ型副黏病毒。 展开更多
关键词 鸽新城疫 lamp 可视化 检测
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鸡圆圈病毒3型可视化LAMP检测方法的建立及应用
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作者 张民秀 谢芝勋 +6 位作者 张艳芳 谢志勤 谢丽基 李孟 罗思思 曾婷婷 王粲 《河南农业科学》 北大核心 2024年第4期128-136,共9页
建立鸡圆圈病毒3型(GyV3)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速检测鸡GyV3提供一种诊断方法。参考GyV3的VP3基因序列,设计1套LAMP特异性引物,分别通过温度优化、引物浓度优化和反应时间的优化,确定鸡GyV3可视化LAMP诊断方... 建立鸡圆圈病毒3型(GyV3)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速检测鸡GyV3提供一种诊断方法。参考GyV3的VP3基因序列,设计1套LAMP特异性引物,分别通过温度优化、引物浓度优化和反应时间的优化,确定鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的扩增温度、引物浓度和反应时间,通过特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测,验证鸡GyV3可视化LAMP诊断方法的特异性、敏感性、稳定性和可靠性。结果显示,鸡GyV3 LAMP检测方法的反应体系:总体积为20.0μL,包括DNA模板1.0μL,2×Master Mix 10.0μL,内引物GyV3-FIP和GyV3-BIP混合液(工作浓度16.0μmol/L)2.0μL,外引物GyV3-F3和GyV3-B3混合液(工作浓度2.0μmol/L)2.0μL,环引物GyV3-LF和GyV3-LB混合液(工作浓度8.0μmol/L)2.0μL,ddH_(2)O 3μL;鸡GyV3 LAMP检测方法的扩增程序:66℃反应20 min,80℃灭活5 min。鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,最低检测浓度为10^(1)拷贝/μL,组内和组间变异系数小于5%;与常规PCR方法检测临床样品的结果比较,两者结果符合率达100%。建立的鸡GyV3可视化LAMP检测方法能特异性检测GyV3,具有特异性好、敏感性高及污染小等优点,且检测结果可通过肉眼观察进行判断,适用于GyV3的临床快速筛查。 展开更多
关键词 鸡圆圈病毒3型(GyV3) 可视化lamp 特异性引物 诊断方法 敏感性
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Real-Time Grouting Monitoring and Visualization Analysis System for Dam Foundation Curtain Grouting
5
作者 樊贵超 钟登华 +3 位作者 任炳昱 崔博 李晓超 岳攀 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2016年第6期493-501,共9页
A real-time monitoring and 3D visualization analysis system is proposed for dam foundation curtain grouting. Based on the real-time control technology, the optimization method and the set theory, a mathematical model ... A real-time monitoring and 3D visualization analysis system is proposed for dam foundation curtain grouting. Based on the real-time control technology, the optimization method and the set theory, a mathematical model of the system is established. The real-time collection and transmission technology of the grouting data provides a data foundation for the system. The real-time grouting monitoring and dynamic alarming method helps the system control the grouting quality during the grouting process, thus, the abnormalities of grouting, such as jacking and hydraulic uplift, can be effectively controlled. In addition, the 3D grouting visualization analysis technology is proposed to establish the grouting information model(GIM). The GIM provides a platform to visualize and analyze the grouting process and results. The system has been applied to a hydraulic project of China as a case study, and the application results indicate that the real-time grouting monitoring and 3D visualization analysis for the grouting process can help engineers control the grouting quality more efficiently. 展开更多
关键词 dam foundation curtain grouting real-time monitoring dynamic alarming model grouting informationmodel (GIM) 3D visualization analysis
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Real-Time Data and Visualization Monitoring of Computer Numerical Control Machine Tools Based on Hyper Text Markup Language 5
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作者 WU Yan XIAO Lijun +2 位作者 DING Xiaoying WANG Bing ZHANG Jieren 《Journal of Donghua University(English Edition)》 EI CAS 2019年第3期261-266,共6页
In order to ensure the safety,quality and efficiency of computer numerical control(CNC)machine tool processing,a real-time monitoring and visible solution for CNC machine tools based on hyper text markup language(HTML... In order to ensure the safety,quality and efficiency of computer numerical control(CNC)machine tool processing,a real-time monitoring and visible solution for CNC machine tools based on hyper text markup language(HTML)5 is proposed.The characteristics of the real-time monitoring technology of CNC machine tools under the traditional Client/Server(C/S)structure are compared and analyzed,and the technical drawbacks are proposed.Web real-time communication technology and browser drawing technology are deeply studied.A real-time monitoring and visible system for CNC machine tool data is developed based on Metro platform,combining WebSocket real-time communication technology and Canvas drawing technology.The system architecture is given,and the functions and implementation methods of the system are described in detail.The practical application results show that the WebSocket real-time communication technology can effectively reduce the bandwidth and network delay and save server resources.The numerical control machine data monitoring system can intuitively reflect the machine data,and the visible effect is good.It realizes timely monitoring of equipment alarms and prompts maintenance and management personnel. 展开更多
关键词 computer numerical control(CNC) machine tools real-time MONITORING visualIZATION hyper text MARKUP language(HTML)5 WebSocket CANVAS
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A New Method for Visual Real-Time Monitoring of Low Frequency Oscillation
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作者 Bo-Jian Wen Shi-Ming Li +2 位作者 Chong-Wen Zhou Jun Luo Fang-Zong Wang 《Smart Grid and Renewable Energy》 2015年第4期59-66,共8页
Visual real-time monitoring is the premise of low frequency oscillation control in power grids. This paper showed a visual method for the control center of power grids to monitor low frequency oscillation. It processe... Visual real-time monitoring is the premise of low frequency oscillation control in power grids. This paper showed a visual method for the control center of power grids to monitor low frequency oscillation. It processed the PMU real-time data with incomplete S-transform, and converted the waveforms to two-dimensional time-frequency figures which showed the initial time, frequency and amplitude of each low frequency oscillation mode directly. GPU was used to show figures and calculate FFT with the purpose of improving calculation efficiency. The results of practical cases show that the real-time characters of low frequency oscillation can be identified availably by this visualization real-time monitoring method which is helpful and suitable for practical application. 展开更多
关键词 Low Frequency OSCILLATION INCOMPLETE S-TRANSFORM real-time Monitoring visual GPU
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Real-time Visualization of Urban with Gigantic Amount of Detailed Buildings
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作者 YANG Fei-yu LI Sheng +1 位作者 WANG Shao-rong WANG Guo-ping 《Computer Aided Drafting,Design and Manufacturing》 2015年第1期22-27,共6页
Complex urban scenery is generally composed of gigantic amount of detailed buildings, efficient representation and rendering are essential for its visualization. We present an accelerating method for urban visualizati... Complex urban scenery is generally composed of gigantic amount of detailed buildings, efficient representation and rendering are essential for its visualization. We present an accelerating method for urban visualization. Our approach can optimize the organization of models in accordance with the quadtree based terrain, which makes the parallelization easier. Through minimizing the draw call within one rendering process, our approach can reduce the time cost of each frame and improve the framerate greatly. Hereby, our system can handle large-scale detailed models with high diversity and also can afford the ability to adjust the rendering strategy automatically according to the state of the hardware. 展开更多
关键词 urban visualization ACCELERATION real-time detailed buildings
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南洋臀纹粉蚧生物学特性及LAMP检测
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作者 黄鹏 张杰 +2 位作者 姚锦爱 蓝炎阳 余德亿 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1052-1062,共11页
【目的】明确南洋臀纹粉蚧Planococcus lilacinus生物学特性及实现对该虫的可视化检测。【方法】室内观察记录南洋臀纹粉蚧不同发育阶段的形态特征和历期及雌成虫的繁殖能力;以南洋臀纹粉蚧28S rDNA序列为靶标,设计其特异性的环介导等... 【目的】明确南洋臀纹粉蚧Planococcus lilacinus生物学特性及实现对该虫的可视化检测。【方法】室内观察记录南洋臀纹粉蚧不同发育阶段的形态特征和历期及雌成虫的繁殖能力;以南洋臀纹粉蚧28S rDNA序列为靶标,设计其特异性的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物组用于建立相应的可视化检测方法,并进行特异性、灵敏度及稳定性验证。【结果】南洋臀纹粉蚧雌雄虫具有不同的世代生活史,卵初产时即可见虫体轮廓,并具1对暗红色单眼;1龄若虫行动活泼,雌雄难辨;2龄若虫体缘出现白色细蜡棒,雌雄体型出现分化;3龄若虫仅存在雌虫,形似雌成虫;蛹仅存在雄虫,分为预蛹期和蛹期;雌成虫体表覆盖厚实的白色蜡粉,体缘18对粗蜡棒突出明显;雄成虫有一对透明发达的前翅,腹部末端具1对白色长蜡丝。该虫卵历期(1.37±0.26)h,雌成虫历期(32.67±4.82)d,各龄若虫、蛹和雄成虫历期均不超过(7.65±0.82)d;两性生殖的单雌产卵量和卵孵化率分别为(531.92±69.98)粒和96.02%±1.35%,孤雌生殖的单雌产卵量和卵孵化率分别为(403.50±71.11)粒和88.41%±3.03%。建立的LAMP可视化检测方法能有效扩增南洋臀纹粉蚧DNA,最佳反应温度和时间及最低检测浓度分别为66℃、55 min和100 fg/μL,反应产物呈绿色阳性,检出率达91.67%~100.00%,但无法扩增其他7种近缘种属粉蚧DNA,反应产物呈橙黄色阴性。【结论】南洋臀纹粉蚧雌雄二型,生长发育快,繁殖力强,急需作好其检测与监测工作;该虫的LAMP可视化检测方法便捷高效、特异性强、灵敏度高且稳定性好,有望用于非专业鉴定人员对该虫的现场快速、准确识别。 展开更多
关键词 南洋臀纹粉蚧 形态特征 发育繁殖 lamp 可视化检测
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猪流行性腹泻病毒可视化RT-LAMP检测方法的建立与初步应用 被引量:7
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作者 李林岳 李任峰 +6 位作者 袁嘉康 秦保亮 庞俊增 蔡琳琳 赵晓会 范国英 王自良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期814-821,828,共9页
为建立猪流行性腹泻病毒(PEDV)可视化反转录-环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,本研究根据PEDV ORF1a/b基因的保守序列,设计了8组特异性引物,以PEDC cDNA为模板,采用试剂盒推荐的各反应条件经LAMP扩增,根据LAMP反应产物琼脂糖凝胶电泳... 为建立猪流行性腹泻病毒(PEDV)可视化反转录-环介导等温扩增(RT-LAMP)检测方法,本研究根据PEDV ORF1a/b基因的保守序列,设计了8组特异性引物,以PEDC cDNA为模板,采用试剂盒推荐的各反应条件经LAMP扩增,根据LAMP反应产物琼脂糖凝胶电泳结果筛选最佳引物组。以筛选的外引物PE2 F3/B3经PCR从PEDV cDNA中扩增ORF1a/b基因,构建重组质粒pPE-ORF1-2并分别经PCR和测序鉴定。结果显示,2号引物组(内引物PE2 FIP/PE2 BIP,外引物PE2 F3/PE2 B3)为最佳引物。PCR和测序鉴定结果表明重组质粒正确构建,经计算其浓度为1.56×1011拷贝/μL,将其稀释1000倍后作为质粒标准品。为建立检测PEDV的RT-LAMP方法,本研究对该方法的反应时间、反应温度、Mg2+浓度、内、外引物及dNTP浓度进行了优化,结果显示,RT-LAMP反应体系为:60℃反应50 min,Mg2+浓度80 mmol/L,内外引物终浓度分别为32μmol/L和5μmol/L,dNTP浓度10 mmol/L;通过在上述体系中加入甲酚红指示剂,初步建立了可视化RT-LAMP检测方法。特异性试验结果显示,该方法仅能检出PEDV,与猪德尔塔冠状病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪传染性胃肠炎病毒均无交叉反应,且阳性管体系颜色由紫红色变为黄色,阴性反应管体系颜色保持紫红色,特异性较强;将重组质粒标准品pPE-ORF1-210倍倍比稀释(1.65×100拷贝/μL~1.65×108拷贝/μL)后作为模板,采用本研究建立的可视化RT-LAMP方法进行敏感性试验,结果显示,该方法对pPE-ORF1-2检测限为10拷贝/μL,比以重组质粒pPE-M-GB为模板,以引物PEGBF/PEGBR的PEDV国标RT-PCR方法的敏感性高1个数量级,敏感性较高;重复性试验结果显示,该方法对不同浓度质粒标准品的批内和批间重复性试验的变异系数均小于5%,重复性较好。对53份临床样品检测结果显示,RT-LAMP和RT-PCR对PEDV的检出率分别为32.1%(17/53)和28.3%(15/53)。二者的总符合率为96.2%(51/53)。本研究建立的PEDV RT-LAMP检测方法具有特异性强、敏感性高、重复性好、操作简便、结果可视化等优点,为PEDV的现场快速检测提供了新的技术支持。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 RT-lamp 快速检测 可视化
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黄芪根腐病尖孢镰刀菌LAMP可视化快速检测方法的建立 被引量:1
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作者 梁伊菲 王春伟 《山西农业科学》 2023年第4期420-426,共7页
由于黄芪的轮作周期缩短、连作面积连续增加,导致黄芪根腐病的发病率大大增加。目前,黄芪根腐病成为限制黄芪产量的主要因素之一,严重制约着黄芪产业的持续发展。虽然多种镰刀菌在整个种植季均可侵染黄芪,但尖孢镰刀菌(Fusarium oxyspor... 由于黄芪的轮作周期缩短、连作面积连续增加,导致黄芪根腐病的发病率大大增加。目前,黄芪根腐病成为限制黄芪产量的主要因素之一,严重制约着黄芪产业的持续发展。虽然多种镰刀菌在整个种植季均可侵染黄芪,但尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)是造成黄芪根部腐烂最主要的病原菌之一。镰刀菌在不同的培养基上形态不同,由多种镰刀菌引起的黄芪根腐症状通常很难根据其形态学的特征加以区分,需要通过一些基因测序手段。翻译延伸因子(TEF-1alpha)已被广泛应用于研究镰刀菌属的种内和种间变异和系统发育。因此,可以针对TEF-1alpha区域为靶点设计LAMP引物。为了给尖孢镰刀菌的野外和现场快速检测提供新思路,为黄芪根腐病病害的田间快速诊断提供一个简便快速的新技术,研究针对尖孢镰刀菌翻译延伸因子(TEF-1alpha)序列设计引物,优化环介导等温扩增(LAMP)反应时间和温度,测试LAMP反应的灵敏性和特异性,构建黄芪根腐病尖孢镰刀菌的LAMP快速检测方法。结果表明,反应最适温度为62℃,最适时间为30 min;在最佳反应条件下,黄芪根腐病尖孢镰刀菌的LAMP快速检测方法对尖孢镰刀菌具有良好的特异性,灵敏度可达到10 pg/μL;在反应开始前加入SYBR Green I显色剂,可在反应结束后观察检测结果。 展开更多
关键词 环介导等温扩增(lamp) 尖孢镰刀菌 黄芪 根腐病 可视化 快速检测
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基于免核酸提取可视化RT-LAMP快速检测黄瓜绿斑驳花叶病毒
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作者 尹新颖 曹际娟 +2 位作者 李鑫 杨莉莉 朴永哲 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期264-271,共8页
本文基于逆转录环介导恒温扩增(RT-LAMP)技术建立葫芦科作物中黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)免核酸提取的可视化快速检测方法。根据CGMMV全基因组序列,筛选保守区域并设计特异性RT-LAMP检测引物。通过荧光扩增方法(加SYTO-9)和可视化方法(... 本文基于逆转录环介导恒温扩增(RT-LAMP)技术建立葫芦科作物中黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV)免核酸提取的可视化快速检测方法。根据CGMMV全基因组序列,筛选保守区域并设计特异性RT-LAMP检测引物。通过荧光扩增方法(加SYTO-9)和可视化方法(加钙黄绿素),开展RT-LMAP特异性、灵敏度和重现性试验分析。结果表明,优化筛选的引物组可以特异性地检测CGMMV,检测灵敏度达到4.21×10^(3) fg/μL,组内和组间变异系数均小于5%,重现性好。对瓜类作物田间种苗、植株叶片及市售种子等103份样品进行检测及一致性分析,表明该方法与基于RNA提取RT-LAMP、荧光RT-qPCR及免疫测试条检测结果之间的Kappa值均为1.0(1~1,95%置信区间),具有很好的一致性。基于免核酸提取的可视化RT-LAMP快检方法成为适合现场快速检测的理想选择,对于CGMMV危害葫芦科作物的田间监测以及疫情防控具有广泛的推广应用前景。 展开更多
关键词 黄瓜绿斑驳花叶病毒 逆转录环介导恒温扩增(RT-lamp) 可视化 免核酸提取
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鱼类传染性造血器官坏死病毒RT-LAMP检测方法的建立及应用 被引量:8
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作者 刘淼 徐黎明 +6 位作者 卢彤岩 赵景壮 曹永生 刘红柏 尹家胜 张金凤 冯剑 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1065-1071,共7页
将逆转录环介导的等温扩增技术(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)引入到鱼类的传染性造血器官坏死病病毒(infectious haematopoietic necrosis virus,IHNV)检测中,建立了简单、快速、灵敏的IHNV... 将逆转录环介导的等温扩增技术(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)引入到鱼类的传染性造血器官坏死病病毒(infectious haematopoietic necrosis virus,IHNV)检测中,建立了简单、快速、灵敏的IHNV检测方法。针对IHNV的聚合酶蛋白基因(polymerase protein,L)设计特异性引物,以IHNV基因组RNA为模板,在反转录酶和Bst DNA聚合酶的作用下进行RT-LAMP,反应产物添加SYBR Green I荧光染料后,肉眼观察阳性样本表现为荧光绿色,阴性样本表现为红棕色。2%琼脂糖凝胶电泳检测结果与可视化检测结果一致。该方法实现了检测结果的可视化。特异性分析显示该方法不与传染性胰脏坏死病毒(infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)及病毒性出血性败血症病毒(viral haemorrhagic septicaemia virus,VHSV)发生交叉反应,并且可检测不低于10 pfu的IHNV RNA。本研究所建立的IHNV RT-LAMP可视化检测方法具有灵敏度高、特异性好、成本低、不依赖任何专门的仪器设备的优点,其检测结果直观可视化,可实现现场高通量快速检测。 展开更多
关键词 传染性造血器官坏死病毒(IHNV) 聚合酶蛋白 RT-lamp 可视化检测
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柑橘黄龙病可视化LAMP检测技术的建立及应用 被引量:20
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作者 王贤达 林雄杰 +2 位作者 胡菡青 王宗华 范国成 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期918-924,共7页
建立柑橘黄龙病(HLB)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为HLB的快速检测提供有力的技术支持。根据LAMP技术原理,针对柑橘黄龙病菌16S rDNA靶序列的6个位点设计4条特异性引物,通过对反应体系和反应条件的优化,并在反应前的体系中加入1... 建立柑橘黄龙病(HLB)可视化环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为HLB的快速检测提供有力的技术支持。根据LAMP技术原理,针对柑橘黄龙病菌16S rDNA靶序列的6个位点设计4条特异性引物,通过对反应体系和反应条件的优化,并在反应前的体系中加入1∶10的钙黄绿素(calcein)和氯化锰(MnCl2)混合液作为荧光显色剂,建立可视化LAMP检测技术,同时对该技术的特异性、灵敏度和样品检测进行了测试。该检测方法具有很高的特异性,反应体系中除了HLB具有特异性的扩增,产生黄绿色荧光扩增产物,其他供试菌株均无特异扩增。对柑橘黄龙病菌总DNA的检测限为1.51×10-3 ng/μL,而对含有目的基因的CG-pMD18-T质粒DNA的检测限为2.12×10-6 ng/μL,与定量PCR灵敏度相当,而比常规PCR灵敏度高1 000倍。利用可视化LAMP技术和定量PCR对来自漳州、南平、福州等地的样品进行检测,结果 2种技术的检出率均为76.7%,符合率达到100%。 展开更多
关键词 柑橘黄龙病菌 钙黄绿素 环介导等温扩增(lamp) 可视化
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基于Matlab和Visual Basic仿真软件开发 被引量:7
15
作者 景微娜 左信 《系统仿真学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1459-1461,1465,共4页
Matlab/Simulink是功能强大的建模仿真工具,Visual Basic语言具有很好的图形界面功能。充分发挥两者各自的优势,可以迅速便捷的开发仿真软件。应用Matlab/Simulink建立过程动态模型,通过Matlab的Real-Time Workshop将模型文件转化为Visu... Matlab/Simulink是功能强大的建模仿真工具,Visual Basic语言具有很好的图形界面功能。充分发挥两者各自的优势,可以迅速便捷的开发仿真软件。应用Matlab/Simulink建立过程动态模型,通过Matlab的Real-Time Workshop将模型文件转化为Visual C++工程,在此基础上做二次开发并将VC工程编译成可执行程序,与Visual Basic实现交互,实现仿真软件的开发。 展开更多
关键词 仿真软件开发 MATLAB/SIMULINK real-time WORKSHOP visual Basic
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鸭圆环病毒LAMP可视化检测方法的建立 被引量:14
16
作者 赵光远 谢芝勋 +4 位作者 谢丽基 庞耀珊 邓显文 刘加波 范晴 《中国动物检疫》 CAS 2012年第3期24-26,共3页
根据GenBank中DuCV基因序列,在保守区设计了6条特异性引物,并对反应条件进行优化,建立了一种适用于鸭圆环病毒(DuCV)的环介导等温扩增快速检测方法(LAMP)。该方法对H9亚型禽流感、小鹅瘟、鸭瘟、鸭肝炎、鸭副黏病毒均无扩增反应;且扩增... 根据GenBank中DuCV基因序列,在保守区设计了6条特异性引物,并对反应条件进行优化,建立了一种适用于鸭圆环病毒(DuCV)的环介导等温扩增快速检测方法(LAMP)。该方法对H9亚型禽流感、小鹅瘟、鸭瘟、鸭肝炎、鸭副黏病毒均无扩增反应;且扩增反应只需在常规水浴锅中进行,1小时内即可完成反应;对DuCV模版DNA的最小检测限为10fg,灵敏度是一步法PCR的1000倍。本研究建立的LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,适合在基层进行DuCV的快速检测。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 环介导等温扩增 可视化检测
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鸭Ⅰ型肝炎病毒RT-LAMP可视化检测方法的建立 被引量:10
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作者 谢丽基 谢芝勋 +4 位作者 刘加波 庞耀珊 邓显文 谢志勤 范晴 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期112-115,共4页
为建立一种快速检测鸭Ⅰ型肝炎病毒(DHV I)的方法,本研究根据基因库中DHV Ⅰ基因的保守序列,设计特异性环介导等温扩增(LAMP)引物,建立了DHV I的RT-LAMP可视化检测方法。该方法的敏感性可达10fg,高于常规PCR方法 100倍;全部反应可在1 h... 为建立一种快速检测鸭Ⅰ型肝炎病毒(DHV I)的方法,本研究根据基因库中DHV Ⅰ基因的保守序列,设计特异性环介导等温扩增(LAMP)引物,建立了DHV I的RT-LAMP可视化检测方法。该方法的敏感性可达10fg,高于常规PCR方法 100倍;全部反应可在1 h内完成;可以通过肉眼观察颜色直接判定结果;对其它鸭常见病原体的检测结果均为阴性。实验结果表明建立的RT-LAMP方法简便、快速、灵敏、特异,可用于DHV Ⅰ感染的快速检测。 展开更多
关键词 鸭Ⅰ型肝炎病毒 环介导等温扩增 可视化检测
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猪圆环病毒2型LAMP检测方法的建立 被引量:5
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作者 申世川 王一成 +2 位作者 袁秀芳 徐丽华 李军星 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第1期21-26,共6页
基于猪圆环病毒2型(porcine circocirus type 2,PCV-2)的ORF2基因建立了一种便捷、灵敏而又特异的可视化环介导等温核酸扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法。该方法通过针对PCV-2 6个位点的4条特异性引物,在Bst DN... 基于猪圆环病毒2型(porcine circocirus type 2,PCV-2)的ORF2基因建立了一种便捷、灵敏而又特异的可视化环介导等温核酸扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法。该方法通过针对PCV-2 6个位点的4条特异性引物,在Bst DNA聚合酶的作用下对PCV-2靶序列进行等温核酸扩增。经过对LAMP反应体系和反应条件的优化,所建立方法在61℃反应1 h能够成功的检测出PCV-2基因组DNA,且操作简单,不需要PCR仪等复杂仪器,结果可经电泳检测及肉眼观察;敏感性和特异性试验表明,所建立的方法能特异地检测PCV-2并且其敏感度可以达到0.5 pg的DNA分子;所建立LAMP方法的阳性检出率与国标PCR的阳性检出率符合度为100%。该研究为PCV-2的现场快速检测提供更加简便、快捷的方法,可以满足基层检疫的需要。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 环介导等温扩增 可视化 快速检测
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布鲁氏菌环介导等温扩增(LAMP)可视化检测方法的建立 被引量:26
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作者 许邹亮 南文龙 +6 位作者 周洁 陆明哲 郭玉广 谭鹏飞 毛开荣 彭大新 陈义平 《中国动物检疫》 CAS 2011年第8期37-40,共4页
应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了布鲁氏菌可视化快速检测方法。针对布鲁氏菌外膜蛋白OMP25基因保守区设计6条特异引物,反应前加入染料羟基萘芬蓝(HNB)作为LAMP扩增的指示剂,63℃恒温反应60min,根据HNB的颜色变化进行结果判定。分别... 应用环介导等温扩增(LAMP)技术建立了布鲁氏菌可视化快速检测方法。针对布鲁氏菌外膜蛋白OMP25基因保守区设计6条特异引物,反应前加入染料羟基萘芬蓝(HNB)作为LAMP扩增的指示剂,63℃恒温反应60min,根据HNB的颜色变化进行结果判定。分别评价所建立LAMP方法的特异性和灵敏性,并对60份牛布鲁氏菌病虎红平板凝集试验(RBT)阳性血清样本,经LAMP和B4/B5-PCR方法进行平行检测。结果显示,本方法最低检出限约为17fg布鲁氏菌基因组DNA。本方法特异性良好,布鲁氏菌反应管均出现特异性LAMP扩增反应,而猪大肠杆菌K99、巴氏杆菌C48-1、猪链球菌ST171、绿脓杆菌等对照组均未出现扩增。针对60份RBT阳性血清的平行检测结果显示,LAMP和B4/B5-PCR这两种方法间的结果符合率为85.0%。B4/B5-PCR检测为阳性的43份样品,经本方法检测全部为阳性;B4/B5-PCR检测为阴性的17份样品,经本方法检测,9份为阳性,8份为阴性。LAMP的敏感性高于B4/B5-PCR方法。实验表明,本文所建立的基于颜色判定的布鲁氏菌LAMP检测方法具有特异、灵敏、设备要求简单等特点,适用于基层兽医部门进行布鲁氏菌的快速检测。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 环介导等温扩增(lamp) 可视化检测
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鸭坦布苏病毒可视化RT-LAMP快速检测方法的建立与初步应用 被引量:9
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作者 吴植 夏文龙 +3 位作者 蔡树东 郭长明 袁维峰 王永娟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第11期3334-3339,共6页
为实现鸭坦布苏病毒(duck tembusu virus,DTMUV)的快速检测,本研究根据GenBank中公布的DTMUV E蛋白基因的高度保守序列设计了1套引物,通过优化反应体系各组分的浓度、反应时间和温度,建立了一种灵敏、便捷的RT-LAMP扩增方法。结果显示,... 为实现鸭坦布苏病毒(duck tembusu virus,DTMUV)的快速检测,本研究根据GenBank中公布的DTMUV E蛋白基因的高度保守序列设计了1套引物,通过优化反应体系各组分的浓度、反应时间和温度,建立了一种灵敏、便捷的RT-LAMP扩增方法。结果显示,在最佳条件下甜菜碱对反应体系影响不明显;该方法灵敏度是常规RT-PCR的100倍;只能特异性扩增坦布苏病毒,对于其他常见的禽源病毒无特异性扩增;检测结果可直接通过肉眼观察来判断;对临床74份疑似病料,可检出65份。本试验建立的方法灵敏性高、特异性强,可用于鸭坦布苏病毒病的临床诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 鸭坦布苏病毒(DTMUV) 环介导等温扩增 可视化 快速检测
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