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Grade classification of neuroepithelial tumors using high-resolution magic-angle spinning proton nuclear magnetic resonance spectroscopy and pattern recognition 被引量:5
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作者 CHEN WenXue LOU HaiYan +9 位作者 ZHANG HongPing NIE Xiu LAN WenXian YANG YongXia XIANG Yun QI JianPin LEI Hao TANG HuiRu CHEN FenEr DENG Feng 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2011年第7期606-616,共11页
Clinical data have shown that survival rates vary considerably among brain tumor patients,according to the type and grade of the tumor.Metabolite profiles of intact tumor tissues measured with high-resolution magic-an... Clinical data have shown that survival rates vary considerably among brain tumor patients,according to the type and grade of the tumor.Metabolite profiles of intact tumor tissues measured with high-resolution magic-angle spinning proton nuclear magnetic resonance spectroscopy (HRMAS 1H NMRS) can provide important information on tumor biology and metabolism.These metabolic fingerprints can then be used for tumor classification and grading,with great potential value for tumor diagnosis.We studied the metabolic characteristics of 30 neuroepithelial tumor biopsies,including two astrocytomas (grade I),12 astrocytomas (grade II),eight anaplastic astrocytomas (grade III),three glioblastomas (grade IV) and five medulloblastomas (grade IV) from 30 patients using HRMAS 1H NMRS.The results were correlated with pathological features using multivariate data analysis,including principal component analysis (PCA).There were significant differences in the levels of N-acetyl-aspartate (NAA),creatine,myo-inositol,glycine and lactate between tumors of different grades (P<0.05).There were also significant differences in the ratios of NAA/creatine,lactate/creatine,myo-inositol/creatine,glycine/creatine,scyllo-inositol/creatine and alanine/creatine (P<0.05).A soft independent modeling of class analogy model produced a predictive accuracy of 87% for high-grade (grade III-IV) brain tumors with a sensitivity of 87% and a specificity of 93%.HRMAS 1H NMR spectroscopy in conjunction with pattern recognition thus provides a potentially useful tool for the rapid and accurate classification of human brain tumor grades. 展开更多
关键词 neuroepithelial tumor grade classification high-resolution magic-angle spinning nuclear magnetic resonance (HRMASNMR) spectroscopy METABONOMIcS pattern recognition
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Ibuprofen-Maltodextrin Interaction: Study of Enantiomeric Recognition and Complex Characterization 被引量:1
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作者 Claudia Garnero Carolina Aloisio Marcela Longhi 《Pharmacology & Pharmacy》 2013年第1期18-30,共13页
The interaction between ibuprofen and maltodextrins with different dextrose equivalent was studied in solution and solid state in order to investigate the effect on the solubility of ibuprofen and to determine their u... The interaction between ibuprofen and maltodextrins with different dextrose equivalent was studied in solution and solid state in order to investigate the effect on the solubility of ibuprofen and to determine their usefulness in terms of chiral recognition. Apparent binding constants were calculated using nuclear magnetic resonance spectroscopy experiments and solubility studies. The results showed an increase in the apparent solubility of ibuprofen in the presence of maltodextrins that depended on their ionization state. The freeze-drying method was used to prepare solid complexes, while physical mixtures were obtained by simple blending. These solid systems were characterized in the solid state using differential scanning calorimetry, thermogravimetric analysis, Fourier Transform-Infrared spectroscopy, scanning electron microscopy and X-ray diffractometry. Detailed nuclear magnetic resonance studies provided evidence of the influence of the type and concentration of the maltodextrin host on the chiral recognition of racemic ibuprofen, indicating that these linear ligands act as chiral selectors. 展开更多
关键词 IBUPROFEN MALTODEXTRIN cHIRAL recognition complex characterization nuclear magnetic resonance Spectroscopy SOLUBILITY Studies
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人早幼粒白血病细胞HL-60胞内pH的^(31)P核磁共振研究 被引量:9
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作者 黄荣清 颜贤忠 +1 位作者 骆传环 杜泽涵 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
建立了无损伤性测定HL 60细胞胞内pH的31 P NMR方法。细胞内无机磷 (Pi)的化学位移对pH非常敏感 ,随pH变化而变化 ,通过测定其化学位移进而能间接确定细胞内的pH。HL 60细胞的31 P核磁共振谱由Pi、ATP等的共振峰组成。根据Pi 峰的化学... 建立了无损伤性测定HL 60细胞胞内pH的31 P NMR方法。细胞内无机磷 (Pi)的化学位移对pH非常敏感 ,随pH变化而变化 ,通过测定其化学位移进而能间接确定细胞内的pH。HL 60细胞的31 P核磁共振谱由Pi、ATP等的共振峰组成。根据Pi 峰的化学位移对HL 60细胞内pH进行了测定。HL 60细胞内Pi 峰的化学位移为 5 .78± 0 .0 1 ,计算得到细胞内pH值为 6.1 6±0 .0 1。31 P核磁共振能在测定细胞胞内pH的同时 ,观测到细胞内多种含磷小分子代谢物 。 展开更多
关键词 R73HL-60细胞 白血病 PH值 核磁共振 细胞代谢 分析
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高脂血症及动脉粥样硬化痰瘀演变的代谢组学研究 被引量:47
4
作者 刘卫红 张琪 +6 位作者 颜贤忠 张蕾 孙博 游云 王丽华 李文 殷小杰 《中医杂志》 CSCD 北大核心 2008年第8期738-741,共4页
目的探讨痰瘀证候的动态演变、时相特点和由痰致瘀在代谢方面的变化。方法选用SPF级雄性Wistar大鼠72只,随机分为正常对照组和模型组,每组36只。以高脂饲料喂饲法复制大鼠高脂血症模型。分别于第2周、第4周和第8周腹主动脉取血,采用核... 目的探讨痰瘀证候的动态演变、时相特点和由痰致瘀在代谢方面的变化。方法选用SPF级雄性Wistar大鼠72只,随机分为正常对照组和模型组,每组36只。以高脂饲料喂饲法复制大鼠高脂血症模型。分别于第2周、第4周和第8周腹主动脉取血,采用核磁共振波谱仪检测并进行主成分分析。结果大鼠血浆1HNMR谱的主成分分析结果显示,各组大鼠代谢谱各不相同。随着造模时间的延长,不同时点模型组大鼠的代谢谱亦各不相同,表明高脂血症前期以脂质代谢紊乱为特点,随着病程进展,参与血液凝固过程的乙酰糖蛋白的出现,说明凝血机制出现异常,同时酮体及乳酸的升高说明脂质代谢紊乱进一步加重,这与同时检测的血脂、血液流变学结果相一致。结论可能从代谢组学分析中找出痰瘀演变过程特异的标志性代谢产物,以阐释中医痰瘀证候的生物学本质。 展开更多
关键词 代谢组学 模式识别 核磁共振 高脂血症 痰证 瘀证
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大鼠肝郁脾虚证的代谢组学研究 被引量:105
5
作者 罗和古 丁杰 +1 位作者 岳广欣 陈家旭 《中西医结合学报》 CAS 2007年第3期307-313,共7页
目的:研究慢性束缚应激大鼠(肝郁脾虚模型)的血浆代谢表型改变,开展中医证候学的研究,试图通过对慢性束缚应激大鼠代谢物组的共性分析和生物标记物的发现,寻找肝郁脾虚证候的生物学本质,探讨代谢组学在中医证候学研究中的应用。... 目的:研究慢性束缚应激大鼠(肝郁脾虚模型)的血浆代谢表型改变,开展中医证候学的研究,试图通过对慢性束缚应激大鼠代谢物组的共性分析和生物标记物的发现,寻找肝郁脾虚证候的生物学本质,探讨代谢组学在中医证候学研究中的应用。方法:选用实验用二级雄性SD大鼠24只,随机分为4组:7d正常对照组(A组)、21d正常对照组(B组)、7d模型组(C组)和21d模型组(D组),每组6只。以慢性束缚方法制作应激大鼠模型。分别于第8天和第22天麻醉后心室取血,用Varian UnityInova 600M超导傅立叶变化核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)波谱仪检测。自由感应衰减信号经过32k傅立叶变换转为一维NMR谱图。调用VNMR软件中的程序将^1H谱按默认值,分别从4.5~0.5ppm(弛豫时间编辑)以及6.0~0ppm(扩散编辑),每段为0.04ppm,进行分段积分,将积分数据归一化后,以文本文件或Excel文件贮存,用于模式识别分析。将上述得到的数据文件利用Simca-P 10.0软件包进行主成分分析。结果:大鼠血浆^1H NMR谱的主成分分析,各组动物代谢谱各不相同,与已知应激状态下动物体内代谢的调节过程及结果相一致。正常对照组与模型组相比较发现,醋酸、乳酸、酪氨酸、低密度脂蛋白和3.44ppm的未知化合物的谱峰峰形改变较为明显。这些发生改变的代谢物可以作为肝郁脾虚证的生物标志物做进一步的研究。结论:各组大鼠血浆^1H NMR代谢谱之间存在差异,而且可能从代谢组学分析中找出特异的标志性代谢产物,阐释中医证候的生物学本质。代谢组学分析是一种有良好发展前景的中医证候学研究方法。 展开更多
关键词 代谢组学 模式识别 核磁共振 中医 大鼠
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银屑病血热证患者治疗前后血浆代谢组学分析 被引量:16
6
作者 刘卫红 李萍 +7 位作者 王萍 颜贤忠 张琪 陈合兵 张蕾 王丽华 于凤华 王莒生 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2009年第4期430-435,共6页
目的研究银屑病血热证患者血浆代谢表型的特征及凉血解毒汤的作用机制。方法选择53例银屑病血热证患者和31例健康志愿者,采用核磁共振谱仪技术分析银屑病血热证治疗前后及健康志愿者血浆代谢产物谱,通过主成分分析法研究健康人与银屑病... 目的研究银屑病血热证患者血浆代谢表型的特征及凉血解毒汤的作用机制。方法选择53例银屑病血热证患者和31例健康志愿者,采用核磁共振谱仪技术分析银屑病血热证治疗前后及健康志愿者血浆代谢产物谱,通过主成分分析法研究健康人与银屑病血热证患者之间、银屑病血热证患者经凉血解毒汤治疗前后代谢产物谱的差异。结果银屑病血热证患者治疗前后及健康志愿者血浆核磁共振氢谱的主成分分析结果显示,不仅银屑病血热证患者与健康对照组能够被明显区分,银屑病血热证治疗前后也能较好的分开。组间内源性代谢物的含量存在明显差异,提示银屑病血热证患者存在脂类、蛋白质、能量代谢异常及肝肾功能损害。凉血解毒汤能调节银屑病血热证患者的糖脂类代谢,使其代谢网络呈现向正常状态修复的趋势。结论采用代谢组学方法能较全面地反应生物体的生理病理及代谢状态,并可应用于药效评价研究。 展开更多
关键词 代谢组学 模式识别 核磁共振 银屑病
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抗结核药物异烟肼肝毒性时效关系的代谢组学 被引量:12
7
作者 廖艳 彭双清 +1 位作者 颜贤忠 张立实 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期730-737,I0005,共9页
目的研究异烟肼灌胃后不同时段大鼠尿液的代谢表型改变及其与组织病理学和血浆生化指标变化的相关性,探讨代谢组学在药物毒理学研究中的应用。方法Wistar大鼠连续经口灌胃0、50、100、200和400mg.kg-1异烟肼3、7、14d,收集给药前24h及... 目的研究异烟肼灌胃后不同时段大鼠尿液的代谢表型改变及其与组织病理学和血浆生化指标变化的相关性,探讨代谢组学在药物毒理学研究中的应用。方法Wistar大鼠连续经口灌胃0、50、100、200和400mg.kg-1异烟肼3、7、14d,收集给药前24h及给药期间每天24h的尿液,测定质子核磁共振(1HNMR)谱,并进行血浆生化指标测定和肝脏组织病理学检查。结果常规毒性研究方法显示异烟肼在较高剂量、较长给药时间(7d以上)时表现出肝毒性,并且有较好的时间-效应关系。对大鼠尿液进行代谢组学研究显示各组动物代谢谱各不相同,随着给药时间的变化,大鼠尿液1HNMR谱发生一定改变,代谢谱的改变与常规毒性检测指标相符且更灵敏。与正常对照组比较,给药组尿样1HNMR谱葡萄糖和牛磺酸显著增加,2-酮戊二酸和柠檬酸显著降低。结论大鼠尿液1HNMR代谢轨迹与异烟肼毒性作用时间密切相关,异烟肼引起的肝毒性与线粒体功能受损、三羧酸循环中能量代谢异常及葡萄糖代谢紊乱有关。代谢组学分析在毒理学研究中有着广泛的应用前景。 展开更多
关键词 代谢组学 核磁共振技术 模式识别 异烟肼 肝毒性
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生物医学核磁共振中的模式识别方法 被引量:16
8
作者 邱玉洁 夏圣安 +1 位作者 叶朝辉 刘买利 《波谱学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期99-111,共13页
模式识别(PR)是把具体事物进行正确归类的科学, 它能解决许多对复杂体系的认识问题. 生物医学核磁共振波谱(NMR)的理解和分析便是其中一种. 在受到病理或者其他刺激后, 生物体内的代谢物水平会发生变化, 这种变化可以通过液体高分辨核... 模式识别(PR)是把具体事物进行正确归类的科学, 它能解决许多对复杂体系的认识问题. 生物医学核磁共振波谱(NMR)的理解和分析便是其中一种. 在受到病理或者其他刺激后, 生物体内的代谢物水平会发生变化, 这种变化可以通过液体高分辨核磁共振的手段来观察. 模式识别把这种认识进一步深化, 不仅可以将正常状态与病理状态区分开, 还能找到是哪些生化指纹导致两种状态的差异, 为生理、病理和药理等研究, 以及临床诊断提供依据. 模式识别与生物核磁共振波谱的结合, 已经发展成为代谢组学研究的关键技术, 甚至被称为基于核磁共振的代谢组学. 主要讨论适用于生物医学核磁共振中的模式识别方法及其最新进展. 展开更多
关键词 生物医学 核磁共振波谱 病理状态 代谢组学 正常状态 PR 药理 复杂体系 正确 NMR
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肝细胞癌、肝硬化患者血清中代谢物组研究 被引量:16
9
作者 陆强 黄一红 +4 位作者 丛辉 刘霞 高红昌 林东海 王惠民 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第2期194-198,共5页
采用核磁共振方法检测肝硬化、肝细胞癌(简称肝癌)患者和健康人血清中代谢物,研究3组血清代谢物组的差异。利用偏最小二乘法-判别式分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)对NMR谱数据进行模式识别分析,探讨利用基于1... 采用核磁共振方法检测肝硬化、肝细胞癌(简称肝癌)患者和健康人血清中代谢物,研究3组血清代谢物组的差异。利用偏最小二乘法-判别式分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)对NMR谱数据进行模式识别分析,探讨利用基于1HNMR代谢组学技术诊断肝癌的可行性。结果表明,与健康人相比,肝硬化、肝癌患者血清中脂质(低密度脂蛋白和极低密度脂蛋白)、胆碱、乙酰乙酸等含量减少,谷氨酰胺、丙酮酸、苯丙氨酸、酪氨酸等含量增加。PLS-DA分析结果显示肝癌患者可与健康人、肝硬化患者鉴别开来,肝癌诊断灵敏度达92.1%,假阳性率为5.7%,优于血清甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)检测。研究结果表明,基于1HNMR代谢组学技术结合PLS-DA的方法具有灵敏、准确、重复性好等优点,有助于肝癌早期诊断。 展开更多
关键词 肝细胞癌 肝硬化 血清 代谢物组 核磁共振 模式识别
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轻稀土镧、铈急性生物效应的血清^1H NMR谱代谢组学研究 被引量:13
10
作者 李中峰 吴惠丰 +4 位作者 张晓宇 李晓晶 廖沛球 李伟生 裴奉奎 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第3期438-442,共5页
采用现代核磁共振和模式识别技术,通过分析腹腔注射给药La(NO3)3(2,10和50mg/kg体重)和Ce(NO3)3(2,10和50mg/kg体重)48h后大鼠血清的核磁共振氢谱,由内源性代谢物浓度的变化研究了两种稀土化合物在大鼠体内的急性生物效应,利用主成分分... 采用现代核磁共振和模式识别技术,通过分析腹腔注射给药La(NO3)3(2,10和50mg/kg体重)和Ce(NO3)3(2,10和50mg/kg体重)48h后大鼠血清的核磁共振氢谱,由内源性代谢物浓度的变化研究了两种稀土化合物在大鼠体内的急性生物效应,利用主成分分析法对两者进行了分类比较.在低剂量(2mg/kg体重)组La(NO3)3和Ce(NO3)3血清中,乳酸和肌酸酐等内源性代谢物浓度发生了微小变化;在高剂量组(10和50mg/kg体重)中,含量变化较大的重要内源性代谢物包括3羟丁酸、丙氨酸、肌酸酐、丙酮、乙酸、琥珀酸和葡萄糖等,其中3羟丁酸和丙氨酸等在La的剂量组中变化较大,Ce的剂量组血清中丙酮、琥珀酸和葡萄糖含量变化明显.实验结果表明,低剂量La和Ce的毒性较低,并对机体影响较小,高剂量则对大鼠肝脏造成损伤,且Ce的毒性大于La. 展开更多
关键词 轻稀土 血清 核磁共振 模式识别 生化效应
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基于~1H-NMR的模式识别方法在慢性心力衰竭患者血清代谢组学中的应用 被引量:11
11
作者 杜智勇 沈安娜 +2 位作者 苏亮 梁健球 许顶立 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期415-419,共5页
目的探讨基于1H-NMR的模式识别方法应用于慢性心力衰竭(CHF)血清代谢组学研究的可行性。方法应用1H-NMR技术对9例CHF患者和6例健康人血清进行检测,对所得数据分别采用主成分分析法(PCA)和正交信号校正偏最小二乘法(OPLS)进行模式识别分... 目的探讨基于1H-NMR的模式识别方法应用于慢性心力衰竭(CHF)血清代谢组学研究的可行性。方法应用1H-NMR技术对9例CHF患者和6例健康人血清进行检测,对所得数据分别采用主成分分析法(PCA)和正交信号校正偏最小二乘法(OPLS)进行模式识别分析,确定CHF患者与健康人血清差异代谢物,比较两种模式识别方法判别能力。结果 CHF患者与健康人血清1H-NMR图谱有明显差异。其中PCA模式识别法未能将CHF组和健康对照组区分开,而用OPLS模式识别方法两组可明显区分。结论 1H-NMR技术是研究CHF代谢组学的有效技术手段,CHF患者血清代谢组与健康人存在明显差异。OPLS模式识别法明显优于PCA法,能够去除非实验因素的影响,提高分类效果。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 磁共振氢谱 代谢组学 模式识别
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血浆代谢组学研究用于肝移植物功能变化的评估 被引量:8
12
作者 张琪 高静 +3 位作者 李伶 陈合兵 李昕权 颜贤忠 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期725-729,共5页
目的探讨基于核磁共振波谱技术的代谢组学方法在肝移植患者围手术期肝功能评价中的应用。方法肝移植患者15例,分别于术前1d、术后1d及1周,空腹收集其血液,对丙氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、白蛋白、总胆红素、葡萄... 目的探讨基于核磁共振波谱技术的代谢组学方法在肝移植患者围手术期肝功能评价中的应用。方法肝移植患者15例,分别于术前1d、术后1d及1周,空腹收集其血液,对丙氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、白蛋白、总胆红素、葡萄糖、甘油三酯、胆固醇以及乳酸等血浆生化指标进行检查,同时测定其核磁共振氢谱,进行代谢组学分析。结果代谢组学分析显示,与术前相比,术后1d患者血浆中的血糖和乳酸水平显著升高,缬氨酸、丙氨酸、丙酮、琥珀酸、谷氨酰胺、胆碱含量亦显著升高;至术后1周,血脂和胆碱水平显著升高,血糖和氨基酸类代谢物含量显著降低。主成分分析显示,肝移植围手术期各时段血样的代谢谱图之间差异显著,并能够互相区分开来。造成组间差异的主要影响因素是血糖、血脂、胆碱、乳酸等物质含量的变化。其中血糖、血脂(包括甘油三酯和胆固醇)以及乳酸的变化规律与临床检测血浆生化的改变一致,但血液中胆碱的含量随着治疗进程出现显著的变化。结论代谢组学分析方法能较清晰地反映肝移植患者围手术期各时间段血浆样本间的代谢差异和变化,作为一种辅助手段,其在肝移植患者术后诊断中可能有良好的研究和应用前景。 展开更多
关键词 肝脏移植 代谢组学 核磁共振 模式识别
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异烟肼肝毒性的代谢组学特征研究 被引量:10
13
作者 廖艳 彭双清 +1 位作者 颜贤忠 张立实 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期288-292,共5页
目的:研究大鼠灌胃异烟肼后其尿液的代谢表型改变及其与组织病理学和血浆生化指标变化的相关性,探讨代谢组学在药物毒理学研究中的应用。方法:Wistar大鼠连续灌胃0,25,50,100,200和400 mg.kg-1异烟肼14 d后收集尿样,测定1H-NMR谱,并进... 目的:研究大鼠灌胃异烟肼后其尿液的代谢表型改变及其与组织病理学和血浆生化指标变化的相关性,探讨代谢组学在药物毒理学研究中的应用。方法:Wistar大鼠连续灌胃0,25,50,100,200和400 mg.kg-1异烟肼14 d后收集尿样,测定1H-NMR谱,并进行血浆生化指标测定和肝脏组织病理学检查。结果:常规毒理学评价方法发现大鼠在中、高剂量表现明显的肝毒性;给药组尿样1H-NMR谱2-氨基己二酸、葡萄糖和牛磺酸明显增加,2-酮戊二酸和柠檬酸明显降低。各剂量组的代谢产物谱变化与肝脏病理和血浆生化改变相一致,并且其敏感性优于常规毒理学检测指标。结论:大鼠尿液1H-NMR代谢产物谱与异烟肼毒性作用强度密切相关,异烟肼引起的肝毒性与线粒体功能受损及三羧酸循环中能量代谢异常有关,还与葡萄糖代谢紊乱有关。代谢组学分析在毒理学研究中有着广泛的应用前景。 展开更多
关键词 代谢组学 核磁共振(NMR) 模式识别 异烟肼 肝毒性
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模型毒物急性毒性尿液核磁共振氢谱标记物的二阶段聚类分析 被引量:7
14
作者 吴惠丰 张晓宇 +5 位作者 李晓晶 廖沛球 李伟生 李中峰 吴亦洁 裴奉奎 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期21-25,共5页
采用现代核磁共振技术,通过分析给药肝、肾损伤模型化合物异硫氰酸α-萘酯(灌胃150 mg/kg体重)和二溴乙胺氢溴酸盐(腹腔注射250 mg/kg体重)24 h内W istar大鼠尿液的1H NMR谱,由尿液中内源性代谢物浓度变化研究了肝、肾模型毒物在大鼠体... 采用现代核磁共振技术,通过分析给药肝、肾损伤模型化合物异硫氰酸α-萘酯(灌胃150 mg/kg体重)和二溴乙胺氢溴酸盐(腹腔注射250 mg/kg体重)24 h内W istar大鼠尿液的1H NMR谱,由尿液中内源性代谢物浓度变化研究了肝、肾模型毒物在大鼠体内的急性毒性。首次利用模式识别技术中的二阶段聚类分析方法解析大鼠尿液1H NMR谱确定了模型化合物尿液1H NMR标记物。结果表明,应用核磁共振和二阶段聚类分析相结合的方法,可提供模型化合物毒性比较清楚的认识。该方法也可用于金属化合物、中药及其它药物的毒性分类和预测研究以及建议各类靶向毒性的NMR标记物。 展开更多
关键词 尿液 核磁共振 毒性 模式识别 二阶段聚类分析
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给药硝酸钕后大鼠完整肝组织及肝组织提取物的NMR代谢组学研究 被引量:7
15
作者 廖沛球 魏来 +4 位作者 刘威 吴亦洁 李晓晶 倪嘉缵 裴奉奎 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1116-1120,共5页
通过分析不同给药剂量硝酸钕[Nd(NO3)3][2,10,50 mg/kg(体重)]后,雄性Wistar大鼠完整肝组织的MAS1HNMR谱和肝组织提取物的1HNMR谱,结合肝组织病理切片图,研究了稀土化合物Nd(NO3)3在大鼠体内的急性生物效应.利用模式识别方法对给药Nd(NO... 通过分析不同给药剂量硝酸钕[Nd(NO3)3][2,10,50 mg/kg(体重)]后,雄性Wistar大鼠完整肝组织的MAS1HNMR谱和肝组织提取物的1HNMR谱,结合肝组织病理切片图,研究了稀土化合物Nd(NO3)3在大鼠体内的急性生物效应.利用模式识别方法对给药Nd(NO3)3组和对照组大鼠肝组织1H NMR谱图数据进行了分析.结果表明,腹腔注射Nd(NO3)3后,大鼠肝脏中甘油三酯、亮氨酸(异亮氨酸)、乳酸、丙氨酸、丙酮酸、磷酸胆碱和葡萄糖含量升高,氮氧三甲胺含量降低.肝脏病理图显示,50 mg/kg(体重)组大鼠肝细胞可见微小坏死灶和门管区炎细胞轻度增多.推测硝酸钕能影响大鼠肝脏中能量代谢(糖代谢和脂肪代谢)和氨基酸代谢,对大鼠肝脏造成损伤,且其损伤程度随剂量的增加有增强趋势. 展开更多
关键词 核磁共振 代谢组学 模式识别 硝酸钕 生物效应
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给药硝酸镨后大鼠尿液和血清的核磁共振代谢组学研究 被引量:8
16
作者 廖沛球 薛蓉 +2 位作者 吴亦洁 裴奉奎 李晓晶 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1421-1428,共8页
采用基于核磁共振的代谢组学方法,分析了腹腔注射给药2,10和50 mg/kg体重剂量硝酸镨(Pr(NO3)3)168h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、琥珀酸、α-酮戊二酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳... 采用基于核磁共振的代谢组学方法,分析了腹腔注射给药2,10和50 mg/kg体重剂量硝酸镨(Pr(NO3)3)168h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、琥珀酸、α-酮戊二酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳酸、牛磺酸及葡萄糖等的浓度变化,并结合大鼠血清指标研究了轻稀土化合物Pr(NO3)3在大鼠体内的急性生物效应。结果表明,Pr(NO3)3急性毒性的靶向器官为肝脏和肾脏,但以肝脏为主,且呈现明显的剂量-反应关系。低、中剂量组的Pr(NO3)3会通过改变大鼠体内酶代谢而造成肝脏线粒体中的能量代谢(脂肪、糖代谢)紊乱;同时,Pr(NO3)3还会影响肾脏的正常功能,改变肾脏中渗透质的平衡,影响肾脏对氨基酸的重吸收和利用。 展开更多
关键词 硝酸镨 体液 核磁共振 生物效应 模式识别 代谢组学
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基于模式识别方法研究深静脉血栓形成大鼠尿液代谢物谱 被引量:9
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作者 曹洁 吕晓革 +4 位作者 李宇 靳茜茜 储晓云 王英元 孙俊红 《法医学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期228-232,共5页
目的采用代谢组学技术研究深静脉血栓形成(deep venous thrombosis,DVT)大鼠尿液中代谢物谱,筛选出可用于DVT诊断和法医学鉴定的小分子生物标志物。方法建立下腔静脉完全结扎DVT大鼠模型,分为模型组、假手术组和对照组,每组各10只。模... 目的采用代谢组学技术研究深静脉血栓形成(deep venous thrombosis,DVT)大鼠尿液中代谢物谱,筛选出可用于DVT诊断和法医学鉴定的小分子生物标志物。方法建立下腔静脉完全结扎DVT大鼠模型,分为模型组、假手术组和对照组,每组各10只。模型组和假手术组大鼠在建模后48 h于代谢笼中收集24 h尿液,同时对照组收集24 h尿液。核磁共振检测其代谢物谱,SIMCA-P 14.1软件进行模式识别,通过正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal PLS-DA,OPLS-DA)模型中的变量权重重要性排序(variable importance in projection,VIP)值结合Mann-Whitney U检验,寻找尿液中差异代谢物。结果模型组、假手术组和对照组大鼠尿液的代谢轮廓呈现显著性差异。通过偏最小二乘法-判别分析(partial least squares method-discriminant analysis,PLS-DA)模型可以有效判别模型组、假手术组与对照组。与对照组大鼠相比,DVT大鼠尿液中亮氨酸、谷氨酰胺、肌酸、肌酐和蔗糖水平上调,3-羟基丁酸、乳酸、丙酮、α-酮戊二酸、柠檬酸和马尿酸水平下调。结论 DVT大鼠尿液中的差异代谢物有望成为该疾病的候选生物标志物,该结果可为DVT的诊断、治疗和法医学鉴定提供研究基础。 展开更多
关键词 法医病理学 代谢组学 深静脉血栓形成 核磁共振 模式识别 大鼠 尿
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基于NMR的代谢组学方法对硝酸钕急性生物效应的研究 被引量:6
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作者 廖沛球 张晓宇 +5 位作者 魏来 李伟生 吴亦洁 李晓晶 倪嘉缵 裴奉奎 《分析化学》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第4期426-432,共7页
采用现代核磁共振和模式识别技术,分析了腹腔注射给药2、10和50mg/kg体重剂量硝酸钕48h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳酸、琥珀酸、牛磺酸及葡萄糖等物种... 采用现代核磁共振和模式识别技术,分析了腹腔注射给药2、10和50mg/kg体重剂量硝酸钕48h内Wistar大鼠尿液和血清的核磁共振氢谱。由尿液及血清中内源性代谢物如柠檬酸、肌酸酐、N-氧三甲胺、氨基酸、乳酸、琥珀酸、牛磺酸及葡萄糖等物种的浓度变化,结合大鼠血清指标和肝、肾组织切片图研究了轻稀土化合物Nd(NO3)3在大鼠体内的急性生物效应。结果表明,3个剂量的Nd(NO3)3主要对大鼠肝脏造成了不同程度的损伤,而且随着剂量的升高渐趋严重。同时,Nd(NO3)3也对肾脏的特定部位(肾乳头、肾小管)造成了损害。 展开更多
关键词 硝酸钕 体液 核磁共振 生物效应 模式识别 代谢组学
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当归对大鼠缺血性脑损伤代谢物的影响 被引量:8
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作者 陈文学 廖维靖 +6 位作者 刘华 白国允 岳勇 邓风 雷皓 刘买利 叶朝辉 《中国康复医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期879-882,共4页
目的:观察大鼠缺血性脑损伤对大、小脑波谱的影响以及当归对大鼠缺血性脑损伤代谢物质的变化。方法:18只雄性Wistar大鼠,体重150—200g,随机分成正常对照组(n=6)、缺血组(n=6)、当归治疗组(n=6)。采用大脑中动脉阻断法(middlecerebralar... 目的:观察大鼠缺血性脑损伤对大、小脑波谱的影响以及当归对大鼠缺血性脑损伤代谢物质的变化。方法:18只雄性Wistar大鼠,体重150—200g,随机分成正常对照组(n=6)、缺血组(n=6)、当归治疗组(n=6)。采用大脑中动脉阻断法(middlecerebralarteryocclusion,MCAO)制作大鼠急性脑缺血损伤模型,缺血3h后,恢复血供或当归治疗,采用离体高分辨魔角旋转波谱(1HHRMASNMR)技术检测,观察大、小脑波谱中胆碱(Cho)、肌酸(Cre)、N-乙酰天门冬氨酸(NAA)、γ-氨基丁酸(GABA)、谷氨酸(Glu)、天冬氨酸(Asp)、甘氨酸(Gly)等共振峰的变化。结果:除Cho,Glu,Asp升高,大鼠急性脑缺血时大多数代谢物含量均明显低于正常对照组,经当归治疗后其代谢物的含量会有所增加。结论:缺血严重影响大、小脑神经元的存活和物质代谢,当归对大鼠缺血性脑损伤具有明显的保护作用。 展开更多
关键词 核磁共振 魔角旋转 模式识别 脑缺血 当归
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代谢物组学的研究进展 被引量:5
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作者 王全军 吴纯启 廖明阳 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期776-780,共5页
代谢物组学是继基因组学和蛋白质组学发展起来的一门新的组学(-omics)技术,是研究药物毒理和基因功能的技术平台,通过分析生物的体液、组织中的内源性代谢产物谱的变化来研究整体的生物学状况和基因调节功能。代谢物组学所涉及的主要... 代谢物组学是继基因组学和蛋白质组学发展起来的一门新的组学(-omics)技术,是研究药物毒理和基因功能的技术平台,通过分析生物的体液、组织中的内源性代谢产物谱的变化来研究整体的生物学状况和基因调节功能。代谢物组学所涉及的主要技术为核磁共振技术和模式识别分析。对代谢物组学研究的样品、核心技术、分析方法和应用等几方面作简要概述。 展开更多
关键词 代谢物组学 研究进展 基因调节 体液 毒理 内源性 药物 核心技术 技术平台 发展
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