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掌叶覆盆子HMGR基因家族的鉴定及表达分析
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作者 陈俊宇 姚玲窕 +3 位作者 许张婷 吴淑婧 彭依晴 俞振明 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1024-1034,共11页
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是药用植物萜类产物骨架生物合成的重要酶之一。为了明确掌叶覆盆子HMGR蛋白的功能,使用生物信息学手段对RcHMGR家族成员的分类、基因结构、染色体定位、启动子信息等进行了系统分析,并比较了不同... 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是药用植物萜类产物骨架生物合成的重要酶之一。为了明确掌叶覆盆子HMGR蛋白的功能,使用生物信息学手段对RcHMGR家族成员的分类、基因结构、染色体定位、启动子信息等进行了系统分析,并比较了不同组织、果实不同成熟阶段及MeJA处理下RcHMGR基因的表达量。结果表明,RcHMGR基因家族共有7个成员,分布于3条染色体上,编码444~601 aa蛋白序列。RcHMGR蛋白分为4个亚家族,亚细胞定位于内质网,均含有HMGR保守功能域。RcHMGR家族基因的启动子上包含激素响应、光响应和低温响应等多种顺式元件。RcHMGR家族基因在掌叶覆盆子不同组织、果实不同成熟阶段和MeJA处理下的表达量均存在显著差异,其中RcHMGR5在果实中高丰度表达,并受到MeJA强烈诱导,与类胡萝卜素在掌叶覆盆子果实中的积累规律相一致,推测是类胡萝卜素合成途径的关键酶。上述结果为后续研究RcHMGR基因家族在萜类生物合成中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 掌叶覆盆子 hmgr 表达分析 MEJA 类胡萝卜素
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Aldo-keto reductase family member C3(AKR1C3)promotes hepatocellular carcinoma cell growth by producing prostaglandin F2α
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作者 KUO-SHYANG JENG PO-YU CHENG +5 位作者 YUEH-HSIEN LIN PO-CHUN LIU PING-HUI TSENG YU-CHAO WANG CHIUNG-FANG CHANG CHUEN-MIIN LEU 《Oncology Research》 SCIE 2024年第1期163-174,共12页
Hepatocellular carcinoma(HCC)is a leading cause of death worldwide.Current therapies are effective for HCC patients with early disease,but many patients suffer recurrence after surgery and have a poor response to chem... Hepatocellular carcinoma(HCC)is a leading cause of death worldwide.Current therapies are effective for HCC patients with early disease,but many patients suffer recurrence after surgery and have a poor response to chemotherapy.Therefore,new therapeutic targets are needed.We analyzed gene expression profiles between HCC tissues and normal adjacent tissues from public databases and found that the expression of genes involved in lipid metabolism was significantly different.The analysis showed that AKR1C3 was upregulated in tumors,and high AKR1C3 expression was associated with a poorer prognosis in HCC patients.In vitro,assays demonstrated that the knockdown of AKR1C3 or the addition of the AKR1C3 inhibitor indomethacin suppressed the growth and colony formation of HCC cell lines.Knockdown of AKR1C3 in Huh7 cells reduced tumor growth in vivo.To explore the mechanism,we performed pathway enrichment analysis,and the results linked the expression of AKR1C3 with prostaglandin F2 alpha(PGF2a)downstream target genes.Suppression of AKR1C3 activity reduced the production of PGF2a,and supplementation with PGF2a restored the growth of indomethacin-treated Huh7 cells.Knockdown of the PGF receptor(PTGFR)and treatment with a PTGFR inhibitor significantly reduced HCC growth.We showed that indomethacin potentiated the sensitivity of Huh7 cells to sorafenib.In summary,our results indicate that AKR1C3 upregulation may promote HCC growth by promoting the production of PGF2α,and suppression of PTGFR limited HCC growth.Therefore,targeting the AKR1C3-PGF2a-PTGFR axis may be a new strategy for the treatment of HCC. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma Aldo-keto reductase family member C3 Prostaglandin F2 alpha Prostaglandin F receptor
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Astragalin attenuates diabetic cataracts via inhibiting aldose reductase activity in rats
3
作者 Na Wang Deepika Singh Qiong Wu 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2023年第8期1186-1195,共10页
AIM:To investigate the aldose reductase(AR)inhibition capacity of astragalin(AST)against streptozoticin-induced diabetic cataracts(DCs)in rats.METHODS:Ex vivo investigations were conducted by treating the lens of a go... AIM:To investigate the aldose reductase(AR)inhibition capacity of astragalin(AST)against streptozoticin-induced diabetic cataracts(DCs)in rats.METHODS:Ex vivo investigations were conducted by treating the lens of a goat placed for 72h in artificial aqueous humor(AAH)of pH 7.8 at room temperature with cataract-causing substance(55 mmol/L of galactose)and in vivo studies were performed on rats via induction with streptozotocin.AST was administered at different dose levels and scrutinize for DC activity.RESULTS:In diabetic rats,AST improved the body weight,blood insulin,and glucose as well as the levels of galactitol in a dose-dependent way,other biochemical parameters i.e.inflammatory mediators and cytokines,and also suppress AR activity.The level of the antioxidant parameters such as superoxide dismutase(SOD),catalase(CAT),and glutathione(GSH)activity were also altered on a diabetic lens after the administration of the AST.CONCLUSION:AST protects against lens opacification to avoid cataracts and polyols formation,indicating that it could be used as a potential therapeutic agent for diabetes. 展开更多
关键词 ASTRAGALIN diabetic cataract LENS OPACIFICATION aldose reductase rats
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血必净注射液对心脏骤停/心肺复苏后大鼠神经功能及生存情况的影响机制
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作者 黄德庆 高玉广 +5 位作者 张元侃 王政林 邓海霞 黄夏冰 庞延 吴林 《中国药房》 CAS 北大核心 2024年第6期653-658,共6页
目的基于S-亚硝基谷胱甘肽还原酶(GSNOR)/S-亚硝基谷胱甘肽(GSNO)途径探讨血必净注射液对大鼠心脏骤停(CA)/心肺复苏(CPR)后神经功能及生存情况影响的潜在机制。方法以室颤法建立CA/CPR大鼠模型,以假手术组大鼠为参照,采用高通量测序分... 目的基于S-亚硝基谷胱甘肽还原酶(GSNOR)/S-亚硝基谷胱甘肽(GSNO)途径探讨血必净注射液对大鼠心脏骤停(CA)/心肺复苏(CPR)后神经功能及生存情况影响的潜在机制。方法以室颤法建立CA/CPR大鼠模型,以假手术组大鼠为参照,采用高通量测序分析挖掘两者差异表达基因,并结合酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测其海马组织中GSNOR、GSNO含量;筛选血必净注射液活性成分,并与GSNOR进行分子对接。将同法造模成功的大鼠分为模型组(30只)、抑制剂(GSNOR抑制剂)组(30只)、血必净组(30只)、血必净+抑制剂组(30只),并设置假手术组(30只),分别于药物首次干预后3h、24h、3d时进行神经功能评价及生存情况记录,并检测上述时间点各组大鼠海马组织中GSNOR、GSNO含量,分析GSNOR、GSNO含量与大鼠改良的神经系统损害严重程度评分表(mNSS)评分的相关性。结果GSNOR编码基因是模型组与假手术组间的差异表达基因之一;与假手术组比较,模型组大鼠海马组织中GSNOR含量显著升高,而GSNO含量显著降低(P<0.05)。血必净注射液中去甲丹参酮、鼠尾草酚酮等活性成分与GSNOR蛋白的结合能均低于-6 kcal/mol,以氢键连接为主。动物实验结果显示,模型组大鼠各时间点的mNSS评分和海马组织中GSNOR含量均显著高于假手术组(P<0.05),生存率和GSNO含量均显著低于假手术组(P<0.05);各给药组大鼠上述指标均显著改善,且血必净组mNSS评分显著低于抑制剂组,抑制剂组GSNOR、GSNO含量的变化较血必净组更明显,血必净+抑制剂组各指标均显著优于血必净组和抑制剂组(P<0.05)。GSNOR含量与mNSS评分呈正相关,GSNO含量与mNSS评分呈负相关(P<0.05)。结论血必净注射液可以改善CA/CPR后大鼠的神经功能,提高其生存率,该作用可能与下调GSNOR并上调GSNO有关。 展开更多
关键词 血必净注射液 心脏骤停 心肺复苏 S-亚硝基谷胱甘肽 S-亚硝基谷胱甘肽还原酶
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高粱种质资源成熟期氮效率评价及筛选
5
作者 李丹 曲匡正 +2 位作者 陆晓春 丛玲 朱振兴 《辽宁农业科学》 2024年第2期83-85,共3页
氮素作为影响作物生长发育的重要元素,是限制作物高产的重要限制因素之一。硝酸还原酶(Nitrate Reductase,简称NR)作为高等植物氮素吸收利用的限速酶,直接调节氮代谢。因此,叶片硝酸还原酶活性作为影响高粱产量的重要生理指标被用于评... 氮素作为影响作物生长发育的重要元素,是限制作物高产的重要限制因素之一。硝酸还原酶(Nitrate Reductase,简称NR)作为高等植物氮素吸收利用的限速酶,直接调节氮代谢。因此,叶片硝酸还原酶活性作为影响高粱产量的重要生理指标被用于评价氮素吸收、利用效率。本研究选取了97份不同来源的高粱材料,通过对97份高粱材料进行成熟期倒二叶和倒三叶的硝酸还原酶活性测定,为筛选高粱氮高效材料奠定基础。 展开更多
关键词 高粱 硝酸还原酶 筛选
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血清成纤维细胞生长因子-21、亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与妊娠期亚临床甲状腺功能减退症的相关性
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作者 赵云虹 侯临平 +1 位作者 李盛华 杨俊英 《中国医药导报》 CAS 2024年第15期88-91,共4页
目的 探究血清成纤维细胞生长因子-21(FGF-21)、亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与妊娠期亚临床甲状腺功能减退症(SCH)的相关性。方法 选取2022年7月至2023年7月山西省临汾市人民医院收诊的妊娠期SCH患者106例为SCH组,另选取院... 目的 探究血清成纤维细胞生长因子-21(FGF-21)、亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与妊娠期亚临床甲状腺功能减退症(SCH)的相关性。方法 选取2022年7月至2023年7月山西省临汾市人民医院收诊的妊娠期SCH患者106例为SCH组,另选取院内同期孕检的健康妊娠期女性106例为健康组。收集两组病历资料,筛查SCH的相关因素,分析血清FGF-21、MTHFR基因多态性对SCH发生的评估效能。结果 SCH组的空腹血糖、血清促甲状腺素(TSH)、FGF-21高于健康组(P<0.05);两组CC、CT、TT基因型分布频率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。SCH组T等位基因分布频率高于健康组(P<0.05)。多因素分析结果显示,血清FGF-21(OR=3.330,95%CI:1.138~9.743)、MTHFR基因多态性(OR=4.104,95%CI:1.403~12.008)是SCH发生的影响因素(P<0.05)。血清FGF-21、MTHFR基因多态性单一及联合诊断SCH发生的受试者操作特征曲线下面积分别为0.738、0.670、0.851。结论 血清FGF-21水平升高、MTHFR基因TT基因型的妊娠期女性SCH发生风险更高,两项联合具有一定的诊断价值。 展开更多
关键词 亚临床甲状腺功能减退症 成纤维细胞生长因子 亚甲基四氢叶酸还原酶
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MTHFR基因多态性对脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后出血性转化的影响
7
作者 陆景红 王训 《中国现代医学杂志》 CAS 2024年第4期66-71,共6页
目的分析亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性对脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后出血性转化(HT)的影响。方法回顾性分析2020年7月—2023年7月在安徽医科大学附属阜阳人民医院接受治疗的120例脑梗死患者的临床资料。依据治疗后24~72 h H... 目的分析亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性对脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后出血性转化(HT)的影响。方法回顾性分析2020年7月—2023年7月在安徽医科大学附属阜阳人民医院接受治疗的120例脑梗死患者的临床资料。依据治疗后24~72 h HT发生情况分为HT组(15例)、无HT组(105例)。比较两组基线资料、MTHFR基因多态性、纤维蛋白原(Fib)、同型半胱氨酸(Hcy)。采用多因素一般Logistic回归模型分析脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后HT发生的危险因素。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析入院时美国国立卫生院卒中量表(NIHSS)评分、Hcy预测脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后HT发生的价值。结果HT组心房颤动发生率、MTHFR基因型677CT占比、入院时NIHSS评分、Hcy水平均高于无HT组(P<0.05)。多因素一般Logistic回归分析结果显示:心房颤动史[OR=1.478(95%CI:1.126,1.940)]、入院时NIHSS评分升高[OR=1.656(95%CI:1.125,2.438)]、MTHFR基因型为677CT[OR=1.871/2.362(95%CI:1.052,3.328/1.081,4.652)]、Hcy水平升高[OR=2.149(95%CI:1.108,4.168)]均为脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后HT发生的危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,入院时NIHSS评分、Hcy均可预测脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后HT发生,其敏感性分别为80.0%(95%CI:0.765,0.883)、73.3%(95%CI:0.717,0.834),特异性分别为74.3%(95%CI:0.659,0.817)、74.3%(95%CI:0.824,0.931)。677CT型患者Hcy水平高于677CC、677TT型患者(P<0.05)。结论心房颤动、MTHFR基因型、入院时NIHSS评分、Hcy均为影响脑梗死患者阿替普酶静脉溶栓后HT发生的重要因素,临床应结合以上指标对高危患者进行重点筛查,尽早采取干预措施。 展开更多
关键词 脑梗死 基因多态性 亚甲基四氢叶酸还原酶 阿替普酶 出血性转化
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DHCR7基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系
8
作者 王业忠 杨明华 +1 位作者 曹少锋 梅璐 《河南医学研究》 CAS 2024年第7期1153-1159,共7页
目的探究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系。方法使用UALCAN、TIMER数据库分析DHCR7基因在不同类型肿瘤中的表达情况。使用GEPIA、TCGA、GEO数据库分析DHCR7基因在胃癌中的表达。Kaplan-Meier Plot... 目的探究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)基因在胃癌中的表达及其与免疫相关基因的关系。方法使用UALCAN、TIMER数据库分析DHCR7基因在不同类型肿瘤中的表达情况。使用GEPIA、TCGA、GEO数据库分析DHCR7基因在胃癌中的表达。Kaplan-Meier Plotter数据库分析DHCR7基因表达与胃癌患者预后的相关性。通过cBioPortal数据库找出与DHCR7共表达的基因,并展示这些基因中相关系数比较高的基因。对胃癌中与DHCR7表达正负相关的基因进行基因本体分析(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,首先分析DHCR7基因与CD8^(+)T细胞以及招募CD8^(+)T细胞相关趋化因子的相关性;其次分析DHCR7基因与免疫激活相关基因的相关性;最后分析DHCR7表达与胃癌患者临床病理学特征的关联。结果DHCR7基因在大多数肿瘤类型中均有高表达趋势。DHCR7基因在胃癌中的表达高于正常胃黏膜。Kaplan-Meier Plotter数据库中201790-s-at芯片结果显示高表达DHCR7组患者生存期较短。与DHCR7负相关基因的GO、KEGG通路富集分析主要富集在免疫相关功能和信号通路上,DHCR7与CD8^(+)T细胞、招募CD8^(+)T细胞相关的趋化因子以及免疫激活基因都具有负相关性。DHCR7高表达与胃癌患者年龄呈正相关。结论DHCR7在胃癌组织中呈高表达,高表达DHCR7患者预后不良,DHCR7基因能够影响胃癌免疫微环境,有望成为胃癌免疫治疗的新靶点。 展开更多
关键词 7-脱氢胆固醇还原酶 胃癌 TCGA GEO 免疫 CD8^(+)T细胞
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雷公藤hmgr基因克隆、序列分析及诱导表达 被引量:11
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作者 武莹 李威 +2 位作者 祝传书 王永宏 张兴 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2012年第11期103-111,共9页
【目的】克隆雷公藤萜类生物合成途径限速酶HMGR的编码基因,并分析雷公藤叶悬浮细胞中该基因在不同质量浓度壳寡糖诱导下的表达水平,为雷公藤萜类生物碱的生物合成提供理论依据。【方法】根据GenBank中报道的限速酶HMGR的编码基因序列... 【目的】克隆雷公藤萜类生物合成途径限速酶HMGR的编码基因,并分析雷公藤叶悬浮细胞中该基因在不同质量浓度壳寡糖诱导下的表达水平,为雷公藤萜类生物碱的生物合成提供理论依据。【方法】根据GenBank中报道的限速酶HMGR的编码基因序列合成简并引物,采用RT-PCR、5′-RACE和3′-RACE方法从雷公藤叶片中获得hmgr基因的cDNA全长序列;用生物信息学方法对限速酶HMGR进行蛋白结构及功能分析;用半定量RT-PCR方法比较hmgr基因在不同质量浓度壳寡糖诱导下的表达差异;用HPLC分析不同质量浓度壳寡糖诱导下雷公藤叶悬浮细胞中3种萜类次生代谢物(内酯醇、吉碱和次碱)的含量。【结果】获得了雷公藤中编码限速酶HMGR的基因全长cDNA序列,该序列开放阅读框长为1 860bp,编码579个氨基酸。生物信息学分析表明,雷公藤hmgr基因编码的蛋白分子质量为61.678ku,等电点为6.98,蛋白质稳定性参数为41.33,为不稳定蛋白质,氨基酸序列包含2个与NADPH结合的位点(DAMGMNM和VGTVGGGT)及2个与HMG-CoA结合的位点(EMPVGYVQIP和TTEG-CLVA)。半定量RT-PCR结果表明,经50mg/L壳寡糖诱导12h的雷公藤叶悬浮细胞中hmgr基因表达最强,且在该诱导条件下细胞中的内酯醇、吉碱和次碱的含量也有不同程度的提高。【结论】雷公藤HMGR蛋白可能为甲羟戊酸(MVA)途径中的限速酶,编码该蛋白的hmgr基因可促进雷公藤萜类物质的合成。 展开更多
关键词 雷公藤 hmgr RACE 壳寡糖
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橡胶草HMGR基因的克隆及表达分析 被引量:18
10
作者 王启超 刘实忠 校现周 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期61-68,共8页
通过比较9种植物的9条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)氨基酸同源区域,设计简并引物,利用RT-PCR和RACE技术首次从橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)中克隆了一个HMGR基因,命名为TKHMGR。通过氨基酸序列同源性比... 通过比较9种植物的9条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)氨基酸同源区域,设计简并引物,利用RT-PCR和RACE技术首次从橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)中克隆了一个HMGR基因,命名为TKHMGR。通过氨基酸序列同源性比对与系统进化分析表明,TKHMGR属于HMGR基因家族的新成员。同时,利用荧光定量方法分析了该基因在不同组织的表达情况。 展开更多
关键词 橡胶草 hmgr 基因克隆 序列分析 荧光定量
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人参HMGR基因的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 郜玉钢 杨鹤 +4 位作者 于英 臧埔 李璠瑛 刘霞 张连学 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期500-504,共5页
以人参根RNA为模板,根据其他植物HMGR基因序列保守区设计特异性简并引物,进行RT-PCR扩增。纯化回收HMGR基因RT-PCR产物与pMD18-T载体连接,再转化到JM109大肠杆菌中进行克隆,对阳性克隆菌重组质粒进行测序和序列分析。结果表明:人参HMGR... 以人参根RNA为模板,根据其他植物HMGR基因序列保守区设计特异性简并引物,进行RT-PCR扩增。纯化回收HMGR基因RT-PCR产物与pMD18-T载体连接,再转化到JM109大肠杆菌中进行克隆,对阳性克隆菌重组质粒进行测序和序列分析。结果表明:人参HMGR核心片段的大小为458bp,与其他植物核苷酸序列有较高的同源性,依次为杜仲86.1%、南京椴83.8%、长春花83.2%、马铃薯82.5%、苹果82.1%、景烈白兰81.6%、肾叶橐吾81.6%、南苍术81.0%、红豆杉80.4%、水稻80.3%。 展开更多
关键词 人参 生物合成 hmgr 克隆
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刺五加HMGR基因的克隆与表达分析 被引量:7
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作者 邢朝斌 吴鹏 +2 位作者 龙月红 何闪 修乐山 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第6期1258-1262,共5页
根据已报道的人参HMGR(3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶)基因cDNA序列设计引物,利用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆刺五加HMGR基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析。通过RT-PCR法... 根据已报道的人参HMGR(3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶)基因cDNA序列设计引物,利用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆刺五加HMGR基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析。通过RT-PCR法检测HMGR在刺五加不同生长发育时期和不同器官中的表达情况。结果克隆到长度为2 217 bp的刺五加HMGR基因cDNA序列,开放阅读框全长1 713 bp,编码570个氨基酸残基,包含HMGR家族的特异性识别序列。HMGR蛋白存在2个跨膜区域。RT-PCR结果显示,刺五加HMGR基因在各生长发育时期和器官中均有表达,但表达量具有显著差异,其中萌芽期的表达量最高,盛花期最低;各器官中,幼茎中表达量最高,是根中的1.58倍。 展开更多
关键词 刺五加 hmgr基因 克隆 RT-PCR 表达
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简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆 被引量:16
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作者 夏瑞 陆旺金 +1 位作者 李建国 杜娟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期903-906,共4页
主要介绍了利用NCBI、DDBJ、Blockmaker、CodeHop和Oligo6.0等数据库和生物软件进行简并引物设计的方法。利用设计的6对简并引物进行RT-PCR,从荔枝(LitchichinensisSonn.)果实中克隆到2个长度分别为510bp和582bp的cDNA片段。通过Blastx... 主要介绍了利用NCBI、DDBJ、Blockmaker、CodeHop和Oligo6.0等数据库和生物软件进行简并引物设计的方法。利用设计的6对简并引物进行RT-PCR,从荔枝(LitchichinensisSonn.)果实中克隆到2个长度分别为510bp和582bp的cDNA片段。通过Blastx检索Genbank进行同源性比对后,发现2片段都与其它植物的HMGR基因具有较高的氨基酸序列同源性。研究表明,该程序化设计的简并引物可信性强,阳性率高,能迅速得到满意结果。 展开更多
关键词 荔枝 间并引物 程序化设计 hmgr基因 克隆
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马铃薯HMGR基因的克隆、序列分析及其表达特征 被引量:12
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作者 陈大华 叶和春 +1 位作者 李国凤 刘彦 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2000年第7期724-727,共4页
采用RT_PCR技术 ,从马铃薯 (SolanumtuberosumL .)幼叶中克隆了一个约 1.0kb的cDNA片段 ,序列分析结果表明 ,该cDNA与已报道的马铃薯HMGR基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性 ,与HMGRⅠ基因同源性为 77.0 % ,HMGRⅡ基因为 93.... 采用RT_PCR技术 ,从马铃薯 (SolanumtuberosumL .)幼叶中克隆了一个约 1.0kb的cDNA片段 ,序列分析结果表明 ,该cDNA与已报道的马铃薯HMGR基因家族的三种类型基因具有较高核酸序列同源性 ,与HMGRⅠ基因同源性为 77.0 % ,HMGRⅡ基因为 93.2 % ,HMGRⅢ基因为 77.1%。其中 3′端非翻译区序列与HMGRⅠ、HMGRⅡ、HMGRⅢ三种基因同源性分别为 5 0 .2 %、80 .3%和 5 0 .7% ,因此推测该cDNA片段为HMGR基因家族中HMGRⅡ亚基因家族新发现的成员之一 ,命名为HMGR_c2。以特异探针进行的Southern杂交结果初步证明 ,HMGR_c2基因至少以两个以上拷贝形式存在于马铃薯基因组中 ;Northern杂交分析表明 ,HMGR_c2基因的全长mRNA约为 2 .0kb。定量RT_PCR分析表明 ,HMGR_c2基因在根、茎、叶等组织中均有表达 ,且在叶片表达量最高 ,约为根、茎的两倍。 展开更多
关键词 马铃薯 hmgr基因 序列分析 表达 类异戊二烯代谢
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秦艽HMGR基因家族的克隆及序列分析 被引量:8
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作者 郑鹏 化文平 王喆之 《陕西师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期67-72,共6页
研究克隆了秦艽3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)家族成员的两条基因,并对其序列进行了生物信息学分析.结果显示,两条HMGR基因都包含完整的开放读码(ORF)框,编码蛋白含有HMGR蛋白特有的4个保守的活性位点,与其他植物HMGR蛋白序列... 研究克隆了秦艽3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)家族成员的两条基因,并对其序列进行了生物信息学分析.结果显示,两条HMGR基因都包含完整的开放读码(ORF)框,编码蛋白含有HMGR蛋白特有的4个保守的活性位点,与其他植物HMGR蛋白序列具有较高的一致性,都具有跨膜结构域,高级结构类同;GmHMGR1和GmHMGR2分别定位于细胞质膜和线粒体中.表达分析显示,GmHMGR1主要在根和花中表达,而GmHMGR2主要在叶中表达. 展开更多
关键词 秦艽 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(hmgr) 高通量测序 序列分析
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添加α-亚麻酸对产蛋鸡内分泌激素和肝脏HMGR的影响 被引量:6
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作者 李志琼 陈代文 张克英 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期588-592,共5页
本试验旨在探讨日粮中添加4.0%α-亚麻酸(ALA)对罗曼粉壳蛋鸡脂质代谢的影响。采用单因素试验设计,设基础日粮(不添加ALA,对照组)和添加4.0%ALA两个处理,每个处理组设5个重复,每个重复10只24周龄罗曼粉壳蛋鸡。试验期28 d。结果表明,与... 本试验旨在探讨日粮中添加4.0%α-亚麻酸(ALA)对罗曼粉壳蛋鸡脂质代谢的影响。采用单因素试验设计,设基础日粮(不添加ALA,对照组)和添加4.0%ALA两个处理,每个处理组设5个重复,每个重复10只24周龄罗曼粉壳蛋鸡。试验期28 d。结果表明,与对照组相比,添加4.0%ALA的处理组蛋鸡血清胰岛素增加极显著(P<0.01),雌二醇第2周增加显著(P<0.05);肝脏HMGR酶活显著下降(P<0.05),HMGR mRNA表达丰度下降(P>0.05),甘油三酯(TG)极显著下降(P<0.01)。本研究表明,添加4.0%ALA可通过改变内分泌激素、肝脏HMGR酶活、基因表达和TG来调节产蛋鸡的胆固醇代谢。 展开更多
关键词 Α-亚麻酸 产蛋鸡 hmgr 胰岛素 雌二醇
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甜瓜HMGR基因全长cDNA的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 郝金凤 李彤彤 +2 位作者 郭艳琼 高峰 哈斯阿古拉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期106-109,115,共5页
根据已报道的reticulatus甜瓜的HMGR cDNA序列设计合成引物,应用RT-PCR技术从甜瓜品种河套蜜瓜幼果总RNA中克隆得到HMGR的全长cDNA序列,共1 939 bp,编码588个氨基酸。序列比对及系统发育分析表明,该HMGR cD-NA序列与已报道的reticulatu... 根据已报道的reticulatus甜瓜的HMGR cDNA序列设计合成引物,应用RT-PCR技术从甜瓜品种河套蜜瓜幼果总RNA中克隆得到HMGR的全长cDNA序列,共1 939 bp,编码588个氨基酸。序列比对及系统发育分析表明,该HMGR cD-NA序列与已报道的reticulatus甜瓜HMGR基因cDNA序列完全一致,和拟南芥HMG1亲缘关系最近。该基因的克隆为研究该基因在甜瓜中的表达特性及其功能奠定基础。 展开更多
关键词 甜瓜 hmgr基因 CDNA RT-PCR
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尾巨桉HMGR基因的克隆及表达分析 被引量:6
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作者 蒋春 张华玲 彭江 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期113-117,共5页
基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(EuHMGR)基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框(ORF),编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP(H)结合基序;同源建模得到EuHMGR三维... 基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(EuHMGR)基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框(ORF),编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP(H)结合基序;同源建模得到EuHMGR三维构象呈"V"型,包含N-结构域、S-结构域和L-结构域。将EuHMGR组DNA与cDNA序列进行比对表明EuHMGR存在一个319bp的内含子。通过实时定量PCR进行组织特异性表达分析表明EuHMGR在茎中的表达量最高,叶次之,在根中基本无表达。该研究为后续尾巨桉EuHMGR的功能验证以及遗传转化奠定基础。 展开更多
关键词 尾巨桉 hmgr 生物信息学 内含子 组织特异性表达
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大戟甲羟戊酸途径关键酶基因hmgr的克隆与分析 被引量:11
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作者 曹小迎 蒋继宏 +2 位作者 刘群 戴传超 陈凤美 《武汉植物学研究》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期123-126,共4页
通过比较6种植物8条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因同源区域,设计简并引物,利用RT-PCR技术成功地从大戟(Euphorbia pekinensis)叶中扩增出458bp的基因片段。通过BlastP比较,所推断的大戟HMGR蛋白序列与杜... 通过比较6种植物8条甲羟戊酸途径关键酶3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因同源区域,设计简并引物,利用RT-PCR技术成功地从大戟(Euphorbia pekinensis)叶中扩增出458bp的基因片段。通过BlastP比较,所推断的大戟HMGR蛋白序列与杜仲Eucommia ulmoides(AAV54051)、穿心莲Andrographis paniculata(AAP14352)、胡黄连Picrorhiza kurrooa(ABC74565)、橡胶树Hevea brasiliensis(AAU08214)、海岛棉Gossypium barba-dense(ABC71314)、龙胆草Gentiana lutea(BAE92730)的一致性分别达到90%、86%、86%、92%、87%和88%。蛋白质保守区、特征区以及进化树分析,初步证实该基因为hmgr基因,这是首次报道从药用植物大戟中克隆到甲羟戊酸途径关键酶HMGR的基因片段。 展开更多
关键词 大戟 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶 基因克隆
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不同花色甘草种质的质量分析及其HMGR基因特征研究 被引量:3
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作者 马春英 梁虹 王文全 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期28-32,共5页
在甘草群体中发现了不同花色的甘草种质,将其定义为白花类型和紫花萼类型。利用HPLC方法对不同花色种质进行了药用活性成分含量测定,发现白花和紫花萼类型的甘草酸、甘草苷和异甘草素含量均高于普通花色类型。对白花类型和紫花萼类型的... 在甘草群体中发现了不同花色的甘草种质,将其定义为白花类型和紫花萼类型。利用HPLC方法对不同花色种质进行了药用活性成分含量测定,发现白花和紫花萼类型的甘草酸、甘草苷和异甘草素含量均高于普通花色类型。对白花类型和紫花萼类型的两个甘草酸含量不同植株的HMGR基因特征分析结果表明,两者在HMGR部分DNA水平上存在碱基差异。 展开更多
关键词 甘草 种质 质量分析 hmgr 基因特征
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