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Modelling of an hydraulic excavator using simplifiedrefined instrumental variable(SRIV)algorithm 被引量:6
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作者 Jun GU James TAYLOR Derek SEWARD 《控制理论与应用(英文版)》 EI 2007年第4期391-396,共6页
Instead of establishing mathematical hydraulic system models from physical laws usually done with the problems of complex modelling processes, low reliability and practicality caused by large uncertainties, a novel mo... Instead of establishing mathematical hydraulic system models from physical laws usually done with the problems of complex modelling processes, low reliability and practicality caused by large uncertainties, a novel modelling method for a highly nonlinear system of a hydraulic excavator is presented. Based on the data collected in the excavator's arms driving experiments, a data-based excavator dynamic model using Simplified Refined Instrumental Variable (SRIV) identification and estimation algorithms is established. The validity of the proposed data-based model is indirectly demonstrated by the performance of computer simulation and the.real machine motion control exoeriments. 展开更多
关键词 Hydraulic excavator Nonlinear dynamics Data based model Simplified refined instrumental variable algorithm
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An Adaptive Nonhydrostatic Atmospheric Dynamical Core Using a Multi-Moment Constrained Finite Volume Method
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作者 Pei HUANG Chungang CHEN +2 位作者 Xingliang LI Xueshun SHEN Feng XIAO 《Advances in Atmospheric Sciences》 SCIE CAS CSCD 2022年第3期487-501,共15页
An adaptive 2 D nonhydrostatic dynamical core is proposed by using the multi-moment constrained finite-volume(MCV) scheme and the Berger-Oliger adaptive mesh refinement(AMR) algorithm. The MCV scheme takes several poi... An adaptive 2 D nonhydrostatic dynamical core is proposed by using the multi-moment constrained finite-volume(MCV) scheme and the Berger-Oliger adaptive mesh refinement(AMR) algorithm. The MCV scheme takes several pointwise values within each computational cell as the predicted variables to build high-order schemes based on single-cell reconstruction. Two types of moments, such as the volume-integrated average(VIA) and point value(PV), are defined as constraint conditions to derive the updating formulations of the unknowns, and the constraint condition on VIA guarantees the rigorous conservation of the proposed model. In this study, the MCV scheme is implemented on a height-based, terrainfollowing grid with variable resolution to solve the nonhydrostatic governing equations of atmospheric dynamics. The AMR grid of Berger-Oliger consists of several groups of blocks with different resolutions, where the MCV model developed on a fixed structured mesh can be used directly. Numerical formulations are designed to implement the coarsefine interpolation and the flux correction for properly exchanging the solution information among different blocks. Widely used benchmark tests are carried out to evaluate the proposed model. The numerical experiments on uniform and AMR grids indicate that the adaptive model has promising potential for improving computational efficiency without losing accuracy. 展开更多
关键词 adaptive mesh refinement multi-moment constrained finite-volume method nonhydrostatic model dynamical core high-order methods
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履带式特种车辆精细化动力学建模与仿真 被引量:1
3
作者 吴锐 于会龙 +1 位作者 董昊天 席军强 《兵工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1384-1401,共18页
履带车辆动力学模型是车辆结构优化设计与控制算法开发、测试与标定的基础。基于商业软件所搭建模型的动力学方程及梯度信息对用户未知,极大地限制了结构参数与控制参数的优化效率。此外,现有商业软件求解效率低、实时性差,影响了控制... 履带车辆动力学模型是车辆结构优化设计与控制算法开发、测试与标定的基础。基于商业软件所搭建模型的动力学方程及梯度信息对用户未知,极大地限制了结构参数与控制参数的优化效率。此外,现有商业软件求解效率低、实时性差,影响了控制算法开发进度。针对上述问题,基于多体动力学推导建立可同时满足纵横垂耦合运动仿真需求的履带车辆精细化动力学模型并进行仿真。建立考虑空间三维耦合运动的车体动力学模型以及精细到履带板的履带链动力学模型。通过计算履带板与各部件相互作用力,将车体模型、履带链模型以及地面相关联,最终构建190自由度的履带车辆动力学模型。在加速、刹车与转向等工况下与ATV(ADAMS Tracked Vehicle Toolkit)进行对比,结果表明自主开发的仿真模型纵横垂向运动仿真结果与商业软件高度一致,验证了新方法的准确性。 展开更多
关键词 履带车辆 多体动力学 精细化建模 履带链模型 动力学建模仿真
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New perspective in statistical modeling of wall-bounded turbulence 被引量:13
4
作者 Zhen-Su She Xi Chen +1 位作者 You Wu Fazle Hussain 《Acta Mechanica Sinica》 SCIE EI CAS CSCD 2010年第6期847-861,共15页
Despite dedicated effort for many decades,statistical description of highly technologically important wall turbulence remains a great challenge.Current models are unfortunately incomplete,or empirical,or qualitative.A... Despite dedicated effort for many decades,statistical description of highly technologically important wall turbulence remains a great challenge.Current models are unfortunately incomplete,or empirical,or qualitative.After a review of the existing theories of wall turbulence,we present a new framework,called the structure ensemble dynamics (SED),which aims at integrating the turbulence dynamics into a quantitative description of the mean flow.The SED theory naturally evolves from a statistical physics understanding of non-equilibrium open systems,such as fluid turbulence, for which mean quantities are intimately coupled with the fluctuation dynamics.Starting from the ensemble-averaged Navier-Stokes(EANS) equations,the theory postulates the existence of a finite number of statistical states yielding a multi-layer picture for wall turbulence.Then,it uses order functions(ratios of terms in the mean momentum as well as energy equations) to characterize the states and transitions between states.Application of the SED analysis to an incompressible channel flow and a compressible turbulent boundary layer shows that the order functions successfully reveal the multi-layer structure for wall-bounded turbulence, which arises as a quantitative extension of the traditional view in terms of sub-layer,buffer layer,log layer and wake. Furthermore,an idea of using a set of hyperbolic functions for modeling transitions between layers is proposed for a quantitative model of order functions across the entire flow domain.We conclude that the SED provides a theoretical framework for expressing the yet-unknown effects of fluctuation structures on the mean quantities,and offers new methods to analyze experimental and simulation data.Combined with asymptotic analysis,it also offers a way to evaluate convergence of simulations.The SED approach successfully describes the dynamics at both momentum and energy levels, in contrast with all prevalent approaches describing the mean velocity profile only.Moreover,the SED theoretical framework is general,independent of the flow system to study, while the actual functional form of the order functions may vary from flow to flow.We assert that as the knowledge of order functions is accumulated and as more flows are analyzed, new principles(such as hierarchy,symmetry,group invariance,etc.) governing the role of turbulent structures in the mean flow properties will be clarified and a viable theory of turbulence might emerge. 展开更多
关键词 Wall turbulence Statistical modeling Structure ensemble dynamics Order function multi-layer
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电磁悬浮型高速磁浮车-岔垂向动力响应
5
作者 曾国锋 韩紫平 +1 位作者 刘鸣博 朱志伟 《同济大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期303-313,共11页
从车辆构造特点出发,建立电磁悬浮(EMS)型高速磁浮车辆悬浮架、悬浮电磁铁链式结构动力学模型,并引入基于状态观测器的悬浮控制算法。结合反映道岔结构特征及动力特性的有限元模型,建立车-岔系统动力响应分析模型。仿真结果表明,所提出... 从车辆构造特点出发,建立电磁悬浮(EMS)型高速磁浮车辆悬浮架、悬浮电磁铁链式结构动力学模型,并引入基于状态观测器的悬浮控制算法。结合反映道岔结构特征及动力特性的有限元模型,建立车-岔系统动力响应分析模型。仿真结果表明,所提出精细化模型的数值模拟结果与实测数据较为接近。在此基础上,开展了单节和多节编组列车在静悬以及低速和高速通过道岔等多种工况下的仿真试验,分析了不同影响因素下高速磁浮车-岔系统振动特征。仿真和实测结果表明,明确车-岔-悬浮控制之间的参数匹配关系是揭示车-岔相互作用机理的前提和关键。 展开更多
关键词 电磁悬浮(EMS)型高速磁浮道岔 车-岔动力响应 精细化模型 悬浮控制 振动机理 仿真试验
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基于精细化建模的换热管涡激振动数值研究
6
作者 孙军帅 李旭鹏 +3 位作者 孙汝雷 温济铭 李小畅 田瑞峰 《哈尔滨工程大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2119-2127,共9页
为了研究换热管的涡激振动行为,本文基于大涡模拟方法建立了精细化流场计算模型。采用HHT-α方法求解结构动力学方程,结合局部动网格变形技术,得到了换热管涡激振动流固耦合计算模型。以雷诺数为3900的固定圆柱绕流算例和Jauvtis&Wi... 为了研究换热管的涡激振动行为,本文基于大涡模拟方法建立了精细化流场计算模型。采用HHT-α方法求解结构动力学方程,结合局部动网格变形技术,得到了换热管涡激振动流固耦合计算模型。以雷诺数为3900的固定圆柱绕流算例和Jauvtis&Williamson的经典涡激振动实验分别对流场计算模型和结构场计算模型进行了验证分析,并研究了不同约化流速下换热管的振动响应、运动轨迹、尾迹模式等。结果表明:建立的涡激振动计算模型可以准确地预测单根换热管的涡激振动行为。本文研究对建立换热管管束结构的流致振动计算模型具有借鉴意义。 展开更多
关键词 精细化建模 大涡模拟 圆柱绕流 局部动网格变形技术 流固耦合 流致振动 超级上端分支 锁频
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极低硫钢的精炼脱硫动力学模型 被引量:14
7
作者 李素芹 熊国宏 +3 位作者 李士琦 朱荣 王新华 陈原 《北京科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第3期244-246,共3页
通过对影响脱硫反应限制性环节的分析,将持续接触和瞬时接触两种反应模式综合考虑,建立了精炼脱硫动力学模型,并通过实验室“极低硫钢精炼脱硫”实验数据对模型进行验证.结果表明,本模型的预测结果与实验结果比较吻合.
关键词 精炼 脱硫 动力学 模型
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柔性工作流理论方法综述 被引量:24
8
作者 李竞杰 王维平 杨峰 《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2010年第8期1569-1577,共9页
分析了柔性工作流的内涵,把实现柔性工作流的理论方法分为动态选择、动态细化、动态偏离和动态变更。对每种方法的实现方式进行了深入探讨,并对各种方法的优缺点和适用领域进行了对比分析。指出目前存在的主要问题是工作流的运行机制僵... 分析了柔性工作流的内涵,把实现柔性工作流的理论方法分为动态选择、动态细化、动态偏离和动态变更。对每种方法的实现方式进行了深入探讨,并对各种方法的优缺点和适用领域进行了对比分析。指出目前存在的主要问题是工作流的运行机制僵化、模型包含的信息不足以及理论方法的功能不全面,而以数据为中心的流程建模与运行、柔性分布式工作流以及柔性与支持性相结合则分别是柔性工作流在理论方法、应用领域和实践应用三个方面的发展趋势。 展开更多
关键词 柔性工作流 动态选择 动态细化 动态偏离 动态变更 建模
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打浆过程控制的新进展 被引量:6
9
作者 汤伟 罗斌 +1 位作者 周红 王孟效 《中国造纸学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期122-129,共8页
全面介绍了打浆过程机理模型、打浆过程动态建模、成浆质量软测量技术、打浆过程在线检测仪表,以及打浆过程控制方案及算法的研究进展与应用现状,讨论了亟待解决的关键技术和对策,指出了努力方向及发展趋势。
关键词 打浆过程 动态建模 软测量 优化控制
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基于频率响应函数的动力学模型修正方法研究 被引量:14
10
作者 朱凼凼 冯咬齐 向树红 《中国工程科学》 2005年第8期89-94,共6页
概述了国内外动力学模型修正技术的研究状况,研究了近些年发展起来的基于频响函数的动力学模型修正方法;利用航天器振动试验测量所得的频响函数,从理论上介绍了频响函数残差法、设计参数型频响函数法和摄动型频响函数法三种基于频响函... 概述了国内外动力学模型修正技术的研究状况,研究了近些年发展起来的基于频响函数的动力学模型修正方法;利用航天器振动试验测量所得的频响函数,从理论上介绍了频响函数残差法、设计参数型频响函数法和摄动型频响函数法三种基于频响函数的动力学模型修正方法,为动力学模型修正技术的发展提供参考。 展开更多
关键词 航天器 动力学 频响函数 模型修正
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基于风场景识别的动态风电功率概率预测方法 被引量:5
11
作者 阎洁 刘永前 +2 位作者 张浩 张慧玲 冯双磊 《现代电力》 北大核心 2016年第2期51-58,共8页
传统风电功率预测是确定的、静态的、非条件性的,无法代表不同外部状态的发电过程,缺失预测误差的概率性信息。针对上述问题,提出了一种动态的基于风场景识别的风电功率概率预测方法。首先建立基于K-means的风场景识别模型,根据风速和... 传统风电功率预测是确定的、静态的、非条件性的,无法代表不同外部状态的发电过程,缺失预测误差的概率性信息。针对上述问题,提出了一种动态的基于风场景识别的风电功率概率预测方法。首先建立基于K-means的风场景识别模型,根据风速和风向识别自然风特征,据此划分风电场风况类别。然后针对各风况类别建立基于相关向量机的概率预测模型。在实际预测中,根据实时风况动态调整概率预测模型参数。以中国西北某风电场为例进行验证,结果表明,该方法提高了单点预测精度、概率预测可靠性和技术分数、运行效率,为预测细化建模提供新的解决思路。 展开更多
关键词 风场景 动态预测 风电场 概率预测 细化建模
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铜精炼阳极炉氧化过程炉膛烟气温度动态模型 被引量:9
12
作者 鄂加强 梅炽 +1 位作者 刘春洋 张卫华 《矿冶》 CAS 2004年第4期60-64,共5页
基于能量平衡原理,建立了铜精炼阳极炉氧化过程炉膛烟气温度变化动态响应模型。由此动态响应模型及其应用可知,当重油质量流量、助燃空气消耗系数、氧化空气质量流量扰动幅度均为其静态值的0 1倍时,重油质量流量扰动、助燃空气消耗系数... 基于能量平衡原理,建立了铜精炼阳极炉氧化过程炉膛烟气温度变化动态响应模型。由此动态响应模型及其应用可知,当重油质量流量、助燃空气消耗系数、氧化空气质量流量扰动幅度均为其静态值的0 1倍时,重油质量流量扰动、助燃空气消耗系数扰动对炉膛内烟气温度变化影响较大,而氧化空气质量流量扰动相对前二者来说,影响要小得多;且铜精炼氧化过程炉膛具有很大的热惯性,这直接导致炉膛烟气温度动态响应速度很慢、动态过程时间很长的现象出现。此动态模型有利于铜精炼阳极炉的在线优化控制。 展开更多
关键词 铜精炼阳极炉 动态模型 氧化过程 重油 烟气温度
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RH真空精炼过程的动态模拟 被引量:7
13
作者 黄宗泽 朱苗勇 许海虹 《材料与冶金学报》 CAS 2002年第3期189-194,共6页
建立了描述RH真空精炼装置内钢液动态脱碳 (脱气 )模型 .对RH真空精炼时的脱碳、脱氧、脱氮和脱氢过程进行了动态模拟研究 ,考察了浸渍管直径、循环流量、吹氩量、氧含量和真空度对脱碳和脱气过程的影响。动态脱碳 (脱气 )模型考虑了反... 建立了描述RH真空精炼装置内钢液动态脱碳 (脱气 )模型 .对RH真空精炼时的脱碳、脱氧、脱氮和脱氢过程进行了动态模拟研究 ,考察了浸渍管直径、循环流量、吹氩量、氧含量和真空度对脱碳和脱气过程的影响。动态脱碳 (脱气 )模型考虑了反应机理 ,认为脱碳是通过上升管中Ar气泡表面、真空室中钢液的自由表面和真空室钢液内部脱碳反应生成的CO气泡表面进行的 ,并且考虑了精炼处理时的抽真空制度 .该模型能全面描述RH精炼过程中不同时刻钢液中碳、氧、氮和氢的含量 ,能较好预测实际过程 ,可用于RH真空精炼过程的优化和新工艺开发 . 展开更多
关键词 RH真空精炼 循环流量 气液两相流 脱碳 脱气 动态模拟 炼钢
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基于FENAP平台的钢筋混凝土桥墩非线性动力分析 被引量:8
14
作者 禚一 李忠献 李宁 《天津大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第10期906-911,共6页
为精细模拟钢筋混凝土桥墩的非线性动力行为,基于钢筋混凝土纤维梁柱单元实用模拟分析平台FENAP,研究了结合纤维梁柱单元与有限元软件ABAQUS进行非线性动力分析的原理,推导了动力分析过程,并开发了FENAP平台的非线性动力分析模块.应用... 为精细模拟钢筋混凝土桥墩的非线性动力行为,基于钢筋混凝土纤维梁柱单元实用模拟分析平台FENAP,研究了结合纤维梁柱单元与有限元软件ABAQUS进行非线性动力分析的原理,推导了动力分析过程,并开发了FENAP平台的非线性动力分析模块.应用该模块分别模拟了钢筋混凝土桥墩在单向地震激励下的数值试验和钢筋混凝土桥墩在双向地震激励下的振动台试验.结果表明,基于FENAP平台所开发的非线性动力分析模块,可有效模拟钢筋混凝土桥墩的复杂非线性行为,可考虑双向弯矩和轴力的耦合作用,且求解精度和计算效率较高,为长大桥梁结构的地震灾变过程模拟提供了一种实用分析手段. 展开更多
关键词 钢筋混凝土 桥墩 精细化模型 纤维梁柱单元 非线性动力分析 模拟平台 双向地震激励
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一种基于知识树和约束的柔性活动动态细化方法 被引量:3
15
作者 蒋艳荣 李卫华 杨劲涛 《智能系统学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期158-165,共8页
柔性工作流在应对业务建模过程中的动态不确定因素、提高工作流系统的柔性具有巨大的优势,然而,柔性活动的动态细化一直是柔性工作流建模和应用的一个难点。因此,提出一种基于知识树和约束的柔性活动动态细化方法。该方法以知识树的包... 柔性工作流在应对业务建模过程中的动态不确定因素、提高工作流系统的柔性具有巨大的优势,然而,柔性活动的动态细化一直是柔性工作流建模和应用的一个难点。因此,提出一种基于知识树和约束的柔性活动动态细化方法。该方法以知识树的包含和泛化关系作为启发信息,以活动选取约束和时序约束作为指导和校验,实现柔性活动的动态细化。在介绍了知识树及其蕴含关系以及活动选取约束和时序约束规则的基础上,给出了柔性活动的动态细化算法,描述了活动选取校验和时序约束校验算法。最后给出了算法的实现和实例分析,其结果表明了所提方法的有效性,能够很好地解决柔性活动的细化问题。 展开更多
关键词 柔性工作流 动态细化 时序约束 工作流生成 过程建模
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铜精炼阳极炉还原过程炉膛烟气温度动态模型 被引量:5
16
作者 鄂加强 梅炽 +3 位作者 时章明 刘春洋 张卫华 陈羽年 《材料与冶金学报》 CAS 2004年第1期25-29,共5页
基于能量平衡原理,建立了铜精炼还原过程炉膛烟气温度动态模型.由此动态模型及应用可知,当液化气质量流量、助燃空气质量流量在其静态值上扰动幅度相等时,液化气质量流量扰动对炉膛内烟气温度变化影响较小,而助燃空气质量流量扰动相对... 基于能量平衡原理,建立了铜精炼还原过程炉膛烟气温度动态模型.由此动态模型及应用可知,当液化气质量流量、助燃空气质量流量在其静态值上扰动幅度相等时,液化气质量流量扰动对炉膛内烟气温度变化影响较小,而助燃空气质量流量扰动相对前者来说,影响要大得多.且铜精炼还原过程炉膛具有很大的热惯性,这直接导致炉膛烟气温度动态响应速度很慢,动态过程时间很长的现象出现.此动态模型有利于铜精炼阳极炉的在线优化控制. 展开更多
关键词 铜精炼阳极炉 动态模型 还原过程 液化气 烟气温度变化
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基于IRML的油气加工系统多层次故障传播模型研究 被引量:6
17
作者 马曦 张来斌 +1 位作者 胡瑾秋 蔡战胜 《石油学报(石油加工)》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1193-1202,共10页
大多数油气加工生产事故是由于系统中相互关联的设备或子系统发生连锁失效而导致,设备或子系统的相互作用关系使故障传播行为呈现复杂性且强非线性的特征,故此,采用基于系统弹性分析建模语言(IRML)的多层次故障传播模型对石油加工复杂... 大多数油气加工生产事故是由于系统中相互关联的设备或子系统发生连锁失效而导致,设备或子系统的相互作用关系使故障传播行为呈现复杂性且强非线性的特征,故此,采用基于系统弹性分析建模语言(IRML)的多层次故障传播模型对石油加工复杂系统故障行为特征进行定性、定量分析。该模型分为静态分析模块和动态分析模块,前者静态分析故障传播结构特征,后者通过故障情景模拟动态分析故障演化机理。通过案例分析,建立了常减压蒸馏系统的多层次故障传播模型,分析该系统故障传播行为的静态特征和动态特征。结果表明,多层次故障传播模型适用于油气加工系统复杂且强非线性的故障行为建模,建模参数可表示复杂系统的结构特征和故障传播行为模式,可进一步用于油气加工系统中故障传播趋势预测、故障溯源和柔性诊断等方面的研究。 展开更多
关键词 油气加工系统 多层次故障传播模型 静态分析模块 动态分析模块 故障传播行为 故障演化
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基于系统动力学的公立医院精细化管理模式分析 被引量:3
18
作者 李慧 王苗苗 +1 位作者 董庆磊 刘洋 《现代医院》 2020年第1期38-40,共3页
运用系统动力学方法,从公立医院精细化管理模式总体结构出发,提炼医院精细化管理的因果关系链和因果关系反馈回路,绘制医院精细化管理关键要素的因果图和系统动力学图,建立医院精细化管理模式的系统动力学模型,在此基础上对医院精细化... 运用系统动力学方法,从公立医院精细化管理模式总体结构出发,提炼医院精细化管理的因果关系链和因果关系反馈回路,绘制医院精细化管理关键要素的因果图和系统动力学图,建立医院精细化管理模式的系统动力学模型,在此基础上对医院精细化管理模式的关键影响因素进行分析,为公立医院精细化管理提供理论依据和操作规范。 展开更多
关键词 系统动力学 公立医院 精细化 管理模式
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AISI304不锈钢管穿孔针挤压动态再结晶规律(英文) 被引量:1
19
作者 郭良刚 董可可 +3 位作者 张保军 杨合 郑文达 刘雄伟 《中国有色金属学会会刊:英文版》 CSCD 2012年第S2期519-527,共9页
在AISI304不锈钢管穿孔针挤压成形过程中,揭示挤压坯料的动态再结晶规律,是实现动态再结晶行为的有效控制,从而获得具有细晶及合格微观组织的管材的基础和关键。基于DEFORM-2D软件平台,以d29mm×4.5mmAISI304不锈钢管的穿孔针挤压... 在AISI304不锈钢管穿孔针挤压成形过程中,揭示挤压坯料的动态再结晶规律,是实现动态再结晶行为的有效控制,从而获得具有细晶及合格微观组织的管材的基础和关键。基于DEFORM-2D软件平台,以d29mm×4.5mmAISI304不锈钢管的穿孔针挤压过程为研究对象,首先建立了该过程适用、可靠的多尺度有限元分析模型;通过大量的数值模拟分析,阐明了关键挤压成形参数(即坯料初始温度和挤压速度)对挤压坯料的动态再结晶体积分数、平均晶粒尺寸及其分布的影响规律,所得结论为根据挤压管材的微观组织对AISI304不锈钢管穿孔针挤压成形过程进行优化设计与稳健控制提供了重要理论依据和指南。 展开更多
关键词 AISI304不锈钢 动态再结晶 穿孔针挤压 建模与仿真 微观组织 晶粒细化
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HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究 被引量:1
20
作者 梁立 刘嵬 +2 位作者 何红秋 苟小军 胡建平 《湖北农业科学》 2015年第13期3283-3288,3293,共7页
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular ... 以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟优化了模建复合物,分子整体结构发生微幅调整,其中活性口袋区关键残基D116-Mg1-Mg2-E152有一定关联柔性摆动,这对于IN结合柔性较大的RLV分子较为有利。运动性分析表明,RLV分子围绕中心羟基嘧啶,两侧恶二唑和氟苯略微靠近。通过与晶体结构及对接结果对比发现,D116和N155可能是识别RLV抑制剂最为关键的两个残基。 展开更多
关键词 HIV-1整合酶 雷特格韦 同源模建 结构优化 分子动力学模拟 运动模式 分子识别
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