CircRTN4调节miR-224-5p/MYT1L轴对胶质母细胞瘤细胞恶性生物学行为的影响

目的:探讨环状RNA(CircRNA)RTN4调节微小RNA(miR)-224-5p/髓磷脂转录因子1样(MYT1L)轴对胶质母细胞瘤(GM)细胞恶性生物学行为的影响。方法:以对数生长期的U251细胞进行设置分组:空白组、阴性对照(sh NC)组、沉默circRTN4 shRNA(sh circRTN4)组、sh circRTN4+抑制剂对照(inhibitor NC)组、sh circRTN4+miR-224-5p抑制剂(miR-224-5p inhibitor)组。Transwell实验、流式细胞术、CCK-8、qRT-PCR、Western blot以及双荧光素酶分别检测细胞迁移与侵袭、凋亡、增殖、CircRTN4、miR-224-5p、MYT1L mRNA表达、增殖蛋白(ki-67)、凋亡蛋白(cleaved Caspase-3)、MYT1L蛋白表达以及miR-224-5p分别与CircRTN4、MYT1L靶向关系验证;qRT-PCR检测GM细胞系U118、U87、U251和LN229细胞及正常人星形胶质细胞系NHA细胞中CircRTN4、miR-224-5p、MYT1L mRNA表达水平。结果:U118、U87、U251和LN229细胞中CircRTN4、MYT1L mRNA表达较NHA细胞显著增加,miR-224-5p表达显著下降(P<0.05);miR-224-5p分别与CircRTN4、MYT1L的有靶向关系。与空白组、sh NC组相比,sh circRTN4组迁移、侵袭数、24h、48h A450值、ki-67、CircRTN4、MYT1L mRNA及蛋白表达显著降低,凋亡率、cleaved Caspase-3表达显著增加(P<0.05);与sh circRTN4+inhibitor NC组相比,sh circRTN4+miR-224-5p inhibitor组迁移、侵袭数、24h、48h A450值、ki-67、MYT1L mRNA及蛋白表达显著增加,凋亡率、cleaved Caspase-3表达显著下降(P<0.05),CircRTN4表达无统计学差异(P>0.05),体内实验证明干扰CircRTN4可显著抑制移植瘤裸鼠肿瘤质量(P<0.05)。结论:沉默CircRTN4调节miR-224-5p/MYT1L轴抑制GM细胞恶性生物学行为。

RTN1在结直肠癌组织中的表达及意义

目的探究网状体家族基因1(Reticulon family gene1,RTN1)在结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)组织中的表达及意义。方法通过利用TIMER、GEO和UALCAN数据库,对RTN1在结直肠癌及周围正常组织中的表达差异进行分析;应用GEPIA2在线分析工具分析RTN1在CRC中的表达模式和相关基因;借助STRING数据库挖掘与RTN1相互关联的蛋白;通过蛋白免疫印迹试验和免疫组化试验对以上生物信息学分析结果进行验证,以深入探索RTN1在CRC组织及周围正常组织中的差异表达。结果根据TIMER数据库的分析,RTN1在结直肠癌组织中的表达水平明显低于正常组织(均P<0.001)。GEO数据库中的四个数据集也表明,RTN1在CRC中的表达水平显著低于正常组织(均P<0.01)。UALCAN数据库进一步证实了这一结果,无论在哪种临床属性下,RTN1在CRC中的表达都低于正常组织。GEPIA2的分析结果表明,无论是结肠癌还是直肠癌,RTN1的表达均显著低于相邻的正常组织(均P<0.05),并且与RTN1表达呈正相关的四个基因(CSF1R、CD4、SLC9A9和ARHGEF6)在结直肠癌中也表现出类似的表达模式。STRING数据库的挖掘显示,RTN1可能与SPAST、REEP5、ATL3、ATL2、RTN4、ATL1、RTN2、TMEM33、BACE1和MANF等蛋白有交互作用。蛋白免疫印迹和免疫组化试验均证实,RTN1在CRC组织中的表达低于邻近正常组织。结论RTN1在结直肠癌组织中的表达低于癌旁正常组织,这一发现可能对CRC的诊断及治疗具有重要意义。

RTNs家族研究进展

编码内质网蛋白家族的基因(RTNs)是一类广泛存在于真核生物的基因家族,它有着特殊的拓扑结构。RTNs蛋白的羧基端存在一个大约200个氨基酸的保守区(RHD),此保守区包含2个疏水区段。RTNs蛋白定位内质网膜上,高等脊椎动物中枢神经受损时,RTN4-A/Nogo-A起抑制神经生长的作用,RTNs蛋白家族其余成员的功能还不是很清楚,可能与胞内运输,细胞分裂和细胞凋亡等有关。现就RTNs成员的基本结构、表达分布、亚细胞定位、拓扑结构和RTNs蛋白的功能等进行综述。

基于RTNs分子标记的虎杖地理属性研究

[目的]研究虎杖的地理属性。[方法]应用基于反转录转座子(RTNs)的iPBS技术对四川省内6个地区的9份虎杖种质资源进行遗传多样性研究。[结果]从50个iPBS引物中筛选出22个多态性较高的引物对9个样品进行扩增,共得到161条扩增片段,其中66.5%的片段具有多态性,每个引物可扩增出4.86个多态性片段。UPGMA聚类结果表明,利用iPBS技术,当遗传相似遗传系数0.79为阈值,可将供试材料分为5类。多样性分析结果表明,虎杖种质资源在分子水平上存在较大差异,基于iPBS标记的虎杖基因型与地理属性有密切关系。[结论]试验研究了虎杖的地理属性,可为虎杖种质资源分类和深入研究植物与环境的关系提供参考。

miR-448/RTN4轴调控结肠癌细胞对5-氟尿嘧啶耐药性的机制研究

目的探讨结肠癌细胞对5-氟尿嘧啶(5-Fu)的抵抗及潜在机制。方法使用5-Fu筛选出HCT116和HT295-Fu抗性细胞系(HCT116/FR和HT29/FR细胞)。通过高通量测序和siRNA功能筛选鉴定5-Fu处理后HCT116/FR细胞中影响细胞凋亡水平的关键基因。过表达该基因(RTN4)后检测HCT116/FR和HT29/FR细胞的凋亡水平和细胞活力水平。过表达或敲低此miRNA(miR-448)后检测HCT116、HT29、HCT116/FR和HT29/FR细胞的细胞活力、细胞凋亡水平和RTN4的表达水平。26例结肠癌患者,按照化疗效果分为对化疗敏感型结肠癌患者(Sensitive)与化疗抵抗型结肠癌患者(Resistant),并采用免疫组织化学染色方法检测RTN4在患者中的表达水平。结果当敲低RTN4时,HCT116/FR细胞的凋亡水平下降(P<0.05)。5-Fu处理HCT116/FR细胞和HT29/FR细胞后,RTN4的mRNA水平均下调(P<0.05)。敲低RTN4后并用5-Fu处理,HCT116和HT29显示出对5-Fu抑制增殖的抵抗(P<0.05)。过表达RTN4后,HCT116/FR和HT29/FR细胞的凋亡水平上升(P<0.05)。5-Fu处理后,HT29/FR和HCT116/FR细胞中miR-448的表达水平上升(P<0.05)。5-Fu处理后并过表达miR-448后,HCT116和HT29细胞的凋亡水平下降(P<0.05)。在HCT116/FR细胞中,过表达miR-448后,RTN4的表达水平下降;敲低miR-448后,RTN4的表达水平上升(P<0.05)。在HT29/FR细胞中,过表达miR-448后,RTN4的表达水平下降;敲低miR-448后,RTN4的表达水平上升(P<0.05)。免疫组织化学分析发现对化疗敏感的结肠癌患者癌组织中RTN4表达水平较高(P<0.05)。结论当结肠癌细胞HCT116和HT29遇到5-Fu后,细胞中miR-448的表达水平上升,miR-448靶向RTN4 mRNA的3端非编码区并降解了RTN4 mRNA,减少了RTN4的蛋白表达,最终提升了结肠癌细胞HCT116和HT29对5-Fu的抗性。

HR-MRI联合RTN-1C评估进展期直肠癌放化疗疗效效能

目的 分析高分辨率磁共振成像(HR-MRI)联合网状蛋白1C(RTN-1C)评估进展期直肠癌放化疗疗效效能。方法 回顾性分析2020年1月至2021年1月我院122例行新辅助放化疗的进展期直肠癌患者临床资料,采用肿瘤消退分级(TRG)评估新辅助放化疗疗效,并分为TRG 1~3级组(疗效良好组)及TRG 4~5级组(疗效不良组),比较两组新辅助放化疗前及放化疗后HR-MRI弥散加权成像(DWI)定量参数表观扩散系数(ADC)、动态对比增强(DCE-MRI)定量参数容量转移常数(K^(trans))、外周血单个核细胞RTN-1C表达水平变化情况,分析ADC值、K^(trans)值及RTN-1C及其联合检测对进展期直肠癌新辅助放化疗疗效的诊断价值。结果 疗效良好组新辅助放化疗前K^(trans)值及RTN-1C相对表达量均高于疗效不良组(P<0.05),放化疗后RTN-1C相对表达量高于疗效不良组(P<0.05),且疗效良好组放化疗前后ADC差值(△ADC值)、K^(trans)差值(△K^(trans)值)及RTN-1C相对表达量差值均高于疗效不良组(P<0.05)。△ADC值、△K^(trans)值与放化疗前RTN-1C相对表达量均对进展期直肠癌新辅助放化疗疗效良好均有较高诊断价值(P<0.05),且Kappa一致性检验显示,△ADC值与△K^(trans)值串联诊断具有较高应用价值(P<0.05),2者串联后与放化疗前RTN-1C相对表达量并联诊断也具有较高应用价值(P<0.05)。结论 HR-MRI联合RTN-1C评估进展期直肠癌新辅助放化疗疗效应用价值较高,可为后续手术方案提供指导意见。

浆膜蛋白RTN1和RTN4基因在小鼠内耳的表达

目的探讨浆膜蛋白RTN1和RTN4基因在小鼠内耳的表达。方法采用5只成年小鼠内耳组织提取总RNA,逆转录后获得小鼠内耳细胞cDNA,根据RTN1和RTN4基因编码区序列设计的引物进行PCR扩增,通过PCR产物分析和DNA测序确定RTN1和RTN4是否在小鼠内耳细胞表达。结果采用小鼠内耳组织总RNA,RT-PCR扩增出RTN1和RTN4基因部分编码区,扩增产物测序证实小鼠内耳中有RTN1和RTN4基因的表达。结论RTN1和RTN4基因在内耳有表达,为RTN1和RTN4与连接蛋白26(connexin26)蛋白的互作关系提供了进一步的证据。浆膜蛋白RTN1和RTN4可能与连接蛋白26在听觉生理中起作用。

RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌中的表达及临床意义

目的探讨RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌组织中的表达及其临床病理意义。方法收集武汉大学人民医院病理科2008~2012年手术切除及活检的甲状腺乳头状癌标本40例和癌旁组织标本20例。采用免疫组织化学方法检测RTN4和TG2的表达,分析二者在甲状腺乳头状癌组织中的表达及与临床病理资料之间的关系。用SPSS 13.0软件对各组免疫组织化学反应的平均吸光度和平均阳性面积率作单因素方差分析和SNK（q）检验（α=0.05）,对甲状腺乳头状癌和癌旁组织RTN4和TG2表达的阳性面积率作双变量相关分析（α=0.05）。结果 1RTN4、TG2在甲状腺乳头状癌中呈高表达,癌旁组织中呈低表达,统计分析显示,甲状腺乳头状癌组织中RTN4、TG2的表达显著高于癌旁组织（P〈0.05）。2RTN4和TG2在有淋巴结转移组中的表达均显著高于无淋巴结转移组,在临床分期Ⅰ和Ⅱ期组阳性率显著高于Ⅲ和Ⅳ期组,在低分化组阳性率显著高于高、中分化组,差异均有统计学意义（均P〈0.05）;二者在不同肿瘤大小、患者年龄、性别组间的差异均无统计学意义（均P〉0.05）。3RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌组织中的表达呈正相关（r=0.587,P〈0.05）。结论 1RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌组织中表达上调,可能与瘤细胞的过度增殖,抗凋亡增强等有关;2RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌的增殖、转移中发挥重要作用;3RTN4和TG2在甲状腺乳头状癌的进展过程中可能发挥着协同作用。

RTN3与细胞凋亡

RTN3是RTN家族的成员之一,因其主要定位于内质网,所以用reticulon来命名.RTN3与RTN4B是RTN家族中目前已知的、唯一一对具有凋亡诱发功能的基因.过表达的RTN3介导了真核细胞的三大凋亡信号转导通路:死亡受体途径、线粒体途径、内质网途径,并使之交联形成凋亡调控网络;RTN3可与RTN4B相互作用,形成同源或异源二聚来调控细胞凋亡.另外,过表达RTN3还参与了细菌的类凋亡作用.RTN3广泛表达于多种组织,其过表达诱发凋亡的机制的总结将让人们更好的了解RTN3及其家族,完善细胞凋亡的信号转导研究.

RTN4-C基因在肝癌组织中的表达及其对SMMC7721细胞生长和凋亡的影响(英文)

RTN4-C属于编码内质网蛋白的基因家族(RTNs)。为研究RTN4-C在肝癌及其癌旁组织中的表达情况及其对SMMC7721肝癌细胞株的影响,利用RT-PCR检测RTN4-C在肝癌及其癌旁组织中的表达。构建RTN4-C-pcDNA3.1真核表达重组质粒,用脂质体介导转染SMMC7721肝癌细胞,通过G418稳定筛选,建立转染RTN4-C/SMMC7721稳定细胞株。MTT法测定转染前后细胞生长改变、吖啶橙染色检测细胞凋亡改变、免疫细胞化学检测肿瘤相关蛋白p53、Hsp70和c-Fos表达改变。结果表明,RTN4-C/SMMC7721细胞生长减慢,与对照组相比,第2、3、4d细胞生长抑制率分别为33·8%±0·026、56·2%±0·094、34·8%±0·077;凋亡明显增多。突变型p53蛋白从核内转移到细胞质且表达减弱,c-Fos、Hsp70蛋白表达量明显减弱。提示RTN4-C基因在肝癌组织中存在表达差异,促进突变型p53的核转移并减少其表达量、抑制癌基因c-Fos和Hsp70的表达,从而抑制SMMC7721细胞的生长,促进其凋亡。

RTN4和TG2在增生期血管瘤组织中高表达及其临床意义

目的探讨RTN4和TG2在人皮肤血管瘤组织中的表达及其临床意义。方法收集武汉大学人民医院病理科2008年-2011年皮肤毛细血管瘤存档蜡块40例,其中男性15例,女性25例。采用免疫组织化学S-P法检测40例皮肤血管瘤增生期、退化期及正常皮肤组织RTN4和TG2表达水平,采用图像分析系统对RTN4和TG2的表达进行定量分析,并用SPSS13.0软件对各组免疫组织化学反应阳性颗粒的平均光密度、阳性面积率做单因素方差分析和SNK(q)检验。结果增生期组RTN4的表达明显高于退化期组和正常皮肤组,而后两组比较差异无统计学意义;增生期组TG2的表达明显高于退化期组和正常皮肤组,而后两组比较差异无统计学意义。结论 RTN4和TG2在增生期血管瘤组织中的表达明显高于正常皮肤组及退化组,提示RTN4和TG2在增生期血管瘤组织中表达上调,可能与瘤细胞的过度增殖,抗凋亡增强等有关。

环状人网状蛋白4调节miR-582-5p/神经纤毛蛋白1轴对结直肠癌细胞恶性生物学行为的影响

目的探讨环状人网状蛋白4(CircRTN4)调节miR-582-5p/神经纤毛蛋白1(NRP1)轴对结直肠癌(CRC)细胞恶性生物学行为的影响。方法选取2019年1月至2023年1月河南科技大学第一附属医院收治的CRC患者50例,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、蛋白质免疫印迹法分别检测患者的癌组织、癌旁组织、人正常结肠黏膜上皮细胞和CRC细胞中CircRTN4、miR-582-5p mRNA及NRP1的蛋白表达;将SW480细胞分别转染si-RTN4、miR-582-5p inhibitor及相应对照,qRT-PCR检测转染效率;通过平板克隆实验、Transwell小室和流式细胞仪等研究CircRTN4对CRC细胞的影响;蛋白质免疫印迹法检测增殖细胞核抗原(PCNA)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)及NRP1蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验检测miR-582-5p与RTN4和NRP1的作用;构建肺癌裸鼠模型,分析敲低RTN4对肿瘤质量、体积及移植瘤中miR-582-5p、NRP1、Ki-67蛋白表达的影响。结果在CRC组织和细胞系中,RTN4、NRP1表达升高,miR-582-5p表达降低(P<0.05);敲低RTN4,降低SW480细胞迁移、增殖与侵袭,下调PCNA、Bcl-2、MMP-2、NRP1表达,促进miR-582-5p、Bax表达及细胞凋亡(P<0.05);miR-582-5p作为RTN4靶点,下调miR-582-5p可减弱RTN4敲低对SW480细胞恶性行为的抑制作用(P<0.05);体内实验显示,抑制RTN4可降低移植瘤质量和体积,降低Ki-67、NRP1表达水平,升高miR-582-5p表达(P<0.05)。结论在CRC组织和细胞系中,CircRTN4高表达,敲低CircRTN4可能通过调节miR-582-5p/NRP1轴抑制CRC细胞的恶性行为。

双转基因小鼠模型中microRNA-153对RTN4的表达调控

目的探讨mir-153在阿尔茨海默病发病机制中的作用。方法通过microRNA芯片及Real-timePCR检测APPswe/PSΔE9双转基因小鼠脑内mir-153的表达;构建高表达mir-153的稳转细胞系,通过western-blot检测稳转细胞系内RTN4的蛋白表达;构建野生型及突变型RTN4的3’UTR荧光素酶报告载体,分别将其与mir-153表达载体或microRNA阴性对照载体共转染入293T细胞内,检测海肾荧光素酶的相对活性以验证mir-153对RTN4 mRNA的作用靶点。结果 microRNA芯片及Real-time PCR检测均证实3月龄APPswe/PSΔE9双转基因小鼠脑内mir-153的表达较同龄野生对照显著降低;在高表达mir-153的稳转细胞系内RTN4的蛋白水平明显降低;共转染野生型RTN4的3’UTR/mir-153表达载体可使海肾荧光素酶相对活性较共转染野生型RTN4的3’UTR/miRNA阴性对照质粒组显著降低(P<0.05),而共转染突变型RTN4的3’UTR/mir-153表达载体组则较之无明显差异。结论在3月龄APPswe/PSΔE9双转基因小鼠脑内存在mir-153的异常表达;mir-153可调控RTN4的蛋白表达;mir-153对RTN4的表达调控是通过结合RTN4 3’UTR 839-845碱基处的作用位点而实现的。

RTN4C裸基因抑制人肝癌细胞生长及转移的体内实验研究

目的 :研究RTN4C裸基因直接注射抗肝癌生长及转移复发作用。方法 :将RTN4C装入逆转录病毒载体 ,扩增提取RTN4C裸基因 ,以LacZ为对照组。将不同裸基因和生理盐水与LCI D2 0裸鼠人肝癌同时皮下接种或待LCI D2 0肝癌成瘤后注射 ,观察对肿瘤成瘤和生长影响。LCI D2 0肿瘤裸鼠皮下接种后 10天 ,分别瘤内注射不同裸基因 ,观察其对肿瘤生长转移影响。LCI D2 0肿瘤肝内接种 ,接种后 2 2天行肝癌切除术 ,术中经切缘或脾内注射不同裸基因 ,观察其对术后转移复发的影响。结果 :不同裸基因与LCI D2 0肝癌同时皮下接种对照组、LacZ组、RTN 4C组 ,肿瘤直径分别为 (1 81± 0 12 )cm ,(1 6 1± 0 2 7)cm、 (0 4 3± 0 0 4 )cm。裸基因肿瘤内注射对照组、LacZ组、RTN4C组 ,瘤径 (cm)分别为 0 91± 0 0 9,0 90± 0 0 6 ,0 2 5± 0 0 4 ;肝癌切除术应用裸基因转移灶累及部位数、切缘复发瘤直径、肝内转移灶数目 ,转移灶累及肝叶数在对照组、LacZ组与RTN4C组间存在显著差异。脾内注射效果优于肝切缘组注射。结论 :RTN4C裸基因注射具有抑制LCI D2

Rtn4-A/B基因敲除小鼠模型的制备

目的通过制备Rtn4-A/B基因敲除小鼠,探索Rtn4-B基因的生物学功能。方法用细菌人工染色体(BAC)载体构建Rtn4-A/B基因打靶载体并使其线性化,通过电转化法将其转入129SvEv品系雄性小鼠胚胎干细胞(embryonic stem cell,ES细胞)。将正确同源重组的ES细胞注射入C57BL/6J小鼠囊胚腔,繁育出嵌合体小鼠后,进一步繁殖以获得杂合子小鼠。抽提小鼠尾尖组织DNA,采用PCR法鉴定小鼠的基因型。结果基因打靶后,得到14个发生双臂正确同源重组ES细胞克隆。利用阳性ES细胞克隆进行囊胚内显微注射,得到5只嵌合率大于50%的雄鼠,最终繁育得到4只Rtn4-A+/-B+/-杂合子小鼠。结论利用ES细胞基因打靶、同源重组等方法,成功获得Rtn4-A/B基因敲除杂合子小鼠。

肝癌发生中RTN4C基因突变研究(英文)

为研究肝癌发生过程中RTN4C基因突变 ,利用直接序列分析、PCR -SSCP等研究了肝癌(HCC)中RTN4C突变与杂合性缺失 (LOH)。HCC中 ,RTN4CP突变为 6 2 9%,LOH为 6 8 4 %。 90 %LOH的肝癌中RTN4C发生突变。RTN4C突变相关的肝癌发生中LOH起重要作用。

精神分裂症患者外周血中RTN4基因的mRNA表达研究

目的检测精神分裂症患者外周血中髓鞘相关抑制因子（RTN4）基因的信使核糖核酸（mRNA）表达量,研究其与临床症状间的关系。方法对44例精神分裂症患者（患者组）和37例社区正常人群（对照组）的外周肘静脉采血2～3 ml,提取总RNA,制备c DNA,比较两组RTN4基因的mRNA表达水平。对患者组采用阳性和阴性综合征量表（PANSS）进行评分,两两比较阳性症状为主组、阴性症状为主组和混合症状为主组三组RTNA基因的mRNA表达水平。结果患者组与对照组外周血中的RTN4基因表达水平存在统计学差异（P〈0.05）,患者组中阳性症状为主组、阴性症状为主组、混合症状为主组,两两之间RTN4表达水平比较差异无统计学意义（P〉0.05）。结论 RTN4基因的mRNA表达量与精神分裂症之间存在着相关性,可为今后进一步了解精神分裂症的发病机制及诊断治疗等方面提供依据。

广西壮族人群RTN4基因多态性及其单倍型与鼻咽癌易感性的关系

目的研究广西壮族人群RTN4基因多态性及其单倍型与鼻咽癌易感性之间的关系。方法运用DNA测序法和单碱基延伸PCR技术,检测广西壮族人群200例确诊为鼻咽癌患者(鼻咽癌组)和200例健康查体者(对照组)的RTN4基因rs2588510和rs1348528位点基因型,并分析RTN4基因的等位基因和单倍型频率。结果 RTN4基因多态性rs2588510和rs1348528位点在对照组和鼻咽癌组中的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义。而两个位点在对照组和鼻咽癌组中单倍型CG频率分别为27.5%和34.8%,单倍型TA频率分别为0.7%和3.0%,鼻咽癌组单倍型CG和TA频率的分布差异显著高于对照组(P=0.007,OR=2.05,95%CI:1.21~3.46;P=0.001,OR=6.48,95%CI:1.69~24.9)。结论 RTN4基因多态性rs2588510和rs1348528位点的单倍型CG和TA可增加广西壮族人群个体鼻咽癌易感性。

RTN1在肺腺癌中表达及对免疫微环境的影响

背景与目的网状体家族基因1(Reticulon family gene 1,RTN1)是一种与内质网相关的网状体编码基因。RTN1在神经内分泌细胞的膜运输或神经内分泌分泌中起关键作用,同时RTN1可作为有神经内分泌成分的恶性肿瘤的潜在诊断/治疗标志物。然而在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者中RTN1的表达情况及其对免疫微环境影响均未有报道。本研究旨在使用公共数据库和生物信息学网络工具研究RTN1在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌中免疫浸润和存活的相关性。方法使用Tumor Immune Estimation Resource 2.0(TIMER 2.0)和Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2(GEPIA 2)分析肿瘤和正常组织中RTN1 mRNA的表达水平。使用人类蛋白质图谱检查RTN1蛋白质表达。利用GEPIA2在线工具分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中RTN1的临床预后意义。为了进一步确认RTN1的潜在功能,使用基因集富集分析对数据进行了分析。此外,我们对来自肿瘤免疫单细胞中心(Tumor Immune Single-cell Hub,TISCH)数据库的两个数据集在单细胞测序水平上进行降维聚类分析,观察RTN1在不同种类免疫细胞的细胞聚类。使用TIMER在线工具分析预测TCGA队列肺腺癌患者免疫微环境中不同种类免疫细胞浸润丰度;使用TIMER和CIBERSORT研究与RTN1共表达基因和其相关肿瘤浸润免疫细胞之间的关系;最后,使用TIMER分析RTN1与免疫检查点之间的相关性。结果我们发现LUAD患者的RTN1表达降低,且与患者的预后密切相关。RTN1参与吞噬体的形成、造血细胞形成和细胞黏附的过程,对T细胞活化起着重要作用,使用cBioPortal与TCGA数据来分析,发现RTN1与BTK、CD4、ECSF1R、MNDA、NCKAP1L和SNX20显著相关。以上基因高表达可能会引起CD4+T细胞、肥大细胞、单核细胞、髓样树突状细胞和M1型巨噬细胞显著上调。并且,RTN1表达与常见免疫检查点CD274、CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1、PDCD1LG2、TIGIT、SIGLEC15密切相关。结论RTN1作为一种肿瘤抑制基因并可能与更好的预后相关。此外,RTN1与可能参与免疫治疗反应的免疫浸润有关。但与其相关的机制需要进一步的研究。

Nogo,a star protein in reticulon family

Nogo is widely expressed in higher vertebrate animals. Nogo gene gives rise to multiple isoforms. All the subtypes of Nogo proteins are characterized by a 200-amino-acid C-terminal domain, including two long hydrophobic sequences. Biological functions of Nogo include inhibition of neurite growth from the cell surface via specific receptors, intracellular trafficking, cell division and apoptosis. Here, we briefly review the elementary structure, taxonomic distribution and tissue expression of Nogo, summarize recent discoveries about localization of Nogo and mechanism of action, and discuss the possible functions of Nogo.