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千屈菜科中rpl2基因内含子缺失现象探析
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作者 施雨彤 徐梁 +1 位作者 郑绍宇 顾翠花 《浙江林业科技》 2018年第2期63-68,共6页
本研究共收集了25种样本,其中紫薇属样本17种,千屈菜科其它属代表种7种,并利用近缘物种柳叶菜科Onagraceae月见草属Oenothera植物Oenothera albicaulis样本作为对照,通过试剂盒法提取DNA,PCR扩增样本rpl2目标区域基因片段,对紫薇属Lager... 本研究共收集了25种样本,其中紫薇属样本17种,千屈菜科其它属代表种7种,并利用近缘物种柳叶菜科Onagraceae月见草属Oenothera植物Oenothera albicaulis样本作为对照,通过试剂盒法提取DNA,PCR扩增样本rpl2目标区域基因片段,对紫薇属Lagerstroemia Linn乃至千屈菜科Lythraceae的rpl2基因内含子缺失情况进行了初步研究,探讨rpl2基因内含子的缺失是否发生在属的水平以及科的水平。实验结果表明,各实验样本的rpl2目标区域的扩增长度短于非千屈菜科植物,同时通过对扩增片段进行Sanger测序的结果比对,确认rpl2基因内含子缺失现象发生在紫薇属及千屈菜科内。本研究结果对于探讨千屈菜科内植物内含子的缺失机理、紫薇属及千屈菜科的后续基因组的其他研究提供了前期基础。 展开更多
关键词 千屈菜科 紫薇属 rpl2内含子 内含子缺失
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两个叶绿体基因位点的DNA条形码在桉属种间鉴定中的应用 被引量:6
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作者 王以红 陶晓瑜 +2 位作者 刘海龙 陈晓明 邱英雄 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1651-1658,共8页
对桉属的13个样本(11个种、1个人工杂交种和1个优良无性系)的trnH-psbA基因间隔区的序列进行了比对和分析,13个桉属样本的trnH-psbA长度范围为538~576bp,序列排序的一致性长度为590bp。共检测出了52个变异性状,其中46个变异性状为碱基... 对桉属的13个样本(11个种、1个人工杂交种和1个优良无性系)的trnH-psbA基因间隔区的序列进行了比对和分析,13个桉属样本的trnH-psbA长度范围为538~576bp,序列排序的一致性长度为590bp。共检测出了52个变异性状,其中46个变异性状为碱基置换,6个性状为插入或缺失。同时,对桉属11个样本的rpl2-trnH基因间隔区(大单拷贝与反向重复接头)区域进行了序列分析,分析表明,11个桉属样本的rpl2-trnH长度范围为79~149bp,序列排序的一致性长度为154bp。共检测出了19个变异性状,其中4个性状为插入或缺失,15个变异性状为碱基置换。尾叶桉优良无性系的trnH-psbA和rpl2-trnH序列与尾叶桉仅1个位点的碱基置换;与巨尾桉、巨桉进行比较,尾叶桉优良无性系的trnH-psbA序列有27bp的插入,以上4个近缘样本在rpl2-trnH区域的序列差异为12个碱基置换。研究表明,通过两个cpDNA基因位点序列不仅可以将桉属不同种进行区分,而且也可以区分尾叶桉优良无性系与尾叶桉。因此,本研究涉及的两个叶绿体基因组位点序列在建立桉树植物种间鉴定的DNA条形码方面具有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 桉属 叶绿体DNA rpl2-trnH TRNH-PSBA 鉴定 DNA条形码
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A Novel Chloroplast-Localized Pentatricopeptide Repeat Protein Involved in Splicing Affects Chloroplast Development and Abiotic Stress Response in Rice 被引量:18
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作者 Junjie Tan Zhenhua Tan +12 位作者 Fuqing Wu Peike Sheng Yueqin Heng Xinhua Wang Yulong Ren Jiulin Wang Xiuping Guo Xin Zhang Zhijun Cheng Ling Jiang Xuanming Liu Haiyang Wang Jianmin Wan 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2014年第8期1329-1349,共21页
Pentatricopeptide repeat (PPR) proteins comprise a large family in higher plants and modulate organellar gene expression by participating in various aspects of organellar RNA metabolism. In rice, the family contains... Pentatricopeptide repeat (PPR) proteins comprise a large family in higher plants and modulate organellar gene expression by participating in various aspects of organellar RNA metabolism. In rice, the family contains 477 members, and the majority of their functions remain unclear. In this study, we isolated and characterized a rice mutant, white stripe leaf (wsl), which displays chlorotic striations early in development. Map-based cloning revealed that WSL encodes a newly identified rice PPR protein which targets the chloroplasts. In wsl mutants, PEP-dependent plastid gene expression was significantly down-regulated, and plastid rRNAs and translation products accumulate to very low levels. Consistently with the observations, wsl shows a strong defect in the splicing of chloroplast transcript rpl2, resulting in aberrant transcript accumulation and its product reduction in the mutant. The wsl shows enhanced sensitivity to ABA, salinity, and sugar, and it accumulates more H2O2 than wild-type. These results suggest the reduced translation efficiency may affect the response of the mutant to abiotic stress. 展开更多
关键词 PPR protein WSL ABA CHLOROPLAST RNA splicing rpl2 abiotic stress responses.
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