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MALDI-TOF-MS检测哈维弧菌前处理条件的探索及聚类分析 被引量:4
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作者 武静 陈英剑 +1 位作者 李继霞 胡成进 《国际检验医学杂志》 CAS 2020年第1期14-17,共4页
目的 对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)检测哈维弧菌的前处理条件进行优化,并通过聚类分析初步探讨质谱对哈维弧菌溯源性的价值。方法 本研究首先利用rpoB测序对33株哈维弧菌进行确证,然后利用MALDI-TOF-MS采集哈维弧... 目的 对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)检测哈维弧菌的前处理条件进行优化,并通过聚类分析初步探讨质谱对哈维弧菌溯源性的价值。方法 本研究首先利用rpoB测序对33株哈维弧菌进行确证,然后利用MALDI-TOF-MS采集哈维弧菌蛋白指纹图谱。并通过培养基的选择、培养时间及样本处理方法对检验前操作程序进行优化。最后,利用MALDI-TOF-MS对33株哈维弧菌进行聚类分析,探讨质谱对细菌溯源性的价值。结果 本研究所用3种培养基的选择对哈维弧菌的鉴定结果差异无统计学意义(P>0.05)。培养时间18、24h哈维弧菌的鉴定结果优于48h的鉴定结果,差异有统计学意义(P<0.05)。但培养18、24h之间鉴定结果差异无统计学意义(P>0.05)。甲酸提取法的效果明显优于直接涂抹法,差异有统计学意义(P<0.05)。基于MALDI-TOF-MS法的聚类分析,能哈维弧菌病感染病原体的溯源提供理论依据。结论 MALDI-TOF-MS法操作简单、快速,可实现对哈维弧菌的准确鉴定和溯源性分析,在海洋渔业和海水养殖业将会发挥重要作用。 展开更多
关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 哈维弧菌 快速检测 rpob分析 聚类分析
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Sequence analysis on drug-resistant rpoB gene of Mycobacterium tuberculosis L-form of isolated from pneumoconiosis workers
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作者 Lu Jun Jiang Shan +1 位作者 Ye Song Hu Zongchang 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2009年第4期223-227,共5页
To study the characteristics of drug-resistant genetic mutation of rpoB on coal workers' pneumoconiosis complicated with L-form of Mycobacterium tuberculosis. Methods: A total of 42 clinical isolated strains of Myco... To study the characteristics of drug-resistant genetic mutation of rpoB on coal workers' pneumoconiosis complicated with L-form of Mycobacterium tuberculosis. Methods: A total of 42 clinical isolated strains of Mycobacterium tuberculosis L-forms were collected, including 31 drug-resistant strains. Their genomes DNA were extracted, the target genes were amplified by PCR, and the hot regions in the rpoB gene were analyzed by automated DNA sequenator. Results: No mutation of rpoB gene was identified in 11 rifampicin-sensitive strains while conformation changes were found in 31 rifampicin-resistant strains. The mutation rate was 93.55% (29/31) in resistant strains, mainly concentrated in codon 531 (51.6%, 16/31) and 526 (32.26%, 10/31). Base substitutions happened, including 27 unit point mutation and 2 two point mutation. The mutation of codon 516 that new found wasn't reported by internal and overseas scholars. Conclusion: The substitution of highly conserved amino acids encoded by rpoB gene results in the molecular mechanism responsible for rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis L-forms. It also proves that rpoB gene is diversiform. 展开更多
关键词 TUBERCULOSIS Mycobacterium tuberculosis L-form Drug resistance rpob Sequence analysis
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部分茶饮料原辅料中优势菌-克罗诺杆菌(原阪崎肠杆菌)的分离和鉴定 被引量:7
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作者 陈雅蘅 赵炜 +1 位作者 王洋 周帼萍 《中国酿造》 CAS 2013年第5期59-61,共3页
克罗诺杆菌(原阪崎肠杆菌)是新兴的条件致病菌,主要通过污染的婴儿配方奶粉引起2岁以下婴幼儿严重疾病甚至死亡。在对茶饮料原辅料192份样品进行细菌总数测定和优势菌16S rDNA序列分析时,发现2批次绿茶和1批次果葡糖浆中优势菌疑似条件... 克罗诺杆菌(原阪崎肠杆菌)是新兴的条件致病菌,主要通过污染的婴儿配方奶粉引起2岁以下婴幼儿严重疾病甚至死亡。在对茶饮料原辅料192份样品进行细菌总数测定和优势菌16S rDNA序列分析时,发现2批次绿茶和1批次果葡糖浆中优势菌疑似条件致病菌-克罗诺杆菌,而且其数量较高(4.0×102cfu/g^104cfu/g)。进而通过rpoB序列分析,将4个分离株鉴定为阪崎克罗诺杆菌Cronobacter sakazakii(原阪崎肠杆菌Enterobacter sakazakii)。结果表明在常见的食品原料-果葡糖浆和绿茶中存在克罗诺杆菌的污染,rpoB分型方法在对克罗诺杆菌属细菌的鉴定到种上表现出高度特异性,灵敏而准确。 展开更多
关键词 克罗诺杆菌 阪崎肠杆菌 茶饮料原辅料 16SrDNA序列分析 rpob序列分析
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