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人核糖体蛋白S13(RPS13)编码基因的克隆及其正反义核酸转染胃癌细胞的初步研究 被引量:3
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作者 翟惠虹 郭新宁 +4 位作者 时永全 王新 兰梅 杨力 樊代明 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期785-789,共5页
目的:扩增人核糖体蛋白S13(RPS13)编码基因序列,构建其正、反义真核表达载体,分别转染胃癌细胞SGC7901及胃癌耐药细胞SGC7901/VCR,以进一步研究RPS13基因与胃癌多药耐药的关系。方法:采用RT-PCR法扩增RPS13cDNA片段编码区全长序列,利用... 目的:扩增人核糖体蛋白S13(RPS13)编码基因序列,构建其正、反义真核表达载体,分别转染胃癌细胞SGC7901及胃癌耐药细胞SGC7901/VCR,以进一步研究RPS13基因与胃癌多药耐药的关系。方法:采用RT-PCR法扩增RPS13cDNA片段编码区全长序列,利用DNA重组技术构建正、反义真核表达载体,经脂质体介导转染胃癌细胞SGC7901及胃癌耐药细胞SGC7901/VCR,筛选正、反义基因稳定转染细胞,RNA斑点杂交法检测正、反义稳定转染细胞mRNA水平的变化。结果:从高表达RPS13的SGC7901/VCR耐药细胞中提取细胞总RNA,RT-PCR法成功扩增了RPS13cDNA片段编码区全长序列,并经测序证实;目的基因按正、反两个方向亚克隆至真核表达载体pcDNA3.1(+),并经酶切鉴定证实;经脂质体介导将正义真核表达载体转染SGC7901细胞,反义真核表达载体转染SGC7901/VCR细胞,G418筛选获得稳定转染细胞;RNA斑点杂交试验证实:正义稳定转染细胞RPS13mRNA水平上调,反义稳定转染细胞RPS13mRNA水平下调。结论:成功克隆了人RPS13编码基因序列,并构建了其正、反义真核表达载体。在胃癌细胞系SGC7901及长春新碱耐药细胞SGC7901/VCR中得到稳定转染细胞株,正义转染细胞中RPS13mRNA表达明显增加,反义转染细胞中表达明显受抑。 展开更多
关键词 人核糖体蛋白S13 反转录PCR 基因转染 胃癌 基因克隆
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蛇床子RPS13蛋白的体外表达及生物信息学分析
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作者 王晨凯 廖怡 +2 位作者 刘苗苗 储俊 吴家文 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期17-21,共5页
核糖体蛋白S13(Ribosomal protein S13,RPS13)属于核糖体蛋白家族,在核糖体中的生物学功能主要是维持核糖体大小亚基之间的动态连接。从蛇床子[Cnidium monnieri(L.)Cuss.]的根、茎、叶组织中提取总RNA,通过RT-PCR扩增蛇床子核糖体蛋白s... 核糖体蛋白S13(Ribosomal protein S13,RPS13)属于核糖体蛋白家族,在核糖体中的生物学功能主要是维持核糖体大小亚基之间的动态连接。从蛇床子[Cnidium monnieri(L.)Cuss.]的根、茎、叶组织中提取总RNA,通过RT-PCR扩增蛇床子核糖体蛋白s13(rps13)的开放阅读框(ORF),成功获得了一段453 bp的基因,该基因片段编码151个氨基酸的蛋白;将获得的目的基因rps13 ORF连接到表达载体p ET22b(+)中,并进一步转化到大肠杆菌表达菌中诱导目的基因体外表达;通过对蛋白结构进行分析表明蛇床子RPS13含有6个α螺旋;对蛇床子RPS13进行系统进化分析表明该蛋白在进化上具有高度保守性,与植物类胡萝卜的RPS13亲缘关系最近。蛇床子RPS13蛋白在体外的成功表达以及对其进行系统的生物信息学分析为进一步深入研究该蛋白的结构和功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 蛇床子 rps13 蛋白质表达 生物信息学
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核糖体蛋白基因RPS13与RPS26在部分非霍奇金淋巴瘤中表达的定量研究 被引量:1
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作者 王晓凌 刘卫平 +3 位作者 赵莎 杨帆 潘云 李甘地 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第46期3298-3300,共3页
关键词 荧光定量PCR方法 非霍奇金淋巴瘤 rps13 蛋白基因 核糖体 人鼻型NK/T细胞淋巴瘤 组织学类型 家族成员 研究发现 基因表达
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实时荧光定量PCR检测核糖体蛋白S13基因在NK/T细胞淋巴瘤中的表达 被引量:2
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作者 杨帆 刘卫平 +5 位作者 何妙侠 唐琼兰 赵莎 张文燕 夏庆杰 李甘地 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期464-466,共3页
目的应用实时荧光定量PCR技术检测NK/T细胞淋巴瘤核糖体蛋白S13(RPS13)基因的表达。方法提取石蜡包埋NK/T细胞淋巴瘤组织总RNA,逆转录为cDNA。应用实时荧光定量PCR技术检测NK/T细胞淋巴瘤RPS13表达水平。结果20例NK/T细胞淋巴瘤RPS13表... 目的应用实时荧光定量PCR技术检测NK/T细胞淋巴瘤核糖体蛋白S13(RPS13)基因的表达。方法提取石蜡包埋NK/T细胞淋巴瘤组织总RNA,逆转录为cDNA。应用实时荧光定量PCR技术检测NK/T细胞淋巴瘤RPS13表达水平。结果20例NK/T细胞淋巴瘤RPS13表达水平明显低于对照。结论RPS13基因表达水平明显低于正常人外周血淋巴细胞,这可能在NK/T细胞淋巴瘤发生、发展中起到一定作用。 展开更多
关键词 NK/T细胞淋巴瘤 实时荧光定量聚合酶链反应 rps13基因
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四环素对高胆固醇喂养兔细胞因子和主动脉斑块面积的影响 被引量:1
5
作者 李章平 张怀勤 +3 位作者 陈寿权 蔡乃绳 李上共 王明山 《浙江医学》 CAS 2003年第4期212-214,共3页
目的 观察四环素对高胆固醇喂养兔肿瘤坏死因子 -α(TNF -α)、内皮素 -1(ET-1)和主动脉斑块面积比的影响 ,以探讨其可能抗动脉粥样硬化斑块的作用及机制。方法 36只雄性日本大耳兔随机分对照组、高胆固醇组和四环素组 ,测定饲养前、后... 目的 观察四环素对高胆固醇喂养兔肿瘤坏死因子 -α(TNF -α)、内皮素 -1(ET-1)和主动脉斑块面积比的影响 ,以探讨其可能抗动脉粥样硬化斑块的作用及机制。方法 36只雄性日本大耳兔随机分对照组、高胆固醇组和四环素组 ,测定饲养前、后血浆TNF -α、ET-1的含量和饲养后的主动脉全长斑块面积比。 结果饲养前各实验组间血浆TNF-α和ET-1的含量差别均无显著性意义 (P>0.05) ,饲养后高胆固醇组血浆TNF -α和ET-1含量明显高于对照组和四环素组 (均P<0.05) ,而后两者差别无显著性意义 (P>0.05) ;饲养后高胆固醇组动脉斑块面积比明显大于对照组和四环素组(P>0.05) ;而四环素组与对照组相比差别无显著性意义(P>0.05)。结论 TNF -α和ET-1参与高胆固醇性动脉粥样硬化的形成。四环素能降低高胆固醇喂养兔的TNF-α、ET-1含量和动脉粥样硬化斑块面积 ,可能具有一定抗动脉粥样硬化的作用并与降低TNF-α、ET-1有关。 展开更多
关键词 四环素 高胆固醇 细胞因子 主动脉斑块 面积 动脉粥样硬化
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Up-regulation of ribosomal protein S13 and L23 are associated with multidrug-resistant phenotype of gastric cancer cells
6
《胃肠病学》 2002年第B11期41-41,共1页
Aims:Prevous study using differential display-PCR had found up-regulation of ribosomal protein S13(RPS13) and L23(RPL23) in vincristine-resistant gastric cancer cells.The aim of this study was to explore the associati... Aims:Prevous study using differential display-PCR had found up-regulation of ribosomal protein S13(RPS13) and L23(RPL23) in vincristine-resistant gastric cancer cells.The aim of this study was to explore the association of RPS13 and RPL23 with multidrug-resistant phenotype of gastric cancer cells.Methods:Northern blot analysis was used to determine the expression of RPS13 and RPL23 in vincristine-resistant gastric cancer cells SGC7901/VCR and its parental cells SGC7901.The full-length cDNAs encoding RPS13 and RPL23 were amplified from SGC7901/VCR cells using RT-PCR.Their sense and antisense expression vectors were constructed by DNA recombinant technique,and transferred into SGC7901 cells(sense vectors) or SGC7901/VCR cells(antisense vectors)by means of Lipofactamine.Drug sensitivity of gastric cancer cells was evalu-ated using MTT assay.Cell cycle analysis was performed using flow cytometry and proliferous index(PI) was calculated.Results:As Northem blot analysis indicated,RNA from SGC7902/VCR cells exhibited moderate signals of PRL23 and RPS13,while RNA from SGC7901 cells exhibited no signal of RPL23 and very weak signal of RPS13.RNA dot blot analysis indicated that RPS13 or RPL23 upregulated SGC7901 cells(SGC7901-RPS13,SGC7901-RPL23)and RPS13 or RPL23 down-regulated SGC7901/VCR cells(SGC7901/VCR-anRPS13,SGC7901/VCR-anRPL23) were successfully prepared by gene transduction.The results of MTT assay indicated that,comparing with non-transfected and empty vector transfected cells,SGC7901-RPL23 cells showed significantly increased IC50 values and resistance index(RI) of vincristine(VCR),adriamycin(ADR),5-fludrouracil(5-Fu) and mitomycin(MMC);SGC7901-RPS12 cells showed significantly increased IC50 values and RI of VCR,ADR and 5-Fu;SGC7901/VCR-anRPL23 cells showed significantly decreased IC50 values and RI of MMC and cisplatin(DDP);SGC7901/VCR-anRPS13 cells showed significantly decreased IC50 values and RI of VCR and MMC.Cell cycle analysis indicated that,comparing with non-transfected and empty vector transfected cells,SGC7901-RPS13 cells showed increased S phase and PI;SGC7901-anRPS13 cells and SGC7901-anRPL23 cells showed decreased S phase and PI.Conclusion:RPL23 and RPS13 are up-regulated in vincristine-resistant gastric cancer cells.Modulation of RPL23 and RPS13 could alter multidrug-resistant phenotype of gastric cancer cells. 展开更多
关键词 表型 核糖体蛋白 胃癌细胞 rps13 RPS23 多药耐药 增量调节
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人核糖体蛋白S13编码基因的克隆及其正反义真核表达载体的构建
7
作者 翟惠虹 郭新宁 +3 位作者 时永全 杨力 胡建国 樊代明 《宁夏医学院学报》 2002年第5期319-322,共4页
目的 :克隆人核糖体蛋白S13(RPS13)cDNA片编码区全长序列 ,构建其正、反义真核表达载体 ,以进一步研究RPS13基因与胃癌多药耐药的关系。方法 :采用RT -PCR法扩增RPS13cDNA片段编码区全长序列 ,DNA重组技术构建其正、反义真核表达载体。... 目的 :克隆人核糖体蛋白S13(RPS13)cDNA片编码区全长序列 ,构建其正、反义真核表达载体 ,以进一步研究RPS13基因与胃癌多药耐药的关系。方法 :采用RT -PCR法扩增RPS13cDNA片段编码区全长序列 ,DNA重组技术构建其正、反义真核表达载体。结果 :RT -PCR法成功扩增了RPS13cDNA片段编码区全长序列 ,经DNA序列分析 ,证实与文献报道的人RPS13编码区序列一致。目的基因分别按正、反两个方向亚克隆至真核表达载体pcDNA3 1(+) ,并经酶切鉴定证实。结论 :成功克隆了人RPS13编码区全长基因序列 ,并构建了正。 展开更多
关键词 人核糖体蛋白S13 编码基因 克隆 真核表达载体 构建 反转录PCR
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肝癌组织长链非编码RNA RP13-143G15.3表达临床意义分析 被引量:4
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作者 廖倩 杨筱筠 仇小强 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2017年第12期829-834,共6页
目的近几年,大量的长链非编码RNA被发现,通过参与表观遗传、转录和翻译等实现对基因表达的调控,促进肿瘤细胞的发生发展和转移。探究长链非编码RNA RP13-143G15.3在肝癌及癌旁组织中的表达水平,分析其差异表达与临床指标之间的相关性,... 目的近几年,大量的长链非编码RNA被发现,通过参与表观遗传、转录和翻译等实现对基因表达的调控,促进肿瘤细胞的发生发展和转移。探究长链非编码RNA RP13-143G15.3在肝癌及癌旁组织中的表达水平,分析其差异表达与临床指标之间的相关性,为肝癌的诊疗提供新的标志物。方法对5例肝癌及癌旁组织进行长链非编码RNA(lncRNAs)表达谱筛查,选择具有表达差异的RP13-143G15.3扩大样本进行验证。收集2016-03-01-2016-06-30广西医科大学肿瘤医院肝胆外科进行肝癌切除术的56例患者肝癌及癌旁组织,采用实时荧光定量PCR技术检测RP13-143G15.3的相对表达水平,并分析其差异表达与患者临床特征、血清学指标及免疫组化指标的相关性。结果5例肝癌组织中RP13-143G15.3表达高于癌旁组织,P=0.005。在大样本56例肝癌组织中相对表达量为0.026 5±0.006,癌旁组织中相对表达量为0.040 7±0.025,肝癌组织中RP13-143G15.3表达明显低于相应癌旁组织(Z=-3.842,P<0.001),与芯片筛查结果不一致。RP13-143G15.3的差异表达与患者乙肝携带史(χ~2=4.667,P=0.031)、门脉高压(χ~2=5.250,P=0.022)、甲胎蛋白水平(χ~2=4.791,P=0.029)、乳酸脱氢酶(Z=-2.237,P=0.025)、谷氨酸脱氢酶(Z=-2.101,P=0.036)、纤维蛋白原(t=-2.103,P=0.040)、CA72-4(Z=-2.147,P=0.032)、免疫学指标CD34(χ~2=9.516,P=0.023)及肿瘤增殖抗原(χ~2=8.000,P=0.005)有关。结论 RP13-143G15.3在肝癌组织中表达下调,其可能起到抑癌作用,有望成为肝癌新的肿瘤标志物及分子靶点,为后续功能研究及机制研究提供理论基础。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 肝癌 RP13-143G15.3 临床特征
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长链非编码RNA对HepG2肝癌细胞增殖及凋亡的影响
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作者 韩娜娜 徐细明 +2 位作者 张美霞 甘园园 何晓琴 《现代生物医学进展》 CAS 2016年第10期1829-1832,1806,共5页
目的:探讨长链非编码RNA RP13-514E23.1在肝癌细胞系中的表达,并观察上调该基因后其下游基因MAPK10的变化及对肝癌细胞Hep G2增殖、凋亡的影响。方法:通过荧光定量PCR(q RT-PCR)检测RP13-514E23.1在正常肝细胞与肝癌细胞系中的表达差异... 目的:探讨长链非编码RNA RP13-514E23.1在肝癌细胞系中的表达,并观察上调该基因后其下游基因MAPK10的变化及对肝癌细胞Hep G2增殖、凋亡的影响。方法:通过荧光定量PCR(q RT-PCR)检测RP13-514E23.1在正常肝细胞与肝癌细胞系中的表达差异,进一步构建质粒转染肝癌Hep G2细胞上调RP13-514E23.1的表达,以Mock组(只加转染试剂)和NC组(转染空载体pc DNA3.1-NC)作为对照评估转染效率及对MAPK10表达的影响。用CCK-8实验和流式细胞术检测转染前后Hep G2细胞的增殖、凋亡的变化。结果:Lnc RNA RP13-514E23.1在大部分肝癌细胞系(Hep G2,SMMC,Huh7,Hep3B)中的表达明显低于正常肝细胞(0.58±0.05 vs 1.00,P<0.05);转染pc DNA-RP13-514E23.1后,q RT-PCR检测Hep G2细胞的RP13-514E23.1和MAPK10m RNA表达量显著升高(分别为29.90±1.40、2.42±0.25,P<0.05),western blot检测MAPK10蛋白表达量较对照组也升高(2.10±0.16,P<0.05);CCK-8结果显示Hep G2细胞在各个时间段增殖均受到抑制(P<0.01),Mock组、NC组和实验组的凋亡率分别为(5.53±1.17)%、(6.40±2.84)%和(46.87±3.45)%(P<0.01)。结论:Lnc RNA RP13-514E23.1在肝癌细胞系中表达异常降低,上调其表达后MAPK10的表达升高,且Hep G2细胞增殖受到抑制、凋亡增加。 展开更多
关键词 肝癌 长链非编码RNA RP13-514E23.1 MAPK10 增殖 凋亡
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