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题名LIPC基因多态性与脉络膜新生血管的关联性
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作者
廖玲
郝芳
蒋丹
黄璐琳
陈浩宇
杨正林
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机构
成都中医药大学医学技术学院
电子科技大学附属四川省人民医院人类疾病基因研究四川省重点实验室
汕头大学·香港中文大学联合汕头国际眼科中心
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出处
《中华实验眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期845-850,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(81430008、81790643,81300802、81670895)
国家重点研发计划项目(2016YFC0905200)
四川省科技厅项目(2014SZ0169、2015SZ0052、2015JQO057、2017JQ0024、2016HH0072、2013JY0195)。
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文摘
目的探讨脉络膜新生血管(CNV)与LIPC基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs10468017、rs920915和rs2070895的相关性。方法采用病例对照研究设计,纳入2010年1月至2016年12月于汕头国际眼科中心就诊的CNV患者221例作为CNV组,430名年龄、性别相匹配的健康志愿者作为正常对照组。抽取受试者空腹外周血各5 ml,抗凝后提取外周血DNA,对LIPC基因的SNP位点rs10468017、rs920915和rs2070895分别进行PCR扩增,纯化后使用单碱基延伸法(SNaPshot)对以上SNP位点进行基因分型。LIPC基因3个SNP位点的基因型频率采用Hardy-Weinberg平衡(HWE)检测;比较CNV组与正常对照组3个位点基因频率和基因型频率。结果LIPC基因3个SNP位点rs10468017、rs920915和rs2070895在总样本中的基因型频率分布均达到遗传平衡(P>0.05)。CNV组LIPC基因SNP位点rs10468017 TT基因型、rs920915 CC基因型和rs2070895 AA基因型的基因型频率分别为3.62%、5.43%和12.22%,正常对照组基因型频率分别为2.56%、5.58%和14.19%,差异均无统计学意义(均P>0.05);CNV组和正常对照组LIPC基因SNP位点rs10468017最小等位基因(T)频率分别为18.1%和17.2%,rs90915最小等位基因(C)频率分别为21.7%和23.1%,rs2070895最小等位基因(A)频率分别为33.7%和38.7%,差异均无统计学意义(均P>0.05)。CNV组和正常对照组LIPC基因3个SNP位点rs10468017、rs920915和rs2070895的优势比(OR)值[95%置信区间(CI)]分别为1.06(0.79~1.44)、0.92(0.70~1.21)和0.80(0.63~1.02)。结论本研究样本范围内未发现LIPC基因3个SNP位点rs10468017、rs920915和rs2070895与汕头地区汉族人群CNV的相关性。
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关键词
LIPC基因
年龄相关性黄斑变性
脉络膜新生血管
单核苷酸多态性
rs10468017
rs920915
rs2070895
关联性
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Keywords
LIPC gene
Age-related macular degeneration
Choroidal neovascularization
Single nucleotide polymorphism
rs 10468017
rs 920915
rs 2070895
Association
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分类号
R774.5
[医药卫生—眼科]
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