利用siRNA靶向沉默Jeko-1细胞survivin mRNA基因的实验研究

本研究旨在探讨Survivin基因在淋巴瘤细胞中的生物学作用,为将来以Survivin为靶点治疗套细胞淋巴瘤提供实验室证据。体外化学合成针对survivin mRNA基因的siRNA片段,通过DMRIE-C转染Jeko-1细胞,以无关siRNA、未转染的细胞为对照,采用RT-PCR和Western blot方法检测siRNA的抑制效果,利用流式细胞术检测细胞的凋亡率,用CCK-8法检测转染24、48、72 h对细胞增殖的影响。结果表明,与未转染的空白组相比,siRNA转染Jeko-1细胞后24、48、72 h survivin mRNA的相对表达量分别为0.49±0.03、0.38±0.02和0.17±0.02;细胞增殖抑制率分别为(31.2±2.1)%、(43.3±3.4)%和(52.6±2.5)%;细胞凋亡率分别为(6.3±0.5)%、(13.5±1.1)%和(23.6±1.6)%;survivin蛋白表达水平逐步减低。结论:靶向survivin的siRNA能在体外特异性下调目的基因survivin mRNA和蛋白的表达,表现出抑制Jeko-1细胞增殖和促使其凋亡的生物学效应,survivin基因有望成为淋巴瘤治疗的一个药物靶点。

siRNA介导的survivin基因沉默诱导人膀胱癌BIU-87细胞凋亡的研究

[目的]研究siRNA(small interferenceRNA)对人膀胱癌BIU-87细胞凋亡和survivin基因表达的影响。[方法]利用Ambion公司设计软件,设计并体外转录合成针对survivin基因的3个特异性siRNA,通过脂质体将siRNA转入BIU-87细胞,分别采用MTT和DNA原位末端标记(TUNEL)法检测siRNA对BIU-87细胞生长抑制率(IR)和凋亡指数(AI),半定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)和WesternBlotting检测siRNA对survivinmRNA及其蛋白表达的影响。[结果]转染后的siRNA1～3组的BIU-87细胞的IR(41.84%、56.21%、54.13%)和AI(21.98%、36.54%、31.34%)均分别显著高于正常对照组(1.98%和3.17%)(P<0.05),survivinmRNA及其蛋白表达水平均显著低于对照组;其中siRNA2～3对BIU-87细胞的IR、AI和survivin表达的抑制作用均显著高于siRNA1。[结论]体外转录合成的siRNA可抑制BIU-87细胞survivin的表达,诱导BIU-87细胞凋亡,从而抑制BIU-87细胞生长,为siRNA介导的膀胱肿瘤基因沉默提供实验依据。

siRNA对SGC7901/VCR细胞mdr1基因沉默效果的影响因素分析

目的分析siRNA沉默人胃癌SGC7901/VCR细胞mdr1基因效果的相关因素。方法设计并体外转录合成4条靶向mdr1的siRNA(mdr1si326、mdr1si1513、mdr1si2631和mdr1si3071),转染SGC7901/VCR细胞,用RTPCR和免疫印迹检测mdr1mRNA和Pgp的表达、流式细胞仪检测细胞内阿霉素的蓄积和MTT法检测细胞对阿霉素的敏感性,综合这4方面结果评价4条siRNA的沉默效果情况;用分子生物学软分析siRNA沉默效果的影响因素。结果沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列编码Pgp的跨膜区而且自身无茎和袢;沉默效果较差的mdr1si3071和最差的mdr1si1513靶序列编码Pgp的胞内区,前者自身成茎和成袢。沉默效果最好的mdr1si326和较好的mdr1si2631靶序列在靶位点和靶位点外间有较少的碱基配对和氢键。siRNA的沉默效果与siRNA3’5’端3个碱基中的A/U数量、N1和N19、GC含量间无规律可循。结论siRNA沉默SGC7901/VCR细胞mdr1的效果与靶序列的结构关系密切。

重组人核糖核酸酶抑制因子 基因的siRNA表达载体构建及B16细胞中基因沉默的鉴定

人核糖核酸酶抑制因子(Human ribonuclease inhibitor, hRI)是细胞质中的一种酸性糖蛋白,可以与血管生长因子(Angiogenin, Ang)紧密结合从而抑制血管形成.利用全基因组合成法合成针对人核糖核酸酶抑制因子基因(hri)的发夹shRNA序列,亚克隆到siRNA表达载体pKD;重组载体经酶切鉴定后,用脂质体法与报告基因绿色荧光蛋白重组融合的人核糖核酸酶抑制因子的逆转录病毒载体pLNCX-EGFP-C1-hri共转染到小鼠黑色素瘤细胞B16中,在荧光显微镜下检测干扰效果.用Image-Pro plus 4.5软件对绿色荧光照片半定量分析干扰效率.结果表明,荧光显微镜显示B16中表达的绿色荧光被干扰,荧光强度半定量分析干扰效率可达80%以上.成功重组构建了针对hri的siRNA表达载体.

siRNA介导Sry基因沉默对小鼠胚胎性别决定基因表达的影响

为研究Sry基因的调控网络,采用siRNA表达载体介导的RNAi技术,特异性地抑制睾丸决定因子Sry在小鼠胚胎中的表达,并观察Sry基因沉默后对在两性性腺分化中起重要作用的Wt1,Sf1,Dax1,Gata4,Sox9及Amh基因表达的影响。利用本课题组先前构建的siRNA重组表达载体(pSilencer4.1/Sry217及pSilencer4.1/Sry565),通过尾静脉注射法导入妊娠9.5天(9.5dpc)的母鼠体内,在11.5dpc时取胚胎,对性别鉴定为雄性的胚胎以RT-PCR法和Western-blot检测Sry基因的表达抑制效果,并同时用定量PCR法检测Wt1等上述性别决定相关基因表达变化情况。结果表明,注射干扰质粒后48hSry基因的mRNA和蛋白表达水平均降低,其中siRNA表达质粒pSilencer4.1/Sry565的抑制效果显著,可达到80%的抑制率。Sry基因沉默后,Wt1基因表达量显著升高;Sf1,Dax1,Gata4,Sox9基因表达水平没有明显变化;Amh基因无表达。试验结果表明,Sry基因表达抑制会导致Wt1基因表达升高;另外,Sry基因激活Sox9基因的表达可能需要其他的辅助因子协同作用。

小干扰RNA沉默survivin基因对结肠癌Caco-2细胞增殖和凋亡的影响

目的:观察survivin在人结肠癌细胞Caco-2中的表达及小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)沉默survivin基因对survivin蛋白表达、细胞增殖及凋亡的影响。方法:以脂质体LipofectAMINE 2000为载体,将针对特异靶点survivin基因的siRNA转染入人结肠癌细胞Caco-2。应用免疫细胞化学SP法和Western印迹法检测survivin蛋白表达的变化,MTT法检测细胞增殖,FCM法检测细胞凋亡。结果:免疫细胞化学检测结果显示,survivin蛋白在Caco-2细胞空白对照组、脂质体对照组及阴性错配对照组的细胞质中均呈强阳性表达,而在survivin-siRNA转染组细胞质中呈弱阳性表达;Western印迹法检测结果显示,survivin-siRNA转染组细胞的蛋白条带亮度明显低于空白对照组、脂质体对照组和阴性错配对照组;MTT检测结果显示,与阴性错配对照组相比,survivin-siRNA转染组细胞生长出现明显的抑制(P<0.05),且不同时段(24、48和72 h)的肿瘤细胞增殖抑制率之间差异有统计学意义(P<0.05);FCM检测结果显示,survivin-siRNA转染组细胞出现明显的亚二倍体峰,细胞凋亡率(9.72%)明显高于空白对照组(P<0.01)。结论:siRNA沉默survivin基因可抑制结肠癌细胞增殖,促进细胞凋亡。推测survivin基因可能成为结肠癌基因治疗的一个新靶点。

siRNA抑制survivin基因周期的影响表达对HeLa细胞

目的设计靶向survivin基因的干涉片段，构建真核表达载体pSUPER／survivin并转染宫颈癌HeLa细胞，探讨siRNA抑制survivin表达对联合1射线宫颈癌HeLa细胞周期的影响。方法化学合成干涉引物，退火获得survivin基因的干涉片段，连入pSUPER载体并测序。将测序正确的pSUPER／survivin载体转染HeLa细胞株，RT—PCR法和流式细胞术检测HeLa细胞中survivin基因的表达，流式细胞术检测转染联合＇射线照射后各组细胞的细胞周期数据。结果本实验成功的构建了pSUPER／survivin载体。转染pSUPER／survivin的HeLa细胞其survivin基因表达水平明显低于未转染的HeLa细胞及转染空载体pSUPER的HeLa细胞。1射线照射后，转染pSUPER／survivin的HeLa细胞发生了S期细胞比例下降，及G2／M期阻滞。结论成功的构建了pSUPER／survivin载体，siRNA干涉survivin可以作为提高放射敏感性的潜在分子靶点，通过减少S期细胞比例，促进肿瘤细胞凋亡，通过增加G2／M期阻滞增加放射线的杀伤。

三物白散对Survivin-RNA基因沉默转染胃癌SGC-7901细胞的影响

目的观察中药三物白散对含存活素(Survivin)基因沉默的慢病毒颗粒(Survivin-RNAi-LV)转染人胃癌SGC-7901细胞的影响。方法分别采用RT-PCR(聚合酶链式反应)、Western blot方法检测人胃癌SGC-7901细胞中Survivin m RNA和蛋白的表达;采用甲基噻唑基四唑(MTT)方法检测胃癌SGC-7901细胞的增殖情况、流式细胞仪检测凋亡率及三物白散对其增殖抑制率及凋亡率的影响。结果重组慢病毒颗粒介导的Survivin基因沉默转染人胃癌SGC-7901细胞可有效使Survivin m RNA和蛋白的表达沉默;三物白散对人胃癌SGC-7901细胞的生长具有抑制作用,并诱导肿瘤细胞凋亡;Survivin基因沉默转染胃癌SGC-7901细胞组应用三物白散,其细胞增殖弱于、细胞凋亡率高于三物白散+空白对照组和三物白散+阴性对照组(P<0.05)。结论含Survivin基因沉默的重组慢病毒颗粒转染人胃癌SGC-7901细胞,能够抑制SGC-7901细胞Survivin的表达,三物白散对Survivin基因沉默转染后胃癌细胞的杀伤力较未转染细胞有明显的提高。

siRNA介导的基因沉默

siRNA(small interfering RNA)介导的基因沉默是细胞内监控寄生的遗传物质、沉默无用的信息模板和调节自然的时空转换的一种分子机制。它与体液免疫和细胞免疫一起形成了动物和人类机体中免疫系统的三大支柱,从不同水平上来对抗体内外有害物质的干扰和侵犯。现已清楚,大约22个核苷酸长的双链RNA能够通过不同途径,以序列特异的方式来高效地沉默含有同源序列的靶RNA分子。这一古老而又迷人的系统现已被公认为是鉴定基因功能、调控基因表达和改变基因表型的简单而有效的方法。可以预计,这一新颖的技术在不远的将来必将形成一条研究功能基因组学、探索信号通路和创造遗传缺陷模型的高速公路,并将开创一条预防和治疗人类疾病的新途径。

siRNA沉默COX-2基因抑制MDA-MB-231细胞增殖

COX-2是前列腺素合成的关键酶，在正常组织细胞中一般不表达或者低表达，在高侵袭性乳腺癌细胞中高表达COX-2。本研究通过使用siRNA技术靶向沉默COX-2基因，从而抑制COX-2的表达，观察MDA-MB-231细胞增殖能力的变化，进一步探讨COX-2在肿瘤细胞增殖过程中所起的作用，并为基因沉默COX-2，防治乳腺癌提供实验依据。

Survivin siRNA、HSP70双基因转染对乳腺癌细胞株MCF7 survivin及HSP70表达的影响

目的探讨survivin siRNA、HSP70双基因转染对乳腺癌细胞株MCF7survivin、HSP70表达的影响。方法常规培养乳腺癌细胞株MCF7,将已构建的真核表达载体(pIRES2-EGFP-survivin siRNA、pIRES2-EGFP-HSP70)用脂质体介导转染MCF7细胞,利用倒置荧光显微镜观察转染后的细胞,通过western-blot、RT-PCR检测转染后细胞中HSP70蛋白、survivin蛋白及survivinmRNA表达的变化。结果转染空载体与转染真核表达载体的乳腺癌细胞株MCF7于倒置荧光显微镜下可见绿色荧光,证实转染成功。转染真核表达载体的MCF7细胞与转染空载体的MCF7细胞和未转染的MCF7细胞相比,survivin mRNA和survivin蛋白表达水平降低,而HSP70蛋白表达升高。结论 survivin siRNA能有效抑制MCF7细胞内源survivin基因的表达,HSP70能上调MCF7细胞HSP70蛋白的表达,为进一步深入研究survivin siRNA、HSP70双基因对乳腺癌细胞株MCF7生物学特性的影响奠定实验基础。

siRNA沉默胰腺癌BXPC-3细胞中Her-2/neu基因对COX-2表达水平及细胞增殖、凋亡、侵袭力的影响

目的分析胰腺癌BXPC-3细胞中原癌基因人表皮生长因子受体-2(Her-2/neu)基因siRNA沉默对环氧合酶-2(COX-2)表达水平及其对细胞增殖、凋亡、侵袭的影响。方法通过Western blot法与实时荧光定量PCR法对正常胰腺细胞株和胰腺癌BXPC-3细胞中的COX-2、Her-2/neu蛋白及其mRNA表达进行检测。建立Her-2/neu基因siRNA慢病毒表达载体并对BXPC-3细胞进行转染,其中转染Her-2/neu siRNA慢病毒载体为观察组,转染NC-GFP-LV为阴性对照组,未转染的细胞为空白对照组。分别采用CCK-8法、流式细胞分析仪和细胞实验技术(Transwell实验)分析Her-2/neu基因siRNA沉默对细胞增殖、凋亡、侵袭的影响。结果 COX-2、Her-2/neu蛋白及其mRNA在胰腺癌BXPC-3细胞中的表达水平明显高于正常胰腺HPDE6C7细胞的表达(P<0.01)。观察组COX-2、Her-2/neu蛋白及其mRNA表达水平明显下调,较阴性对照组与空白对照组表达水平均明显降低(P<0.01),而阴性对照组与空白对照组表达水平的比较,并无显著差异(P>0.05)。Her-2/neu基因siRNA沉默可明显减弱细胞增殖和侵袭力,增加细胞凋亡率。结论 COX-2、Her-2/neu蛋白及其mRNA在胰腺癌BXPC-3细胞中均呈现高表达,且Her-2/neu基因siRNA沉默可明显阻滞细胞增殖及侵袭,导致细胞凋亡。

NF-κB p65基因沉默条件下HT29细胞中Survivin表达活性的研究

目的:以特异性siRNA转染结肠癌细胞HT29,沉默NF-κB p65基因的表达,研究肿瘤细胞中NF-κB p65调节Survivin基因的表达。方法:以噻唑蓝(MTT)法观察对细胞增殖活性的影响,明确最佳的作用浓度。通过Western Blot检测结肠癌细胞内NF-κB p65及Survivin蛋白表达水平的变化。将设计合成好的特异性针对NF-κB p65基因的片段,体外转染结肠癌细胞株HT29,Western Blot检测NF-κB p65基因沉默效应,进而观察对结肠癌细胞内Survivin蛋白表达水平的影响,明确NF-κB p65是否有Survivin表达的调节作用。结果:siRNA干扰后细胞内NF-κB p65蛋白表达水平降低,较对照细胞组差异有统计学意义(P<0.01)。同时NF-κB p65基因沉默后,取消了先前缺氧条件下细胞内Survivin的表达增高,与对照细胞组相比无统计学意义差异(P>0.05)。结论:采用特异性siRNA片段对结肠癌进行靶向NF-κB p65基因沉默,能有效降低Survivin基因的表达,抑制Survivin可能通过多种信号转导通路参与肿瘤的发生发展过程。

脂质体RNAiMAX介导siRNA转染沉默星形胶质细胞AQP4基因

目的明确脂质体RNAiMAX(lipofectamine RNAiMAX)是否可以介导小干扰RNA(siRNA)转染入原代培养星形胶质细胞并实现水通道蛋白4(AQP4)基因沉默。方法利用原代培养的Wistar大鼠大脑皮层星形胶质细胞,通过倒置荧光显微镜和Tecan酶标仪,观察lipofectamine RNAiMAX是否能介导Cy3标记的siRNA转染入细胞内,以及RNAiMAX浓度和siRNA浓度对转染效率的影响;利用Real-time PCR方法检测AQP4 siRNA转染的基因沉默效果。结果倒置荧光显微镜和Tecan酶标仪检测发现,随着siRNA和RNAiMAX浓度的增加,转染细胞荧光强度随之增加(n=6);Real-time PCR检测结果显示,3ml/L RNAiMAX和30nmol/L AQP4 siRNA以及6ml/L RNAiMAX和60nmol/L AQP4 siRNA转染星形胶质细胞24h、48h、72h时,AQP4 mRNA水平均降低80%以上(n=6)。结论 Lipofectamine RNAiMAX可以介导siRNA转染入原代培养星形胶质细胞中并实现AQP4基因的沉默,3ml/L RNAiMAX和30nmol/L AQP4 siRNA即可达到理想的沉默效果。

沉默Survivin基因对人头颈鳞癌细胞周期以及细胞凋亡的影响

目的采用基因沉默手段沉默人头颈鳞癌细胞中Survivin基因的表达,进而探讨Survivin基因沉默对人头颈鳞癌细胞凋亡的影响。方法采集人头颈鳞癌PCI-37B细胞作为观察对象,根据细胞处理方式的差异将其分为观察组、阴性对照组、空白对照组。其中观察组采用基因沉默手段对PCI-37B细胞进行处理,将Sruvivin-SiRNA进行细胞转到入PCI-37B。阴性对照组选用FAM-SiRNA-Mate复合物。空白对照组则应用未进行转染处理的正常细胞。采用流式细胞仪检测PCI-37B细胞凋亡情况,观察细胞周期的变化,并与阴性对照组、空白对照组进行比较。结果Survivin基因沉默处理后,人头颈鳞癌细胞PCI-37B细胞凋亡率明显升高,与阴性对照组、空白对照组比较差异存在显著,并且阴性对照组与空白对照组比较无显著差异(P>0.05);细胞周期变化观察结果显示,Survivin基因沉默能够对肿瘤细胞周期产生影响,降低鳞癌细胞在S期的比率,与阴性对照组、空白对照组比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论应用基因沉默手段沉默Survivin基因的表达可有效诱导人头颈鳞癌细胞PCI-37B细胞的凋亡活动,对抑制肿瘤细胞的生长以及浸润具有重要作用,临床可以此作为切入点研究、制定人头颈鳞癌的靶向治疗方案。

氨基修饰对siRNA基因沉默功能的影响

目的:观察小干扰RNA(siRNA)经氨基修饰后对其功能的影响。方法:将合成的单链siRNA退火成双链siRNA,2%琼脂糖凝胶鉴定退火是否成功。整合有加强绿色荧光蛋白(EGFP)报告基因的pcDNA3质粒小提纯化。脂质体法将双链siRNA和pcDNA3/EGFP共转HEK293细胞。倒置荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白(GFP)表达情况并进行定量测定,用SPSS11.5软件进行统计学分析。结果:各实验组siRNA均抑制了GFP的表达,与pcDNA3/EGFP转染组相比较有显著性差异。结论:氨基修饰后对siRNA的基因沉默作用没有影响。

SiRNA介导的基因沉默及其在植物抗病毒应用中的研究进展

基因沉默是由双链RNA介导的同源RNA的降解现象,是一种古老的RNA监控系统,协助生物体抵抗外来核酸的入侵。基因沉默系统是植物抵抗病毒侵染的防卫体系,在长期的协同进化过程中,由病毒编码的抑制蛋白可以抵消基因沉默系统的作用。本文对基因沉默的过程、病毒编码的抑制子蛋白及基因沉默在植物抗病毒工程的研究进展进行简要综述。

靶向VEGFR2基因的siRNA分子血清稳定性及其基因沉默效应

目的设计并合成抗小鼠VEGFR2基因的siRNA分子(siVEGFR2),研究其血清稳定性和基因沉默效应,以便进一步研究经组织靶向性结构修饰后该siRNA分子的特性。方法设计并合成抗小鼠VEGFR2基因的siRNA分子,在37℃条件下与新鲜血清共孵育24h,不同时间点后取样电泳观察其完整性;用脂质体介导转染体外培养的MS1细胞,通过半定量RT-PCR分析基因沉默效果。结果随着孵育时间延长,未经修饰的siVEGFR2分子在血清中逐渐降解;经siVEGFR2转染的MS1细胞中,VEGFR2mRNA的表达水平明显下降,与空白转染组和对照siRNA转染组相比有显著差异(P<0.001),而空白转染组和对照siRNA转染组间比较无显著性差异(P=0.157)。结论裸siVEGFR2分子在血清中容易降解,siVEGFR2能特异性沉默靶基因的表达,为下一步体内应用siVEGFR2分子时稳定性修饰的必要性提供了理论依据。

具有较高基因沉默效应的siRNA设计

详细说明了如何通过对特定基因mRNA序列进行分析设计具有较高基因沉默效应的siRNA方法,并应用该方法针对小鼠早幼粒细胞白血病基因pml3设计相应的siRNA.通过RTPCR和WesternBlot的方法,验证了其对pml3基因表达的抑制效果,实验证明通过我们提出的方法所设计的siRNA具有较高的基因沉默效应.