核仁小分子RNA(snoRNA)是一类广泛分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件,并以此划分为3大类:box C/D snoRNA、box H/ACA snoRNA和MRP RNA。其中box C/D和box H/ACA是已知snoRNA的主要类型,以碱基配对的方式分别...核仁小分子RNA(snoRNA)是一类广泛分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件,并以此划分为3大类:box C/D snoRNA、box H/ACA snoRNA和MRP RNA。其中box C/D和box H/ACA是已知snoRNA的主要类型,以碱基配对的方式分别指导着核糖体RNA的甲基化和假尿嘧啶化修饰。研究发现,s n o R N A除了在核糖体R N A的生物合成中发挥作用之外,还能够指导snRNA、tR N A和m R N A的转录后修饰。此外,还有相当数量的snoRNA功能不明,被称为孤儿snoRNA(orphan snoRNA)。在哺乳动物的孤儿snoRNA中,印迹snoRNA(imprinted snoRNA)是最为特殊的一群,由基因组印迹区编码,具有明显的组织表达特异性。原核生物古细菌中类snoRNA的鉴定表明这些非编码RNA家族成员的古老起源;而哺乳动物中大量的snoRNA反转座子的存在更为人们探索snoRNA在基因组中扩增和功能进化提供了新的思路。展开更多
目的探讨snoRNA来源的piRNA在乳腺癌中对FOXO3a基因的影响。方法将5个化学合成的pi-snoRNAs(pi-sno44/74/75/78/81)分别转入MDA-MB-231乳腺癌细胞后收样提取总RNA,检测每个piRNA对FOXO3a m RNA水平的影响,找出对FOXO3a作用最明显的piRNA...目的探讨snoRNA来源的piRNA在乳腺癌中对FOXO3a基因的影响。方法将5个化学合成的pi-snoRNAs(pi-sno44/74/75/78/81)分别转入MDA-MB-231乳腺癌细胞后收样提取总RNA,检测每个piRNA对FOXO3a m RNA水平的影响,找出对FOXO3a作用最明显的piRNA,验证其对FOXO3a蛋白水平的影响;收集2016年3月~2016年10月在我科行乳腺根治手术的乳腺癌患者术后新鲜肿瘤及瘤旁标本28对,检测其中pi-sno81、sno81及FOXO3a的表达情况;应用典型相关分析对pi-sno81、sno81及FOXO3a在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达情况进行相关性分析,了解pi-sno81与FOXO3a的相关性。结果 qRT-PCR检测发现,FOXO3a基因表达被pisno44/74/75/81上调;其中pi-sno81上调FOXO3a最明显,且pi-sno81明显上调了FOXO3a蛋白水平;FOXO3a在乳腺癌中呈低表达;相关性分析发现,pi-sno81在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达与FOXO3a在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达成正相关(P<0.001,Corr=0.835)。结论 snoRNA来源的pi-sno81能上调乳腺癌细胞中FOXO3a基因的表达,并可能通过影响FOXO3a的表达影响乳腺癌细胞的生长。展开更多
Through computer screening of Genbank and experimental analysis a novel snoRNA, termed Z25, was first identified from mammals. Z25 snoRNA is 69 nucleotide in length, possessing typical boxC/D and terminal repeat seque...Through computer screening of Genbank and experimental analysis a novel snoRNA, termed Z25, was first identified from mammals. Z25 snoRNA is 69 nucleotide in length, possessing typical boxC/D and terminal repeat sequence, a 11 nt long sequence complementarity to 18S rRNA implies that Z25 snoRNA is a 2′ O ribose methylation guide at A1678 (human coordinate) of 18S rRNA. Z25 snoRNA is encoded by the fifth intron of human, mouse and rat nucleolin genes that have been found as the host genes for U20 and U23 snoRNA.展开更多
文摘核仁小分子RNA(snoRNA)是一类广泛分布于真核生物细胞核仁的小分子非编码RNA,具有保守的结构元件,并以此划分为3大类:box C/D snoRNA、box H/ACA snoRNA和MRP RNA。其中box C/D和box H/ACA是已知snoRNA的主要类型,以碱基配对的方式分别指导着核糖体RNA的甲基化和假尿嘧啶化修饰。研究发现,s n o R N A除了在核糖体R N A的生物合成中发挥作用之外,还能够指导snRNA、tR N A和m R N A的转录后修饰。此外,还有相当数量的snoRNA功能不明,被称为孤儿snoRNA(orphan snoRNA)。在哺乳动物的孤儿snoRNA中,印迹snoRNA(imprinted snoRNA)是最为特殊的一群,由基因组印迹区编码,具有明显的组织表达特异性。原核生物古细菌中类snoRNA的鉴定表明这些非编码RNA家族成员的古老起源;而哺乳动物中大量的snoRNA反转座子的存在更为人们探索snoRNA在基因组中扩增和功能进化提供了新的思路。
文摘目的探讨snoRNA来源的piRNA在乳腺癌中对FOXO3a基因的影响。方法将5个化学合成的pi-snoRNAs(pi-sno44/74/75/78/81)分别转入MDA-MB-231乳腺癌细胞后收样提取总RNA,检测每个piRNA对FOXO3a m RNA水平的影响,找出对FOXO3a作用最明显的piRNA,验证其对FOXO3a蛋白水平的影响;收集2016年3月~2016年10月在我科行乳腺根治手术的乳腺癌患者术后新鲜肿瘤及瘤旁标本28对,检测其中pi-sno81、sno81及FOXO3a的表达情况;应用典型相关分析对pi-sno81、sno81及FOXO3a在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达情况进行相关性分析,了解pi-sno81与FOXO3a的相关性。结果 qRT-PCR检测发现,FOXO3a基因表达被pisno44/74/75/81上调;其中pi-sno81上调FOXO3a最明显,且pi-sno81明显上调了FOXO3a蛋白水平;FOXO3a在乳腺癌中呈低表达;相关性分析发现,pi-sno81在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达与FOXO3a在乳腺癌及癌旁乳腺组织中的表达成正相关(P<0.001,Corr=0.835)。结论 snoRNA来源的pi-sno81能上调乳腺癌细胞中FOXO3a基因的表达,并可能通过影响FOXO3a的表达影响乳腺癌细胞的生长。
基金Supported by Natural Science Project Establishment Subject of Jiangxi Science & Technology Normal University(KY2008ZY03 )Teaching Research Provincial Project Establishment Subject of Higher Education of Jiangxi Province (JXJG-13-29)~~
文摘Through computer screening of Genbank and experimental analysis a novel snoRNA, termed Z25, was first identified from mammals. Z25 snoRNA is 69 nucleotide in length, possessing typical boxC/D and terminal repeat sequence, a 11 nt long sequence complementarity to 18S rRNA implies that Z25 snoRNA is a 2′ O ribose methylation guide at A1678 (human coordinate) of 18S rRNA. Z25 snoRNA is encoded by the fifth intron of human, mouse and rat nucleolin genes that have been found as the host genes for U20 and U23 snoRNA.