水稻Hsp70基因第一个内含子中snoRNA基因簇的保守性及分布特点

对水稻、野生稻和茭白Ｈｓｐ７０基因第一个内含子进行ＰＣＲ分析及部分序列测定，分析结果表明植物Ｈｓｐ７０基因内含子编码多个ｓｎｏＲＮＡ的基因组织具有一定的保守性和分布范围，揭示了植物内含子编码的ｓｎｏＲＮＡ在进化过程中具有比脊椎动物和酵母更加丰富的多样性和移动性．

酵母snoRNA基因簇启动子的比较分析

报道对酿酒酵母ｓｎｏＲＮＡ基因簇启动子序列的研究结果．通过计算机分析，发现酿酒酵母中Ｚ２Ｚ８和ＳｎＲ１９０Ｕ１４ｓｎｏＲＮＡ基因簇有相似的启动子结构．这两个ｓｎｏＲＮＡ基因簇都是由一个上游的启动子负责整个基因簇的转录，产生多个顺反子ｓｎｏＲＮＡ的前体，然后再加工成熟为各个独立的ｓｎｏＲＮＡ．在启动子保守序列ＴＡＴＡｂｏｘ的上游还发现２个ＲＡＰ１序列，表明ｓｎｏＲＮＡ基因簇的表达可以通过ＲＡＰ１元素与核糖体蛋白基因的表达协同调控．这是在ｓｎｏＲＮＡ基因的启动子中首次发现ＲＡＰ１调控元素．对ｓｎｏＲＮＡ基因簇的进化特点也进行了讨论．

核仁小分子RNA及其基因组织形式

核仁小分子RNA(snoRNA)是非编码RNA中研究得最多,了解得最详细的成员之一。依据snoRNA保守的序列和结构元件可将其分成三类:box C/D snoRNA,box H/ACA snoRNA以及MRP RNA。它们的主要功能分别为指导rRNA或snRNA中特异位点的2′-O-核糖甲基化修饰、假尿嘧啶化修饰或作为分子伴侣参与靶标RNA高级结构的形成。目前发现的snoRNA基因组织主要有四种形式:独立基因编码的snoRNA、内含子编码的snoRNA、多顺反子snoRNA基因簇和内含子编码的snoRNA基因簇。但是,并不是每种生物都具有这四种基因组织形式。大多数脊椎动物的snoRNA产生于蛋白质基因的内含子中,植物snoRNA基因多以基因簇的形式存在,大部分酵母snoRNA由独立基因编码,锥体虫snoRNA以多顺反子形式存在,果蝇snoRNA基因都位于宿主基因的内含子中。随着对snoRNA研究工作的不断深入,snoRNA基因组织形式也呈现出前所未有的复杂性和多样性。

酿酒酵母反义snoRNA一级结构的分析

对酿酒酵母Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ基因组中发现和鉴定的４１个反义ｓｎｏＲＮＡ进行一级结构的分析表明：酿酒酵母ｓｎｏＲＮＡ基因富含ＡＴ；４１个反义ｓｎｏＲＮＡ全都具有ｂｏｘＣ’和ｂｏｘＤ’结构元素；根据反义ｓｎｏＲＮＡ保守结构元素及反义序列的数目和位置的特点，将反义ｓｎｏＲＮＡ分为５种结构类型，认为ｓｎｏＲＮＡ分子具有两个主要的功能区；在ｓｎＲ５７、ｓｎＲ５９、ｓｎＲ６８、ｓｎＲ７１和ｓｎＲ７５不具有指导甲基化反义序列的功能区中，发现有一段长１０～１２个核苷酸的序列与ｒＲＮＡ互补．为进一步研究反义ｓｎｏＲＮＡ的结构与功能提供了重要线索．

Identification of a Novel snoRNA Gene in Arabidopsis thaliana L.

[ Objective] To identify a novel snoRNA gene in Arabidopsis thalianan. [ Method ] Genome sequence of Arabidopsis thalianan was screened by using bioinformatics methods, and the sequence structure, organization form and function of typical candidate gene were analyzed. [ Result] The identified snR95 box H/ACA snoRNA had conservative component and structural features of box C/D snoRNA family, possessed two more than 10 nt long rRNA antisense elements. The result revealed that the novel snoRNA is a partial counterpart of the rice Z270, named box C/D snoRNA -AthZ270. [ Conclusion ] Z270 snoRNA in Arabidopsis thalianan has different function with common snoRNA.

β-罗勒烯诱导表达的SFIBO基因候选启动子短截分析

植物通讯信号分子β-罗勒烯在植物防御方面起着重要作用,受β-罗勒烯诱导快速高表达的SFIBO(snoRNAs Fast-Induced by Ocimene)基因的启动子特性有待研究。SFIBO基因起始密码子上游有877 bp,依据这段序列上已知的元件分布特征,将877 bp分成三段:-877~-1 bp、-637~-1 bp和-277~-1 bp。将这3个片段分别扩增后与GUS报告基因构建融合表达框,并利用浸花法将这3个植物双元表达载体转化拟南芥Col-0。对GUS组织化学染色进行分析,结果显示SFIBO基因的有效启动子为起始密码子上游637 bp DNA片段,β-罗勒烯诱导反应的顺式作用元件在-637~-277 bp之间的这360 bp DNA序列上。以上结果为下一步确定β-罗勒烯响应元件的具体序列和研究SFIBO基因的功能提供了科学依据。