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题名水稻水溶性环氧化合物水解酶的生物信息学分析
被引量:3
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作者
郑柳城
朱宏波
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机构
广东海洋大学农学院
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出处
《生物信息学》
2009年第2期108-112,139,共6页
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基金
国家自然科学基金(批准号:30500318)项目资助
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文摘
水溶性环氧化合物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase,SEH)是一组催化环氧化合物水解为相应邻位二醇的酶类,在哺乳动物、植物、昆虫和微生物体内广泛存在。通过BLAST对水稻基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得10个水溶性环氧化物水解酶(Soluble Epoxide Hydrolase SEH)sEH蛋白的同源序列。经分析发现这些基因在水稻不同胁迫处理下各个部位都有所表达,而且不同成员之间的表达模式存在较大的差异。水稻sEH蛋白主要参与角质层形成,应激反应,以及病原防御等生理过程,特别在脱毒过程中扮演着重要的角色。对蛋白质多序列联配和三级结构预测结果表明:水溶性环氧化合物水解酶的核心结构域由3个催化残基Asp、His和Asp形成三位一体的催化活性构象。这类基因的表达受抗逆环境诱导,其功能与抗逆性有关,为基因工程抗逆育种提供了参考。
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关键词
水溶性环氧化合物水解酶(EH)
生物信息学
水稻
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Keywords
soluble epoxide hydrolase(seh) ,rice (oryza sativa), bioinformatics
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分类号
Q556
[生物学—生物化学]
S511
[农业科学—作物学]
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