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沙蚕蛋白酶高效降解变异新冠病毒S蛋白作用与S蛋白的生化特性分析
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作者 阚慕洁 白若伦 +4 位作者 刘智奇 白宇 王少华 刘剑凯 洪敏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期251-257,共7页
从今年3月起,WHO不再将新冠病毒感染,列为全球关注的灾害性卫生事件,但是新感染病例依然存在,其原因与病毒基因组经常突变,引起特异抗体失效和免疫逃逸有关,同时特异性治疗药物依然有限。病毒S蛋白是病毒感染宿主细胞的关键结构,S蛋白... 从今年3月起,WHO不再将新冠病毒感染,列为全球关注的灾害性卫生事件,但是新感染病例依然存在,其原因与病毒基因组经常突变,引起特异抗体失效和免疫逃逸有关,同时特异性治疗药物依然有限。病毒S蛋白是病毒感染宿主细胞的关键结构,S蛋白质突变,导致其结构生化特征和功能等随之变化。我们曾分析了世卫组织(WHO)认定的野生型和5种关切变异毒株的生化特征,并研究证实了日本刺沙蚕碱性丝氨酸蛋白酶(ASP_(NJ))可以高效与相对特异地降解野生型病毒S蛋白。本文分析了Omicron变异毒株(BA.2、BF.7、XBB.1)S蛋白质与ASP_(NJ)相关的生物化学特征,并经SDS-PAGE分析,直观证实了ASP_(NJ)可以高效降解这些S蛋白质,但变异株S蛋白抵抗ASP_(NJ)消化能力更强一些。本文还报告了ASP_(NJ)对野生型假病毒的影响,初步结果显示,ASP_(NJ)可能具有减少野生型假病毒感染293T-CAE2受体细胞的作用。这些结果表明,ASP_(NJ)有可能成为一种新工具酶,用于研究新冠病毒的结构与功能。 展开更多
关键词 新冠病毒 刺突蛋白 沙蚕碱性丝氨酸蛋白酶 变异新冠病毒 假病毒
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牛冠状病毒刺突蛋白研究进展 被引量:2
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作者 刘强 牛小霞 +6 位作者 方敏 刘艳玲 高辉 陈吉祥 加华才让 张思浓 李勇 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期944-956,共13页
牛冠状病毒(bovine coronavirus, BCoV)是一种能感染牛肠道、呼吸道引起新生犊牛腹泻、成年牛冬季痢疾和各年龄段的牛呼吸道疾病的重要病原体,严重危害着养牛业的发展。刺突(spike, S)蛋白是该病毒主要的结构蛋白和免疫原性蛋白,在病毒... 牛冠状病毒(bovine coronavirus, BCoV)是一种能感染牛肠道、呼吸道引起新生犊牛腹泻、成年牛冬季痢疾和各年龄段的牛呼吸道疾病的重要病原体,严重危害着养牛业的发展。刺突(spike, S)蛋白是该病毒主要的结构蛋白和免疫原性蛋白,在病毒初始感染和诱导保护性免疫中发挥重要作用。本文就该病毒刺突蛋白的结构特征、生物学功能及应用研究、免疫原性、变异原因和潜在双受体系统的最新研究进展做一阐述,期望为新型疫苗研制和靶点治疗药物开发提供科学依据,以便制定快速有效的安全防治对策应对预出现的新毒株。 展开更多
关键词 牛冠状病毒 刺突蛋白 生物学功能 蛋白变异
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基于双核酸适配体的磁珠-SERS标签三明治结构用于SARS-CoV-2病毒表面S蛋白的快速检测
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作者 田先敏 许珊珊 +4 位作者 关鹏程 冯笛 王甜 张月皎 李剑锋 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期1-7,共7页
面对新型冠状病毒2019(COVID-19)传播速度极快的情况,发展快速、准确和低成本的诊断方法以检测SARS-CoV-2病毒的特定抗原非常必要。基于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的COVID-19检测需要特定的实验室,耗时较长。本文针对SARS-CoV-2刺突蛋... 面对新型冠状病毒2019(COVID-19)传播速度极快的情况,发展快速、准确和低成本的诊断方法以检测SARS-CoV-2病毒的特定抗原非常必要。基于逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)的COVID-19检测需要特定的实验室,耗时较长。本文针对SARS-CoV-2刺突蛋白,提出了一种基于核酸适配体特异性识别的一步捕获底物和检测探针的表面增强拉曼光谱(SERS)检测平台。利用模拟病毒(PSV)进行实验,不经预处理,在5 min内用便携式拉曼光谱仪检测SARS-CoV-2病毒及其变异株。实验结果表明,针对模拟病毒的检出限为200 TU/mL。此外,该方法可以检测另外5种SARS-CoV-2的变异病毒株,咽拭子体系中的极限检测限可以达到5000 TU/mL。实际大批量咽拭子的实验结果可以达到特异性为100%的效果。因此,该平台在SARS-CoV-2的医护点快速诊断中具有很大的应用潜力。 展开更多
关键词 SERS SARS-CoV-2 刺突蛋白 模拟病毒(PSV) 便携式拉曼光谱仪
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猪流行性腹泻病毒S蛋白和M蛋白截短表达及多克隆抗体制备
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作者 李德龙 周建方 +9 位作者 余远迪 丁鸿飞 肖奇奇 黄庄 李悦林 罗丽娜 黄涵 刘辉鑫 杨婧婧 付利芝 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期41-44,共4页
为制备猪流行性腹泻病毒(PEDV)S蛋白和M蛋白的多克隆抗体,用蛋白结构分析软件对S和M基因序列进行分析,截取2个基因的相关抗原片段,依据大肠埃希氏菌偏好密码子进行密码子优化、序列合成。将合成的片段克隆至pET-32a(+),转化入大肠埃希氏... 为制备猪流行性腹泻病毒(PEDV)S蛋白和M蛋白的多克隆抗体,用蛋白结构分析软件对S和M基因序列进行分析,截取2个基因的相关抗原片段,依据大肠埃希氏菌偏好密码子进行密码子优化、序列合成。将合成的片段克隆至pET-32a(+),转化入大肠埃希氏菌BL21(DE3),IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE检测。大量表达重组蛋白,免疫昆明小鼠制备多克隆抗体。结果表明,成功表达大小约为38ku和32ku的重组蛋白Sm和Mm,免疫小鼠后制备的抗Sm多克隆抗体效价超过1:25600,抗Mm多克隆抗体效价超过1:51200,且Westernblot表明多克隆抗体特异性良好。研究制备的多克隆抗体可以为建立PEDV检测方法和开发亚单位疫苗提供材料。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒S蛋白 M蛋白 抗原表位 多克隆抗体
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SARS⁃CoV⁃2免疫逃逸NTD中和抗体的分子机制
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作者 洪琴 徐诗奇 +3 位作者 王艳兴 张超 黄忠 丛尧 《电子显微学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期329-338,共10页
针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)中和抗体的开发,主要针对SARS-CoV-2表面的刺突(Spike,S)蛋白。大多数中和SARS-CoV-2的单克隆抗体(MAbs)可结合S蛋白的受体结合结构域(re... 针对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)中和抗体的开发,主要针对SARS-CoV-2表面的刺突(Spike,S)蛋白。大多数中和SARS-CoV-2的单克隆抗体(MAbs)可结合S蛋白的受体结合结构域(receptor-binding domain,RBD),从而阻断病毒与血管紧张素转化酶2(Angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)的相互作用。作者早期通过SARS-CoV-2原型株S蛋白免疫小鼠,筛选得到S2G4,S2H5,S4D4,S5B84株与S蛋白氮末端结构域(N-terminal domain,NTD)不同表位结合的单克隆抗体,其中S2H5活病毒中和能力最强。本研究利用冷冻电镜技术解析了S2H5的抗原结合片段(Fab)结合SARS-CoV-2原型株S蛋白复合体的结构,共获得六种构象,其中S2H5 Fab结合在S蛋白的NTD上,结构模拟完整S2H5抗体结合S蛋白可以空间上阻碍S蛋白与ACE2相互作用,揭示了S2H5中和SARS-CoV-2原型株的结构基础。此外,作者应用假病毒中和实验,分析了上述四种抗体对SARS-CoV-2多种突变株的中和能力,显示了其突变株对NTD抗体的免疫逃逸,并从结构生物学角度对各突变株表现出的免疫逃逸提供了可能的解释。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 刺突蛋白 中和抗体 冷冻电镜
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马铃薯三糖甘草次酸衍生物通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂
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作者 万欣 洪崇竣 +2 位作者 王进绅 宋高鹏 刘叔文 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期474-483,共10页
目的 研究马铃薯三糖甘草次酸衍生物能否通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞,作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂。方法 以天然SARS-CoV-2进入抑制剂甘草酸为先导化合物,利用活性亚结构的拼合原理等设计并合成了系列马铃薯三糖甘草次酸衍生... 目的 研究马铃薯三糖甘草次酸衍生物能否通过抑制SARS-CoV-2进入靶细胞,作为潜在的小分子新冠病毒融合抑制剂。方法 以天然SARS-CoV-2进入抑制剂甘草酸为先导化合物,利用活性亚结构的拼合原理等设计并合成了系列马铃薯三糖甘草次酸衍生物。利用SARS-CoV-2假病毒体外细胞感染模型,检测该系列甘草次酸衍生物的体外抗SARS-CoV-2活性;利用表面等离子共振技术及假病毒模型寻找先导化合物1b的抗病毒作用靶点;利用SARS-CoV-2 S蛋白介导的细胞-细胞融合体系,检测先导化合物1b是否作用于SARS-CoV-2病毒入侵宿主的膜融合过程;基于分子对接与定点突变技术,确定先导化合物1b与S蛋白的作用模式等。结果 先导化合物1b对SARS-CoV-2奥密克戎假病毒有显著抑制作用,EC50值为3.28μmol/L(P<0.05),对其它SARS-CoV-2变异株假病毒有广谱抗病毒活性。细胞-细胞膜融合实验显示1b能够抑制合胞体的形成。分子对接预测先导化合物1b可与S1与S2亚基交界处的空腔中的Glu309、Ser305、Arg765、Lys964等多个保守氨基酸残基产生氢键作用,亲和力为-8.6 kcal/mol。化合物1b在10、5、2.5、1.25μmol/L时对Arg765、Lys964、Glu309和Leu303突变后的假病毒的抑制活性显著降低(P<0.01)。结论 马铃薯三糖甘草次酸衍生物能够靶向作用于S蛋白,特异性干扰病毒-细胞膜融合阶段,继而发挥抗SARS-CoV-2感染的作用,是一类结构新颖的小分子SARS-CoV-2融合抑制剂。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 小分子新冠病毒融合抑制剂 刺突蛋白 甘草次酸衍生物
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Spike蛋白介导细胞融合程度定量方法的建立及其在药物筛选中的应用
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作者 刘慕仪 张畅 +7 位作者 李辉龙 刘家茏 焉秋林 杨孟欣 黄麟飞 万禄明 钟辉 魏从文 《安徽大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第5期82-93,共12页
新型冠状病毒Spike蛋白(S蛋白)与受体ACE2结合介导细胞融合的发生,为进一步探究新冠感染合胞体发生、发展的规律及致病机制,明确关键蛋白靶点,筛选干预合胞体形成的药物,笔者拟构建新冠S蛋白介导的细胞融合程度的定量方法.利用pCDH-CMV-... 新型冠状病毒Spike蛋白(S蛋白)与受体ACE2结合介导细胞融合的发生,为进一步探究新冠感染合胞体发生、发展的规律及致病机制,明确关键蛋白靶点,筛选干预合胞体形成的药物,笔者拟构建新冠S蛋白介导的细胞融合程度的定量方法.利用pCDH-CMV-MCS-EF1-Puro、pLV-CMV-MCS-3FLAG-IRES-Bla、S蛋白基因序列、ACE2基因序列、LacZ基因序列、EcoRⅠ限制性内切酶及同源重组酶构建慢病毒穿梭质粒pCDH-S,pCDH-ACE2,pLV-α与pLV-ω,利用该慢病毒质粒分别构建稳定表达S蛋白与ACE2蛋白的293FT和A549细胞系,随后利用pLV-α与pLV-ω慢病毒质粒分别感染上述稳定细胞系,构建出可以定量细胞融合程度的细胞系293FT-S_(1-56),A549-S_(1-56),293FT-ACE2△_(11-41),A549-ACE2△_(11-41).最后采用Western Blot蛋白免疫印迹技术鉴定上述融合定量细胞系中S蛋白与ACE2蛋白的过表达效果,并通过细胞共培养确定融合效果,用β-半乳糖苷酶报告基因检测试剂盒定量细胞融合程度.结果显示,慢病毒载体和稳定细胞系构建成功,时间梯度、转染梯度实验显示该系统具有良好的定量灵敏度,并能用于卡莫司他(Camostat mesylate)和氯硝柳胺(Niclosamide)等药物抗融合效果的定量评价.成功构建的新冠病毒Spike蛋白介导细胞融合程度定量系统,可用于不同S蛋白突变体致融合能力评价和抗融合药物筛选评价,可为进一步的研究奠定技术基础. 展开更多
关键词 新型冠状病毒 SPIKE蛋白 ACE2受体 细胞融合定量 慢病毒
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糖尿病合并新型冠状病毒S蛋白感染小鼠病理生理特征
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作者 苏小月 李静璇 +3 位作者 林颖 张永祥 肖智勇 周文霞 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期410-419,共10页
目的建立糖尿病(DM)合并新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染小鼠模型,研究DM合并SARS-CoV-2感染病程发展中的重要病理生理变化。方法将野生型(WT)小鼠和由细胞角蛋白18基因启动子驱动的人血管紧张素转化酶2受体(K18-hACE2,简称hACE2)的转基... 目的建立糖尿病(DM)合并新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染小鼠模型,研究DM合并SARS-CoV-2感染病程发展中的重要病理生理变化。方法将野生型(WT)小鼠和由细胞角蛋白18基因启动子驱动的人血管紧张素转化酶2受体(K18-hACE2,简称hACE2)的转基因小鼠分别随机分为溶剂对照组、DM组、SARS-CoV-2病毒刺突蛋白感染(S)组以及DM合并S蛋白感染(DM+S)组,每组10~12只。除溶剂对照组及S组外,其余组通过10周高脂饮食后连续3 d ip给予链脲佐菌素(STZ)40 mg·kg^(-1)诱导DM症状,溶剂对照组及S组给予等体积0.1 mol·L^(-1)柠檬酸钠缓冲液。在此基础上,S组及DM+S组小鼠经鼻腔滴入15μg SARS-CoV-2 S蛋白与1 g·L^(-1)聚肌胞苷酸(Poly[I:C])的混合溶液50μL,溶剂对照组滴鼻给予等体积无菌水。在高脂喂养第6周和ip给予STZ 1周后,以口服葡萄糖耐量实验评价小鼠糖耐量水平及胰岛β细胞功能。高脂喂养第6周至ip给予STZ 2周后,每周用血糖仪检测小鼠随机血糖及空腹血糖。DM小鼠S蛋白感染前及感染24,48和120 h后,每组取3只小鼠颌下静脉取血后处死并取肺组织,采用苏木精-伊红染色法观察合并S蛋白感染前后的肺组织病理改变。S组小鼠在感染S蛋白前及感染6,24,48,72和120 h后采血,Luminex液相芯片技术检测小鼠血浆细胞因子白细胞介素1β(IL-1β)、IL-2、IL-6、IL-10、IL-17、干扰素诱导蛋白10(IP-10)、干扰素γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、单核细胞趋化蛋白1(MCP-1)和粒细胞集落刺激因子(G-CSF)水平,ELISA检测血浆硫酸乙酰肝素(HS)水平;将细胞因子水平、HS水平与小鼠感染S蛋白后的肺部病理损伤程度进行Spearman相关性分析。结果STZ合并高脂饮食可诱导小鼠DM样表现,hACE2-DM组随机血糖(P<0.01)和1周后的空腹血糖(P<0.05)均显著高于WT-DM组,且hACE2-DM小鼠胰岛功能损伤程度显著高于WT-DM小鼠(P<0.05)。与DM组相比,DM+S组小鼠均表现出更严重的肺部病理变化,并伴有大量炎症浸润和肺间质增厚。与溶剂对照组相比,S蛋白感染6 h,WT-S组小鼠血浆中促炎细胞因子G-CSF,IL-6和IP-10均显著升高(P<0.01),S蛋白感染24 h,促炎细胞因子IL-17和抗炎细胞因子IL-10均显著升高(P<0.05);S蛋白感染6 h,hACE2-S组血浆中促炎细胞因子IL-1β,IL-6,TNF-α,MCP-1,G-CSF和IP-10均显著升高(P<0.05,P<0.01);WT-DM+S组和hACE2-DM+S组IL-17分别在S蛋白感染24和6 h显著升高(P<0.01,P<0.05),hACE2-DM+S组IFN-γ和IL-1β延迟至48 h显著升高(P<0.05,P<0.01),MCP-1延迟至72 h显著升高(P<0.05)。与溶剂对照组相比,S蛋白感染6和24 h后,WT-S组血浆中HS水平显著升高(P<0.05,P<0.01),48 h开始降低;同时,与WT-S组相比,感染6 h后,WT-DM+S组HS水平略升高,24 h出现降低;hACE2-S组HS水平于24 h显著升高(P<0.01),且在S蛋白感染24,48和120 h后与WT-S组基本持平;S蛋白感染6,24和48 h后,hACE2-DM+S组血浆HS水平均显著升高(P<0.01,P<0.05),升高持续时间较其S组长。小鼠血浆中IL-1β,IL-10,MCP-1,IP-10,G-CSF以及HS水平与DM+S小鼠肺损伤程度呈正相关(P<0.05,P<0.01)。结论本研究建立的DM合并SARS-CoV-2 S蛋白感染小鼠模型能成功模拟临床患者的部分病理生理特征,主要表现为较单纯感染免疫反应钝化,HS水平升高且持续时间较长。IL-1β,IL-10,MCP-1,IP-10,G-CSF以及HS可能有助于及时了解DM合并SARS-CoV-2感染患者的病程。 展开更多
关键词 新型冠状病毒感染 SARS-CoV-2 S蛋白 糖尿病 动物模型 细胞因子 硫酸乙酰肝素
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基于增量学习的冠状病毒人际感染预测研究
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作者 杨晓宇 沈骜 +3 位作者 沈嘉豪 廖玉琼 强小利 寇铮 《广州大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第2期37-47,共11页
2019年底至今,新型冠状病毒大流行严重影响了公众卫生和社会秩序,而基于机器学习的预测方法可以判别冠状病毒的可感染性表型和大流行风险。目前,已发现6类感染人的冠状病毒,病毒基因组序列差异显著,病毒持续遗传变异导致机器学习模型性... 2019年底至今,新型冠状病毒大流行严重影响了公众卫生和社会秩序,而基于机器学习的预测方法可以判别冠状病毒的可感染性表型和大流行风险。目前,已发现6类感染人的冠状病毒,病毒基因组序列差异显著,病毒持续遗传变异导致机器学习模型性能下降并引发潜在的学习遗忘现象。文章基于增量学习的模型框架,使用One-class SVM算法对冠状病毒新类群进行持续鉴别,并进一步使用参数共享和知识蒸馏的联合策略改造BP神经网络,对冠状病毒人际感染表型进行持续学习和预测。结果显示,One-class SVM对6类病毒区分的权衡参数v组合在0.92、0.81、0.24、0.11、0.55、0.20下达到最优的病毒类群分类效果;当隐藏层节点批次增加为6时,预测模型取得最好性能表现,IAC取得最大值0.9035,BT取得最大值-0.0399,有效地抑制了神经网络模型的学习遗忘趋势,模型的预测性能接近联合训练的性能表现(IAC:0.9236),明显优于未使用知识蒸馏的神经网络(IAC:0.7764),进一步与其他增量方法比较,优于基于样本的ESRIL方法(IAC:0.8662)和基于模型参数的CCLL方法(IAC:0.8853),具有重要的公共卫生应用价值。 展开更多
关键词 增量学习 冠状病毒 刺突蛋白 人际感染
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SARS-CoV-2刺突糖蛋白对神经细胞的损伤效应及机制
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作者 王娇 李佳佳 +3 位作者 肖文一 韦冬晖 蒋宁 周文霞 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期375-383,共9页
目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳... 目的探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)刺突糖蛋白(S蛋白)对人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)的损伤效应及其机制。方法用S蛋白0(细胞对照组),25,50,75和100 mg·L^(-1)处理SH-SY5Y 24 h,CCK-8法检测细胞活力;比色法检测乳酸脱氢酶(LDH)释放率;EdU试剂盒检测细胞增殖;荧光素酶发光法检测细胞内ATP含量;JC-1荧光探针法检测细胞线粒体膜电位(MMP);Seahorse XF检测细胞糖酵解及线粒体氧化磷酸化水平。结果与细胞对照组相比,S蛋白25,50,75和100 mg·L^(-1)组细胞活力显著降低(P<0.01),半数抑制浓度(IC_(50))为65.05 mg·L^(-1);LDH释放率显著增加(P<0.01);EdU阳性细胞比例显著降低(P<0.01);S蛋白75和100 mg·L^(-1)组细胞内ATP含量显著降低(P<0.01);S蛋白50和75 mg·L^(-1)组细胞内MMP显著降低(P<0.05,P<0.01);S蛋白50 mg·L^(-1)组基础糖酵解水平和糖酵解能力的最大值显著升高(P<0.05,P<0.01),S蛋白25和50 mg·L^(-1)组呼吸能力最大值显著升高(P<0.05,P<0.01)。SH-SY5Y细胞活力与细胞内ATP含量和MMP均呈正相关(r^(2)=0.9209,P=0.001;r^(2)=0.6170,P=0.0025);与反映细胞糖酵解水平的细胞基础糖酵解水平和糖酵解能力最大值呈负相关(r^(2)=0.5194,P=0.0285;r^(2)=0.6664,P=0.0073),与反映线粒体氧化磷酸化水平的ATP生成能力呈负相关(r^(2)=0.8204,P=0.0008)。结论S蛋白使SH-SY5Y细胞活力下降,抑制细胞增殖,其机制可能与干扰神经细胞内能量代谢密切相关。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2) 刺突糖蛋白 人神经母细胞瘤细胞 神经损伤 糖酵解 能量代谢
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靶向SARS-CoV-2的纳米抗体研究进展
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作者 程小龙 孟妮 +1 位作者 刘喜富 陈静 《河北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期294-302,共9页
席卷全球的新型冠状病毒病(corona virus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的,SARS-CoV-2是继严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respi... 席卷全球的新型冠状病毒病(corona virus disease 2019,COVID-19)是由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)引起的,SARS-CoV-2是继严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(middle east respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)后人类发现的第三种引起全球大流行的冠状病毒.刺突蛋白(spike protein,S)的受体结合域(receptor binding domain,RBD)可以与细胞表面的血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme2,ACE2)结合,进而入侵细胞内部,启动病毒的复制.为了预防和治疗新冠病毒肺炎,研究人员研发了多种疫苗、小分子药物及抗体药物.纳米抗体(nanobodies,Nbs)是可识别抗原的最小结合片段,具有体积小、渗透性高、热稳定性好、结合特异性高、生产成本低、免疫原性小等优势,在治疗SARS-CoV-2中效果显著.对SARS-CoV-2的纳米抗体研究进展进行了综述,这些纳米抗体的发现,对于新冠病毒病的诊断和治疗均有潜在的应用价值. 展开更多
关键词 冠状病毒 新型冠状病毒 刺突蛋白 纳米抗体
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SARS-CoV假病毒中和试验技术的建立及评价 被引量:14
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作者 闫克夏 谭文杰 +3 位作者 张相民 王慧娟 李岩 阮力 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期440-446,共7页
为避免传统的SARS病毒中和试验需要操作活毒而存在的生物安全隐患,建立了基于假病毒系统、操作较安全的SARS中和试验技术平台。本研究应用高效表达SARS-CoV S(密码子优化的全长S蛋白,简称S)的真核表达载体(pVRC8304),与HIV慢病毒包装质... 为避免传统的SARS病毒中和试验需要操作活毒而存在的生物安全隐患,建立了基于假病毒系统、操作较安全的SARS中和试验技术平台。本研究应用高效表达SARS-CoV S(密码子优化的全长S蛋白,简称S)的真核表达载体(pVRC8304),与HIV慢病毒包装质粒(p CMV△8.2)及转移质粒(pHR′CMV EGFP)3个质粒载体系统共同转染人胚肾细胞293T,包装了SARS假病毒;通过SARS假病毒感染的RD-A细胞中标记基因EGFP表达的分析,确定SARS假病毒能有效进入细胞,建立了可在BSL-2级实验室操作的SARS病毒中和试验技术平台。用该技术平台对不同免疫血清进行了中和抗体分析,并比较了基于假病毒和基于SARS活病毒的中和试验效果。结果显示:SARS假病毒和SARS活病毒两个中和试验系统获得中和抗体滴度变化趋势一致,表明本研究构建的SARS假病毒可替代SARS活病毒用于建立操作上安全的SARS病毒中和试验技术平台。 展开更多
关键词 SARS-COV S蛋白 假病毒 中和试验
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PEDV S蛋白B细胞抗原表位的筛选和鉴定 被引量:15
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作者 孙东波 朗洪武 +5 位作者 时洪艳 陈建飞 崔晓辰 王承宝 佟有恩 冯力 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第9期971-977,共7页
以猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)S基因的免疫优势区S1(1~2367bp)为靶基因,利用基于gⅢ表达外源多肽的fd丝状噬菌体展示系统,构建S1基因噬菌体展示肽库,以纯化病毒制备的兔抗PEDV多克隆血清为靶蛋白,对S1基... 以猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)S基因的免疫优势区S1(1~2367bp)为靶基因,利用基于gⅢ表达外源多肽的fd丝状噬菌体展示系统,构建S1基因噬菌体展示肽库,以纯化病毒制备的兔抗PEDV多克隆血清为靶蛋白,对S1基因噬菌体展示肽库进行3轮生物淘选,结果获得3个高亲和力的序列,分别命名为S1P1(248~280位氨基酸)、S1P2(442~499位氨基酸)和S1P3(697~742位氨基酸).ELISA和蛋白质印迹结果显示,S1P1、S1P2和S1P3短肽都能被兔抗PEDV多克隆血清识别,其中S1P3反应性最强.为了进一步揭示S1P1、S1P2和S1P3短肽的抗原性,制备了3个短肽GST融合蛋白和它们串连后GST融合蛋白的单因子血清,间接免疫荧光试验(IFA)结果证实,抗S1P2-GST、S1P3-GST和S1P123-GST融合蛋白的单因子血清能够识别Vero细胞培养物中天然的PEDV. 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S蛋白 抗原表位 噬菌体展示
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猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株S基因的克隆、序列分析及线性抗原表位区的鉴定 被引量:21
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作者 孙东波 冯力 +4 位作者 陈建飞 时洪艳 佟有恩 刘胜旺 陈洪岩 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期224-229,共6页
以猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株的RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得的3个相互重叠的cDNA克隆覆盖了S基因,序列比对结果表明:PEDV CH/JL株S基因与CV777、Brl/87、JS、KPEDV和Chinju99毒株S基因核苷酸序列的同源性分别为96.97%、96.87%、96.41... 以猪流行性腹泻病毒CH/JL毒株的RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得的3个相互重叠的cDNA克隆覆盖了S基因,序列比对结果表明:PEDV CH/JL株S基因与CV777、Brl/87、JS、KPEDV和Chinju99毒株S基因核苷酸序列的同源性分别为96.97%、96.87%、96.41%、94.02%和93.93%,氨基酸序列的同源性分别为96.17%、95.88%、96.10%、92.36%和92.05%;分子进化树分析结果显示,PEDV CH/JL株S基因与JS毒株S基因亲缘关系最近,处于同一群。利用DNAstar Protean程序预测了PEDV CH/JL株S蛋白一个抗原表位区(83-276aa),将其克隆到原核表达载体pGEX-6p-1后转化E.coliBL21(DE3)感受态细胞,在终浓度1.0mmol/L的IPTG诱导下获得了表达,Western blot结果显示,预测的抗原表位区GST融合蛋白能与猪流行性腹泻病毒多克隆抗血清反应,提示该抗原表位区含有线性抗原表位。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S基因 序列分析 线性抗原表位区
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猪流行性腹泻病毒S1蛋白在干酪乳杆菌中的分泌表达及免疫原性分析 被引量:12
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作者 葛俊伟 姜艳平 +4 位作者 汪淼 乔薪瑗 徐义刚 唐丽杰 李一经 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期256-260,共5页
将猪流行性腹泻病毒(PEDV)纤突蛋白S1基因片段插入干酪乳杆菌分泌型表达载体pPG-2中,构建了重组表达载体pPG-s1,将其电转化干酪乳杆菌L.casei393,获得了表达PEDV S1蛋白的重组乳酸菌杆菌。重组杆菌诱导后,经western blot、间接ELISA实... 将猪流行性腹泻病毒(PEDV)纤突蛋白S1基因片段插入干酪乳杆菌分泌型表达载体pPG-2中,构建了重组表达载体pPG-s1,将其电转化干酪乳杆菌L.casei393,获得了表达PEDV S1蛋白的重组乳酸菌杆菌。重组杆菌诱导后,经western blot、间接ELISA实验表明,目的蛋白获得了分泌表达。将该重组干酪乳杆菌经口服接种途径免疫BALB/c小鼠,免疫后于不同时间分别测定了粪便中特异性的sIgA和血清中IgG;用MTT法检测免疫小鼠细胞脾淋巴细胞增殖情况。结果表明该重组干酪乳杆菌表达系统能刺激动物黏膜免疫应答和系统免疫应答,在肠道可产生分泌型IgA抗体,并可检测到高水平血清IgG;不仅能诱导体液免疫反应,还可诱导细胞免疫应答。表明所构建的重组干酪乳杆菌表达系统作为口服疫苗具有潜在的应用价值,为探索新型猪流行性腹泻口服疫苗的研制奠定了基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 S蛋白 干酪乳杆菌 免疫反应
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严重急性呼吸道综合征冠状病毒疫苗研究现状 被引量:6
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作者 叶迅 孟夏 +3 位作者 董继斌 梁旻 胡放 陈红专 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第3期331-334,共4页
冠状病毒被认为是新近爆发的严重急性呼吸道综合征的病原体 .迄今公共数据库中已发表了不同国家和地区分离的 12个SARS病毒株基因组完整序列 .突起蛋白是冠状病毒的主要抗原 ,包含许多抗原决定簇 .SARS冠状病毒突起蛋白的相对保守性为... 冠状病毒被认为是新近爆发的严重急性呼吸道综合征的病原体 .迄今公共数据库中已发表了不同国家和地区分离的 12个SARS病毒株基因组完整序列 .突起蛋白是冠状病毒的主要抗原 ,包含许多抗原决定簇 .SARS冠状病毒突起蛋白的相对保守性为有效疫苗的开发奠定了很好的研究基础 .灭活或减毒的冠状病毒疫苗存在一定的局限性和危险性 . 展开更多
关键词 严重急性呼吸道综合征 冠状病毒 疫苗 突起蛋白 SARS 基因组
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猪传染性胃肠炎病毒S蛋白抗原位点分子特征分析 被引量:14
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作者 于天飞 朱红标 +4 位作者 孙天国 张健 蔡雅璐 庞后琴 史小飞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期135-138,共4页
为了进一步研究猪传染性胃肠炎病毒S蛋白抗原位点的分子特征,选取GenBank中22株TGEV分离株,采用生物信息学方法对抗原位点氨基酸序列进行同源性比对分析。结果表明,不同分离株的A和C位点高度保守,B和D位点则有一些变化。
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 纤突蛋白 抗原表位分子特征分析
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SARS冠状病毒S蛋白部分序列1的克隆与表达 被引量:5
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作者 袁仕善 吴少庭 +4 位作者 秦莉 黄达娜 高世同 张仁利 余新炳 《中国人兽共患病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期13-16,共4页
目的 构建SARS冠状病毒S蛋白部分序列 1(S1)的原核重组表达质粒 ,并分析其在大肠杆菌中的表达状况。方法 采用逆转录 -多聚酶链反应 (RT -PCR)技术从SARS冠状病毒RNA中扩增出编码S1蛋白的基因片段 ,并克隆至pMD18-T载体上 ;菌落PCR鉴... 目的 构建SARS冠状病毒S蛋白部分序列 1(S1)的原核重组表达质粒 ,并分析其在大肠杆菌中的表达状况。方法 采用逆转录 -多聚酶链反应 (RT -PCR)技术从SARS冠状病毒RNA中扩增出编码S1蛋白的基因片段 ,并克隆至pMD18-T载体上 ;菌落PCR鉴定阳性克隆并测序列分析 ;将阳性克隆的插入片段亚克隆至表达载体pGEX - 4T - 2 ,转化大肠杆菌JM10 9,PCR和双酶切鉴定转化菌落 ;将阳性菌株经IPTG诱导 ,SDS -PAGE和免疫印迹分析截短型S蛋白的表达。结果 RTPCR扩增出S1蛋白的特异片段 ,其阳性克隆的序列存在 2处碱基突变第 36位G变为A ;第 333位由C变为T) ,其中第 36位为有义突变 ,第 333位为同义突变 ;阳性克隆中截短型S1蛋白的基因片段被亚克隆到表达载体pGEX - 4T - 2而构建成重组表达质粒 ,并在JM 10 9中表达了S1蛋白的融合蛋白 ,表达的蛋白能与GST免疫血清和SARS病人血清反应。结论 成功构建了SARS冠状病毒S1蛋白的重组表达质粒 ,该质粒在大肠杆菌中表达了截短型S蛋白的融合蛋白。 展开更多
关键词 SARS 冠状病毒 基因克隆 基因表达 基因序列 严重急性呼吸综合征 S1蛋白
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SARS冠状病毒S蛋白在昆虫细胞中的表达和纯化 被引量:4
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作者 李志杰 要国华 +4 位作者 刘靖华 赵善超 邓鹏 徐军 姜勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期303-304,共2页
For expressing the recombinant S protein in spodoptera fragiperda(Sf9) cells, the full-length cDNA of S protein was firstly amplified from plasmid pET-14b/S by means of PCR and subcloned into baculovirus transfer ve... For expressing the recombinant S protein in spodoptera fragiperda(Sf9) cells, the full-length cDNA of S protein was firstly amplified from plasmid pET-14b/S by means of PCR and subcloned into baculovirus transfer vector pFastBacTM 1, forming a recombinant plasmid pFastBacTM 1/S. It was then transposited with baculovirus shuttle vector (Bacmid) in the Max efficiency DH10BAC component cells by homologous recombination to construct the expression vector Bacmid/S. The Bacmid/S, after identified by PCR, was used to transfect Sf9 cells to express the target protein. The expressed recombinant S protein was analyzed by Western blot with human anti-SARS-CoV antiserum. The results showed that the recombinant S protein had been expressed correctly and efficiently in insect Sf9 cells and was purified by Ni-NTA affinity chromatography. (Western) blot showed that recombinant S protein could be recognized by human anti-SARS-CoV antiserum. 展开更多
关键词 SARS冠状病毒 S蛋白 昆虫细胞 严重急性呼吸综合征 syndrome SARS-CoV 纯化 表达 宿主细胞 相互作用 细胞受体
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鸡传染性支气管炎病毒H株纤突蛋白S1基因的克隆及其在毕赤酵母中表达 被引量:9
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作者 黄亚东 郑青 +3 位作者 李校堃 王林川 赵振芬 黄自然 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期144-148,共5页
鸡传染性支气管炎病毒(IBV)河南分离株H,经SPF鸡胚增殖,差速离心纯化病毒,SDS-蛋白酶K法抽提病毒RNA。参照IBVBeaudette株纤突蛋白S1基因序列设计并合成引物,以其进行RT-PCR,成功地扩增出IBVH株S1基因。扩增产物经BstYⅠ、HaeⅢ和PstⅠ... 鸡传染性支气管炎病毒(IBV)河南分离株H,经SPF鸡胚增殖,差速离心纯化病毒,SDS-蛋白酶K法抽提病毒RNA。参照IBVBeaudette株纤突蛋白S1基因序列设计并合成引物,以其进行RT-PCR,成功地扩增出IBVH株S1基因。扩增产物经BstYⅠ、HaeⅢ和PstⅠ酶切分析,结果表明,IBVH株S1基因的RFLP图谱与M41株S1基因的完全一致,初步断定IBVH株为Mass血清型。将IBVH株S1基因克隆于pGEM-T载体中进行序列分析,结果表明该基因全长为1611bp(从ATG到S前体蛋白裂解位点),与标准株M41和Beaudette的S1基因序列相比较,同源率分别达到97.39%和97.27%。将IBVH株S1基因亚克隆到pPICZ-A表达载体,转化毕赤酵母中,SDS-PAGE实验证实了IBVH株S1基因在毕赤酵母中得以表达,进一步用鸡抗IBV血清做Westernblot检测,证实了表达产物的抗原特异性。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 纤突蛋白S1基因 克隆 毕赤酵母 表达
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