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Role of PRMTs in cancer: Could minor isoforms be leaving a mark? 被引量:14
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作者 R Mitchell Baldwin Alan Morettin Jocelyn C té 《World Journal of Biological Chemistry》 CAS 2014年第2期115-129,共15页
Protein arginine methyltransferases(PRMTs) catalyze the methylation of a variety of protein substrates, many of which have been linked to the development, progression and aggressiveness of different types of cancer. M... Protein arginine methyltransferases(PRMTs) catalyze the methylation of a variety of protein substrates, many of which have been linked to the development, progression and aggressiveness of different types of cancer. Moreover, aberrant expression of PRMTs has been observed in several cancer types. While the link between PRMTs and cancer is a relatively new area of interest, the functional implications documented thus far warrant further investigations into its therapeutic potential. However, the expression of these enzymes and the regulation of their activity in cancer are still significantly understudied. Currently there are nine main members of the PRMT family. Further, the existence of alternatively spliced isoforms for several of these family members provides an additional layer of complexity. Specifically, PRMT1, PRMT2, CARM1 and PRMT7 have been shown to have alternative isoforms and others may be currently unrealized. Our knowledge with respect to the relative expression and the specific functions of these isoforms is largely lacking and needs attention. Here we present a review of the current knowledge of theknown alternative PRMT isoforms and provide a rationale for how they may impact on cancer and represent potentially useful targets for the development of novel therapeutic strategies. 展开更多
关键词 Protein ARGININE METHYLTRANSFERASE ARGININE methylation Cancer Alternative SPLICING isoformS
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Effects of CXCL12 isoforms in a pancreatic pre-tumour cellular model:Microarray analysis
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作者 Monia Cecati Matteo Giulietti +2 位作者 Alessandra Righetti Berina Sabanovic Francesco Piva 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2021年第15期1616-1629,共14页
BACKGROUND Pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC)is the fourth leading cause of death among cancers,it is characterized by poor prognosis and strong chemoresistance.In the PDAC microenvironment,stromal cells release d... BACKGROUND Pancreatic ductal adenocarcinoma(PDAC)is the fourth leading cause of death among cancers,it is characterized by poor prognosis and strong chemoresistance.In the PDAC microenvironment,stromal cells release different extracellular components,including CXCL12.The CXCL12 is a chemokine promoting the communication between tumour and stromal cells.Six different splicing isoforms of CXCL12 are known(α,β,γ,δ,ε,θ)but their role in PDAC has not yet been characterized.AIM To investigate the specific role ofα,β,andγCXCL12 isoforms in PDAC onset.METHODS We used hTERT-HPNE E6/E7/KRasG12D(Human Pancreatic Nestin-Expressing)cell line as a pancreatic pre-tumour model and exposed it to theα,β,andγCXCL12 isoforms.The altered expression profiles were assessed by microarray analyses and confirmed by Real-Time polymerase chain reaction.The functional enrichment analyses have been performed by Enrichr tool to highlight Gene Ontology enriched terms.In addition,wound healing assays have been carried out to assess the phenotypic changes,in terms of migration ability,induced by theα,β,andγCXCL12 isoforms.RESULTS Microarray analysis of hTERT-HPNE cells treated with the three different CXCL12 isoforms highlighted that the expression of only a few genes was altered.Moreover,theαandβisoforms showed an alteration in expression of different genes,whereasγisoform affected the expression of genes also common withαandβisoforms.Theβisoform altered the expression of genes mainly involved in cell cycle regulation.In addition,all isoforms affected the expression of genes assay confirmed that CXCL12 enhanced the migration ability of hTERT-HPNE cells.Among the CXCL12 splicing isoforms,theγisoform showed higher induction of migration thanαandβisoforms.CONCLUSION Our data suggests an involvement and different roles of CXCL12 isoforms in PDAC onset.However,more investigations are needed to confirm these preliminary observations. 展开更多
关键词 CXCL12 Splicing isoforms Pancreatic cancer MICROARRAY Migration Wound healing assay
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Microarray analysis to explore the effect of CXCL12 isoforms in a pancreatic pre-tumor cell model
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作者 Yan-Dong Miao Jiang-Tao Wang +1 位作者 Xiao-Long Tang Deng-Hai Mi 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2021年第47期8194-8198,共5页
CXCL12 expression was significantly lower in tumor samples than in corresponding normal samples.CXCL12 expression was significantly positively related to the infiltration levels of T cells,dendritic cells(DCs),immatur... CXCL12 expression was significantly lower in tumor samples than in corresponding normal samples.CXCL12 expression was significantly positively related to the infiltration levels of T cells,dendritic cells(DCs),immature DCs,cytotoxic cells,Tfh cells,mast cells,B cells,Th1 cells,natural killer(NK)cells,pDCs,neutrophils,and T helper cells(Spearman correlation coefficient>0.5,P<0.001)and negatively correlated with the infiltration level of NK CD56bright cells.In addition,pancreatic hTERT-HPNE cells treated with three diverse CXCL12 isoforms exhibited changes mainly in the regulation of the epithelialmesenchymal transition activation pathway. 展开更多
关键词 CXCL12 Pancreatic cancer Splicing isoforms Bioinformatics analysis Tumor microenvironment Pathway
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Aberrant expression of alternative isoforms of transcription factors in hepatocellular carcinoma 被引量:3
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作者 Olga Krivtsova Anna Makarova Natalia Lazarevich 《World Journal of Hepatology》 CAS 2018年第10期645-661,共17页
Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most prevalent malignancies worldwide and the second leading cause of death among all cancer types. Deregulation of the networks of tissue-specific transcription factors(TFs... Hepatocellular carcinoma(HCC) is one of the most prevalent malignancies worldwide and the second leading cause of death among all cancer types. Deregulation of the networks of tissue-specific transcription factors(TFs) observed in HCC leads to profound changes in the hepatic transcriptional program that facilitates tumor progression. In addition, recent reports suggest that substantial aberrations in the production of TF isoforms occur in HCC. In vitro experiments have identified distinct isoform-specific regulatory functions and related biological effects of liver-specific TFs that are implicated in carcinogenesis, which may be relevant for tumor progression and clinical outcome. This study reviews available data on the expression of isoforms of liver-specific and ubiquitous TFs in the liver and HCC and their effects, including HNF4α, C/EBPs, p73 and TCF7 L2, and indicates that assessment of the ratio of isoforms and targeting specific TF variants may be beneficial for the prognosis and treatment of HCC. 展开更多
关键词 ALTERNATIVE isoformS TRANSCRIPTION factors Hepatocellular carcinoma ALTERNATIVE SPLICING Hepatic differentiation PERSONALIZED treatment
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顺铂处理后肺癌细胞剪接因子SRSF1 mRNA异构体的变化 被引量:4
5
作者 马春霞 杨梦莉 +3 位作者 李明阳 杨渊 陈香岭 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第8期879-884,892,共7页
目的:观察不同浓度顺铂处理后肺癌细胞中剪接因子(SRSF1)mRNA异构体的变化,并寻找其中发挥主要抗凋亡作用的异构体。方法:使用不同浓度的顺铂处理肺癌细胞系A549和H1299后提取总RNA,设计SRSF1基因不同的引物(F1∶R1、F1∶F2及F2∶R1)进... 目的:观察不同浓度顺铂处理后肺癌细胞中剪接因子(SRSF1)mRNA异构体的变化,并寻找其中发挥主要抗凋亡作用的异构体。方法:使用不同浓度的顺铂处理肺癌细胞系A549和H1299后提取总RNA,设计SRSF1基因不同的引物(F1∶R1、F1∶F2及F2∶R1)进行RT-PCR以检测其mRNA剪接异构体的变化。结果:在A549和H1299细胞中检测到了5种异构体(Isoform-a、Isoform-b、Isoform-d、Isoform-e、Isoform-f),且主要表现为随着顺铂浓度的升高,非编码蛋白的mRNA异构体的比例明显上升,主要是Isoform-d的上升;而编码蛋白的mRNA异构体所占比例明显下降,主要是Isoform-a下降;同时SRSF1的总mRNA水平也是逐渐降低的。结论:在顺铂处理下,肺癌A549和H1299细胞中的SRSF1的转录水平被下调,其mRNA选择性剪接向下调编码蛋白的mRNA异构体的方向转变,造成编码蛋白的mRNA异构体降低的主要原因为Isoform-a,该异构体可能是SRSF1基因发挥抗细胞凋亡作用的主要异构体。 展开更多
关键词 顺铂 剪接因子 mRNA剪接 选择性剪接 异构体 细胞凋亡
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全反式维甲酸诱导神经母细胞瘤分化及TrkA剪接异构体表达的研究 被引量:3
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作者 刘璇 曹方方 +2 位作者 张男 王韫秀 张继红 《现代肿瘤医学》 CAS 2011年第11期2161-2165,共5页
目的:通过对NB细胞系SH-SY5Y进行体外实验,研究ATRA对NB细胞的增殖抑制与诱导分化作用,进而探讨TrkA剪接异构体在不同分化程度的SH-SY5Y细胞中的表达情况。方法:将SH-SY5Y细胞取对数生长期细胞培养分组,利用台盼蓝拒染计数活细胞,倒置... 目的:通过对NB细胞系SH-SY5Y进行体外实验,研究ATRA对NB细胞的增殖抑制与诱导分化作用,进而探讨TrkA剪接异构体在不同分化程度的SH-SY5Y细胞中的表达情况。方法:将SH-SY5Y细胞取对数生长期细胞培养分组,利用台盼蓝拒染计数活细胞,倒置相差显微镜观察细胞形态学变化。采用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法检测TrkA三种剪接异构体的表达水平。结果:对照组活细胞数随着培养时间延长而增多,实验组中ATRA对SH-SY5Y的生长抑制作用在(0.1-10)μmol/L浓度范围内有剂量依赖关系。不同浓度的ATRA均可诱导SH-SY5Y细胞产生形态学上的变化,对照组细胞分化百分率随时间延长无明显变化,各时间段间比较,差异不显著(F=2.889,P=0.079)。TrkAⅠ/ⅡmRNA表达水平增加与ATRA浓度及作用时间呈正相关。TrkAⅢmRNA表达与ATRA浓度及作用时间呈负相关。结论:在SH-SY5Y细胞中,ATRA对细胞生长抑制作用呈明显的时间和剂量依赖关系;TrkAⅠ/Ⅱ表达与ATRA作用时间、剂量呈正相关;随着ATRA作用浓度及作用时间的增加,TrkAⅢmRNA表达降低。 展开更多
关键词 酪氨酸激酶受体A 剪接异构体 神经母细胞瘤 全反式维甲酸 细胞分化
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人MCP cDNA的克隆、序列分析及同种型的比较 被引量:2
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作者 黄健 李文鑫 +1 位作者 苟德明 蒋达和 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第4期355-358,共4页
以人胚胎m R N A 为模板, 采用 R T P C R 法得到了人补体调节蛋白膜辅蛋白( M C P) 的一种c D N A 全基因,序列分析结果表明, 所获得的 M C Pc D N A 为文献报道中10 种同种型中的一种, 属 M C ... 以人胚胎m R N A 为模板, 采用 R T P C R 法得到了人补体调节蛋白膜辅蛋白( M C P) 的一种c D N A 全基因,序列分析结果表明, 所获得的 M C Pc D N A 为文献报道中10 种同种型中的一种, 属 M C P C2 型, 该c D N A 含一编码369 个氨基酸的阅读框架, 其中的 S T P 区含14 个氨基酸, 由 S T P C 编码, 胞浆尾区含23 个氨基酸, 为 C Y T2 。 展开更多
关键词 膜辅蛋白 MCP CDNA 序列分析 同种型
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急性白血病患者WT1基因及其异构体表达的研究 被引量:4
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作者 聂泽强 李晓云 +1 位作者 王英慧 马爻芳 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 北大核心 2011年第2期146-148,152,共4页
目的探讨WT1基因及其4种异构体(±17AA,±KTS)在急性白血病患者中表达情况和临床意义。方法用RT-PCR检测39例急性白血病患者和10例正常对照骨髓或外周血细胞的WT1基因表达情况,对其中WT1阳性标本采用荧光定量PCR(RQ-RT-PCR)检测... 目的探讨WT1基因及其4种异构体(±17AA,±KTS)在急性白血病患者中表达情况和临床意义。方法用RT-PCR检测39例急性白血病患者和10例正常对照骨髓或外周血细胞的WT1基因表达情况,对其中WT1阳性标本采用荧光定量PCR(RQ-RT-PCR)检测WT1、WT1(+17AA)、WT1(+KTS)的表达量,并对其表达量进行统计分析。结果 10例正常对照骨髓或外周血细胞未检出WT1基因表达;39例初治AL中有28例患者高表达WT1基因,阳性率71.8%,各型间阳性率无明显差异;4种异构体的相对比例:+17AA/-17AA为(1.31±0.24)∶1,+KTS/-KTS(1.48±0.38)∶1;+17AA/-17AA,+KTS/-KTS比例的改变与患者预后关系密切,分别以1.31∶1,1.48∶1为界,比例高者临床预后差(P<0.05);动态随访5例AL患者,WT1基因及其异构体相对比例初治和复发组均明显高于完全缓解组,初治组和复发组无差别。结论 WT1基因在急性白血病中异常高表达,检测WT1基因各亚型相对比例的改变可以判断临床预后。 展开更多
关键词 急性白血病 WT1基因 RQ-RT-PCR 异构体
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顺铂处理癌细胞后CDC25 mRNA剪接异构体的变化 被引量:3
9
作者 杨梦莉 陈香岭 +4 位作者 马春霞 姚宇峰 史荔 马千里 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第2期159-164,共6页
目的:探讨顺铂(CDDP)对肺癌、宫颈癌细胞和人胚肾细胞CDC25磷酸酶mRNA的选择性剪接的影响。方法:将培养的肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa、CaSki细胞及人胚肾293FT细胞分为实验组和对照组,实验组细胞用CDDP处理,对照组细胞用DMS... 目的:探讨顺铂(CDDP)对肺癌、宫颈癌细胞和人胚肾细胞CDC25磷酸酶mRNA的选择性剪接的影响。方法:将培养的肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa、CaSki细胞及人胚肾293FT细胞分为实验组和对照组,实验组细胞用CDDP处理,对照组细胞用DMSO处理,设计CDC25A、CDC25B、CDC25C引物,利用RTPCR检测CDC25 mRNA剪接异构体的表达变化。结果:与对照组细胞比较,随着CDDP浓度的增加,肺癌A549和H1299细胞,宫颈癌C33A、SiHa和CaSki细胞以及人胚肾293FT细胞中CDC25B、CDC25C mRNA剪接异构体比例有明显变化,而CDC25A mRNA剪接异构体变化不明显。结论:CDDP引起细胞DNA损伤时,可发生CDC25mRNA选择性剪接异构体的比例发生变化,这可能与肿瘤药物治疗时的抗性有关。 展开更多
关键词 CDC25磷酸酶 mRNA剪接异构体 顺铂 肿瘤细胞 培养的 聚合酶链式反应 DNA损伤
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p53选择性剪接异构体在胃癌中表达的研究 被引量:2
10
作者 刘丹丹 高志星 +3 位作者 王婷 刘俊衡 孙娜 季万胜 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2012年第2期107-110,共4页
目的探讨p53的5种选择性剪接异构体p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况及其与胃癌发生、发展的关系。方法收集2010年3月至2010年6月15例胃癌根治术患者的手术切除标本,采用巢式RT-PCR检... 目的探讨p53的5种选择性剪接异构体p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况及其与胃癌发生、发展的关系。方法收集2010年3月至2010年6月15例胃癌根治术患者的手术切除标本,采用巢式RT-PCR检测胃癌组织与癌旁组织中p53β、p53γ、Δ133p53、Δ133p53β和Δ133p53γ共5种异构体mRNA的表达情况,并进行统计学分析。结果在15例胃癌组织与癌旁组织中均未检测出p53γ、Δ133p53β和Δ133p53γmRNA的表达。Δ133p53在胃癌组织中的表达率为73.3%(11/15),在癌旁组织中为20.0%(3/15),差异有统计学意义(P=0.009)。p53β在胃癌组织中的表达率为20.0%(3/15),在癌旁组织中为66.7%(10/15),差异有统计学意义(P=0.0253)。结论Δ133p53 mRNA和p53βmRNA在胃癌和癌旁组织中的表达情况不同,这两种异构体的差异性表达与胃癌的发生发展有关。 展开更多
关键词 胃癌 P53 选择性剪接 异构体 巢式RT-PCR
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三氧化二砷对HBx-Hep G_2细胞侵袭转移能力的影响 被引量:3
11
作者 彭土生 杨启君 余桂芳 《疑难病杂志》 CAS 2014年第5期506-508,512,F0003,共5页
目的探讨三氧化二砷(As_2_3)对HBx—Hep G_2细胞体外黏附、侵袭、迁移能力的影响及其机制。方法慢病毒介导构建HBx—Hep G_2细胞模型,免疫细胞化学法检测HBx蛋白表达,分别采用MTT法、Transwell小室检测As_2O_3对HBx—Hep G_2细胞黏附、... 目的探讨三氧化二砷(As_2_3)对HBx—Hep G_2细胞体外黏附、侵袭、迁移能力的影响及其机制。方法慢病毒介导构建HBx—Hep G_2细胞模型,免疫细胞化学法检测HBx蛋白表达,分别采用MTT法、Transwell小室检测As_2O_3对HBx—Hep G_2细胞黏附、迁移、侵袭能力的影响,免疫组化方法检测As_2O_3作用前后HBx-Hep G_2细胞CD44V6表达的改变。结果构建后的HBx—Hep G_2细胞呈现HBx阳性信号,主要分布于胞浆,无局部高浓度聚集。随着As_2O_3作用时间的延长及浓度增加,HBx—Hep G_2细胞对Matrigel的黏附能力也随之增加;与作用前相比,As_2O_3作用后HBx—Hep G_2细胞游走与穿透基底膜的能力明显受抑制[(128±8)vs.(102±7)、(96±5)vs.(85±6)]个/HP(P<0.05);与As_2O_3作用前比较,H-SCOKE及阴性表达率均下降[(3.75±0.55)vs.(2.54±0.68)、(92.65±4.86)%vs.(63.27±5.98)%]能抑制HBx—Hep G_2细胞CD44v6的表达(P<0.05)。结论 As_2O_3能抑制HBx-Hep G_2细胞与细胞的黏附、迁移和侵袭能力,其抑制作用可能与CD44v6的表达下调有关。 展开更多
关键词 肝癌 HBx-Hep G2细胞 三氧化二砷 黏附 侵袭 CD44拼接异构体6
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纤维粘连蛋白基因ED-B片段在涎腺肿瘤中的表达 被引量:2
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作者 王鸿琳 赵焕英 李翠英 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2005年第4期361-364,共4页
目的:研究纤维粘连蛋白基因ED-B片段在涎腺正常组织及其良、恶性肿瘤组织中的表达情况,探讨其与涎腺良、恶性肿瘤发生、发展的关系。方法:分别提取涎腺正常组织及其良、恶性肿瘤组织的总RNA,RT-PCR法扩增ED-B片段,重组于pGEM-T easy载体... 目的:研究纤维粘连蛋白基因ED-B片段在涎腺正常组织及其良、恶性肿瘤组织中的表达情况,探讨其与涎腺良、恶性肿瘤发生、发展的关系。方法:分别提取涎腺正常组织及其良、恶性肿瘤组织的总RNA,RT-PCR法扩增ED-B片段,重组于pGEM-T easy载体,酶切制备成模板,体外逆转录方法合成cRNA探针,通过RT-PCR和原位杂交方法分别检测ED-B mRNA的表达情况。结果:ED-B-在正常涎腺及其良、恶性肿瘤组织中均呈高表达;ED-B+在正常腺体组织中不表达,而在良性肿瘤中有表达,且在恶性肿瘤中其阳性表达程度增高。结论:随着涎腺向肿瘤、恶性肿瘤方向的转化,FN基因ED-B剪切片段的表达逐渐增强。 展开更多
关键词 涎腺 肿瘤 纤维粘连蛋白 剪切片段 基因表达
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顺铂处理下肺癌细胞中剪接因子SRSF2 mRNA异构体的变化 被引量:3
13
作者 马春霞 杨梦莉 +5 位作者 陈香玲 李明阳 杨渊 刘淑媛 史荔 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第9期1010-1015,共6页
目的:分析不同浓度顺铂(CDDP)处理后肺癌细胞中剪接因子2(SRSF2)mRNA异构体及蛋白水平的变化及机制。方法:分别使用8、16、24、32、40、48及56μmol/L的CDDP处理肺癌细胞系A549和12、24、36、48、60、72及84μmol/L的CDDP处理肺癌细胞系... 目的:分析不同浓度顺铂(CDDP)处理后肺癌细胞中剪接因子2(SRSF2)mRNA异构体及蛋白水平的变化及机制。方法:分别使用8、16、24、32、40、48及56μmol/L的CDDP处理肺癌细胞系A549和12、24、36、48、60、72及84μmol/L的CDDP处理肺癌细胞系H1299为实验组,同时设立实验组最高浓度CDDP浓度组等体积的DMSO处理的两种细胞的对照组;提取处理后细胞的总RNA,设计SRSF2基因不同的引物(F1∶R1,F2∶F2,F2∶R1),RT-PCR检测mRNA剪接异构体的变化;采用Western-blot检测不同浓度CDDP处理后A549细胞中SRSF2蛋白的表达。结果:在A549和H1299细胞中检测到了6种异构体(a、b、c、d、e、f),且随着处理CDDP浓度的增加,非编码蛋白的mRNA异构体的比例明显上升,主要是Isoform-b和Isoform-e的上升;而编码蛋白的mRNA异构体所占比例明显下降,主要是Isoform-d的下降;同时处理后两种细胞SRSF2的总mRNA水平也逐渐降低,但SRSF2蛋白水平则逐渐升高。结论:在CDDP处理的肺癌细胞A549和H1299中,SRSF2蛋白水平被上调,这种上调可能被SRSF2通过向自身mRNA选择性剪接上调非编码蛋白和下调编码蛋白的mRNA异构体的转录水平来调节。 展开更多
关键词 顺铂 剪接因子2 mRNA选择性剪接 mRNA异构体 细胞凋亡
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TCF4N剪接异构体在食管癌细胞中的表达研究 被引量:1
14
作者 罗超 何刚 +6 位作者 官兴颖 唐敏 刘双 甘生敏 李娟 彭志平 章波 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第24期2476-2480,共5页
目的证实食管癌中TCF4N剪接异构体的存在,并初步探讨其功能。方法采用RT-PCR方法扩增,并PCR产物测序鉴定。克隆TCF4N剪接异构体并构建真核表达载体,将其转染EC109细胞高效表达,检测其对细胞生物学特性的影响。结果在癌细胞株中,TCF4N剪... 目的证实食管癌中TCF4N剪接异构体的存在,并初步探讨其功能。方法采用RT-PCR方法扩增,并PCR产物测序鉴定。克隆TCF4N剪接异构体并构建真核表达载体,将其转染EC109细胞高效表达,检测其对细胞生物学特性的影响。结果在癌细胞株中,TCF4N剪接异构体被证实存在。对比食管癌组织与癌旁组织发现TCF4N异构体在癌组织中表达显著降低(P<0.05)。成功构建了TCF4N表达载体,在EC109细胞中获得高效表达。功能分析显示:增强TCF4N表达可抑制EC109细胞的增殖,影响细胞周期的分布,并抑制TCF4的转录活性。结论在人食管癌中具有抑制功能的TCF4N剪接异构体与食管癌的发生有一定关联。 展开更多
关键词 TCF4 剪接异构体 食管癌 转录活性
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比格犬雌激素受体β四个剪接异构体的发现 被引量:2
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作者 许琴 董翔 +7 位作者 李建瑛 许永华 任秀梅 赵彦斌 白杰英 孙兆增 曾林 胡仲明 《中国比较医学杂志》 CAS 2014年第11期33-40,共8页
目的在比格犬下丘脑-垂体-性腺轴上筛查雌激素受体β的剪接异构体。方法针对ERβmRNA CDS序列的八个外显子,两两外显子依次组合设计引物,运用PCR法,以比格犬下丘脑、垂体、卵巢、子宫组织c DNA为模板扩增相应序列,测序后在NCBI网站比对... 目的在比格犬下丘脑-垂体-性腺轴上筛查雌激素受体β的剪接异构体。方法针对ERβmRNA CDS序列的八个外显子,两两外显子依次组合设计引物,运用PCR法,以比格犬下丘脑、垂体、卵巢、子宫组织c DNA为模板扩增相应序列,测序后在NCBI网站比对,确定是目的基因后,用DNAMAN软件比对分析及手工校对,获得ERβ的剪接异构体。结果获得到了比格犬ERβ的四个剪接异构体,分别是第4外显子完整缺失的ERβ剪接异构体(缺失300 bp),部分第4与部分第5外显子组合缺失的两个组合型缺失的ERβ剪接异构体(各缺失334bp,265 bp),以及第七外显子完整缺失的ERβ剪接异构体(缺失181 bp)。第4外显子完整缺失的剪接异构体和第7外显子完整缺失的剪接异构体获得了全长编码序列,另两个剪接异构体为部分编码序列。结论研究获得了比格犬ERβ的四个剪接异构体,为后续研究其在比格犬生殖调控中的作用机制打下了基础。 展开更多
关键词 比格犬 雌激素受体Β 剪接异构体
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顺铂处理后几种癌细胞中Bim基因mRNA异构体的变化 被引量:2
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作者 王玺 马春霞 +10 位作者 陆成龙 杨艳波 杨梦莉 刘舒媛 李明阳 杨渊 袁梅 史荔 段金梅 王丽 俞建昆 《贵州医科大学学报》 CAS 2017年第8期885-892,共8页
目的:探讨不同浓度顺铂处理6种肿瘤细胞后,细胞中Bim基因mRNA选择性剪接异构体的表达及变化规律。方法:用梯度浓度的顺铂处理肺癌细胞(A549、H1299)、人胚肾细胞(293FT)、宫颈癌细胞(SiHa、CaSki、C33A),提取各细胞的总RNA,用半定量RT-... 目的:探讨不同浓度顺铂处理6种肿瘤细胞后,细胞中Bim基因mRNA选择性剪接异构体的表达及变化规律。方法:用梯度浓度的顺铂处理肺癌细胞(A549、H1299)、人胚肾细胞(293FT)、宫颈癌细胞(SiHa、CaSki、C33A),提取各细胞的总RNA,用半定量RT-PCR、琼脂糖凝胶电泳及凝胶图像分析软件检测分析Bim基因mRNA异构体的组成比例和相对水平的变化。结果:用顺铂处理后,在6种细胞中都检测到了BimEL、BimL、BimS、Bimα2、Bimα4和Bimβ7共6种mRNA异构体;随着顺铂处理浓度的增高,各细胞中BimL异构体所占比例和表达水平都有明显的增加。结论:顺铂可能通过转录和mRNA选择性剪接两种机制上调Bim基因的表达,从而促进细胞凋亡;且BimL是主要被上调的异构体。 展开更多
关键词 BCL-2家族 Bim 细胞凋亡 顺铂 mRNA剪接 选择性剪接 mRNA异构体
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IGF-1基因产物的结构和功能多样化 被引量:6
17
作者 张兵兵 王远亮 范开 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期209-213,共5页
胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因包含6个外显子,具有转录和翻译产物多样化的特点,原因在于存在多个转录起始位点的选择性应用,转录产物的选择性剪接,以及不同多聚腺苷酸化位点的使用。长期以来人们普遍关注由外显子3和4编码的循环型IGF-... 胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因包含6个外显子,具有转录和翻译产物多样化的特点,原因在于存在多个转录起始位点的选择性应用,转录产物的选择性剪接,以及不同多聚腺苷酸化位点的使用。长期以来人们普遍关注由外显子3和4编码的循环型IGF-1在生长发育中的作用,最近对肌肉、神经等组织自分泌/旁分泌的局部型IGF-1研究发现,选择性剪接产生的IGF-1变体具有外显子5和6编码的延伸肽(E肽),并表现出特殊的生物学功能,如IGF-1Ea、IGF-1Eb(MGF)及其E肽在骨骼肌、心肌、神经等组织中表现出促进生长和损伤修复的功能,这些特殊功能可能通过细胞表面的一种特殊E肽受体介导。 展开更多
关键词 胰岛素样生长因子-1 同源变体 选择性剪接 损伤修复
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CD_(44)不同剪接体在喉癌中的表达及其临床意义 被引量:1
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作者 别国梁 林功标 李志春 《医学综述》 2010年第8期1257-1260,共4页
目的探讨CD44不同剪接体在喉癌中的表达及其临床意义。方法收集39例病理分期为Ⅰ~Ⅳ级喉癌样本及癌旁正常组织。应用反转录-聚合酶链反应分析CD44不同剪接体在喉癌及癌旁正常组织中的表达。结果克隆的CD44剪接变异体有123bp,包含一个... 目的探讨CD44不同剪接体在喉癌中的表达及其临床意义。方法收集39例病理分期为Ⅰ~Ⅳ级喉癌样本及癌旁正常组织。应用反转录-聚合酶链反应分析CD44不同剪接体在喉癌及癌旁正常组织中的表达。结果克隆的CD44剪接变异体有123bp,包含一个完整的阅读框,可变剪接区只有变异型剪接外显子6。喉癌组织中CD44v6基因的表达率显著高于癌旁正常组织(P<0.05)。Ⅲ~Ⅳ期的喉癌组织中CD44v6基因表达率与Ⅰ~Ⅱ期比较,差异有统计学意义(P<0.05);发生淋巴结转移的喉癌组织中CD44v6基因表达率与无淋巴结转移的喉癌组织比较,差异有统计学意义(P<0.05);不同病理分级的喉癌组织,其CD44v6基因表达率间差异有统计学意义(P<0.05);CD44v6基因表达率与肿瘤T分级无关(P>0.05)。结论CD44v6在一定程度上参与了肿瘤的发生、发展,是影响预后的因子之一。CD44v6的过表达与肿瘤的侵袭、转移和临床分期有关。对CD44v6的检测不仅能预测患者的预后,还可为肿瘤的个体化治疗直接提供信息。 展开更多
关键词 CD44剪接变异体 喉癌组织 临床意义 剪接体 CD44V6基因 反转录-聚合酶链反应 癌旁正常组织 无淋巴结转移
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耳蜗α_(1D) L-型电压门控钙通道剪切异构体的克隆和体外表达研究 被引量:1
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作者 申卫东 韩东一 《中华耳科学杂志》 CSCD 2007年第2期192-197,共6页
目的克隆大鼠耳蜗毛细胞电压门控钙通道α1D剪切异构体并在体外表达。方法以耳蜗基底膜中组织总RNA为模板,利用长距离RT-PCR克隆耳蜗毛细胞表达的电压门控钙通道α1D剪切异构体,并利用异源表达系统在哺乳动物细胞系进行表达。结果克隆... 目的克隆大鼠耳蜗毛细胞电压门控钙通道α1D剪切异构体并在体外表达。方法以耳蜗基底膜中组织总RNA为模板,利用长距离RT-PCR克隆耳蜗毛细胞表达的电压门控钙通道α1D剪切异构体,并利用异源表达系统在哺乳动物细胞系进行表达。结果克隆的耳蜗毛细胞表达的α1D剪切异构体全长cDNA长达6.2kb,构建了哺乳动物表达载体,建立了稳定表达该剪切异构体的细胞系。结论内耳毛细胞表达组织特异性的α1D剪切异构体,该异构体在外源表达系统中的表达为今后研究耳蜗α1DL-型钙通道蛋白的电生理和药理特性奠定了基础。 展开更多
关键词 电压门控钙通道 耳蜗 剪切异构体 克隆 异源表达系统
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人CD44新剪接变异体克隆及分析
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作者 向秋 何晓松 +6 位作者 朱华 雷迅 凌月福 肖胜军 范才文 黄岚珍 王建红 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1734-1737,共4页
目的:应用逆转录多聚酶链式反应(RT-PCR)分析CD44在鼻咽癌组织和鼻咽癌细胞株中表达,来寻找新的人CD44剪接变异体。方法:在CD44基因起始和终止密码子两端及变异剪接外显子v10中和剪接位点处设计特异性引物,以鼻咽癌组织、细胞株5-8F和HN... 目的:应用逆转录多聚酶链式反应(RT-PCR)分析CD44在鼻咽癌组织和鼻咽癌细胞株中表达,来寻找新的人CD44剪接变异体。方法:在CD44基因起始和终止密码子两端及变异剪接外显子v10中和剪接位点处设计特异性引物,以鼻咽癌组织、细胞株5-8F和HNE1 cDNA为模板进行RT-PCR扩增,产物测序。然后,应用生物信息学对克隆序列进行分析。结果:新克隆的CD44剪接变异体有1634bp,包含一个完整的阅读框,起始密码子在序列的12位,终止密码子在序列的1301位,可变剪接区只有变异型剪接外显子10,预测编码429氨基酸。GenBank登陆号:EF581837。结论:一个新的、预测编码429个氨基酸的CD44剪接变异体存在于研究的人鼻咽癌组织和细胞株中,它的功能有待于进一步研究。 展开更多
关键词 CD44 剪接变异体 鼻咽肿瘤
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