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基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性
被引量:
9
1
作者
刘海春
卢帅
+6 位作者
冉挺
张艳敏
徐金星
熊潇
徐安阳
陆涛
陈亚东
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2191-2206,共16页
B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对...
B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源.两个主题作为研究重点:生物活性构象和描述符.首先对分子对接方法(Glide、Gold、Ligand Fit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价,后将研究的对象分子对接到B-Raf活性位点并获得生物活性构象.基于准确的对接结果,计算得到16个打分评价函数和21个能量描述符,以此构建定量构效关系模型.QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1:r2=0.852,=0.790,=0.864;模型M2:r2=0.738,=0.812,=0.8605).同时探讨了对抑制活性有重要影响的描述符,结果表明打分评价函数(G_Score,-ECD,Dock_Score,PMF)与能量描述符(S(hb_ext),DE(int),Emodel)对抑制活性影响非常大.通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测,一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-Raf II型抑制剂被获得.上述信息对于进一步设计新颖高效的B-Raf II型抑制剂提供了有用的指导.
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关键词
B-RAF
ⅱ
型抑制剂
分子对接
打分评价函数
对接能量描述符
定量构效关系模型
下载PDF
职称材料
一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值分析
2
作者
周天祥
柯云泉
宣培才
《高校应用数学学报(A辑)》
CSCD
北大核心
2009年第2期221-233,共13页
研究了矩形区域在Ⅱ型三角剖分下具有C^2-拼接的二元三次样条插值与逼近问题.给出了一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值条件,存在性,唯一性,逼近度估计及其凸性分析.
关键词
ⅱ
型三角剖分
二元三次样条
C^2-拼接
插值
逼近度
凸性分析
下载PDF
职称材料
双周期二元五次样条的插值与逼近
3
作者
余锦鸿
《广西民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2009年第1期37-44,共8页
讨论矩形域上Ⅱ型三角剖分下一类具有C1连续的双周期二元五次样条函数的插值逼近问题,并证明了该插值问题的存在唯一性,给出了相应的插值逼近度.
关键词
ⅱ
型三角剖分
双周期
二元五次样条
插值
逼近
下载PDF
职称材料
一类Ⅱ型剖分下的二元三次周期样条的超限插值和逼近(英)
4
作者
游功强
《Journal of Mathematical Research and Exposition》
CSCD
1999年第3期521-532,共12页
本文讨论了Ⅱ一型三角剖分△(2)mn下的一类二元三次周期样条的超限插值和逼近,给出了它的表示以及存在唯一性,最后,估计了它的逼近阶.
关键词
三角部分
周期样条
超限插值
逼近
二元三次样条
下载PDF
职称材料
题名
基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性
被引量:
9
1
作者
刘海春
卢帅
冉挺
张艳敏
徐金星
熊潇
徐安阳
陆涛
陈亚东
机构
中国药科大学理学院
中国药科大学、天然药物活性组分与药效国家重点实验室
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期2191-2206,共16页
基金
国家自然科学基金(21102181,81302634)资助项目~~
文摘
B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源.两个主题作为研究重点:生物活性构象和描述符.首先对分子对接方法(Glide、Gold、Ligand Fit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价,后将研究的对象分子对接到B-Raf活性位点并获得生物活性构象.基于准确的对接结果,计算得到16个打分评价函数和21个能量描述符,以此构建定量构效关系模型.QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1:r2=0.852,=0.790,=0.864;模型M2:r2=0.738,=0.812,=0.8605).同时探讨了对抑制活性有重要影响的描述符,结果表明打分评价函数(G_Score,-ECD,Dock_Score,PMF)与能量描述符(S(hb_ext),DE(int),Emodel)对抑制活性影响非常大.通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测,一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-Raf II型抑制剂被获得.上述信息对于进一步设计新颖高效的B-Raf II型抑制剂提供了有用的指导.
关键词
B-RAF
ⅱ
型抑制剂
分子对接
打分评价函数
对接能量描述符
定量构效关系模型
Keywords
B-Raf
type
ⅱ
inhibitor
Molecular docking
Scoring
function
Docking-generated energy-
based
descriptor
Quantitative structure–activity relationship model
分类号
TQ460.1 [化学工程—制药化工]
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职称材料
题名
一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值分析
2
作者
周天祥
柯云泉
宣培才
机构
绍兴文理学院数学系
出处
《高校应用数学学报(A辑)》
CSCD
北大核心
2009年第2期221-233,共13页
基金
浙江省重点学科(B类)计算数学基金
浙江省自然科学基金(102002)
文摘
研究了矩形区域在Ⅱ型三角剖分下具有C^2-拼接的二元三次样条插值与逼近问题.给出了一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值条件,存在性,唯一性,逼近度估计及其凸性分析.
关键词
ⅱ
型三角剖分
二元三次样条
C^2-拼接
插值
逼近度
凸性分析
Keywords
type
-
ⅱ
triangulation
bivariate degree
convexity analysis cubic
spline
C^2-join
interpolation
approximation
分类号
O174.41 [理学—基础数学]
下载PDF
职称材料
题名
双周期二元五次样条的插值与逼近
3
作者
余锦鸿
机构
广西民族大学数学与计算机科学学院
出处
《广西民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2009年第1期37-44,共8页
基金
广西民族大学研究生教育创新计划(GXUN-CHX0877)
文摘
讨论矩形域上Ⅱ型三角剖分下一类具有C1连续的双周期二元五次样条函数的插值逼近问题,并证明了该插值问题的存在唯一性,给出了相应的插值逼近度.
关键词
ⅱ
型三角剖分
双周期
二元五次样条
插值
逼近
Keywords
type
-
ⅱ
triangulation
double periodic
bivariate quintic
spline
s
interpolation
approximation
分类号
O174 [理学—基础数学]
下载PDF
职称材料
题名
一类Ⅱ型剖分下的二元三次周期样条的超限插值和逼近(英)
4
作者
游功强
机构
绍兴文理学院数学系
出处
《Journal of Mathematical Research and Exposition》
CSCD
1999年第3期521-532,共12页
文摘
本文讨论了Ⅱ一型三角剖分△(2)mn下的一类二元三次周期样条的超限插值和逼近,给出了它的表示以及存在唯一性,最后,估计了它的逼近阶.
关键词
三角部分
周期样条
超限插值
逼近
二元三次样条
Keywords
transfinite interpolation
periodic bivariate cubic
spline
s
type
-
ⅱ
triangulation
approximation order
分类号
O174.41 [理学—基础数学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性
刘海春
卢帅
冉挺
张艳敏
徐金星
熊潇
徐安阳
陆涛
陈亚东
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2015
9
下载PDF
职称材料
2
一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值分析
周天祥
柯云泉
宣培才
《高校应用数学学报(A辑)》
CSCD
北大核心
2009
0
下载PDF
职称材料
3
双周期二元五次样条的插值与逼近
余锦鸿
《广西民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2009
0
下载PDF
职称材料
4
一类Ⅱ型剖分下的二元三次周期样条的超限插值和逼近(英)
游功强
《Journal of Mathematical Research and Exposition》
CSCD
1999
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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