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基于分子对接和QSAR方法预测B-Raf Ⅱ型抑制剂活性 被引量:9
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作者 刘海春 卢帅 +6 位作者 冉挺 张艳敏 徐金星 熊潇 徐安阳 陆涛 陈亚东 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第11期2191-2206,共16页
B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对... B-Raf激酶在促分裂素原活化蛋白激酶(MAPK)信号转导通路中起着重要作用,已被确定为癌症治疗非常有吸引力的靶标.新型高效B-Raf抑制剂的开发成为癌症治疗的一个热门研究领域.本文以结构多样的B-Raf II型抑制剂为研究对象,联合应用分子对接和定量构效关系(QSAR)模型研究其定量构效关系去探讨抑制活性的起源.两个主题作为研究重点:生物活性构象和描述符.首先对分子对接方法(Glide、Gold、Ligand Fit、Cdocker和Libdock)进行准确性评价,后将研究的对象分子对接到B-Raf活性位点并获得生物活性构象.基于准确的对接结果,计算得到16个打分评价函数和21个能量描述符,以此构建定量构效关系模型.QSAR结果表明模型具有高度精确的拟合和强的预测能力(模型M1:r2=0.852,=0.790,=0.864;模型M2:r2=0.738,=0.812,=0.8605).同时探讨了对抑制活性有重要影响的描述符,结果表明打分评价函数(G_Score,-ECD,Dock_Score,PMF)与能量描述符(S(hb_ext),DE(int),Emodel)对抑制活性影响非常大.通过虚拟筛选和QSAR模型理论预测,一些新的具有潜在抑制活性的化合物作为B-Raf II型抑制剂被获得.上述信息对于进一步设计新颖高效的B-Raf II型抑制剂提供了有用的指导. 展开更多
关键词 B-RAF 型抑制剂 分子对接 打分评价函数 对接能量描述符 定量构效关系模型
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一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值分析
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作者 周天祥 柯云泉 宣培才 《高校应用数学学报(A辑)》 CSCD 北大核心 2009年第2期221-233,共13页
研究了矩形区域在Ⅱ型三角剖分下具有C^2-拼接的二元三次样条插值与逼近问题.给出了一类具有C^2-拼接的二元三次样条的插值条件,存在性,唯一性,逼近度估计及其凸性分析.
关键词 型三角剖分 二元三次样条 C^2-拼接 插值 逼近度 凸性分析
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双周期二元五次样条的插值与逼近
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作者 余锦鸿 《广西民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2009年第1期37-44,共8页
讨论矩形域上Ⅱ型三角剖分下一类具有C1连续的双周期二元五次样条函数的插值逼近问题,并证明了该插值问题的存在唯一性,给出了相应的插值逼近度.
关键词 型三角剖分 双周期 二元五次样条 插值 逼近
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一类Ⅱ型剖分下的二元三次周期样条的超限插值和逼近(英)
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作者 游功强 《Journal of Mathematical Research and Exposition》 CSCD 1999年第3期521-532,共12页
本文讨论了Ⅱ一型三角剖分△(2)mn下的一类二元三次周期样条的超限插值和逼近,给出了它的表示以及存在唯一性,最后,估计了它的逼近阶.
关键词 三角部分 周期样条 超限插值 逼近 二元三次样条
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