耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST联合SCCmec基因分型与耐药性分析

目的了解滨州医学院附属医院MRSA菌株多位点序列分型(MLST)联合SCCmec基因型分布和各种基因型的耐药特征。方法采用聚合酶链反应(PCR)对MRSA菌株进行MLST联合SCCmec基因分型;采用Walk WAY96PLUS PC33药敏板检测MRSA抗菌药物敏感性。结果 SCCmec基因分型结果以Ⅲ型为主(63/67株,占94.03%),MLST分型共检测出6种基因型:ST88、ST121、ST221、ST82、ST239及ST399,其中以ST239(61/67,91.04%)为主,耐药性分析显示SCCmecⅢ型MRSA菌株表现为多重耐药。结论ST239-MRSA-SCCmecⅢ型菌株为鲁北地区MRSA主要流行菌株,该型菌株对多种抗生素呈多重耐药;MLST联合SCCmec基因分型方法是MRSA遗传背景研究简便快速的方法。

111株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌MLST基因分型研究

目的:回顾性调查昆明医科大学附属甘美医院2010年10月-2013年12月分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株的多位点序列分型(MLST)基因分型状况及流行趋势,为防控MRSA暴发提供数据资料。方法:收集昆明医科大学附属甘美医院2010年10月-2013年12月连续分离的非重复MRSA111株,通过MLST分析获得7个管家基因的等位基因谱,提交至MLST同站确定序列型(ST),进一步结合病历资料获取科别及时间段的集中流行趋势。结果:111株MRSA经MLST分析得到11个ST序列型,发现其中104株细菌集中在ST239、ST5、ST7和ST15型别,尤其是ST239和ST5型。ST239共有43株,且86.05%(37/43)集中于2010年10月-2011年2月,主要出现在呼吸科、神经外科、ICU和乳腺科4个科室;ST5共有42株,且80.95%(34/43)集中于2013年7-10月,主要出现在呼吸科、神经外科、ICU、干疗科和乳腺科5个科室;ST7为11株;ST15为8株;ST641、ST6、ST9、ST59、ST965、ST88、ST217各1株。结论:昆明医科大学附属甘美医院MRSA的ST型别多样化,但主要流行克隆系为ST239和ST5,ST7、ST15、ST464、ST6、ST9、ST59、ST965、ST88、ST217等克隆系也有分布。

ICU患者分离金黄色葡萄球菌的耐药性及分子流行病学特征

目的了解某院重症监护病房(ICU)金黄色葡萄球菌的耐药特点及分子流行病学特征。方法收集2014年1—12月该院ICU分离的金黄色葡萄球菌,进行细菌鉴定及药物敏感性试验,采用金黄色葡萄球菌A蛋白(spa)分型及多位点序列分型(MLST)方法进行分型。结果 160株金黄色葡萄球菌中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)120株(占75.00%)。MRSA对红霉素、克林霉素、左氧氟沙星的耐药率均>80%;MSSA对头孢唑林敏感,对红霉素、克林霉素、左氧氟沙星的耐药率分别为62.50%、35.00%、10.00%。spa分型和MLST结果显示,120株MRSA主要为ST239-t030、ST239-t037、ST5-t2460 3种型别,其中ST239-t030(105株,87.50%)为主要流行菌株,8个ICU均有检出;MSSA存在较多型别,ST59-t437仅在神经内科(8株)和消化科(2株)检出,ST6-t701、ST398-t3625、ST398-t1793和ST121-t2092分别仅在神经内科(7株)、麻醉科(5株)、神经外科(4株)和心外科(4株)检出。结论该院ICU MRSA分离率较高,以ST239-t030克隆株为主,存在医院内流行;不同型别MSSA在各科室内存在流行趋势。

天津地区4株金黄色葡萄球菌多位点测序分型

目的 :应用分子进化学方法和信息学分析 ,研究4株金黄色葡萄球菌(SA)临床株的来源和遗传背景。方法 :微量肉汤稀释法测定MIC、PCR扩增mecA基因 ,PBP2a平板乳胶凝集法识别MRSA、MSSA ;应用多位点测序分型 (MultilocusSequencingTyping,MLST)进行ST分型比较。结果 :2株MRSA ,SA76和SA137 ,mecA基因的PCR扩增阳性 ,PBP2a平板乳胶凝集法阳性。另2株MSSA ,SA11和SA155 ,mecA基因的PCR扩增、PBP2a平板乳胶凝集法阴性。MLST分型显示SA76和SA137的等位基因谱为2 -3 -1 -1 -4 -4 -3 ,归属ST9型 ,SA11为1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 ,属ST1型 ,SA155为5 -4 -1 -4 -4 -6 -3 ,属ST7型。结论 :MLST作为SA分型方法 ,分辨率高 ,结果准确 ,易于标准化。通过信息学分析 ,可以将MRSA克隆株、MLST分型、遗传背景和SCCmec联系起来 ,适于进行分子进化学研究。

广州地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分子分型及耐药性分析

目的了解广州地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)分子型别及其对临床常用抗生素的耐药情况,为防控MRSA感染提供依据。方法收集2010年10月至2011年4月广州地区两家教学医院临床分离的MRSA 142株,应用SCCmec、spa、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)等方法进行分子分型,检测这些菌株对苯唑西林、克林霉素等17种临床常用抗生素的药物敏感性,分析临床MRSA的耐药情况。结果 142株MRSA中121株为医院获得型金葡菌(HA-MRSA),20株为社区获得型金葡菌(CA-MRSA),1株未定型MRSA。这些MRSA可分为16种spa型,8种ST型及13种PFGE型。HA-MR-SA中的ST239-MRSA-Ⅲ-t030、ST239-MRSA-Ⅲ-t037和ST5-MRSA-Ⅱ-t002为主要流行克隆,也发现CA-MRSA中ST59-MR-SA-Ⅳ-t437克隆的流行,且这些流行克隆有特定的耐药谱。结论广州地区流行的金葡菌仍以HA-MRSA为主,同时也有一定量的CA-MRSA检出和传播,且CA-MRSA的多重药物敏感性已在下降。

化脓性感染金黄色葡萄球菌耐药性及分子流行型别分析

目的分析2017年上半年西京医院化脓性感染金黄色葡萄球菌的耐药性及分子流行型别,为临床合理用药提供依据。方法收集2017年1—6月分离自化脓性感染患者脓性分泌物样本的金黄色葡萄球菌,采用Vitek 2 Compact全自动微生物鉴定系统进行菌株鉴定及药物敏感性试验,采用多位点序列分型(MLST)联合spa分型方法进行分子流行病学分型。结果共分离金黄色葡萄球菌171株,其中社区感染113株,医院感染58株。医院感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分离率(62.07%)明显高于社区感染(30.97%)。分子分型结果显示,医院感染和社区感染MRSA分别以ST239-t030和ST239-t037为主。结论 2017年上半年西京医院化脓性感染金黄葡萄球菌医院感染和社区感染在多个方面存在明显差异。MRSA克隆型别相对比较集中,医院感染存在院内播散现象。应加强医院感染控制力度,降低医院感染发生率。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的MLST分型及耐药性分析

目的对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行多位点序列分析(MLST),初步了解泉州地区MRSA的MLST分型、MRSA的耐药性与ST及ST克隆系的相关性方法收集2013-2015年本地区分离47株MRSA,采用MLST对受试菌的7个等位基因进行序列分析,同时进行网上数据库比对,得到每个菌株相应的等位基因号。结果 47株菌分为14个ST型,2个型别为新的型别(已提交未反馈)。每个型别包含1-17株菌。ST59是优势型别(36.2%),包含17株菌;其次为ST239(17.0%),包含8株菌;ST59分布于2013年、2014年、2015年,表示该型别菌株在本地区长期存在;ST59分布于3所医院,表示该型别菌株本地区广泛分布。结论本地区MRSA分离株基因多态性大,ST59和ST239是本地区MRSA分离株的优势ST型。

开放性骨折术后迟发性感染患者脓性分泌物分离CA-MRSA菌株分子型与耐药性及毒力特征

目的探究开放性骨折术后迟发性感染患者脓性分泌物分离社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)分子型、耐药性及毒力特征。方法收集2018年1月-2021年7月南京市溧水区人民医院开放性骨折术后患者脓性分泌物分离MRSA 90株,分为CA-MRSA和医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HA-MRSA),多位点序列分析(MLST)检测葡萄球菌染色体mec(SCCmec)分型,分析系统检测耐药性,聚合酶链式反应(PCR)检测毒力基因。结果90株MRSA中检出CA-MRSA 53株(58.89%),HA-MRSA 37株(41.11%);53株CA-MRSA对苯唑西林、青霉素、氨苄西林耐药率为100.00%,对米诺环素和磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药率分别为3.77%和13.21%,而对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁100%敏感,与HA-MRSA比较,CA-MRSA对氯霉素、克林霉素、庆大霉素的耐药率较低(P<0.05);MLST分型中有ST59型33株(62.26%),ST338型7株(13.21%),ST217型4株(7.55%),ST398型、ST5432型各3株(5.66%),ST5424型、ST5型和ST2141型各1株(1.89%);SCCmec分型共检出5种SCCmec分型,CA-MRSA以SCCmecⅣ型和SCCmecⅤ型为主,分别有22株(41.51%)和27株(50.94%),SCCmecⅡ型2株(3.77%),SCCmecⅠ型和SCCmecⅢ型各1株(1.89%);检出7种毒力基因,其中hla、hlb在CA-MRSA和HA-MRSA中均存在,tsst、eta、etb在CA-MRSA和HA-MRSA中检出率均<10%,且37株HA-MRSA中均无etb检出;CA-MRSA中lukSF、PSMα3检出率高于HA-MRSA(P<0.05)。结论开放性骨折术后迟发性感染以CA-MRSA为主,CA-MRSA对多种抗菌药物具有耐药性,但对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁、米诺环素和磺胺甲噁唑/甲氧苄啶敏感性较高,以ST59型、ST338型和SCCmecⅣ、Ⅴ型为主,毒力基因中hla、hlb可能是MRSA重要的毒力基因,而lukSF、PSMα3可能是CA-MRSA和HA-MRSA之间存在差异的关键。

上海市猪源与人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的分离及分子分型

为研究上海地区猪源和人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的流行及分子分型特点,分别在上海市3个规模化猪场及1个屠宰场采集猪鼻腔拭子共计170份;在上海市某医院采集不同住院病人的痰、咽拭子等样品共计120份。所有样品通过75g/L氯化钠肉汤预增菌,显色培养基显色培养及双重PCR(nuc和mecA基因)方法分离鉴定金黄色葡萄球菌及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;采用金黄色葡萄球菌盒式染色体、多位点序列和葡萄球菌蛋白A方法进行分型。结果显示,共分离到83株猪源金黄色葡萄球菌,其中45株为猪源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;52株人源金黄色葡萄球菌,其中15株为人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌。分型结果显示猪源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全部为ST9-SCCmecⅣb型,其中37株为spat899型,2株为spat2922型。人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌中14株为ST5-SCCmecⅡ-t002型,1株为ST88型,其用葡萄球菌蛋白A方法分型为新型,已被命名为t10775型,用金黄色葡萄球菌盒式染色体方法未能分型。结果表明,上海地区猪源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌主要流行的是ST9-t899-SCCmecⅣb型,而人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌主要流行的是ST5-t002-SCCmecⅡ型,猪源和人源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌之间暂未发现有相互传播的迹象。

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌多位点序列分型与耐药性研究

目的了解深圳地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)分子型别特征及其对常用抗生素的耐药情况,为治疗和防控MRSA感染提供科学依据。方法对2012-2014年深圳地区9家哨点医院临床分离的228株MRSA进行多位点序列分型,检测其对庆大霉素(GEN)、环丙沙星(CIP)、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶(SXT)、红霉素(ERY)、万古霉素(VAN)、克林霉素(CLI)、四环素(TET)和利奈唑胺(LNZ)等8种非-β内酰胺类抗生素的敏感性。结果 228株MRSA可分为33种ST型,其中以ST59型为主,占41.7%(95/228);其次为ST338型,占15.4%(35/228);经e BURST软件分析它们属于15种克隆复合体和1个单一克隆,其中CC59为主要克隆,占61.0%(139/228),其次为CC239,占9.6%(22/228);ST59和ST338同属于CC59,耐药谱均为ERY/CLI/TET。结论深圳地区流行的MRSA以CC59为主,可选用环丙沙星或磺胺甲噁唑/甲氧苄啶治疗。

新生儿耐甲氧西林金黄色葡萄球菌多位点序列分型与耐药相关性分析

目的研究新生儿科耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子特性及耐药性情况,探讨二者之间的相关性。方法选择MRSA的7个管家基因作为目的基因,对2008年4月至2009年10月新乡医学院儿科分离的21株MRSA进行PCR扩增测序,应用多位点序列分型(MLST)技术对其分子特性和遗传特性进行分析,同时采用纸片扩散法检测其对13种抗生素的耐药情况。结果 21株MRSA可扩增得到24个等位基因,13个序列型,其中ST239序列型最多,占28.57%,其次为ST5序列型,占14.29%。药敏试验显示除了万古霉素和利福平外,对其他抗生素均耐药,耐药率为57%～100%。结论本地区新生儿科MRSA主要流行的克隆系为ST239和ST5,耐药性与序列型及序列克隆系相关性差。

内蒙古地区皮肤化脓性感染部位分离的金黄色葡萄球菌耐药及毒力特征研究

目的分析皮肤化脓性感染部位分离的金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)耐药、毒力及分子流行病学特征,为临床抗感染用药提供实验依据。方法收集内蒙古医科大学附属医院2020年5-12月皮肤科住院患者皮肤化脓性感染部位及鼻腔分泌物样本进行细菌分离培养。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定疑似金葡菌菌落,用微量肉汤稀释法进行药物敏感性试验,PCR扩增金葡菌毒力基因,实时荧光定量PCR检测tsst-1、pvl、hla、clfA 4种毒力基因在不同来源金葡菌菌株中的相对表达量。对金葡菌菌株进行多位点序列分型(MLST)。耐药率及毒力基因检出率比较采用χ2检验或Fisher确切概率法,计量资料组间比较采用t检验或曼-惠特尼U非参数检验。结果在210例住院患者中,共分离金葡菌85株,包括皮肤化脓性感染部位54株(病例组),鼻腔部位31株(对照组)。药敏试验结果显示,85株金葡菌中14株为耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。85株菌对青霉素耐药率[90.59%(77/85)]最高;对克林霉素和红霉素耐药率分别为60.00%(51/85)、61.18%(52/85),未发现对利福平、万古霉素和利奈唑胺耐药菌株。PCR显示,病例组菌株pvl基因检出率(33.33%,18/54)高于对照组(12.90%,4/31,χ2=4.28,P=0.038)。实时荧光定量PCR显示,对照组菌株clfA相对表达量[3.87(2.30,5.94)]高于病例组[1.63(0.95,2.62),P=0.007]。85株金葡菌分型共得到17个ST型别,其中主要优势型别为ST398-甲氧西林敏感金葡菌(20/71)和ST22-MRSA(9/14)。ST22-MRSA菌株毒力基因pvl检出率(14/14)明显高于非ST22型MRSA(0,P<0.001)。结论皮肤化脓性感染部位分离的金葡菌对青霉素、克林霉素和红霉素耐药率较高,这些抗生素不应作为临床经验治疗的首选药;皮肤金葡菌感染性疾病发病可能与毒力基因pvl有关;金葡菌鼻腔定植可能与clfA基因有关。

血流感染金黄色葡萄球菌分子生物学特征

目的 了解血流感染金黄色葡萄球菌分子分型、毒力基因及耐药基因携带情况,为临床诊疗提供依据。方法 收集2018-2020年山东省某医院血流感染金黄色葡萄球菌,通过全基因组测序(WGS)和生物信息学分析得到多位点序列分型(MLST)、毒力基因和耐药基因。微量肉汤稀释法测试对常用抗菌药物耐药性。利用核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析菌株间相关性。结果 共收集62株血流感染金黄色葡萄球菌,其中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)15株,检出7种STs,优势型别为ST59,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)菌株47株,检出11种STs,以ST22最多见。检出31种毒力基因和16种肠毒素基因。耐药基因携带率高达98.4%(61/62),检出率最高的耐药基因为blaZ(83.9%,52/62),其次为erm(c)(41.9%,26/62)、mecA(24.2%,15/62)。MRSA耐药基因检出率高于MSSA。对青霉素(96.8%,60/62)、红霉素(82.2%,51/62)、克林霉素(45.2%,28/62)耐药率较高。对利奈唑胺(1.6%,1/62)、替加环素(1.6%,1/62)耐药率较低,未发现万古霉素耐药菌株。cgMLST分析发现除两株菌无等位基因差异外,其余菌株均存在30~440个等位基因差异。结论 本院血流感染金黄色葡萄球菌优势型别为ST22,且在遗传信息上有较大差异,以散发感染为主。所有分离株携带毒力基因谱系丰富,耐药基因检出率高。