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荣昌猪初产繁殖性状的全基因组关联研究
被引量:
3
1
作者
吴平先
陈力
+5 位作者
龙熙
柴捷
张廷焕
徐顺来
郭宗义
王金勇
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期103-112,共10页
旨在鉴定荣昌猪初产繁殖性状的重要变异位点和基因,为荣昌猪繁殖性状的遗传改良提供重要的分子标记和基因资源。本研究选取429头荣昌母猪进行猪50K芯片基因分型,经过质量控制和基因型填充后,保留35 046个SNPs用于分析。采用主成分分析...
旨在鉴定荣昌猪初产繁殖性状的重要变异位点和基因,为荣昌猪繁殖性状的遗传改良提供重要的分子标记和基因资源。本研究选取429头荣昌母猪进行猪50K芯片基因分型,经过质量控制和基因型填充后,保留35 046个SNPs用于分析。采用主成分分析法研究群体结构,利用混合线性模型(mixed-linear model, MLM)将出生年、出生月作为固定效应,将主成分值作为协变量对总产仔数、活产仔数、死胎数和初生窝重性状进行全基因组关联分析(GWAS)。结果显示,在全基因组显著水平上鉴定出2个影响荣昌猪初生窝重的SNPs和1个影响荣昌猪死胎数的SNP;在潜在显著水平上鉴定到5个影响荣昌猪总产仔数的SNPs, 3个影响荣昌猪活产仔数的SNPs和10个影响荣昌猪死胎数的SNPs。通过全基因组关联分析筛选到1个显著的SNP(SSC17:57 315 180 bp)同时影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重,1个显著的SNP(SSC1:279 214 647 bp)同时影响荣昌猪活产仔数和总产仔数,暗示基因在不同性状间具有一因多效性。本研究根据候选基因的相关分子生物学功能,确定BMP7基因为影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重的重要候选基因,MSH3和CBLB基因为影响荣昌猪死胎数的重要候选基因。以上结果为荣昌猪繁殖性状提供了重要的遗传变异位点和候选基因,也为荣昌猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。
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关键词
荣昌猪
全基因组关联分析
产仔数
死胎数
初生窝重
下载PDF
职称材料
从母猪爆发产死胎中分离出伪狂犬病毒
被引量:
4
2
作者
陈焕春
金梅林
+3 位作者
王厚钰
罗满林
刘超
吴美州
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991年第4期390-393,共4页
从武汉市青山良种场猪场1990年秋季母猪爆发产死胎病例中的4头死胎猪取脑和内脏组织进行病毒分离,均出现典型细胞病变,经电镜形态学观察和抗伪狂犬病毒单克隆抗体免疫荧光技术确定为伪狂犬病毒.
关键词
猪
母猪
死胎
伪狂犬病毒
细胞病变
下载PDF
职称材料
题名
荣昌猪初产繁殖性状的全基因组关联研究
被引量:
3
1
作者
吴平先
陈力
龙熙
柴捷
张廷焕
徐顺来
郭宗义
王金勇
机构
重庆市畜牧科学院
国家生猪技术创新中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期103-112,共10页
基金
重庆市财政专项资金项目(22514C)
重庆市绩效激励引导专项(cstc2021jxjl8001)
国家生猪技术创新中心奖补专项(21606)。
文摘
旨在鉴定荣昌猪初产繁殖性状的重要变异位点和基因,为荣昌猪繁殖性状的遗传改良提供重要的分子标记和基因资源。本研究选取429头荣昌母猪进行猪50K芯片基因分型,经过质量控制和基因型填充后,保留35 046个SNPs用于分析。采用主成分分析法研究群体结构,利用混合线性模型(mixed-linear model, MLM)将出生年、出生月作为固定效应,将主成分值作为协变量对总产仔数、活产仔数、死胎数和初生窝重性状进行全基因组关联分析(GWAS)。结果显示,在全基因组显著水平上鉴定出2个影响荣昌猪初生窝重的SNPs和1个影响荣昌猪死胎数的SNP;在潜在显著水平上鉴定到5个影响荣昌猪总产仔数的SNPs, 3个影响荣昌猪活产仔数的SNPs和10个影响荣昌猪死胎数的SNPs。通过全基因组关联分析筛选到1个显著的SNP(SSC17:57 315 180 bp)同时影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重,1个显著的SNP(SSC1:279 214 647 bp)同时影响荣昌猪活产仔数和总产仔数,暗示基因在不同性状间具有一因多效性。本研究根据候选基因的相关分子生物学功能,确定BMP7基因为影响荣昌猪总产仔数、活产仔数和初生窝重的重要候选基因,MSH3和CBLB基因为影响荣昌猪死胎数的重要候选基因。以上结果为荣昌猪繁殖性状提供了重要的遗传变异位点和候选基因,也为荣昌猪繁殖性状的基因组选择提供了重要的理论基础。
关键词
荣昌猪
全基因组关联分析
产仔数
死胎数
初生窝重
Keywords
Rongchang pig
GWAS
number of
piglet
s
number of
stillborn
litter weight born alive
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
从母猪爆发产死胎中分离出伪狂犬病毒
被引量:
4
2
作者
陈焕春
金梅林
王厚钰
罗满林
刘超
吴美州
机构
华中农业大学畜牧兽医系
武汉市青山良种场
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991年第4期390-393,共4页
文摘
从武汉市青山良种场猪场1990年秋季母猪爆发产死胎病例中的4头死胎猪取脑和内脏组织进行病毒分离,均出现典型细胞病变,经电镜形态学观察和抗伪狂犬病毒单克隆抗体免疫荧光技术确定为伪狂犬病毒.
关键词
猪
母猪
死胎
伪狂犬病毒
细胞病变
Keywords
stillborn piglet
pseucorabies virus
cytopathic effect
分类号
S858.282.6 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荣昌猪初产繁殖性状的全基因组关联研究
吴平先
陈力
龙熙
柴捷
张廷焕
徐顺来
郭宗义
王金勇
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
下载PDF
职称材料
2
从母猪爆发产死胎中分离出伪狂犬病毒
陈焕春
金梅林
王厚钰
罗满林
刘超
吴美州
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1991
4
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职称材料
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