香菇L808细胞核与线粒体基因组注释分析

对香菇品种L808细胞核与线粒体基因组进行注释分析,结果表明,L808核基因组中含有29.48%的重复序列,以长末端逆转录重复序列(LTRs)为主,其中Gypsy超家族占到基因组的19.07%,Copia超家族仅占2.22%。经结构预测,核基因组中有11490个编码基因,转录本平均长度1854.69 bp,基因编码区平均长度1418.70 bp,基因外显子平均为6.19个,基因内含子平均为84.02个。共有11227个基因得到具体注释,其中碳水化合物活性酶相关基因共660个。L808线粒体基因组全长121411 bp,编码44个基因,包括18个蛋白质编码基因,1个核糖体基因和26个转运RNA基因,其中cox1、cox3、nad1、nad5、cob等5个基因中存在内含子。