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瞿麦药学研究概况
被引量:
24
1
作者
刘晨
张凌珲
+5 位作者
杨柳
姚默
高昂
汪叶庭
巩江
倪士峰
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第33期20387-20388,20392,共3页
在广泛文献检索基础上,对瞿麦的种属、鉴别、药理、临床应用及禁忌进行了综述,为进一步开发利用提供资料。
关键词
瞿麦(Dianthus
superbus
L.)
鉴别
成分
药理
临床应用
下载PDF
职称材料
基于高通量测序的瞿麦叶片转录组分析
2
作者
武悦
单飞彪
+3 位作者
闫文芝
杨蕾
李彦标
陈阳
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第5期1522-1529,共8页
为获得瞿麦(Dianthus superbus L.)的基因数据并了解其基因功能,本研究通过高通量测序技术对瞿麦幼苗叶片的转录组进行测序,并对其进行生物信息学分析。通过Illumina测序平台共获得10825条Unigene,总长度为15384267 bp。将获得的Unigen...
为获得瞿麦(Dianthus superbus L.)的基因数据并了解其基因功能,本研究通过高通量测序技术对瞿麦幼苗叶片的转录组进行测序,并对其进行生物信息学分析。通过Illumina测序平台共获得10825条Unigene,总长度为15384267 bp。将获得的Unigene分别与Nr、GO、KOG等7大数据库进行比对,最终有8255条(76.26%)Unigene获得注释。其中8201条Unigene在Nr数据库中获得注释,注释同源物种主要是甜菜、藜麦;与GO数据库比对后获得注释Unigene 5886条,分为细胞组分、生物进程和分子功能3个功能大类23个亚类;KEGG数据库共获得注释Unigene 6204条,共涉及6大类45个亚类346个代谢通路,其中以新陈代谢相关通路分布较多;KOG数据库共获得注释Unigene 5303条,分为25个功能类别,基因注释最多的为一般功能和翻译后修饰;在所有Unigene中共检测到SSR位点5201个,以单核苷酸和三核苷酸重复为主。本研究为开展瞿麦功能基因挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了理论基础。
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关键词
瞿麦(Dianthus
superbus
)
转录组
基因注释
代谢通路
简单重复序列
原文传递
题名
瞿麦药学研究概况
被引量:
24
1
作者
刘晨
张凌珲
杨柳
姚默
高昂
汪叶庭
巩江
倪士峰
机构
西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室西北大学生命科学学院
西藏民族学院医学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第33期20387-20388,20392,共3页
基金
西部资源生物与现代生物技术实验室教育部重点实验室基金(编号:KH09030)
西藏自治区科技厅重大科技专项基金(编号:20091012)
陕西省教育厅科学研究项目计划(编号:2010JK862)资助
文摘
在广泛文献检索基础上,对瞿麦的种属、鉴别、药理、临床应用及禁忌进行了综述,为进一步开发利用提供资料。
关键词
瞿麦(Dianthus
superbus
L.)
鉴别
成分
药理
临床应用
Keywords
Dianthus
superbus
L.
Identification
Composition
Pharmacology
Clinical applications
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
基于高通量测序的瞿麦叶片转录组分析
2
作者
武悦
单飞彪
闫文芝
杨蕾
李彦标
陈阳
机构
巴彦淖尔市农牧业科学研究院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第5期1522-1529,共8页
基金
内蒙古自治区科技成果转化专项项目(BZC191033)
内蒙古农牧业科学院青年创新基金项目(2020QNJJNO15)共同资助
文摘
为获得瞿麦(Dianthus superbus L.)的基因数据并了解其基因功能,本研究通过高通量测序技术对瞿麦幼苗叶片的转录组进行测序,并对其进行生物信息学分析。通过Illumina测序平台共获得10825条Unigene,总长度为15384267 bp。将获得的Unigene分别与Nr、GO、KOG等7大数据库进行比对,最终有8255条(76.26%)Unigene获得注释。其中8201条Unigene在Nr数据库中获得注释,注释同源物种主要是甜菜、藜麦;与GO数据库比对后获得注释Unigene 5886条,分为细胞组分、生物进程和分子功能3个功能大类23个亚类;KEGG数据库共获得注释Unigene 6204条,共涉及6大类45个亚类346个代谢通路,其中以新陈代谢相关通路分布较多;KOG数据库共获得注释Unigene 5303条,分为25个功能类别,基因注释最多的为一般功能和翻译后修饰;在所有Unigene中共检测到SSR位点5201个,以单核苷酸和三核苷酸重复为主。本研究为开展瞿麦功能基因挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了理论基础。
关键词
瞿麦(Dianthus
superbus
)
转录组
基因注释
代谢通路
简单重复序列
Keywords
Dianthus
superbus
Trancriptome
Gene annotation
Metabolic pathways
Simple sequence repeat
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
瞿麦药学研究概况
刘晨
张凌珲
杨柳
姚默
高昂
汪叶庭
巩江
倪士峰
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
24
下载PDF
职称材料
2
基于高通量测序的瞿麦叶片转录组分析
武悦
单飞彪
闫文芝
杨蕾
李彦标
陈阳
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022
0
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