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题名南通地区腺病毒41型遗传变异及进化特征分析
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作者
季霄雷
郭陈
孙怡华
陈雨佳
陈璐
蔡秀丽
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机构
南通市疾病预防控制中心微生物检验科
南通市崇川区疾病预防控制中心微生物检验科
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出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1596-1606,共11页
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基金
南通市科技局基础科学研究项目(项目号:JCZ2022117),题目:南通市幼儿病毒性急性胃肠炎病原谱构建及变异趋势研究。
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文摘
F亚属的人类腺病毒(Human adenovirus,HAdV)与急性胃肠炎相关,是儿童急性胃肠炎住院的常见病因。本研究收集了712份<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本,检出HAdV-F阳性52例,阳性检出率为7.30%。对Ct值<30的样本进行文库构建及测序,经Blast比对,得到的21条全基因组序列均为HAdV-41。与HAdV-41原型株相比较,Long fiber和Short fiber的核苷酸一致性低于全基因组核苷酸一致性。对HAdV-41全基因组的遗传进化分析显示,其分子进化速率为7.882×10^(-5)替换/位点/年(95%HPD,3.885×10^(-5)~1.234×10^(-4))。本课题研究对南通地区流行的HAdV-41进行了流行病学特征及基因进化特征分析,为南通地区HAdV-41所致疾病防控及病原溯源奠定了基础。
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关键词
肠道腺病毒
全基因组
HAdV-41
分子进化速率
tmrca
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Keywords
Enteric adenovirus
Whole genome
HAdV-4l
Rate of molecular evolution
tmrca
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分类号
R373.2
[医药卫生—病原生物学]
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