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巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg和ND4L基因克隆及多态性分析
被引量:
2
1
作者
杜民
叶德来
+5 位作者
牛宝珍
段加明
岳冉
宋桃稳
王文涛
刘艳红
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期32-37,共6页
为了解巨魾鱼的种质资源情况,采用PCR技术扩增克隆并测序,得到巨魾NADH dehydrogenase subunit-3(ND3),精氨酸的转运RNA(tRNA-Arg)和NADH dehydrogenase subunit-4L(ND4L)基因全序列各12条.通过DNAMAN 5.2.2软件进行序列比对,采用MEGA 5...
为了解巨魾鱼的种质资源情况,采用PCR技术扩增克隆并测序,得到巨魾NADH dehydrogenase subunit-3(ND3),精氨酸的转运RNA(tRNA-Arg)和NADH dehydrogenase subunit-4L(ND4L)基因全序列各12条.通过DNAMAN 5.2.2软件进行序列比对,采用MEGA 5.02软件进行碱基质量分数分析,计算遗传距离,并构建系统发育树.结果表明:巨魾鱼ND3基因序列全长为346bp,碱基质量分数A为26.2%,T为29.6%,C为28.8%,G为15.4%,其中A+T质量分数(55.8%)高于G+C质量分数(44.2%),12个ND3基因序列存在5种单倍型,发生了5次转换,1次颠换,5种单倍型之间平均相对遗传距离为0.007;tRNA-Arg基因序列全长为71bp,碱基质量分数A为23.9%,T为23.9%,C为29.6%,G为22.6%,其中A+T质量分数(47.8%)低于G+C质量分数(52.2%),12个基因序列完全一致;ND4L基因序列全长为297bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,碱基质量分数A为24.6%,T为26.3%,C为33.3%,G为15.8%,其中A+T质量分数(50.9%)高于G+C质量分数(49.1%),12个基因序列完全一致;将巨魾鱼与鮡科的其他10种鱼类的ND3,tRNA-Arg和ND4 L基因用Minimum Evolution法(ME)构建系统发育树,发现12尾巨魾鱼单独聚为一支,这一结果与传统的形态学分类相似.
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关键词
巨魾
ND3
trna-arg
ND4L
序列分析
系统发育
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职称材料
dna Y基因产物提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达
2
作者
马忠
邱奇峰
+1 位作者
华子春
朱德煦
《南京大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
1997年第1期55-61,共7页
对提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达水平进行了研究。通过PCR方法在其结构基因5端添加起密码子ATG,用人工合成的不依赖于ρ因子的终止序列替换3端非翻译区,得到完整的人尿激酶原结构基因。将其克隆在表达质粒p...
对提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达水平进行了研究。通过PCR方法在其结构基因5端添加起密码子ATG,用人工合成的不依赖于ρ因子的终止序列替换3端非翻译区,得到完整的人尿激酶原结构基因。将其克隆在表达质粒pKK233-2中,转化大肠杆菌E.coliJA221,人尿激酶原得到初步表达。但表达水平很低,原因可能是人尿激酶原cDNA富含真核细胞偏爱的密码子,而大肠杆菌中识别这些密码子的tRNA是稀有tRNA。通过相容性质粒pUBS520引进dnaY基因,增加大肠杆菌中tRNAArgAGA/AGG的含量,以改善大肠杆菌对人尿激酶原cDNA中稀有Arg密码子的识别,人尿激酶原的表达水平提高约5倍。
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关键词
尿激酶原
CDNA
dnaY基因
血栓性疾病
药物疗法
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职称材料
题名
巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg和ND4L基因克隆及多态性分析
被引量:
2
1
作者
杜民
叶德来
牛宝珍
段加明
岳冉
宋桃稳
王文涛
刘艳红
机构
红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室
红河学院生命科学与技术学院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第12期32-37,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31360638)
云南省教育厅科学研究基金重大专项项目(ZD2013009)
+4 种基金
云南省中青年学术带头人后备人才项目(2015HB059)
红河学院创新性实践教学改革试点项目
红河学院中青年学术带头人后备人才项目(2014HB0203)
红河学院博士专项项目(14bs11)
大学生创新创业实践训练平台建设(CXSJ1340)
文摘
为了解巨魾鱼的种质资源情况,采用PCR技术扩增克隆并测序,得到巨魾NADH dehydrogenase subunit-3(ND3),精氨酸的转运RNA(tRNA-Arg)和NADH dehydrogenase subunit-4L(ND4L)基因全序列各12条.通过DNAMAN 5.2.2软件进行序列比对,采用MEGA 5.02软件进行碱基质量分数分析,计算遗传距离,并构建系统发育树.结果表明:巨魾鱼ND3基因序列全长为346bp,碱基质量分数A为26.2%,T为29.6%,C为28.8%,G为15.4%,其中A+T质量分数(55.8%)高于G+C质量分数(44.2%),12个ND3基因序列存在5种单倍型,发生了5次转换,1次颠换,5种单倍型之间平均相对遗传距离为0.007;tRNA-Arg基因序列全长为71bp,碱基质量分数A为23.9%,T为23.9%,C为29.6%,G为22.6%,其中A+T质量分数(47.8%)低于G+C质量分数(52.2%),12个基因序列完全一致;ND4L基因序列全长为297bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,碱基质量分数A为24.6%,T为26.3%,C为33.3%,G为15.8%,其中A+T质量分数(50.9%)高于G+C质量分数(49.1%),12个基因序列完全一致;将巨魾鱼与鮡科的其他10种鱼类的ND3,tRNA-Arg和ND4 L基因用Minimum Evolution法(ME)构建系统发育树,发现12尾巨魾鱼单独聚为一支,这一结果与传统的形态学分类相似.
关键词
巨魾
ND3
trna-arg
ND4L
序列分析
系统发育
Keywords
Bagarius yarrelli
ND3
trna-arg
ND4L
sequence analysis
phylogeny
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
dna Y基因产物提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达
2
作者
马忠
邱奇峰
华子春
朱德煦
机构
南京大学生物化学系
南京大学医药生物技术国重点实验室
出处
《南京大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
1997年第1期55-61,共7页
基金
国家"863"高技术发展计划资助
文摘
对提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达水平进行了研究。通过PCR方法在其结构基因5端添加起密码子ATG,用人工合成的不依赖于ρ因子的终止序列替换3端非翻译区,得到完整的人尿激酶原结构基因。将其克隆在表达质粒pKK233-2中,转化大肠杆菌E.coliJA221,人尿激酶原得到初步表达。但表达水平很低,原因可能是人尿激酶原cDNA富含真核细胞偏爱的密码子,而大肠杆菌中识别这些密码子的tRNA是稀有tRNA。通过相容性质粒pUBS520引进dnaY基因,增加大肠杆菌中tRNAArgAGA/AGG的含量,以改善大肠杆菌对人尿激酶原cDNA中稀有Arg密码子的识别,人尿激酶原的表达水平提高约5倍。
关键词
尿激酶原
CDNA
dnaY基因
血栓性疾病
药物疗法
Keywords
scu PA cDNA
expression in E.coli
rare tRNA
Arg
AGA/AGG
分类号
R394.8 [医药卫生—医学遗传学]
R973.2 [医药卫生—药品]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg和ND4L基因克隆及多态性分析
杜民
叶德来
牛宝珍
段加明
岳冉
宋桃稳
王文涛
刘艳红
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
下载PDF
职称材料
2
dna Y基因产物提高人尿激酶原cDNA在大肠杆菌中的表达
马忠
邱奇峰
华子春
朱德煦
《南京大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
1997
0
下载PDF
职称材料
已选择
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