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基于RNA-based NGS检测非小细胞肺癌融合基因临床实践中国专家共识 被引量:6
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作者 中国初级卫生保健基金会肿瘤精准诊疗专业委员会 中国抗癌协会肿瘤精准治疗专业委员会 +7 位作者 中国抗癌协会肿瘤病理专委会肺癌学组 钟华 韩宝惠 林冬梅 周清华 宋勇 周晓燕 周清 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期801-812,共12页
基于RNA水平的二代测序(RNA-based next-generation sequencing, RNA-based NGS)技术已被非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)临床实践指南和专家共识推荐为融合基因的检测方法之一。NSCLC可用药靶点主要包括基因突变和融... 基于RNA水平的二代测序(RNA-based next-generation sequencing, RNA-based NGS)技术已被非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)临床实践指南和专家共识推荐为融合基因的检测方法之一。NSCLC可用药靶点主要包括基因突变和融合,用于评估靶向治疗可行性的基因突变和融合基因检测均不可或缺。目前,基于DNA水平的NGS(DNA-based NGS)结合RNA-based NGS一次性同步检测基因突变和融合的技术已部分应用于临床实践。然而,RNA-based NGS检测融合基因的应用时机、应用场景和质控方面在我国仍缺乏规范和标准。本共识将进一步明确RNA-based NGS在融合基因检测中的应用时机、应用场景和质控,并给予指导性建议,推动RNA-based NGS在NSCLC临床诊疗中的应用,使患者能够最大程度地从融合基因检测中获益。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 融合基因 RNA-based ngs 靶向治疗 专家共识
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二代测序对比增强免疫组化检测非小细胞肺癌ROS1基因探索 被引量:3
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作者 邓秋华 刘利平 +3 位作者 邱源 黄丽燕 何冬云 杨海虹 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第6期955-958,共4页
目的:比较增强免疫组化(Ventana immunohistochemistry,Ventana IHC)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)C-ros原癌基因1-受体酪氨酸激酶(C-ros oncogene 1 receptor tyrosine kinase,ROS1)蛋白表达和二代测序(next-gen... 目的:比较增强免疫组化(Ventana immunohistochemistry,Ventana IHC)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)C-ros原癌基因1-受体酪氨酸激酶(C-ros oncogene 1 receptor tyrosine kinase,ROS1)蛋白表达和二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术检测ROS1基因融合突变的一致性。方法:应用NGS技术在DNA层面检测966例NSCLC患者标本ROS1基因融合突变情况,同时应用Ventana IHC检测其中732例标本ROS1蛋白的表达情况。结果:NGS检测结果显示966例NSCLC患者的ROS1基因融合突变率为1.0%(10/966),阳性样本病理类型为肺腺癌。Ventana IHC检测结果显示ROS1蛋白表达阳性率为17.6%(129/732),阳性样本病理类型主要为肺腺癌。Ventana IHC和NGS两种方法检测结果的一致性为83.6%(612/732),kappa=0.110(P<0.001)。两种方法检测ROS1基因差异具有统计学意义(P<0.001)。结论:作为ROS1基因的检测方法,Ventana IHC法比NGS法更灵敏,两种方法检测结果的一致性较差,两者差异具有统计学意义。Ventana IHC筛查出ROS1阳性样本,可采用NGS进行验证。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 C-ros原癌基因1-受体酪氨酸激酶 增强免疫组化 二代测序 靶向治疗
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芯片捕获二代测序技术在新生儿疾病筛查中的应用 被引量:6
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作者 王欣 孙云 +4 位作者 王彦云 洪冬洋 管贤伟 蒋涛 许争峰 《临床检验杂志》 CAS 2022年第3期173-178,共6页
目的探讨芯片捕获二代测序技术在新生儿疾病筛查中的临床应用价值。方法收集新生儿遗传代谢病筛查干血滤纸片样本,采用芯片捕获二代测序技术对169种常见疾病致病基因的已报道致病位点进行检测,检出位点采用Sanger测序验证。结果150例样... 目的探讨芯片捕获二代测序技术在新生儿疾病筛查中的临床应用价值。方法收集新生儿遗传代谢病筛查干血滤纸片样本,采用芯片捕获二代测序技术对169种常见疾病致病基因的已报道致病位点进行检测,检出位点采用Sanger测序验证。结果150例样本中有4例为可疑阳性患者(阳性率为2.67%),88例为致病基因携带者(携带率为58.67%),58例未检测到致病基因变异。其中,携带1个致病基因变异的样本高达40.7%,最多可见携带4个不同的致病基因变异。携带频率最高的致病基因为GJB2和SLC26A4,其次为PAH、SLC22A5、DUOX2、SLC12A3、USH2A及ACADS。结论基于芯片捕获二代测序技术的新生儿疾病筛查扩大了筛查病种,与传统生化筛查结果进行结合和分析,可有效降低筛查假阳性率,提高阳性预测值,具有重要的临床价值。 展开更多
关键词 基因筛查 芯片捕获二代测序 遗传代谢病 新生儿筛查
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“靶向式”教学与人才培养模式的探索与实践 被引量:2
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作者 龙建辉 王双娇 +1 位作者 岳扬扬 刘东娜 《中国地质教育》 2019年第2期68-71,共4页
专业人才的培养是高等教育的重要目标。随着教育教学改革的推进,如何有目的地培养专业人才对高等教育模式提出了更高要求。本文深入分析了地学专业教育机制、社会现状以及学生心理等方面的问题,着重从学业专攻、能力培养、个性化塑造和... 专业人才的培养是高等教育的重要目标。随着教育教学改革的推进,如何有目的地培养专业人才对高等教育模式提出了更高要求。本文深入分析了地学专业教育机制、社会现状以及学生心理等方面的问题,着重从学业专攻、能力培养、个性化塑造和综合素质提升四个方面对地学人才的培养模式进行了探索,分析了国内外高校的教学模式与成效,并对太原理工大学地质工程专业的教学与人才培养模式的实践进行整合与总结。 展开更多
关键词 "靶向式"教学 人才培养模式 教学理念 地学专业
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森林植被衰减系数极化特征研究 被引量:1
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作者 胡楚锋 周洲 +2 位作者 李南京 张麟兮 许家栋 《西北工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第1期1-5,共5页
采用室内宽带极化测量系统获得了小场景森林植被3~10 GHz高精度多极化的频域数据,通过时域响应定量推导了极化衰减差异与回波电平的数学关系,并结合植被的形态特征分析了极化衰减特征随频率的变化规律。结果表明通过不同极化的衰减系... 采用室内宽带极化测量系统获得了小场景森林植被3~10 GHz高精度多极化的频域数据,通过时域响应定量推导了极化衰减差异与回波电平的数学关系,并结合植被的形态特征分析了极化衰减特征随频率的变化规律。结果表明通过不同极化的衰减系数差异能够刻画森林植被结构的形态分布特征。当频率较低时,森林植被的结构分布体现有向性,随着频率的升高,主要的回波来自于冠层,植被结构呈现随机性分布特点。 展开更多
关键词 森林植被 衰减系数 极化 时域响应
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用多方位-距离滤波法解纯方位定位问题
6
作者 许志刚 董志荣 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第4期418-422,共5页
通过预估初距 ,将距离、方位滤波法应用于纯方位单目标定位问题 ,利用二乘滤波原理建立了多方位 -距离滤波法应用于观测器方位序列估计目标运动参数的数学模型 ,给出并严格证明了方位与初距的变化规律 ,为建立快速。
关键词 纯方位系统 目标定位 多方位—距离滤波法
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大学英语元学习能力及定向教学策略探讨
7
作者 苏雪莲 《黑河学院学报》 2017年第2期126-127,共2页
在英语教学中,提高学生的元学习能力对学生的学习成效具有一定的作用。培养元学习能力实现定向化教学,是比较先进的教学过程。大学英语元学习能力的培养及定向教学策略的制订,可以根据培养定向教学意识、提高教师的定向教学技能、将教... 在英语教学中,提高学生的元学习能力对学生的学习成效具有一定的作用。培养元学习能力实现定向化教学,是比较先进的教学过程。大学英语元学习能力的培养及定向教学策略的制订,可以根据培养定向教学意识、提高教师的定向教学技能、将教学理论有效融于定向教学实践等角度构建。 展开更多
关键词 大学英语 元学习能力 定向教学策略
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ABO血型基因分型中靶向捕获二代测序技术的建立 被引量:6
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作者 梁爽 吴凡 +3 位作者 苏宇清 梁延连 洪文旭 徐筠娉 《中国输血杂志》 CAS 2020年第9期881-885,共5页
目的建立以多重PCR捕获为基础的ABO血型基因二代测序(next-generation sequencing,NGS)分型技术,结合血清学鉴定技术,对ABO血型准确定型。方法开发用于ABO血型的多重PCR捕获的NGS技术,靶向捕获ABO基因全序列建立DNA文库,利用Illumina NG... 目的建立以多重PCR捕获为基础的ABO血型基因二代测序(next-generation sequencing,NGS)分型技术,结合血清学鉴定技术,对ABO血型准确定型。方法开发用于ABO血型的多重PCR捕获的NGS技术,靶向捕获ABO基因全序列建立DNA文库,利用Illumina NGS平台对20例深圳市血液中心健康无偿献血者血液标本做ABO基因测序分型;同时用血型血清学方法、PCR-SSP基因分型方法、以及第6、7外显子Sanger测序对同一批标本做ABO血型鉴定,以验证这种NGS技术做ABO血型鉴定的准确性。结果 1)利用新建立的靶向捕获二代测序技术对20例健康无偿献血者血液标本ABO基因的测序分析:平均测序深度为4 667±893,特异性与均一性分别为92.59%和92.47%,测序深度>20覆盖度为98.25%,均得到了唯一的分型结果。2)新建立的靶向捕获二代测序技术对于20例标本做的ABO全基因测序分型所得结果与血清学鉴定方法和基因分型技术的结果相符。结论成功建立了ABO基因多重PCR靶向捕获NGS测序技术,可以满足ABO血型的鉴定要求。 展开更多
关键词 ABO血型鉴定 基因分型 二代测序 多重PCR捕获 全基因测序 血清学 PCR-SSP Sanger测序
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罕见基因突变晚期非小细胞肺腺癌靶向治疗有效1例 被引量:1
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作者 陈思名 雷雨 白俊 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第24期4403-4406,共4页
肺癌是我国最常见的恶性肿瘤。根据中国恶行肿瘤流行情况分析显示,肺癌发病率及死亡率居于中国恶性肿瘤之首,肺癌最常见的类型为非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC),[1]。近年来分子靶向治疗在晚期NSCLC的治疗中已展示出巨... 肺癌是我国最常见的恶性肿瘤。根据中国恶行肿瘤流行情况分析显示,肺癌发病率及死亡率居于中国恶性肿瘤之首,肺癌最常见的类型为非小细胞肺癌(non-small cell lungcancer,NSCLC),[1]。近年来分子靶向治疗在晚期NSCLC的治疗中已展示出巨大的成功。本文现就1则罕见基因突变晚期非小细胞肺腺癌靶向治疗情况进行报告。1临床资料患者,男,69岁,有吸烟史。因"咳嗽、咳痰1月余"于2018年11月13日入院。咳黄色黏痰,伴左侧胸痛、气短,无发热、心慌、心悸、夜间阵发性呼吸困难、痰中带血等不适。 展开更多
关键词 ARMS ngs CTDNA 非小细胞肺癌 靶向治疗
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基于高通量测序的伴随诊断试剂临床评价方法及运用 被引量:3
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作者 高宇 吕允凤 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第7期982-986,共5页
随着分子生物学技术的发展,靶向治疗药物已经在临床广泛应用,但药物的治疗效果存在着较大的个体差异,需要伴随诊断试对可获益患者进行区分.与此同时,高通量测序作为高通量测序具有速度快、准确性高、报告位点多、所需样本量小等等优势,... 随着分子生物学技术的发展,靶向治疗药物已经在临床广泛应用,但药物的治疗效果存在着较大的个体差异,需要伴随诊断试对可获益患者进行区分.与此同时,高通量测序作为高通量测序具有速度快、准确性高、报告位点多、所需样本量小等等优势,将高通量测序作为伴随诊断试剂指导用药有着强烈的需求.但如何对高通量测序可同时报告多个位点的性能进行临床评价是研究人员还是监管者都面临的巨大挑战.美国FDA提出了Follow-on临床评价方法,通过外部等效性研究评价二者的临床性能的一致性.本文基于在美国使用该临床评价方法已上市的产品对基于高通量测序的伴随诊断试剂的评价方法进行阐述,以期为我国研究人员和生产企业在该类产品研发、申报时提供参考. 展开更多
关键词 高通量测序 伴随诊断 Follow-On 靶向治疗
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MEOS海上光电监视系统
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作者 许仲仁 《海洋技术》 北大核心 2002年第2期64-68,共5页
主要介绍 MEOS海上光电监视系统的组成方案和系统工作原理、系统总体方案设计思想。同时还讨论了目标特性与作用距离之间的关系 ,给出试验所获得的主要技术指标 ,总结了系统主要技术特点。
关键词 光电监视 目标探测 指向器 红外辐射 MEOS系统 作用距离
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2018年肿瘤基因检测大事盘点
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作者 李敬杰 陈亚伟 +3 位作者 都潇 李彤 胡莹 张恒辉 《肿瘤综合治疗电子杂志》 2019年第1期27-34,共8页
本文回顾了近一年来肿瘤基因检测领域的大事件,主要包括:靶向治疗新老靶点药物的研究及耐药后机制的探索;液体活检在肿瘤早筛、疗效预测、预后评估、复发监测、肿瘤异质性及进化等方面的研究进展;免疫检查点抑制剂治疗疗效相关生物标志... 本文回顾了近一年来肿瘤基因检测领域的大事件,主要包括:靶向治疗新老靶点药物的研究及耐药后机制的探索;液体活检在肿瘤早筛、疗效预测、预后评估、复发监测、肿瘤异质性及进化等方面的研究进展;免疫检查点抑制剂治疗疗效相关生物标志物的研究进展。本文将分类盘点在主要国际国内肿瘤会议和顶级临床期刊上公布和发表的重要临床研究,以便读者快速全面了解基因检测的最新进展和未来趋势。 展开更多
关键词 液体活检 靶向治疗 免疫治疗 二代测序
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Evaluation of bacterial pathogen diversity,abundance and health risks in urban recreational water by amplicon next-generation sequencing and quantitative PCR 被引量:6
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作者 Qijia Cui Tingting Fang +2 位作者 Yong Huang Peiyan Dong Hui Wang 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2017年第7期137-149,共13页
The microbial quality of urban recreational water is of great concern to public health.The monitoring of indicator organisms and several pathogens alone is not sufficient to accurately and comprehensively identify mic... The microbial quality of urban recreational water is of great concern to public health.The monitoring of indicator organisms and several pathogens alone is not sufficient to accurately and comprehensively identify microbial risks.To assess the levels of bacterial pathogens and health risks in urban recreational water,we analyzed pathogen diversity and quantified four pathogens in 46 water samples collected from waterbodies in Beijing Olympic Forest Park in one year.The pathogen diversity revealed by 16 S r RNA gene targeted next-generation sequencing(NGS) showed that 16 of 40 genera and 13 of 76 reference species were present.The most abundant species were Acinetobacter johnsonii,Mycobacterium avium and Aeromonas spp.Quantitative polymerase chain reaction(q PCR) of Escherichia coli(uid A),Aeromonas(aer A),M.avium(16S r RNA),Pseudomonas aeruginosa(oaa) and Salmonella(inv A) showed that the aer A genes were the most abundant,occurring in all samples with concentrations of 10^(4–6) genome copies/100 m L,followed by oaa,inv A and M.avium.In total,34.8% of the samples harbored all genes,indicating the prevalence of these pathogens in this recreational waterbody.Based on the q PCR results,a quantitative microbial risk assessment(QMRA) showed that the annual infection risks of Salmonella,M.avium and P.aeruginosa in five activities were mostly greater than the U.S.EPA risk limit for recreational contacts,and children playing with water may be exposed to the greatest infection risk.Our findings provide a comprehensive understanding of bacterial pathogen diversity and pathogen abundance in urban recreational water by applying both NGS and q PCR. 展开更多
关键词 Human pathogens Urban water Recreational activities 16S rRNA gene targeted ngs qPCR Quantitative microbial risk assessment
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丙泊酚目标靶控输注用于颅内动脉瘤介入治疗麻醉诱导的临床观察 被引量:1
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作者 阮剑辉 程南 夏中元 《中国医师进修杂志》 2014年第30期1-4,共4页
目的 观察丙泊酚目标靶控输注用于颅内动脉瘤介入治疗麻醉诱导过程中对血流动力学的影响.方法 择期行颅内动脉瘤介入治疗患者90例,按随机数字表法分为三组:对照组(C组)、血浆药物浓度靶控输注组(P组)和效应室药物浓度靶控输注组(... 目的 观察丙泊酚目标靶控输注用于颅内动脉瘤介入治疗麻醉诱导过程中对血流动力学的影响.方法 择期行颅内动脉瘤介入治疗患者90例,按随机数字表法分为三组:对照组(C组)、血浆药物浓度靶控输注组(P组)和效应室药物浓度靶控输注组(E组),每组30例.C组采用丙泊酚2 mg/kg单次静脉推注;P组设定丙泊酚血浆靶浓度为4μg/ml;E组设定丙泊酚效应室靶浓度为4 μg/m],三组均采用瑞芬太尼浓度为4 ng/ml的血浆靶控输注,静脉推注顺阿曲库铵0.2 mg/kg.持续监测呼气末二氧化碳分压、脑电双频指数、平均动脉压(MAP)、心率(HR)、心电图、脉搏血氧饱和度及生命体征.记录各组患者诱导前(T0)、插管即刻(T1)、插管后1 min (T2)、3 min(T3)、5 min(T4)、10 min(T5)的MAP和HR,记录血流动力学异常发生率及血管活性药物使用情况.结果 三组T0时MAP及HR比较差异无统计学意义(P>0.05).三组T1时MAP及HR均显著低于本组T0,差异有统计学意义(P<0.05);P组T1时MAP及HR显著低于E组和C组,差异有统计学意义(P<0.05).P组使用血管活性药物例数显著低于C组[6.7%(2/30)比40.0%(12/30)],差异有统计学意义(P<0.01).结论 丙泊酚血浆药物浓度作为目标靶控输注浓度更适合颅内动脉瘤介入手术患者的麻醉诱导. 展开更多
关键词 二异丙酚 颅内动脉瘤 靶控输注 麻醉诱导 介入治疗
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