霍乱弧菌VPI毒力岛的tcpI-P和tcpH-A间隔区序列在不同菌株中的差异分析

目的 TcpA是霍乱弧菌主要定居因子毒素共调菌毛的主要亚单位 ,基因位于VPI毒力岛上。古典生物型和ElTor生物型霍乱弧菌菌株的tcpA序列有较大差异 ,同时毒力岛上其他一些区域 ,主要包括部分基因的间隔区序列也存在差异。我们已在不同ElTor流行株与非流行株以及非O1/非O13 9菌株中又发现 4种新的tcpA序列。笔者拟探明这 4种不同类型tcpA序列的菌株中 ,VPI毒力岛上其他几个差异片段 (tcpI -P间隔区和tcpH -A间隔区 )是否与相应tcpA序列有平行的变异关系、进而分析毒力岛和菌株分化的多样性。方法 在tcpI-P和tcpH -A间隔区外侧保守区中设计引物 ,扩增包含这两个间隔区的片段并进行测序 ,计算比较序列差异。结果 基因tcpH与tcpA之间的间隔区序列两两间比较的一致性在 63 3 %至 95 3 %之间 ;基因tcpI与tcpP之间的间隔区序列两两间比较的一致性在 2 6 7%至 10 0 %之间。这些间隔区序列并没有像tcpA序列在这些菌株中的差异那样显示出类似的变异水平 ,甚至一些菌株的tcpA序列有较大差异时、某些区域反而高度一致。结论 在不同tcpA序列的菌株中tcpI-P间隔区和tcpH -A间隔区及tcpA这三个片段分化变异的速率不同 ,并不具有平行性。这些序列的多样性反映了霍乱弧菌VPI毒力岛以及菌株分化的多样性。这种分化也提?