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禾本科植物内生真菌研究19:圆柱披碱草内生真菌的系统发育学研究
1
作者
王志伟
张晨炜
+2 位作者
詹漓晖
亢燕
纪燕玲
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期408-416,共9页
[目的]本文旨在确定圆柱披碱草(Elymus cylindricus)内生真菌的分类地位。[方法]选择5株分离自新疆、青海的圆柱披碱草内生真菌菌株,采用SDS法提取基因组DNA,利用选择性引物对其tub B和tef A基因片段进行扩增和克隆测序,下载NCBI中的相...
[目的]本文旨在确定圆柱披碱草(Elymus cylindricus)内生真菌的分类地位。[方法]选择5株分离自新疆、青海的圆柱披碱草内生真菌菌株,采用SDS法提取基因组DNA,利用选择性引物对其tub B和tef A基因片段进行扩增和克隆测序,下载NCBI中的相似序列并进行比对分析,用MEGA 6.0软件构建系统发育树。[结果]成功获得差异极小的各菌株序列,且tub B序列确认为仅1个拷贝,而2个菌株的tef A序列则有2个拷贝。在最大简约树上披碱草菌株的tef A和tub B第1拷贝均在EBY(Epichloe bromicola/E.yangzii)大支上,与E.sinica比较接近;tef A的第2拷贝与ETC(E.typhina complex)中的成员聚类。[结论]Epichloesp.-Elymus cylindricus是一个新的共生体组合。圆柱披碱草分离菌株为杂交起源的Epichloe属真菌,可能起源于E.bromicola(syn.E.yangzii)和E.sylvatica间的杂交。
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关键词
圆柱披碱草
Epichloe属真菌
tubB
tefa
系统发育分析
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职称材料
题名
禾本科植物内生真菌研究19:圆柱披碱草内生真菌的系统发育学研究
1
作者
王志伟
张晨炜
詹漓晖
亢燕
纪燕玲
机构
南京农业大学生命科学学院
海南丰源无公害农业技术研究所
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期408-416,共9页
基金
国家自然科学基金项目(30670008
31372365)
文摘
[目的]本文旨在确定圆柱披碱草(Elymus cylindricus)内生真菌的分类地位。[方法]选择5株分离自新疆、青海的圆柱披碱草内生真菌菌株,采用SDS法提取基因组DNA,利用选择性引物对其tub B和tef A基因片段进行扩增和克隆测序,下载NCBI中的相似序列并进行比对分析,用MEGA 6.0软件构建系统发育树。[结果]成功获得差异极小的各菌株序列,且tub B序列确认为仅1个拷贝,而2个菌株的tef A序列则有2个拷贝。在最大简约树上披碱草菌株的tef A和tub B第1拷贝均在EBY(Epichloe bromicola/E.yangzii)大支上,与E.sinica比较接近;tef A的第2拷贝与ETC(E.typhina complex)中的成员聚类。[结论]Epichloesp.-Elymus cylindricus是一个新的共生体组合。圆柱披碱草分离菌株为杂交起源的Epichloe属真菌,可能起源于E.bromicola(syn.E.yangzii)和E.sylvatica间的杂交。
关键词
圆柱披碱草
Epichloe属真菌
tubB
tefa
系统发育分析
Keywords
Elymus cylindricus
Epichloe
tubB
tefa
phylogenetic analysis
分类号
Q939.5 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
禾本科植物内生真菌研究19:圆柱披碱草内生真菌的系统发育学研究
王志伟
张晨炜
詹漓晖
亢燕
纪燕玲
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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