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Influence of Temperature on Symbiotic Bacterium Composition in Successive Generations of Egg Parasitoid, Anagrus nilaparvatae 被引量:1
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作者 WANG Xin XU Hong-xing +3 位作者 LIU Shu-ping TANG Jiang-wu ZHENG Xu-song LV Zhong-xian 《Rice science》 SCIE CSCD 2016年第4期203-210,共8页
Anagrus nilaparvatae is the dominant egg parasitoid of rice planthoppers and plays an important role in biological control. Symbiotic bacteria can significantly influence the development, survival, reproduction and po... Anagrus nilaparvatae is the dominant egg parasitoid of rice planthoppers and plays an important role in biological control. Symbiotic bacteria can significantly influence the development, survival, reproduction and population differentiation of their hosts. To study the influence of temperature on symbiotic bacterial composition in the successive generations of A. nilaparvatae, A. nilaparvatae were raised under different constant temperatures of 22 °C, 25 °C, 28 °C, 31 °C and 34 °C. Polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis was used to investigate the diversity of symbiotic bacteria. Our results revealed that the endophytic bacteria of A. nilaparvatae were Pantoea sp., Pseudomonas sp. and some uncultured bacteria. The bacterial community composition in A. nilaparvatae significantly varied among different temperatures and generations, which might be partially caused by temperature, feeding behavior and the physical changes of hosts. However, the analysis of wsp gene showed that the Wolbachia in A. nilaparvatae belonged to group A, sub-group Mors and sub-group Dro. Sub-group Mors was absolutely dominant, and this Wolbachia composition remained stable in different temperatures and generations, except for the 3rd generation under 34 °C during which sub-group Dro became the dominant Wolbachia. The above results suggest that the continuous high temperature of 34 °C can influence the Wolbachia community composition in A. nilaparvatae. 展开更多
关键词 temperature ANAGRUS nilaparvatae WOLBACHIA bacterial community polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis rice brown PLANTHOPPER
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应用TGGE技术分析人肠道中双歧杆菌的组成 被引量:10
2
作者 庞小燕 张宝让 +1 位作者 魏桂芳 赵立平 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期738-743,共6页
用温度梯度凝胶电泳(TGGE)技术结合16SrDNA克隆、测序,对健康人肠道中双歧杆菌的组成进行了分析。10例健康人肠道双歧杆菌的TGGE分析显示:人肠道内双歧杆菌的组成具有宿主特异性,不同人肠道双歧杆菌种的多样性和种类不同。通过对一健康... 用温度梯度凝胶电泳(TGGE)技术结合16SrDNA克隆、测序,对健康人肠道中双歧杆菌的组成进行了分析。10例健康人肠道双歧杆菌的TGGE分析显示:人肠道内双歧杆菌的组成具有宿主特异性,不同人肠道双歧杆菌种的多样性和种类不同。通过对一健康儿童肠道双歧杆菌属特异性PCR扩增产物的测序及TGGE电泳行为的分析发现,该个体双歧杆菌TGGE图谱中的条带分别代表Bifidobacteriumbifidum、B.infantis、B.longum、B.adolescentis、B.pseudocatenulatum等种和一新种,其中B.pseudocatenulatum(假小链双歧杆菌)是大多数个体共有且较优势的种类。用传统培养方法只检出B.pseudocatenulatum和B.longum两种。基于双歧杆菌属特异性PCR基础上的TGGE方法结合16SrDNA克隆文库分析可较灵敏、直观地反映人肠道中双歧杆菌的组成。 展开更多
关键词 双歧杆菌 温度梯度凝胶电泳(tgge)、粪便、16S rDNA克隆文库
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MTHFR基因C677T点突变的PCR-TGGE检测技术的建立
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作者 莫雪华 李月琴 +3 位作者 谢卫兵 王彤歌 吴军民 周天鸿 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 2002年第1期99-103,共5页
目的 :建立检测MTHFRC6 77T点突变的PCR -TGGE技术 .方法 :以中国人群外周血基因组DNA为模板 ,用聚合酶链反应扩增该基因外显子 4 ,用温度梯度凝胶电泳 (TGGE)分析检测PCR产物 ,对电泳结果异常者进行DNA测序 .结果 :垂直型TGGE与平行型T... 目的 :建立检测MTHFRC6 77T点突变的PCR -TGGE技术 .方法 :以中国人群外周血基因组DNA为模板 ,用聚合酶链反应扩增该基因外显子 4 ,用温度梯度凝胶电泳 (TGGE)分析检测PCR产物 ,对电泳结果异常者进行DNA测序 .结果 :垂直型TGGE与平行型TGGE均发现该外显子存在杂合性突变 ,经DNA测序证实为C6 77T点突变 .结论 :该技术具有快速、分辨能力高和重复性好的特点 ,是一种有效的检测核酸序列变异和点突变的技术 . 展开更多
关键词 MTHFR基因 C677T点突变 PCR-tgge检测技术 温度梯度凝胶电泳 基因突变 分子生物学 中国人
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DGGE/TGGE方法在土壤微生物群落研究中的应用 被引量:4
4
作者 杜宇峰 叶央芳 《江苏环境科技》 2005年第B12期128-131,共4页
变性梯度凝胶电(DGGE) 温度梯度凝胶电泳(TGGE)已成为环境微生物学领域比较微生物群落多样性和检测种群动力学的重要分子手段,本文介绍了DGGE/TGGE方法在土壤微生物群落研究中的应用进展及存在的缺陷,并提出了改进建议。
关键词 变性梯度凝胶电泳 温度梯度凝胶电泳 微生物多样性
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大港孔店油田水驱油藏微生物群落的分子分析 被引量:37
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作者 佘跃惠 张学礼 +2 位作者 张凡 王凌华 赵立平 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期329-334,共6页
通过多聚酶链式反应 温度梯度凝胶电泳(PCR TGGE)和构建16SrRNA基因克隆文库两种方法对比研究了大港油田孔二北断块注水井和采油井的微生物群落结构。16SrDNAV3区PCR扩增产物的TGGE图谱分析表明,这两个油井的微生物群落结构差异很大。... 通过多聚酶链式反应 温度梯度凝胶电泳(PCR TGGE)和构建16SrRNA基因克隆文库两种方法对比研究了大港油田孔二北断块注水井和采油井的微生物群落结构。16SrDNAV3区PCR扩增产物的TGGE图谱分析表明,这两个油井的微生物群落结构差异很大。注水井样品的TGGE图谱中有6条主要条带,而采油井样品中只有一个条带占绝对优势。同时,建立了两个样品的16SrRNA基因克隆文库,从中分别挑选了10 8和5 0个克隆进行限制性酶切片段长度多样性分析(ARDRA)。注水井样品有33个操作分类单元(OTU) ,其中6个OTU是优势类型;而采油井样品只有8个OTU ,有1个OTU在文库中占绝对优势。克隆文库和TGGE的研究结果一致,均表明注水井样品的微生物多样性比采油井丰富很多。每个OTU的代表克隆序列分析结果表明,注水井样品中的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲和放线菌纲,尤其是红细菌亚纲( 4 7% )。采油井样品的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲,尤其是假单胞菌属( 6 2 % )。 展开更多
关键词 油藏 16S RRNA基因 tgge 克隆文库 微生物群落 多样性
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土壤微生物分子生态学研究中总DNA的提取 被引量:72
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作者 赵勇 周志华 +3 位作者 李武 刘彬彬 潘迎捷 赵立平 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期854-860,共7页
建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限... 建立了一种土壤DNA提取方法。根据DNA产量和纯度2个评价指标,从3种手提土壤DNA方法中优选出方法B为手提DNA方法(Labmethod),它包括样品预处理,细胞裂解,粗DNA纯化,其中细胞裂解组合了玻璃珠击打,SDS裂解,溶菌酶裂解。进一步应用PCR-限制性片段长度多态性(Restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)技术及PCR-温度梯度凝胶电泳(Temperaturegradientgelelectrophoresis,TGGE)技术,结合DNA产量、纯度、片段大小以及所反映的微生物群落结构特性等指标评价了手提方法(Labmethod)得到的总DNA质量,并将这些结果与2种应用较广的商业试剂盒(MoBioUltraCleanSoilDNAKit和Bio101FastDNASPINKit(ForSoil))所得DNA的各种指标进行了比较。结果表明,手提方法(Labmethod)的粗DNA产量低于Bio101Kit的,但高于MoBioKit的。这些方法所得DNA的长度都在21kb左右,Labmethod提取的DNA没有严重被剪切现象,而2种试剂盒提取的DNA都有不同程度的剪切。手提方法得到的DNA经纯化后,应用细菌及真菌特异引物进行PCR扩增,均能获得目的片段,表明该方法能从土壤中同时有效提取细菌和真菌总基因组DNA。并且,手提方法所得DNA的细菌16SrDNA和真菌18SrDNA的PCR-RFLP图谱与两种商业试剂盒的图谱基本相似,但3种方法提取的DNA在细菌16SrDNAV3区和真菌28SrDNA片段的PCR-TGGE图谱上都存在一定差异,主要表现在一些弱势条带的有无或强弱上。这说明手提方法提取的总DNA与2种商业试剂盒一样,在一定程度上能反映微生物群落的多样性和组成。总之,手提DNA方法(Labmethod)所用试剂普通,价格便宜,能在4h以内获得够质够量的土壤DNA用于微生物分子生态学研究,较适合于广大普通实验室进行土壤DNA提取工作。 展开更多
关键词 土壤DNA提取 DNA质量 PCR扩增 限制性片段长度多态性分析 温度梯度凝胶电泳分析
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不同低温驯化策略下的厌氧氨氧化活性 被引量:26
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作者 杨朝晖 徐峥勇 +2 位作者 曾光明 刘有胜 肖勇 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第3期300-305,共6页
在3种不同的低温驯化策略下启动3套规格相同的厌氧序批式生物膜反应器(ASBBR),在对运行过程中氮素变化规律进行分析的同时,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对生物膜上的细菌种群结构进行分析,初步考察了厌氧氨氧化的活性.结果表明,对应a... 在3种不同的低温驯化策略下启动3套规格相同的厌氧序批式生物膜反应器(ASBBR),在对运行过程中氮素变化规律进行分析的同时,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对生物膜上的细菌种群结构进行分析,初步考察了厌氧氨氧化的活性.结果表明,对应a1、a2和a33种不同的低温驯化策略,A1、A2和A33个反应器分别经过62,56,70d的驯化后,表现出不同的厌氧氨氧化活性.以氮素转化效率作为衡量标准,其活性依次为A3>A1>A2.DGGE分析进一步说明,在不同的驯化策略下,反应器表现出不同的种群多样性,但种群结构基本保持一致;在接种物相同的策略中,降温幅度对种群多样性的影响与其对厌氧氨氧化活性的影响具有一致性. 展开更多
关键词 低温驯化策略 厌氧氨氧化 氮素转化 变形梯度凝胶电泳(DGGE)
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厨余垃圾高温堆肥中嗜热细菌种群结构分析 被引量:14
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作者 杨朝晖 刘有胜 +2 位作者 曾光明 肖勇 杨恋 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期733-737,共5页
基于16SrDNA的PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术和系统发育分析,对厨余垃圾高温堆肥中嗜热细菌种群结构进行研究.堆肥高温阶段(>50℃)持续7d,在此期间从堆体中采样并提取微生物总DNA,使用细菌通用引物GC-341F/907R从总DNA中成功PCR扩... 基于16SrDNA的PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术和系统发育分析,对厨余垃圾高温堆肥中嗜热细菌种群结构进行研究.堆肥高温阶段(>50℃)持续7d,在此期间从堆体中采样并提取微生物总DNA,使用细菌通用引物GC-341F/907R从总DNA中成功PCR扩增出目标16SrDNA片段,对扩增16SrDNA进行DGGE分析,DGGE条带相似性Cs值分析和切胶测序,使用序列数据进行同源性分析并建立系统发育树.DGGE和相似性Cs值分析结果表明,堆肥高温阶段有着比较丰富的细菌多样性,同时存在明显的优势种群结构变化;切胶测序和系统发育分析结果表明,大部分高温阶段优势种群序列与芽孢杆菌属(Bacillus)和梭菌属(Clostridium)中的嗜热菌群具有较近的亲缘关系. 展开更多
关键词 厨余垃圾 高温堆肥 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 嗜热细菌 系统发育分析
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低温厌氧氨氧化生物滤池群落结构分析 被引量:7
9
作者 曾涛涛 李冬 +3 位作者 邱文新 曾辉平 刘涛 张杰 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第6期6-10,共5页
为了解低温(15.0~16.5℃)稳定运行的厌氧氨氧化生物滤池微生物特征,利用扫描电镜(SEM)、变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)和克隆测序等方法,对低温稳定运行的两个上流式厌氧氨氧化生物滤池进行微生物群落结构分析.SEM结果显示,陶粒填料反应... 为了解低温(15.0~16.5℃)稳定运行的厌氧氨氧化生物滤池微生物特征,利用扫描电镜(SEM)、变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)和克隆测序等方法,对低温稳定运行的两个上流式厌氧氨氧化生物滤池进行微生物群落结构分析.SEM结果显示,陶粒填料反应器(B1)内丝状菌较多,球形细菌分布密度较低,而火山岩填料反应器(B2)没有发现丝状菌,球形细菌分布密集.DGGE结果表明,B1与B2反应器微生物种类有所差别,种群相似性为68.1%,B2反应器内细菌丰度更高,但两反应器内厌氧氨氧化细菌种类相同.通过细菌及ANAMMOX菌16S rRNA克隆测序,鉴定反应器内厌氧氨氧化细菌为Candidatus Kueneniastuttgartiensis.采用火山岩填料生物滤池反应器形式,并富集Candidatus Kuenenia stuttgartiensis,有助于厌氧氨氧化工艺在较低温度(15.0~16.5℃)条件下稳定运行和推广应用. 展开更多
关键词 厌氧氨氧化 变性梯度凝胶电泳 生物滤池 低温
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分子生物学技术在产甲烷古菌研究中的应用 被引量:13
10
作者 王刘阳 尹小波 胡国全 《中国沼气》 2008年第1期19-24,共6页
鉴于产甲烷古菌在环境和能源两大方面的特殊作用,对它的研究一直是微生物学研究的焦点之一。现代分子生物学技术的发展与应用,进一步推动了对产甲烷古菌的研究。本文将综述产甲烷古菌基因克隆研究进展以及几项有代表性的分子生物学技术... 鉴于产甲烷古菌在环境和能源两大方面的特殊作用,对它的研究一直是微生物学研究的焦点之一。现代分子生物学技术的发展与应用,进一步推动了对产甲烷古菌的研究。本文将综述产甲烷古菌基因克隆研究进展以及几项有代表性的分子生物学技术在产甲烷古菌研究中的应用。 展开更多
关键词 产甲烷古菌 基因克隆 DGGE tgge FISH
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堆肥低温起爆微生物筛选及其初步应用 被引量:5
11
作者 魏自民 王佰洁 +4 位作者 赵越 席北斗 郭悠然 解新宇 李雪 《环境科学研究》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2015年第6期981-986,共6页
为解决北方寒冷地区因低温导致有机废弃物处理周期漫长且效率低等问题,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术与传统平板培养相结合的方法,从低温堆肥中分离出19株嗜冷细菌,并采用序列引导分离分子生物学技术,最终获得目... 为解决北方寒冷地区因低温导致有机废弃物处理周期漫长且效率低等问题,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术与传统平板培养相结合的方法,从低温堆肥中分离出19株嗜冷细菌,并采用序列引导分离分子生物学技术,最终获得目标优势菌株CY1.将CY1与筛选的糖、淀粉、蛋白质分解菌株CY14、CY17和CY19复配成低温复合菌剂,研究优化组合菌剂对低温鸡粪堆肥的影响.结果表明,堆肥至第6天时,复合菌剂处理(T)堆料中w(OM)(OM为有机质)下降了12.64%;水溶性有机物(DOM)三维荧光光谱显示,低温复合菌剂处理类蛋白峰(峰T)的荧光峰强度下降了44.10%,类腐殖酸峰(峰C)的荧光峰强度上升了39.00%.添加复合菌剂能够提高堆肥低温起爆效率,可为我国北方寒冷地区低温堆肥提供技术优化. 展开更多
关键词 堆肥 低温起爆 复合菌剂 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 荧光光谱
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EMS对穿梭质粒pZ189诱变作用的初步研究 被引量:5
12
作者 范奇元 李寿祺 +3 位作者 傅继梁 翟朝阳 陈雁 刘柏林 《华西医科大学学报》 CAS CSCD 1992年第3期293-296,共4页
用甲基磺酸乙酯(EMS)处理穿梭质粒pZ189的转化菌,提取经处理的质粒再转化大肠杆菌MBM7070菌株。然后,在特定的选择性培养基上筛选出pZ189质粒上靶基因SupF发生了突变的转化子,计算了突变型频率。用DNA温度梯度凝胶电泳(TGGE)检出了含有S... 用甲基磺酸乙酯(EMS)处理穿梭质粒pZ189的转化菌,提取经处理的质粒再转化大肠杆菌MBM7070菌株。然后,在特定的选择性培养基上筛选出pZ189质粒上靶基因SupF发生了突变的转化子,计算了突变型频率。用DNA温度梯度凝胶电泳(TGGE)检出了含有SupF突变基因的DNA片段. 展开更多
关键词 穿梭质粒 甲基磺酸乙酯 诱变作用
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时相温度梯度凝胶电泳在线粒体基因突变检测中的应用 被引量:2
13
作者 谭端军 刘玲玲 +4 位作者 文毅 薛桥 王士雯 Lee-Jun C Wong 陈天健 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期139-141,共3页
目的 评价时相温度梯度凝胶电泳技术 (TTGE)在肿瘤患者线粒体基因同质性和异质性突变检测中的应用。方法 对117例肿瘤组织和配对正常组织的全线粒体基因进行PCR扩增和TTGE突变筛选分析 ,对TTGE显示在肿瘤和配对正常组织中具有不同类... 目的 评价时相温度梯度凝胶电泳技术 (TTGE)在肿瘤患者线粒体基因同质性和异质性突变检测中的应用。方法 对117例肿瘤组织和配对正常组织的全线粒体基因进行PCR扩增和TTGE突变筛选分析 ,对TTGE显示在肿瘤和配对正常组织中具有不同类型电泳带型变化的片段进行测序。结果 TTGE在总共 36 5 4片段中发现 16 0个体细胞性线粒体基因突变片段 ,经与直接测序结果比较 ,TTGE检测体细胞性突变的敏感性和特异性分别达 96 2 7%和 94 0 5 %。结论 TTGE是筛选线粒体基因体细胞性同质性突变和各种比例异质性突变的一种敏感方法。 展开更多
关键词 肿瘤 时相温度凝胶梯度电泳 DNA 线粒体 突变
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应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落 被引量:2
14
作者 洪纬 魏桂芳 +2 位作者 庞小燕 王凌华 赵立平 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2005年第1期19-22,共4页
目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19~29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌... 目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCRTGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析。方法8例成年个体包括4男4女,年龄19~29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品)。提取菌斑DNA,PCR扩增16SrDNAV3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析。结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%~95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下。结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定。 展开更多
关键词 菌斑 下颌 牙周 PCR 成年 温度梯度凝胶电泳 tgge 微生物群落 16SrDNA 相似性系数
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发酵肉制品菌群的非培养鉴定技术研究进展 被引量:4
15
作者 王稳航 徐倩倩 +1 位作者 滕安国 刘安军 《肉类研究》 2014年第9期17-21,共5页
随着分子生物学技术的快速发展,以聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)为基础的非培养鉴定技术在发酵肉制品菌群鉴定中得到越来越广泛的应用。其方法主要有种特异性PCR、聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳等。与传统的分离培养鉴... 随着分子生物学技术的快速发展,以聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)为基础的非培养鉴定技术在发酵肉制品菌群鉴定中得到越来越广泛的应用。其方法主要有种特异性PCR、聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳等。与传统的分离培养鉴定方法相比,非培养方法具有直接、快速、准确、实时等优点,但同时也存在一些缺点,如样品复杂程度、DNA(RNA)提取条件、PCR反应过程的差异等均可影响鉴定结果。非培养鉴定技术与传统微生物鉴定技术相结合,能够对发酵肉制品菌群多态性和动态变化做出准确的鉴定。 展开更多
关键词 发酵肉制品 菌群 非培养方法 种特异性聚合酶链反应 聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳
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产氢菌株Clostridium sp.T7的快速筛选 被引量:1
16
作者 刘洪艳 陈国超 《天津科技大学学报》 CAS 2011年第2期13-16,48,共5页
取自潮间带的污泥分别在不同温度下(80、100、121,℃)进行热休克预处理,富集产氢菌群并测定其产氢量,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析混合菌群组成.结果表明:3种热处理条件下混合菌群的产氢量都要高于对照未处理菌群.DGGE图谱表明,与80... 取自潮间带的污泥分别在不同温度下(80、100、121,℃)进行热休克预处理,富集产氢菌群并测定其产氢量,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析混合菌群组成.结果表明:3种热处理条件下混合菌群的产氢量都要高于对照未处理菌群.DGGE图谱表明,与80、100,℃热休克处理混合菌群相比,经121,℃热休克处理富集的混合菌群,其电泳条带最少,测序结果发现该混合菌群中包括产氢菌Clostridium sp..从该混合菌群中纯化并鉴定了1株产氢菌株Clostridiumsp.T7(登录号HM104461).培养温度对菌株T7产氢有一定影响,温度在25~55,℃范围内菌株Clostridium sp.T7都能产氢,最适产氢温度是35,℃. 展开更多
关键词 热休克预处理 变性梯度凝胶电泳 产氢菌株 培养温度
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持续偏热环境对肉鸡盲肠菌群多样性的影响 被引量:29
17
作者 彭骞骞 王雪敏 +3 位作者 张敏红 冯京海 甄龙 张少帅 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期186-194,共9页
【目的】环境温度是影响家禽肠道菌群的重要因素之一,随着环境温度的改变,家禽肠道正常菌群也会受到影响,研究持续偏热环境对肉鸡肠道微生物多样性及结构的影响,为肉鸡健康养殖提供理论依据。【方法】试验选取22 d爱拔益加(AA)肉鸡144... 【目的】环境温度是影响家禽肠道菌群的重要因素之一,随着环境温度的改变,家禽肠道正常菌群也会受到影响,研究持续偏热环境对肉鸡肠道微生物多样性及结构的影响,为肉鸡健康养殖提供理论依据。【方法】试验选取22 d爱拔益加(AA)肉鸡144只转入环境控制舱,随机分成3个处理组(21、26和31℃),每个处理6个重复,每个重复8只鸡(公母各4只),在21℃、相对湿度60%的环境下适应7 d。29 d时,试验温度分别调整到21、26和31℃,相对湿度60%,至试验结束,共14 d。于试验第7、14天末,每处理随机选取6只(公母各3只;每重复选1只),无菌采集盲肠内容物,将同一处理组的6个样品混合均匀,迅速放入无菌的离心管中,液氮速冻,-80℃冰箱保存备用。采用16S r DNA的PCR-DGGE分子技术,结合共性和特异性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,分析持续偏热处理7、14 d时,对盲肠内容物菌群的结构和多样性的影响。【结果】(1)26、31℃组肉仔鸡盲肠DGGE条带数(菌群丰富程度)均低于21℃组,且31℃组低于26℃组;31℃组肉仔鸡盲肠DGGE条带数,在试验14 d明显低于试验7 d;(2)不同组之间聚类图和多样性指数分析可知,26、31℃组对肉鸡盲肠菌群的影响较大,且31℃组肉鸡盲肠菌群多样性,在试验14 d明显低于试验7 d;(3)DGGE图谱条带序列分析表明,适温和偏热环境下肉鸡盲肠内的共性菌群是Alistipes timonensis和Barnesiella viscericola,21℃组肉鸡盲肠中特异性菌群是Ruminococus faecis,26、31℃组肉鸡盲肠中特异性菌群是Lutispora thermophila和Faecalibacterium prausnitzii,31℃组肉鸡盲肠中特异性菌群是Gemmiger formicilis。【结论】持续偏热处理(26和31℃)与21℃组相比,影响肉鸡肠道菌群的结构和多样性,且不同偏热程度、偏热处理时间对肉鸡影响程度不同。 展开更多
关键词 偏热环境 肉鸡 肠道菌群 变性梯度凝胶电泳 多样性
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苹果锈果类病毒的温度梯度凝胶电泳 被引量:2
18
作者 蒋伶活 陈炜 +1 位作者 田波 刘仪 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1990年第4期278-283,共6页
用温度梯度凝胶电泳技术研究了苹果锈果类病毒(ASSV)的变性行为,并与菊花矮化类病毒(CSV)的变性行为进行了比较。提纯的 ASSV 的温度梯度电泳示出了类病毒特有的从类似于棒状的分子到打开的环状分子的构象转变曲线,与 CSV 及报道的马铃... 用温度梯度凝胶电泳技术研究了苹果锈果类病毒(ASSV)的变性行为,并与菊花矮化类病毒(CSV)的变性行为进行了比较。提纯的 ASSV 的温度梯度电泳示出了类病毒特有的从类似于棒状的分子到打开的环状分子的构象转变曲线,与 CSV 及报道的马铃薯纺锤块状类病毒(PSTV)相似。但 ASSV 的构象转变中点温度及转变的协同性均低于 CSV。在8.9mol/LTBE 缓冲液中,ASSV 构象转变的中点温度和半辐值分别为41.5℃和2.4℃,而 CSV 的分别为46.0℃和1.0℃。在 ASSV 的温度梯度凝胶电泳图中,除了有代表单分子构象转变的曲线外,还观察到另一构象转变曲线,作者认为这代表了在提纯过程中由分子间碱基配对形成的双分子复合体的变性曲线。 展开更多
关键词 ASSV 温度梯度电泳 苹果锈果病
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Carbendazim induces a temporary change in soil bacterial community structure 被引量:3
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作者 WANG Xiuguo, SONG Min, GAO Chunming, DONG Bin, ZHANG Qun, FANG Hua, YU Yunlong Department of Plant Protection, College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China. 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2009年第12期1679-1683,共5页
The effect of carbendazim applications on the diversity and structure of a soil bacterial community was studied under field conditions using temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) and partial sequence analy... The effect of carbendazim applications on the diversity and structure of a soil bacterial community was studied under field conditions using temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) and partial sequence analysis of PCR-amplified 16S rRNA gene. After four successive introductions of carbendazim at a level of 0.94 kg active ingredient (a.i.)/ha, the genetic diversity (expressed as Shannon index, H′) decreased from 1.43 in the control to 1.29 in treated soil. This harmful effect seems to increase with the concentration of carbendazim. The value of H' in the soil treated with carbendazim at 4.70 kg a.i./ha was reduced to 1.05 (P ≤ 0.05). The structure of soil bacterial community was also affected after four repeated applications of carbendazim at levels of 0.94, 1.88 and 4.70 kg a.i./ha, as seen in the relative intensities of the individual band. However, the bacterial community in carbendazim-treated soil recovered to that in the control 360 d after the first treatment. The results indicated that repeated applications of carbendazim could reduce soil microbial diversity and alter the bacterial community structure temporarily. 展开更多
关键词 CARBENDAZIM bacterial diversity temperature gradient gel electrophoresis phylogenetic analysis
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温度梯度凝胶电泳技术及应用 被引量:5
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作者 陈汉奎 冯忻 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第3期297-299,共3页
温度梯度凝胶电泳(TGGE)是一种用于检测核酸序列变异和点突变的电泳方法.该法利用不同构象的核酸分子具有不同的变性温度(Tm)来进行分离.TGGE方法具有分辨能力高、重复性好和节省时间的特点。
关键词 温度梯度 序列变异 tgge 电泳
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