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视神经病变诱导反应蛋白在多发性骨髓瘤中的表达及临床意义
1
作者
郭妮
贾亚春
+5 位作者
梁肖
慕艳华
杜轲
魏雅萌
郭艳妮
孔光耀
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期244-249,共6页
目的研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值。方法利用3个基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据集(GSE6477、GSE1...
目的研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值。方法利用3个基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据集(GSE6477、GSE136324和GSE24080),分析OPTN在MM中的表达;通过收集MM患者临床骨髓标本,利用qRT-PCR实验进一步验证OPTN在MM患者中的表达情况。使用Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析OPTN在MM预后和诊断中的价值。同时利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载MM转录组数据,根据OPTN mRNA表达水平中位数界,将MM患者分为OPTN高、低表达组,用R语言limma包筛选差异表达基因后,对差异基因进行富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)从而挖掘OPTN在MM中的潜在临床意义及其可能参与的分子机制。结果OPTN在MM组织中表达显著低于正常组织(P<0.05);OPTN表达变化与MM患者的国际分期体系(International Staging System,ISS)显著相关(P<0.05);ROC结果显示OPTN表达变化可区分正常人和MM患者。生存分析显示OPTN低表达患者总生存率(overall survival,OS)显著低于高表达患者(P<0.05)。GO、KEGG和GSEA富集分析结果表明,OPTN可能通过调控NOD样受体、NF-κB、TNF及RAS/MAPK等通路进而影响细胞凋亡、自噬及调节细胞免疫反应等参与MM的进程。结论OPTN在多发性骨髓瘤中低表达,与患者预后不良相关,可能作为MM诊断及治疗的重要潜在生物标志物。
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关键词
基因表达数据库(GEO)
癌症基因组图谱(TCGA)
视神经病变诱导反应蛋白(OPTN)
多发性骨髓瘤(MM)
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职称材料
题名
视神经病变诱导反应蛋白在多发性骨髓瘤中的表达及临床意义
1
作者
郭妮
贾亚春
梁肖
慕艳华
杜轲
魏雅萌
郭艳妮
孔光耀
机构
西安交通大学第二附属医院生物诊断治疗国家地方联合工程研究中心
榆林市第三医院
出处
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期244-249,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.82170140,82370146)
陕西省自然科学基金资助项目(No.2020JQ-558,2023-JC-QN-0870,2023-JC-QN-0942)。
文摘
目的研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值。方法利用3个基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)数据集(GSE6477、GSE136324和GSE24080),分析OPTN在MM中的表达;通过收集MM患者临床骨髓标本,利用qRT-PCR实验进一步验证OPTN在MM患者中的表达情况。使用Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析OPTN在MM预后和诊断中的价值。同时利用癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载MM转录组数据,根据OPTN mRNA表达水平中位数界,将MM患者分为OPTN高、低表达组,用R语言limma包筛选差异表达基因后,对差异基因进行富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)从而挖掘OPTN在MM中的潜在临床意义及其可能参与的分子机制。结果OPTN在MM组织中表达显著低于正常组织(P<0.05);OPTN表达变化与MM患者的国际分期体系(International Staging System,ISS)显著相关(P<0.05);ROC结果显示OPTN表达变化可区分正常人和MM患者。生存分析显示OPTN低表达患者总生存率(overall survival,OS)显著低于高表达患者(P<0.05)。GO、KEGG和GSEA富集分析结果表明,OPTN可能通过调控NOD样受体、NF-κB、TNF及RAS/MAPK等通路进而影响细胞凋亡、自噬及调节细胞免疫反应等参与MM的进程。结论OPTN在多发性骨髓瘤中低表达,与患者预后不良相关,可能作为MM诊断及治疗的重要潜在生物标志物。
关键词
基因表达数据库(GEO)
癌症基因组图谱(TCGA)
视神经病变诱导反应蛋白(OPTN)
多发性骨髓瘤(MM)
Keywords
geneexpressionomnibus(GEO)
thecancergenome
atlas
(
tgca
)
optineurin(OPTN)
multiplemyeloma(MM)
分类号
R733.3 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
视神经病变诱导反应蛋白在多发性骨髓瘤中的表达及临床意义
郭妮
贾亚春
梁肖
慕艳华
杜轲
魏雅萌
郭艳妮
孔光耀
《西安交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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