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循环miR⁃124作为铅神经毒性标志物的灵敏性、稳定性和组织特异性研究
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作者 周慧 王雁 +3 位作者 李华 汪溪洁 陈华英 马璟 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期154-161,共8页
目的:验证循环微小核糖核酸(microRNA,miRNA)⁃124的稳定性、组织特异性及其检测铅神经毒性的灵敏性,为循环miR⁃124用于铅神经毒性评价提供依据。方法:采用Zea⁃Longa线栓法建立大鼠大脑中动脉闭塞模型,采集血液样本离心、分装后立即检测... 目的:验证循环微小核糖核酸(microRNA,miRNA)⁃124的稳定性、组织特异性及其检测铅神经毒性的灵敏性,为循环miR⁃124用于铅神经毒性评价提供依据。方法:采用Zea⁃Longa线栓法建立大鼠大脑中动脉闭塞模型,采集血液样本离心、分装后立即检测或在室温、2~8℃和-70~-90℃条件下储存不同时间后,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real⁃time polymerase chain reaction,RT⁃qPCR)检测miR⁃124的表达;分别使用对乙酰氨基酚(1250 mg/kg)、异丙肾上腺素(2.5 mg/kg)和庆大霉素(80 mg/kg)建立大鼠肝毒性、心脏毒性和肾毒性模型,采集血液样本检测并比较造模前后循环miR⁃124的变化;使用醋酸铅(300、600 mg/kg)建立大鼠神经毒性模型,采用酶联免疫吸附测定方法(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测白细胞介素(interleukin,IL)⁃10、IL⁃1β和肿瘤坏死因子⁃α(tumor necrosis factorα,TNF⁃α)的变化,比较检测到细胞因子和循环miR⁃124含量变化的时间评估其灵敏性。结果:以新鲜血液样本作为对照,血液样本室温保存6 h,2~8℃保存24 h,-70~-90℃保存36 d以及3次冻融后循环miR⁃124仍保持稳定,稳定性可以支持实验室需求;循环miR⁃124在大鼠肝毒性、心脏毒性和肾毒性模型中均无明显改变,具有良好的组织特异性;与细胞因子相比,循环miR⁃124可以更灵敏地检测铅暴露引起的神经炎症。结论:循环miR⁃124具有良好的稳定性、组织特异性和灵敏性,可作为评价铅神经毒性的潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 循环miR⁃124 生物标志物验证 灵敏性 稳定性 组织特异性
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美国虹鳟鱼同工酶分析 被引量:3
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作者 张荣华 王丙乾 +3 位作者 孙中武 王宏伟 贾明仁 尹洪滨 《水产学杂志》 CAS 2007年第1期50-56,共7页
运用聚丙烯酰胺凝胶电泳法结合酶的特异性染色方法对美国虹鳟5种组织(眼睛、心脏、肾脏、肝脏和肌肉)的乳酸脱氢酶(LDH)、酯酶(EST)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PDH)、过氧化物酶(POD)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、α-淀粉酶(α-AMY)和苹果酸脱... 运用聚丙烯酰胺凝胶电泳法结合酶的特异性染色方法对美国虹鳟5种组织(眼睛、心脏、肾脏、肝脏和肌肉)的乳酸脱氢酶(LDH)、酯酶(EST)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G-6-PDH)、过氧化物酶(POD)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、α-淀粉酶(α-AMY)和苹果酸脱氢酶(MDH)7种同工酶进行了初步研究,并对7种酶的同工酶位点及酶谱表型进行了分析。结果表明:美国虹鳟LDH、EST、G-6-PDH、POD、GDH和MDH存在不同程度的组织特异性,而α-AMY则无明显组织差异。EST由8个基因位点编码;LDH酶带多于典型的5条酶带;MDH具有线粒体型(m-MDH)和上清液型(s-MDH)两种类型;共记录了24个基因座位,其中5个为多态座位,多态座位比例为20.83%,有效等位基因数为1.4167,表明美国虹鳟的遗传多样性居较高水平。 展开更多
关键词 同工酶 电泳 组织特异性 美国虹鳟 生化遗传分析
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棉花GhGGPase基因克隆、序列分析及原核表达
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作者 禄亚洲 赛富涛 +1 位作者 李榕 李鸿彬 《新疆农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期1008-1015,共8页
【目的】棉花GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GhGGPase)基因的克隆、功能序列分析及原核表达。【方法】利用RT-PCR技术从棉花纤维中克隆棉花GhGGPase基因,进行生物信息学分析,构建原核表达载体pET28a-GhGGPase,转化大肠杆菌BL21(DE3)并进行体外... 【目的】棉花GDP-L-半乳糖磷酸化酶(GhGGPase)基因的克隆、功能序列分析及原核表达。【方法】利用RT-PCR技术从棉花纤维中克隆棉花GhGGPase基因,进行生物信息学分析,构建原核表达载体pET28a-GhGGPase,转化大肠杆菌BL21(DE3)并进行体外诱导表达,通过SDS-PAGE检测目的蛋白的表达。【结果】从陆地棉纤维组织中扩增得到L-半乳糖磷酸化酶基因的cDNA开放读码框为1 350 bp,为包含450个氨基酸的蛋白质,理论分子质量为49 kDa。对氨基酸序列进行生物信息学分析,GhGGPase蛋白具有组氨酸三聚体(HIT)蛋白超家族的主要特性的结构域。进化树分析的表明棉花GhGGPase与柑橘CuGGPase在进化上亲缘关系上较近。成功构建了pET28a-GhGGPase原核表达载体;获得分子质量约为49 kDa左右的重组蛋白GhGGPase。半定量RT-PCR的组织表达特异性分析表明GhGGPase基因与棉纤维的快速伸长发育密切相关。【结论】GhGGPase基因的克隆、序列分析和重组蛋白的诱导表达为深入研究该基因在棉纤维发育中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 棉花纤维 GDP—L-半乳糖磷酸化酶基因克隆 组织表达特异性 原核表达
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基于网络药理学结合GEO数据库的天麻治疗阿尔茨海默病潜在作用机制研究 被引量:1
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作者 莫可 朱成豪 +2 位作者 张远帆 张伟 孙志蓉 《中国现代中药》 CAS 2023年第2期342-353,共12页
目的:采用网络药理学、生物信息学方法研究天麻治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法:利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SymMap、PharmMapper、GEO、GeneCards等多个数据库获取天麻活性... 目的:采用网络药理学、生物信息学方法研究天麻治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法:利用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SymMap、PharmMapper、GEO、GeneCards等多个数据库获取天麻活性成分及AD疾病相关靶点。运用STRING、DAVID数据库及Cytoscape软件构建天麻活性成分-靶点-通路网络,筛选关键成分,并将其与GEO数据库筛选的关键靶点导入CB-DOCK2数据库进行分子对接。通过BioGPS数据库查询了解交集靶点在人体各组织、部位的分布及表达情况。结果:筛选得到的27个天麻活性成分与AD疾病共有176个交集靶点,靶点遍及人体肝、心、肺、胰、肾、全血、全脑等组织,靶点基因功能偏向蛋白酪氨酸激酶活性、三磷酸腺苷(ATP)结合等。天麻可能通过作用于磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、叉形头转录因子O(FoxO)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)等通路相关的靶标起到治疗AD的作用。分子对接结果显示,天麻治疗AD的关键成分4-(4’-羟基苄氧基)苄基甲基醚、N6-(4’-羟基苄基)腺嘌呤核苷、巴利森苷J等与表皮生长因子受体(EGFR)、酪氨酸蛋白激酶2(JAK2)、整合素β3(ITGB3)、纤连蛋白1(FN1)、E3泛素蛋白连接酶(CBL)、酪氨酸蛋白磷酸酶非受体1型(PTPN1)有较好的结合力,N6-(4’-羟基苄基)腺嘌呤核苷表现最好。结论:天麻活性成分可能通过参与调控PI3K-Akt通路的相关靶点,同时调节肝、心、肺等器官正常运转,从而实现治疗AD的作用。 展开更多
关键词 天麻 阿尔茨海默病 分子对接 差异表达基因 组织特异性表达基因
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陆地棉bHLH转录因子GhMYC4基因的克隆及功能分析 被引量:6
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作者 高丽华 刘博欣 +2 位作者 李金博 吴燕民 唐益雄 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期33-41,共9页
通过电子克隆技术从陆地棉中分离了一个Gh MYC4基因(Gen Bank登录号:KF751654),该基因编码的蛋白属于b HLH类转录因子。生物信息学分析结果显示:该基因完整开放阅读框有1 650 bp,编码549个氨基酸。Gh MYC4蛋白的N-端具有MYC蛋白家族特有... 通过电子克隆技术从陆地棉中分离了一个Gh MYC4基因(Gen Bank登录号:KF751654),该基因编码的蛋白属于b HLH类转录因子。生物信息学分析结果显示:该基因完整开放阅读框有1 650 bp,编码549个氨基酸。Gh MYC4蛋白的N-端具有MYC蛋白家族特有的b HLH-MYC-N保守结构域,C端具有高度保守的DNA结合域即b HLH结构域。同源比对和系统进化树分析结果显示Gh MYC4蛋白与陆地棉b HLH转录因子和可可b HLH转录因子的亲缘关系最近,与其他物种的MYC2家族成员具有很大的相似性。通过Real time-PCR检测该基因的组织表达特异性,结果显示该基因在陆地棉的根部和叶片中高效表达,纤维中微量表达。在拟南芥原生质体中进行该基因的瞬时表达,证实了Gh MYC4蛋白定位于细胞核。转Gh MYC4的拟南芥受到高盐和干旱胁迫后相比于对照在表型上表现出很好的抗旱耐盐性能,其叶片相对含水量、可溶性糖含量及脯氨酸含量显著高于对照,MDA含量显著低于对照。该结果为培育抗旱耐盐棉花新品种提供了新的基因来源。 展开更多
关键词 陆地棉 b HLH转录因子 MYC蛋白 亚细胞定位 组织表达特异性 抗旱耐盐
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cDNA cloning, functional expression and cellular localization of rat liver mitochondrial electron-transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase protein
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作者 HUANG Shengbing SONG Wei LIN Qishui 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2005年第4期357-367,共11页
A membrane-bound protein was purified from rat liver mitochondria.After being di-gested with V8 protease,two peptides containing identical 14 amino acid residue sequences were obtained.Using the 14 amino acid peptide ... A membrane-bound protein was purified from rat liver mitochondria.After being di-gested with V8 protease,two peptides containing identical 14 amino acid residue sequences were obtained.Using the 14 amino acid peptide derived DNA sequence as gene specific primer,the cDNA of correspondent gene 5′-terminal and 3′-terminal were obtained by RACE technique.The full-length cDNA that encoded a protein of 616 amino acids was thus cloned,which included the above mentioned peptide sequence.The full length cDNA was highly homologous to that of human ETF-QO,indicating that it may be the cDNA of rat ETF-QO.ETF-QO is an iron sulfur protein located in mitochondria inner membrane containing two kinds of redox center:FAD and[4Fe-4S]center.After comparing the sequence from the cDNA of the 616 amino acids protein with that of the mature protein of rat liver mitochondria,it was found that the N terminal 32 amino acid residues did not exist in the mature protein,indicating that the cDNA was that of ETF-QOp.When the cDNA was expressed in Saccharomyces cerevisiae with inducible vectors,the protein product was enriched in mitochondrial fraction and exhibited electron transfer activity(NBT re-ductase activity)of ETF-QO.Results demonstrated that the 32 amino acid peptide was a mito-chondrial targeting peptide,and both FAD and iron-sulfur cluster were inserted properly into the expressed ETF-QO.ETF-QO had a high level expression in rat heart,liver and kidney.The fu-sion protein of GFP-ETF-QO co-localized with mitochondria in COS-7 cells. 展开更多
关键词 electron transfer flavoprotein ubiquinone oxidoreductase PRECURSOR rat protein purification gene clone tissuespecificity.
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拟南芥AtRAC在盐胁迫应答中的功能研究 被引量:3
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作者 翟先芝 杨虹伟 +4 位作者 杨皓 刘志斌 王健美 杨毅 李旭锋 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期416-422,共7页
本实验所研究的拟南芥AtRAC含有两个RING结构域和三个蛋白激酶C保守区域1结构域即C1结构域.通过体外泛素化证明了AtRAC具有E3连接酶活性,亚细胞定位实验结果表明AtRAC定位在细胞核中.组织特异性分析表明AtRAC在根中的表达量很高,但是在... 本实验所研究的拟南芥AtRAC含有两个RING结构域和三个蛋白激酶C保守区域1结构域即C1结构域.通过体外泛素化证明了AtRAC具有E3连接酶活性,亚细胞定位实验结果表明AtRAC定位在细胞核中.组织特异性分析表明AtRAC在根中的表达量很高,但是在茎、叶和花中的表达量较低,而且AtRAC的表达受到NaCl胁迫的诱导.进一步对atrac突变体的分析表明,在NaCl处理下,突变体atrac的萌发率降低,侧根数目也降低.初步研究表明拟南芥AtRAC可能是一个与盐胁迫应答相关的基因. 展开更多
关键词 E3连接酶 亚细胞定位 表达谱分析 组织特异性 盐胁迫
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