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基于转录组测序和RT-qPCR技术的烟草糖酯合成基因挖掘
被引量:
1
1
作者
黄申
闫茗熠
+5 位作者
陈梦月
尚紫博
杨晨
张金林
褚智国
毛多斌
《轻工学报》
CAS
北大核心
2023年第6期78-84,117,共8页
为挖掘调控烟草糖酯合成的功能基因,采用转录组测序对烟草腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因及其功能进行分析,并利用RT-qPCR对分析结果进行验证。结果表明:共获得11962个腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因,其中5145个上调表达基因,6817个...
为挖掘调控烟草糖酯合成的功能基因,采用转录组测序对烟草腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因及其功能进行分析,并利用RT-qPCR对分析结果进行验证。结果表明:共获得11962个腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因,其中5145个上调表达基因,6817个下调表达基因;上调表达基因主要包括生物学进程(2265个)、分子功能(1169个)、细胞成分(363个)3大类,可将基因序列定位到122条代谢通路中,其中与糖酯合成相关的糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成被高度富集,腺毛细胞中酰基糖通路显著上调,有12个基因在功能上与酰基转移酶有关;在腺毛细胞中,分析得到的12个基因中有11个基因的表达量都高于叶细胞,其中gene63826、gene16194和gene37511表达分别上调195.79倍、166.23倍和132.65倍。上述11个基因可能参与调控腺毛细胞合成糖酯,为下一步验证基因功能提供依据。
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关键词
烟草糖酯
腺毛细胞
转录组
差异表达基因
RT-QPCR
下载PDF
职称材料
烟草糖酯SSR分子标记筛选及辅助育种应用
被引量:
13
2
作者
陈彪
陈铭
+9 位作者
李洋洋
屈亚芳
程立锐
杨爱国
胡日生
刘旦
罗成刚
向世鹏
冯全福
常爱霞
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2019年第3期8-15,共8页
为明确与糖酯紧密连锁的SSR分子标记在烟草实际育种工作中的可用性,加快烤烟糖酯遗传改良进程,本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和GC-MS检测技术,以不同遗传背景的5个烟草种质以及192份重组自交系遗传群体为试验材料,对5个SSR分子标记...
为明确与糖酯紧密连锁的SSR分子标记在烟草实际育种工作中的可用性,加快烤烟糖酯遗传改良进程,本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和GC-MS检测技术,以不同遗传背景的5个烟草种质以及192份重组自交系遗传群体为试验材料,对5个SSR分子标记开展了筛选和验证研究。结果表明,5个分子标记中,PT20315、PT30354两个分子标记在不同遗传背景中多态性稳定,并且其多态性条带与糖酯表型差异的对应性较好;在重组自交系群体中,两个分子标记鉴定的基因型与糖酯表型的一致率分别为93.75%和90.58%,可用于高糖酯烟草分子辅助育种中。目前,利用两个分子标记辅助选择,已经定向改良获得高糖酯K326等新品系材料。
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关键词
烟草
糖酯
分子标记
辅助育种
下载PDF
职称材料
题名
基于转录组测序和RT-qPCR技术的烟草糖酯合成基因挖掘
被引量:
1
1
作者
黄申
闫茗熠
陈梦月
尚紫博
杨晨
张金林
褚智国
毛多斌
机构
郑州轻工业大学烟草科学与工程学院
山东中烟工业有限责任公司济南卷烟厂
山东中烟工业有限责任公司技术中心
出处
《轻工学报》
CAS
北大核心
2023年第6期78-84,117,共8页
基金
中国烟草总公司科技重点研发项目(110202002001,110202202006)。
文摘
为挖掘调控烟草糖酯合成的功能基因,采用转录组测序对烟草腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因及其功能进行分析,并利用RT-qPCR对分析结果进行验证。结果表明:共获得11962个腺毛细胞和叶细胞的差异表达基因,其中5145个上调表达基因,6817个下调表达基因;上调表达基因主要包括生物学进程(2265个)、分子功能(1169个)、细胞成分(363个)3大类,可将基因序列定位到122条代谢通路中,其中与糖酯合成相关的糖酵解/糖异生、淀粉和蔗糖代谢、苯丙烷类生物合成被高度富集,腺毛细胞中酰基糖通路显著上调,有12个基因在功能上与酰基转移酶有关;在腺毛细胞中,分析得到的12个基因中有11个基因的表达量都高于叶细胞,其中gene63826、gene16194和gene37511表达分别上调195.79倍、166.23倍和132.65倍。上述11个基因可能参与调控腺毛细胞合成糖酯,为下一步验证基因功能提供依据。
关键词
烟草糖酯
腺毛细胞
转录组
差异表达基因
RT-QPCR
Keywords
tobacco sugar ester
glandular trichomes
transcriptome
differentially expressed gene
RT-qPCR
分类号
TS413 [农业科学—烟草工业]
下载PDF
职称材料
题名
烟草糖酯SSR分子标记筛选及辅助育种应用
被引量:
13
2
作者
陈彪
陈铭
李洋洋
屈亚芳
程立锐
杨爱国
胡日生
刘旦
罗成刚
向世鹏
冯全福
常爱霞
机构
中国农业科学院烟草研究所
中国农业科学院研究生院
中国烟草中南农业试验站
出处
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2019年第3期8-15,共8页
基金
中国烟草总公司湖南省公司科技项目“烟草表面致香前体物分子模块创制及湖南主栽品种香气性状定向改良”(18-20Aa02)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610232017006)
文摘
为明确与糖酯紧密连锁的SSR分子标记在烟草实际育种工作中的可用性,加快烤烟糖酯遗传改良进程,本研究利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和GC-MS检测技术,以不同遗传背景的5个烟草种质以及192份重组自交系遗传群体为试验材料,对5个SSR分子标记开展了筛选和验证研究。结果表明,5个分子标记中,PT20315、PT30354两个分子标记在不同遗传背景中多态性稳定,并且其多态性条带与糖酯表型差异的对应性较好;在重组自交系群体中,两个分子标记鉴定的基因型与糖酯表型的一致率分别为93.75%和90.58%,可用于高糖酯烟草分子辅助育种中。目前,利用两个分子标记辅助选择,已经定向改良获得高糖酯K326等新品系材料。
关键词
烟草
糖酯
分子标记
辅助育种
Keywords
tobacco
sugar
ester
molecular marker
assisted breeding
分类号
S572.03 [农业科学—烟草工业]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组测序和RT-qPCR技术的烟草糖酯合成基因挖掘
黄申
闫茗熠
陈梦月
尚紫博
杨晨
张金林
褚智国
毛多斌
《轻工学报》
CAS
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
烟草糖酯SSR分子标记筛选及辅助育种应用
陈彪
陈铭
李洋洋
屈亚芳
程立锐
杨爱国
胡日生
刘旦
罗成刚
向世鹏
冯全福
常爱霞
《中国烟草科学》
CSCD
北大核心
2019
13
下载PDF
职称材料
已选择
0
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