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Molecular Characterization and Expression Analysis of TaZFP15, a C_2H_2-Type Zinc Finger Transcription Factor Gene in Wheat (Triticum aestivum L.) 被引量:22
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作者 SUN Zhao-hua DING Chang-huan +1 位作者 LI Xiao-juan XIAO Kai 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2012年第1期31-42,共12页
Based on sequencing of part clones in a root subtractive cDNA library, an expressed sequence tag (EST) sharing high similarity to a rice C2H2 zinc finger transcription factor (ZFP15) was obtained in wheat. Through... Based on sequencing of part clones in a root subtractive cDNA library, an expressed sequence tag (EST) sharing high similarity to a rice C2H2 zinc finger transcription factor (ZFP15) was obtained in wheat. Through bioinformatics approach, the wheat C2H2-type ZFP gene referred to TaZFP15 has been identified and characterized. As a full-length cDNA of 670 bp, TaZFP15 has an open reading frame of 408 bp and encodes a 135-aa polypeptide. TaZFP15 contains two C2H2 zinc finger domains and each one has a conserved motif QALGGH. The typical L-box, generally identified in the C2H2 type transcription factors, has also been found in TaZFP15. Phylogenetic analysis suggested that TaZFP15 shares high similarities with rice ZFP15 (GenBank accession no. AY286473), maize ZFP (GenBank accession no. NM_001159094) and a subset of other zinc-finger transcription factor genes in plant species. The expression of TaZFP15 was up-regulated by starved-Pi stress, showing a pattern to be gradually elevated along with the progression of the Pi-stress in a 23-h treatment regime. Similarly, the transcripts of TaZFP15 in roots were also induced by nitrogen deficiency, and abiotic stresses of drought and salinity. No responses of TaZFP15 were detected in roots to nutrition deficiencies of P, Zn, and Ca, and the external treatment of abscisic acid (ABA). TaZFP15 could be specifically amplified in genome A, B, and D, and without variability in the sequences, suggesting that TaZFP15 has multi-copies in the homologous hexaploid species. Transgenic analysis in tobacco revealed that up-regulation of TaZFP15 could significantly improve plant dry mass accumulation via increasing the plant phosphorus acquisition capacity under Pi-deficiency condition. The results suggested that TaZFP15 is involved in mediation of signal transductions of diverse external stresses. 展开更多
关键词 Triticum aestivum L. zinc-finger transcription factor gene nutrition deficiency abiotic stress expression pattern
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LncRNA HAGLR激活RUNX2并抑制NLRP3炎症小体对胫骨骨折愈合的影响 被引量:1
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作者 王文 陈新宇 +2 位作者 黄兹艺 邓杨柳 崔红旺 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期830-837,共8页
目的研究长链非编码RNA(LncRNA)HAGLR对胫骨骨折(TF)小鼠的NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体表达和骨折愈合的影响并探讨机制。方法体外对成骨细胞MC3T3-E1沉默HAGLR,CCK-8法检测细胞活力,TUNEL法检测细胞凋亡,qPCR法检测骨碱性磷酸酶(BA... 目的研究长链非编码RNA(LncRNA)HAGLR对胫骨骨折(TF)小鼠的NOD样受体蛋白3(NLRP3)炎症小体表达和骨折愈合的影响并探讨机制。方法体外对成骨细胞MC3T3-E1沉默HAGLR,CCK-8法检测细胞活力,TUNEL法检测细胞凋亡,qPCR法检测骨碱性磷酸酶(BALP)和骨钙素的表达。Western blot法检测RUNX2、磷酸化RUNX2(p-RUNX2)以及NLRP3、半胱天冬酶1(Caspase1)、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、白细胞介素-1β(IL-1β)的表达。通过小鼠TF手术建立TF小鼠模型,在模型小鼠体内过表达HAGLR,并在过表达HAGLR的基础上沉默RUNX2或加入炎症小体抑制剂MCC950。qPCR法检测HAGLR和RUNX2的表达,Western blot法检测胰岛素样生长因子-1(IGF-1)的表达。microCT测量小鼠骨痂体积(MBV),称量小鼠的全长胫骨湿重。结果沉默HAGLR导致MC3T3-E1细胞活力降低且凋亡率增加(P<0.05),且RUNX2、p-RUNX2、BALP和骨钙素表达量均降低(P<0.05),NLRP3、Caspase1、ASC、IL-1β的表达量都增加(P<0.05)。与健康组织比较,TF小鼠体内HAGLR和RUNX2表达量降低(P<0.05)。过表达HAGLR促进TF小鼠体内的HAGLR和RUNX2表达,并增加MBV和全长胫骨湿重以及IGF-1的表达量(P<0.05)。在过表达HAGLR的基础上沉默RUNX2导致TF小鼠的MBV、全长胫骨湿重和IGF-1表达量都降低(P<0.05)。而在过表达HAGLR的基础上加入NLRP3炎症小体抑制剂MCC950导致MBV、全长胫骨湿重和IGF-1表达又增加(P<0.05)。结论LncRNA HAGLR通过激活RUNX2并抑制NLRP3炎症小体促进TF的愈合。 展开更多
关键词 胫骨骨折 同源框D基因簇反义生长相关的长非编码RNA Runt相关转录因子2 NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3 炎症小体
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ZFhx3基因变异与心房颤动、脑梗死和肺血栓栓塞的关系
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作者 柏松 黄博雅 +4 位作者 李津 张竹芬 张毅茹 曹玉萍 张国彦 《河北医药》 CAS 2023年第18期2794-2797,共4页
目的 通过现象学扫描研究老年人群中单核苷酸多态性(SNP) rs2106261,在转录因子ZFhx3基因、心房颤动(AF)及其他相关表型中的表达。方法 本研究从老年疾病SNP数据库(JG-SNP)中检索连续的临床体检数据(n=2 433,平均年龄80岁)。收集医疗图... 目的 通过现象学扫描研究老年人群中单核苷酸多态性(SNP) rs2106261,在转录因子ZFhx3基因、心房颤动(AF)及其他相关表型中的表达。方法 本研究从老年疾病SNP数据库(JG-SNP)中检索连续的临床体检数据(n=2 433,平均年龄80岁)。收集医疗图表临床资料,包括AF诊断。采用DNA芯片法进行基因分型。还分析42个病理和26个临床表型,包括脑梗死(CI)和肺血栓栓塞(LT),在临床体检中通过肉眼检查诊断。结果 2 433例患者中,18.6%为心房颤动(AF),29.4%为CI,4.9%为LT表现型。经年龄、性别、糖尿病、高血压和吸烟校正后,rs2106261 SNP的A等位基因与AF显著相关(AA+AG/GG,OR=1.51,95%CI:1.16~1.97,P=0.002)。CI与rs2106261无关(P=0.14)。然而,在<80岁的患者中,rs2106261与CI显著相关(AA+AG/GG,OR=1.57,95%CI:1.09~2.26,P=0.01)。LT也与rs2106261相关(AA+AG/GG,OR=1.99,95%CI:1.31~3.01,P=0.001)。在对AF的存在进行调整后,rs2106261与CI和LT的相关性仍为阳性,表明该SNP变异可能作为一个独立的风险标记。结论 ZFHX3基因多态性rs2106261 (A等位基因)是AF及AF相关表型的风险标记。 展开更多
关键词 ZFhx3基因 心房颤动 脑梗死 肺血栓栓塞
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lncRNA Zeb1-AS1调控JAK2/STAT3信号通路影响骨关节炎软骨细胞的增殖和凋亡
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作者 刘旋 张磊 张凤军 《蚌埠医学院学报》 CAS 2023年第11期1510-1513,共4页
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)E盒结合锌指蛋白1反义1(Zeb1-AS1)对骨关节炎软骨细胞的增殖和凋亡的影响,并探讨其机制是否与调控蛋白酪氨酸激酶2/信号转导和转录激活因子3(JAK2/STAT3)信号通路有关。方法:将骨关节炎软骨细胞分为si-N... 目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)E盒结合锌指蛋白1反义1(Zeb1-AS1)对骨关节炎软骨细胞的增殖和凋亡的影响,并探讨其机制是否与调控蛋白酪氨酸激酶2/信号转导和转录激活因子3(JAK2/STAT3)信号通路有关。方法:将骨关节炎软骨细胞分为si-NC组、si-Zeb1-AS1组、si-Zeb1-AS1+JAK2/STAT3信号通路抑制剂(AG490)组。运用细胞计数试剂盒、流式细胞术检测细胞活力和凋亡率。Western blotting分析B细胞淋巴瘤(Bcl-2)、Bcl相关X蛋白(Bax)、p-JAK2和p-STAT3表达水平。结果:与si-NC组比较,si-Zeb1-AS1组骨关节炎软骨细胞增殖(48、72 h)、Bcl-2、p-JAK2和p-STAT3蛋白表达明显升高(P<0.01),凋亡率、Bax蛋白表达明显降低(P<0.01)。与si-Zeb1-AS1组比较,si-Zeb1-AS1+AG490组骨关节炎软骨细胞增殖(48、72 h)、Bcl-2、p-JAK2和p-STAT3蛋白表达明显降低(P<0.01),凋亡率、Bax蛋白表达明显升高(P<0.01)。结论:干扰lncRNA Zeb1-AS1通过激活JAK2/STAT3信号通路能够促进骨关节炎软骨细胞增殖、抑制细胞凋亡。 展开更多
关键词 骨关节炎 E盒结合锌指蛋白1反义1 蛋白酪氨酸激酶2/信号转导和转录激活因子3
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示-环指长比与6个指骨发育相关基因多态性的关联性
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作者 杨梦怡 牛世博 +5 位作者 张静 彭亮 党洁 马占兵 陆宏 霍正浩 《解剖学报》 CAS CSCD 2024年第2期181-187,共7页
目的探讨6个指骨发育相关基因,即成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)、印度刺猬信号分子(IHH)、Msh同源盒1(MSX1)、Runx家族转录因子2(RUNX2)、SRY盒转录因子9(SOX9)及Wnt家族成员5A(WNT5A)13个位点单核苷酸多态性(SNP)与人类示-环指长比(2... 目的探讨6个指骨发育相关基因,即成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)、印度刺猬信号分子(IHH)、Msh同源盒1(MSX1)、Runx家族转录因子2(RUNX2)、SRY盒转录因子9(SOX9)及Wnt家族成员5A(WNT5A)13个位点单核苷酸多态性(SNP)与人类示-环指长比(2D∶4D)的关联性。方法采用数码相机拍摄宁夏地区731名在校大学生(男性358名,女性373名)手部正面照片,采用GraphPad Prism 8.0图像分析软件标记解剖点并测量示(2)指及环(4)指指长;多重PCR法进行6个基因13个SNP位点(rs1047057、rs755793、rs41258305、rs3731881、rs3100776、rs12532、rs3821949、rs45585135、rs3749863、rs1042667、rs12601701、rs1829556和rs3732750)的基因分型;单因素方差分析或独立样本t检验间接评估2D∶4D与13个SNP位点间的关联性。结果宁夏大学生女性左手和右手2D∶4D均显著高于男性(均P<0.01);13个SNP位点基因型、等位基因频率在不同性别间的差异均无显著统计学意义(均P>0.05);不同性别中,男性左手2D∶4D与SOX9基因rs12601701位点基因型显著关联(P<0.05),右手2D∶4D与WNT5A基因rs1829556位点基因型显著关联(P<0.05);女性右手2D∶4D与MSX1基因rs12532(P<0.01)和rs3821949(P<0.05)位点基因型显著关联。结论SOX9(rs12601701)、WNT5A(rs1829556)、MSX1(rs12532和rs3821949)基因多态性可能与宁夏地区人群2D∶4D的形成有关。 展开更多
关键词 指骨发育基因 Msh同源盒1基因 SRY盒转录因子9基因 Wnt家族成员5A基因 指长比 多重聚合酶链反应 宁夏 大学生
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ZHX3基因沉默对BMSCs中成骨相关因子表达的影响 被引量:1
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作者 张苗苗 包翠芬 +2 位作者 王艳 闵鹤鸣 秦书俭 《天津医药》 CAS 2015年第12期1356-1360,共5页
目的探讨锌指蛋白和同源框3(ZHX3)基因沉默对骨髓间充质干细胞(BMSCs)中smad3、smad4、RUNX2表达的影响。方法构建ZHX3低表达慢病毒载体并转染大鼠BMSCs(ZHX3沉默组),同时设空载病毒转染BMSCs(载体对照组)及不做任何处理的BMSCs(空白对... 目的探讨锌指蛋白和同源框3(ZHX3)基因沉默对骨髓间充质干细胞(BMSCs)中smad3、smad4、RUNX2表达的影响。方法构建ZHX3低表达慢病毒载体并转染大鼠BMSCs(ZHX3沉默组),同时设空载病毒转染BMSCs(载体对照组)及不做任何处理的BMSCs(空白对照组)。荧光显微镜下测定细胞转染率并采用免疫印迹技术鉴定转染是否成功;采用免疫荧光化学和免疫印迹技术定性定量检测ZHX3沉默时smad3、smad4、RUNX2表达情况。结果(1)复苏培养的细胞具有BMSCs表型。(2)转染后,ZHX3沉默组和载体对照组均表达绿色荧光,空白对照组不表达荧光,且沉默组ZHX3基因表达显著低于载体对照组。(3)免疫荧光结果显示,smad3、smad4的阳性表达位于细胞核和细胞质,RUNX2的阳性表达主要定位于细胞核。3组细胞均可见阳性表达细胞,且空白对照组与载体对照组之间荧光强度未见显著差异,但ZHX3基因沉默组的荧光强度显著低于2个对照组。(4)免疫印迹检测smad3、smad4、RUNX2的条带于空白对照组和载体对照组中无显著差异,但均显著高于ZHX3沉默组(P<0.05)。结论ZHX3基因沉默后BMSCs体外成骨能力延迟,可能通过下调smad3、smad4、RUNX2来发挥作用。 展开更多
关键词 DNA结合蛋白质类 锌指 基因 同源盒 转录因子 基因沉默 间质干细胞 smad3 SMAD4 RUNX2 转录 抑制因子-锌指蛋白和同源框3
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锌指蛋白36家族的研究进展 被引量:2
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作者 努尔布维·吐尔孙 姚晓光(综述) 李南方(审校) 《心脏杂志》 CAS 2013年第2期238-240,共3页
本文对锌指蛋白(ZFP)36家族成员的结构和功能的研究进展进行了综述。研究表明,ZFP36作为转录后调节因子,参与了多种生物学功能包括炎症、代谢综合征及肿瘤的发生发展,并证明ZFP36基因可作为肥胖相关的代谢综合征的重要候选基因。
关键词 锌指蛋白36 转录后调节因子 候选基因
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RGC-32和ZEB1在胃癌组织中的表达 被引量:5
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作者 夏祥伟 茅国新 《肿瘤基础与临床》 2015年第3期193-197,共5页
目的探讨补体反应基因-32(RGC-32)与锌指E盒结合蛋白(ZEB1)在胃癌组织中的表达及意义。方法应用免疫组化S-P法分别检测60例胃癌、,60例癌前病变、20例正常胃黏膜组织中RGC-32和ZEB1蛋白的表达情况。结果 RGC-32在胃癌、癌前病变及正常... 目的探讨补体反应基因-32(RGC-32)与锌指E盒结合蛋白(ZEB1)在胃癌组织中的表达及意义。方法应用免疫组化S-P法分别检测60例胃癌、,60例癌前病变、20例正常胃黏膜组织中RGC-32和ZEB1蛋白的表达情况。结果 RGC-32在胃癌、癌前病变及正常胃黏膜组织中的阳性表达率依次降低,分别为78.3%、41.7%、40.0%(P<0.05)。ZEB1在胃癌、癌前病变及正常胃黏膜组织中的阳性表达率亦依次降低,分别为88.3%、50.0%、20.0%(P<0.05)。胃癌组织中RGC-32和ZEB1的表达与胃癌的病理分化程度、TNM分期和淋巴结转移有关(P<0.05)。胃癌组织、癌前病变组织中的RGC-32与ZEB1表达均呈正相关关系(r=0.568、0.452,P<0.05)。结论 RGC-32、ZEB1的异常表达可能促进胃癌的发生、发展和浸润转移,两者可能作为胃癌诊断和预后判断的指标,有可能成为胃癌治疗的新靶点。 展开更多
关键词 补体反应基因-32 锌指E盒结合蛋白 胃癌
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SH-SY5Y细胞中过表达RIPK3对ZFP36基因转录的影响
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作者 张国禄 程世翔 +4 位作者 徐忠伟 衣泰龙 廖吉连 涂悦 张赛 《天津医药》 CAS 2016年第4期418-422,共5页
目的探讨SH-SY5Y细胞中受体相互作用蛋白激酶-3(RIPK3)下游信号通路及其中的关键信号分子的作用。方法通过质粒转染的方式在实验组SH-SY5Y细胞内表达外源性RIPK3蛋白,将转染空载质粒载体SH-SY5Y细胞作为对照组。通过观察质粒所携带的绿... 目的探讨SH-SY5Y细胞中受体相互作用蛋白激酶-3(RIPK3)下游信号通路及其中的关键信号分子的作用。方法通过质粒转染的方式在实验组SH-SY5Y细胞内表达外源性RIPK3蛋白,将转染空载质粒载体SH-SY5Y细胞作为对照组。通过观察质粒所携带的绿色荧光蛋白(GFP)在细胞中的表达情况以验证转染结果,Westernblot对外源性RIPK3表达进行验证。MTT法检测细胞增殖活性,观察过表达RIPK3对细胞活性的影响,以确认其在细胞内是否具有生物活性。运用转录组测序技术(RNAseq)分别检测2组细胞内基因转录丰度并应用IngenuityPathway Analysis(IPA)数据库进行分析,获得RIPK3下游信号通路及关键分子。通过微滴式数字化PCR(dd PCR)对部分RNAseq结果进行验证。结果外源性RIPK3在细胞内具有生物活性,能够抑制SH-SY5Y细胞的增殖。RNAseq数据经IPA分析后得出锌指蛋白36(ZFP36)为RIPK3下游效应分子,其相关效应分子包括血管内皮生长因子(VEGF)、人脱帽酶2(DCP2)、脑源性神经营养因子(BDNF)、肿瘤坏死因子(TNF)的转录丰度也发生了相应的变化。结论 RIPK3能够参与对ZFP36以及与其相关效应分子的转录调控,进而在神经系统的发育、炎症和肿瘤发生等生理、病理过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 细胞系 肿瘤 锌指 基因表达调控 血管内皮生长因子类 脑源性神经营养因子 肿瘤坏死因子类 受体相互作用蛋白激酶-3 锌指蛋白36 人脱帽酶2
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结直肠癌组织Snail、pim-3、E-cadherin和Her-2的表达及与预后的关系 被引量:8
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作者 朱婷 步大成 +1 位作者 张英轶 姚俊霞 《局解手术学杂志》 2019年第10期778-781,共4页
目的分析结直肠癌组织锌指转录因子(Snail)、丝/苏氨酸激酶-3(pim-3)、上皮黏附素(E-cadherin)和人表皮生长因子受体-2(Her-2)的表达与结直肠癌患者预后的关系。方法选取2016年7月至2017年7月我院行腹会阴联合直肠癌根治术(Miles手术)的... 目的分析结直肠癌组织锌指转录因子(Snail)、丝/苏氨酸激酶-3(pim-3)、上皮黏附素(E-cadherin)和人表皮生长因子受体-2(Her-2)的表达与结直肠癌患者预后的关系。方法选取2016年7月至2017年7月我院行腹会阴联合直肠癌根治术(Miles手术)的120例患者的结直肠癌组织标本作为观察组,选择在我院86例健康体检者的正常结直肠组织标本作为对照组。比较分析对照组正常结直肠组织标本与观察组患者的结直肠癌组织标本中Snail、pim-3、E-cadherin和Her-2阳性率差异及其与患者预后的关系。结果观察组患者结直肠癌组织标本中E-cadherin的阳性率明显低于对照组,Snail、pim-3和Her-2的阳性率明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0. 05)。120例结直肠癌患者术后12个月随访率为100%,随访结果显示,患者病死率为30. 83%(37/120),生存率为69. 17%(83/120)。死亡患者中Snail、pim-3和Her-2阳性表达率高于生存患者,而E-cadherin阳性表达率低于生存患者,差异具有统计学意义(P <0. 05)。结论 Snail、pim-3、E-cadherin和Her-2参与了结直肠癌的发病进程,且与患者术后生存率有密切的关系。 展开更多
关键词 结直肠癌 腹会阴联合直肠癌根治术 锌指转录因子 丝/苏氨酸激酶-3 上皮黏附素 人表皮生长因子受体-2
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ZHX3基因沉默对BMSCs中BMP2/smad通路的影响 被引量:1
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作者 李艳芹 张苗苗 +3 位作者 闵鹤鸣 王艳 秦书俭 袁静 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期990-994,共5页
目的:探讨转录抑制因子——锌指蛋白和同源框3(zinc fingers and homeoboxes 3,ZHX3)基因沉默对骨髓间充质干细胞(bone marrow stem cells,BMSCs)中BMP2/smad通路相关因子骨形成蛋白2(bone morphogenetic protein 2,BMP2)、磷酸化smad1(... 目的:探讨转录抑制因子——锌指蛋白和同源框3(zinc fingers and homeoboxes 3,ZHX3)基因沉默对骨髓间充质干细胞(bone marrow stem cells,BMSCs)中BMP2/smad通路相关因子骨形成蛋白2(bone morphogenetic protein 2,BMP2)、磷酸化smad1(phospho-smad1(或pho-smad1))表达的影响。方法:构建ZHX3低表达慢病毒载体转染大鼠BMSCs,同时设阴性对照空载病毒转染BMSCs及空白对照不做任何处理的BMSCs。采用荧光显微镜下测定细胞转染率、免疫印迹技术鉴定转染效果、免疫细胞化学和免疫印迹技术定性定量检测ZHX3沉默时BMP2、pho-smad1和smad4的表达情况。细胞经成骨诱导液处理后进行碱性磷酸酶和茜素红染色检测各组细胞成骨能力。结果:1复苏培养的细胞具有BMSCs形态。2转染后,ZHX3低表达组和空载体对照组均表达绿色荧光,转染率分别为(93.18±4.41)%和(92.56±4.35)%,空白对照组不表达荧光,未见转染阳性细胞(F=1 123.464,P<0.05)。3免疫细胞化学及免疫印迹结果显示,BMP2、pho-smad1、smad4于3组细胞内均可见阳性表达,但ZHX3低表达组的BMP2、pho-smad1水平(0.383 0±0.006 3,0.329 1±0.025 8)明显高于空白对照组(0.306 2±0.011 6,0.209 0±0.017 0)和空载体对照组(0.291 2±0.022 2,0.180 0±0.018 7),P<0.05;而ZHX3低表达组smad4的表达(0.107 4±0.004 3)显著低于空白对照组(0.380 1±0.023 6)和空载体对照组(0.353 7±0.016 7),P<0.05。4空白对照组、空载体对照组、ZHX3低表达组均可见碱性磷酸酶阳性表达的细胞及矿化结节,但后者数量均小于前两者。结论:ZHX3基因低表达可延迟BMSCs体外成骨能力,可能通过调控BMP2/smad通路中的smad4来发挥作用。 展开更多
关键词 锌指蛋白和同源框3 基因沉默 骨髓间充质干细胞 骨形成蛋白 SMAD
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Zic3通过非经典Wnt和VEGF信号轴调控斑马鱼胚胎脑血管发育的分子机制
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作者 李帅庭 王云鹏 +3 位作者 袁志 王业启 程志 黄慧哲 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第19期1831-1838,共8页
目的探究锌指转录因子3(zic3)基因对斑马鱼早期脑血管发育的影响及其机制。方法利用CRISPR/Cas9技术获得zic3基因突变体,以野生型斑马鱼(AB品系)为对照,统计各个基因型72 hpf(hour post fertilization)胚胎脑出血比例。利用血管标记转... 目的探究锌指转录因子3(zic3)基因对斑马鱼早期脑血管发育的影响及其机制。方法利用CRISPR/Cas9技术获得zic3基因突变体,以野生型斑马鱼(AB品系)为对照,统计各个基因型72 hpf(hour post fertilization)胚胎脑出血比例。利用血管标记转基因鱼AB(Tg flk1∶gfp)与zic3突变体杂交,将得到的zic3^(+/-)(Tg flk1∶gfp)进行自交得到同窝对照,使用激光共聚焦显微镜观察72 hpf胚胎血管发育表型(n=30),利用RT-PCR检测相关基因表达。结果成功获得了zic3纯合突变体并经基因测序验证。与对照组相比,zic3纯合突变体存在明显的出血表型,且质膜膜泡关联蛋白(plasmalemma vesicle associated protein,Plvap)基因与zic2基因的表达量明显升高(P<0.05),但杂合突变体未观察到此表型。在杂合突变体中,后脑血管发育出现明显抑制,血管数量相比野生型降低60%(P<0.05),存在明显发育缺陷。同时非经典Wnt信号通路基因(wnt5a、wnt7ba、wnt9b)以及血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)通路基因(kdrl、vegfab、ephrlnB2)表达量均明显上升(P<0.05)。结论在斑马鱼中zic3功能可被zic2进行代偿,zic3通过抑制plvap的表达降低胚胎脑血管通透性,通过抑制非经典Wnt信号和VEGF信号通路调控胚胎脑血管发育。 展开更多
关键词 斑马鱼 锌指转录因子3 非经典Wnt信号 血管内皮生长因子 脑血管发育
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锌指同源框3基因多态性与不同亚型缺血性卒中结局的特异性关联研究
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作者 程丝 许喆 +5 位作者 左颖婷 刘阳 王安心 石延枫 李昊 王拥军 《中国卒中杂志》 2021年第11期1102-1109,共8页
目的分析中国卒中人群中锌指同源框3(zinc finger homeobox 3,ZFHX3)基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)位点对卒中结局的影响。方法本研究基于全国多中心前瞻性中国国家卒中登记研究Ⅲ,连续纳入2015年8月-2018年3月首次... 目的分析中国卒中人群中锌指同源框3(zinc finger homeobox 3,ZFHX3)基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)位点对卒中结局的影响。方法本研究基于全国多中心前瞻性中国国家卒中登记研究Ⅲ,连续纳入2015年8月-2018年3月首次发生急性缺血性卒中或TIA的患者,收集人口学信息、病史和卒中结局等相关临床资料。卒中结局包括随访1年内卒中复发(缺血性卒中或出血性卒中)、联合血管事件(卒中、心肌梗死及血管性死亡事件)及不良功能结局(mRS>2分)。采用竞争性等位基因特异性PCR技术对3个SNV位点(rs7193343、rs879324、rs12932445)进行基因分型。对于研究过程中的计量资料和计数资料,分别采用线性回归或逻辑回归进行关联分析;对于卒中结局,分别采用Cox或逻辑回归进行关联分析。结果最终纳入7674例患者,平均年龄61.7±11.5岁,其中女性2438例(31.77%)。关联分析结果显示,处于高度连锁不平衡状态(相关系数R 2=0.88)的rs879324和rs12932445位点与心房颤动、入院时NIHSS评分及卒中亚型有关联。在不同卒中亚型中,3个SNV位点均与1年联合血管事件相关,在校正年龄、性别及心房颤动协变量后关联性仍然显著。在心源性栓塞型卒中患者中,rs7193343位点的T等位基因与卒中复发、联合血管事件的发生有关联(校正HR 1.92,95%CI 1.21~3.05;校正HR 1.95,95%CI 1.26~3.01);rs879324位点的A等位基因和rs12932445位点的C等位基因与联合血管事件有关联(校正HR 1.58,95%CI 1.10~2.27;校正HR 1.66,95%CI 1.16~2.38)。在原因未明型卒中患者中,rs7193343位点的T等位基因与卒中复发和联合血管事件的发生有关联(校正HR 1.34,95%CI 1.09~1.64;校正HR 1.36,95%CI 1.11~1.66)。校正相关因素后未发现3个SNV位点与不良功能结局之间存在关联。结论ZFHX3基因上的变异位点与特定卒中亚型的卒中复发及联合血管事件的发生风险存在关联,但未发现与不良功能结局有关。 展开更多
关键词 锌指同源框3基因 卒中结局 卒中遗传学 关联分析
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偏肿革裥菌C2H2型转录因子SFP1基因克隆、生物信息学及表达分析
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作者 王莹 池玉杰 +2 位作者 张健 谷新治 杨旭欣 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期100-107,共8页
以L.gibbosa菌丝体总RNA反转录的cDNA为模板,通过RT-PCR克隆得到一个C2H2型锌指转录因子的cDNA序列。对该基因进行基因克隆、生物信息学分析,并利用实时荧光定量法对木屑处理下该基因的表达进行分析。通过保守结构域预测与结构分析发现... 以L.gibbosa菌丝体总RNA反转录的cDNA为模板,通过RT-PCR克隆得到一个C2H2型锌指转录因子的cDNA序列。对该基因进行基因克隆、生物信息学分析,并利用实时荧光定量法对木屑处理下该基因的表达进行分析。通过保守结构域预测与结构分析发现该基因为裂指蛋白1类(SFP1)C2H2型锌指转录因子,具有2个C2H2家族的保守结构域,将该基因命名为Lg-sfp1。该基因CDS全长1947 bp,编码一个由648个氨基酸组成的亲水性膜内蛋白,蛋白大小为68.27 ku。通过SWISS-MODEL预测的三级空间结构发现两个完整的C2H2结构。木屑处理下Lg-sfp1基因表达比无木屑处理下表达量低,推断木屑促进了L.gibbosa氧化应激反应,当氧化应激反应大量发生时,参与氧化应激反应负调控的sfp1基因表达受到抑制,为后续研究偏肿革裥菌sfp1基因在木材降解,特别是氧化应激反应中的功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 偏肿革裥菌 锌指转录因子 SFP1 基因克隆 基因表达
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烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析 被引量:15
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作者 杨明磊 晁江涛 +4 位作者 王大伟 胡军华 吴华 龚达平 刘贯山 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期337-349,共13页
C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana taba... C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组数据库,运用Blastp比对,结合Pfam和SMART分析,鉴定了118条普通烟草C2H2锌指蛋白家族成员;对烟草C2H2锌指蛋白家族进行了进化树分析、结构域分析、物理化学性质分析、染色体定位、基因结构分析、三维结构分析及组织表达分析等。结果表明:不同成员的氨基酸长度差异较大;系统进化及结构域分析显示,所有C2H2家族成员可以被分为5个亚家族,同一亚家族成员之间在结构域和理化性质上呈现较高一致性;每个成员都含有C2H2结构域,在数量上存在较大差异;将所有基因家族成员定位在22条染色体上;组织表达分析表明,每个C2H2亚家族都有成员在不同组织中表达,在叶及根中有些基因的表达量较高。 展开更多
关键词 C2H2锌指蛋白转录因子 烟草 基因家族
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茶树两个Dof转录因子的分离及其在温度胁迫中的响应分析 被引量:12
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作者 李辉 黄蔚 +3 位作者 刘志薇 王永鑫 吴致君 庄静 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期312-322,共11页
茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsD... 茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsDof1和CsDof2转录因子都具有典型的锌指结构域,分别位于第133-195和124-186个氨基酸位点之间.对CsDof1和CsDof2转录因子理化性质、亲/疏水性、二级和三级结构分析显示,两者都是亲水性蛋白且显偏碱性.空间结构分析显示,CsDof1和CsDof2均有1个α-螺旋,且Dof结构域的位点完全相同,均有4个半胱氨酸残基.实时定量PCR表明,CsDof1和CsDof2在不同茶树品种、不同温度胁迫下均能诱导表达,且表达呈现差异. 展开更多
关键词 茶树 Dof转录因子 锌指结构 温度胁迫 基因表达
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人工转录因子研究进展 被引量:11
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作者 赵兴卉 朱旭东 黄培堂 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期341-347,共7页
转录因子是真核表达调控中非常重要的一类反式作用因子,通常由DNA结合结构域与效应结构域两部分组成,研究发现这两个结构域可以各自独立发生作用。基于转录因子的这种结构特点,可以人为地选择针对特定序列的DNA结合结构域与具有特定作... 转录因子是真核表达调控中非常重要的一类反式作用因子,通常由DNA结合结构域与效应结构域两部分组成,研究发现这两个结构域可以各自独立发生作用。基于转录因子的这种结构特点,可以人为地选择针对特定序列的DNA结合结构域与具有特定作用的效应结构域构建人工转录因子。目前人工转录因子的DNA结合结构域多为C2 H2 型锌指结构,每一个锌指单元由大约30个氨基酸组成,识别DNA双螺旋大沟中相连的3bp序列,并可通过氢键作用与相应的碱基结合;多个锌指可以串联成簇,从而识别并结合较长的DNA序列区域。常见的人工转录因子的效应结构域有激活结构域以及抑制结构域,不同的效应结构域赋予人工转录因子不同的功能。目前人工转录因子已经在基础研究、药物设计以及基因治疗等领域得到了广泛的应用。 展开更多
关键词 人工转录因子 锌指 噬菌体展示 基因治疗
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转录因子ZFP580在缺氧预处理抗大鼠心肌细胞缺氧/复氧损伤中的作用 被引量:1
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作者 孟祥艳 于海龙 +2 位作者 买霞 张文成 徐瑞成 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1553-1558,共6页
目的:通过观察缺氧预处理对心肌细胞缺氧/复氧损伤的保护作用及锌指核转录因子ZFP580表达的改变,探讨ZFP580的作用及机制。方法:培养大鼠H9c2心肌细胞,分为3组:(1)缺氧/复氧(H/R)组:H9c2心肌细胞换用模拟缺血溶液(pH=6.2)缺氧(95%N2+5%C... 目的:通过观察缺氧预处理对心肌细胞缺氧/复氧损伤的保护作用及锌指核转录因子ZFP580表达的改变,探讨ZFP580的作用及机制。方法:培养大鼠H9c2心肌细胞,分为3组:(1)缺氧/复氧(H/R)组:H9c2心肌细胞换用模拟缺血溶液(pH=6.2)缺氧(95%N2+5%CO2)培养3 h,复氧培养2 h;(2)缺氧预适应(HPC)组:H9c2心肌细胞经3个循环的短暂缺氧(10 min)/复氧(20 min)处理后,进行同上H/R实验;(3)对照(C)组:正常培养的H9c2心肌细胞。通过MTT染色及LDH水平判定HPC的作用。Western blotting方法观察心肌细胞中转录因子ZFP580表达及ERK1/2磷酸化情况,以及ERK1/2磷酸化抑制剂PD98059对ZFP580表达的影响。分别构建高/低表达ZFP580的慢病毒载体并转染H9c2心肌细胞,经H/R实验后利用Annexin V-PE/7-AAD染色及流式细胞术检测H9c2细胞凋亡情况,Western bloting方法观察caspase-3活化情况。结果:HPC能显著改善H/R处理后H9c2心肌细胞存活率降低和LDH漏出的现象。Western blotting结果显示,HPC组心肌细胞中ZFP580表达及ERK1/2磷酸化程度较H/R处理组明显上升,且PD98059预处理明显抑制HPC诱导的ZFP580的表达上调。慢病毒介导的基因转染实验发现,ZFP580高表达的H9c2心肌细胞在H/R损伤后凋亡率降低且细胞中活化caspase-3表达下降。结论:HPC可引起心肌细胞中转录因子ZFP580表达上调,ZFP580作为ERK1/2通路的下游靶分子发挥抗心肌细胞凋亡的作用。ZFP580表达上调可能作为内源性保护机制之一介导了HPC的细胞保护作用。 展开更多
关键词 转录因子 锌指 缺氧预处理 细胞凋亡 半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3
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人类转录因子样新基因TFL76的初步研究 被引量:1
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作者 李慧 邹星 +1 位作者 慈宏亮 李亦平 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2004年第3期337-339,共3页
运用基于基因组数据库特定基因同源基因的克隆策略得到人类新基因TFL76 ,它编码 12个C2 H2 型锌指基序 .其cDNA序列长 2 2 6 8bp,预测的编码蛋白含 6 77个氨基酸 ,分子量 (Mr)为 76× 10 3 .生物信息学分析表明 ,TFL76的N末端含有... 运用基于基因组数据库特定基因同源基因的克隆策略得到人类新基因TFL76 ,它编码 12个C2 H2 型锌指基序 .其cDNA序列长 2 2 6 8bp,预测的编码蛋白含 6 77个氨基酸 ,分子量 (Mr)为 76× 10 3 .生物信息学分析表明 ,TFL76的N末端含有多种蛋白激酶的磷酸化位点和核定位信号 ,具有转录因子的特征 .染色体定位为 19q13.4 ,此位点存在很多与癌症相关的基因 .对 9.5d和 10 .5d的鼠胚进行全胚原位杂交 ,结果表明 ,此基因在前肢芽和后肢芽表达较高 .图 5表 1参 展开更多
关键词 同源基因 锌指基序 转录因子 全胚原位杂交
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子宫内膜癌抑癌基因研究进展 被引量:9
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作者 张佳 王永红 《国际妇产科学杂志》 CAS 2011年第5期428-431,共4页
子宫内膜癌是妇女常见的恶性肿瘤之一,发病率有逐年上升的趋势。随着分子生物学和免疫学的发展,关于子宫内膜癌分子水平的致癌机制研究日益深入,如癌基因、抑癌基因、DNA错配修复基因、雌激素代谢酶相关基因、甾体激素受体基因和细胞周... 子宫内膜癌是妇女常见的恶性肿瘤之一,发病率有逐年上升的趋势。随着分子生物学和免疫学的发展,关于子宫内膜癌分子水平的致癌机制研究日益深入,如癌基因、抑癌基因、DNA错配修复基因、雌激素代谢酶相关基因、甾体激素受体基因和细胞周期调控蛋白等。综述目前研究热点——抑癌基因的进展,为进一步探讨子宫内膜癌的发生发展、临床治疗及预后的判断提供重要依据。 展开更多
关键词 子宫内膜肿瘤 基因 肿瘤抑制 PTEN磷酸水解酶 肿瘤抑制蛋白质P53 基因 p16 周期素依赖激酶抑制剂P27 人类RUNT相关转录因子3 CHFR基因
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