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Analysis of genetic relationship among Arbutus unedo L. genotypes using RAPD and SSR markers 被引量:3
1
作者 Filomena Gomes Rita Costa +2 位作者 Maria M. Ribeiro Elisa Figueiredo Jorge M. Canhoto 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2013年第2期227-236,共10页
The strawberry tree (Arbutus unedo L.) is an underutilized, drought tolerant, fire resistant species with a south western distribution in Europe, and with ecological and putative socio-economical impact in Portugal ... The strawberry tree (Arbutus unedo L.) is an underutilized, drought tolerant, fire resistant species with a south western distribution in Europe, and with ecological and putative socio-economical impact in Portugal and Mediterranean countries. Our aim was to develop an appropriate set of molecular markers to enable genetic diversity to be assessed and to fingerprint Arbutus unedo genotypes for breeding and conservation purposes in Portugal. Twenty-seven trees from a broad geographic range were screened with 20 random amplified polymorphic DNA (RAPD primers) and 11 microsatellite markers (SSR). The RAPDs generated 124 bands, 57.3% of which were polymorphic, with an expected heterozygosity of 27%. We cross-amplified 11 SSR primers developed for Vaccinium spp., and 5 were found to be polymorphic in A. unedo, with 75% of expected heterozygosity, a number of alleles of 11.6, a null allele frequency of 7.6% and a polymorphic information content of 71%. Although the SSRs were more polymorphic and informative than the RAPDs, both markers displayed high genetic variability with the gathered data. No geographic pattern was observed in the genetic variation distribution based on both marker systems, and the lack of correlation between genetic and geographical matrices was confirmed by Mantel tests. Likely, no correlation was found between pairwise SSR and RAPD band-sharing matrices. These results and their implications on A. unedo breeding and conservation programs are discussed. 展开更多
关键词 ERICACEAE fingerprinting geographic pattern molecular markers strawberry tree.
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Detecting mislabeling and identifying unique progeny in Acacia mapping population using SNP markers 被引量:1
2
作者 Asif Javed Muhammad Mohd Zaki Abdullah +1 位作者 Norwati Muhammad Wickneswari Ratnam 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期1118-1126,共9页
Acacia hybrids offer a great potential for paper industry in Southeast Asia due to their fast growth and ability to grow on abandoned or marginal lands. Breeding Acacia hybrids with desirable traits can be achieved th... Acacia hybrids offer a great potential for paper industry in Southeast Asia due to their fast growth and ability to grow on abandoned or marginal lands. Breeding Acacia hybrids with desirable traits can be achieved through marker assisted selection(MAS) breeding. To develop a MAS program requires development of linkage maps and QTL analysis. Two mapping populations were developed through interspecific hybridization for linkage mapping and QTL analysis. All seeds per pod were cultured initially to improve hybrid yield as quality and density of linkage mapping is affected by the size of the mapping population. Progenies from two mapping populations were field planted for phenotypic and genotypic evaluation at three locations in Malaysia,(1) Forest Research Institute Malaysia field station at Segamat, Johor,(2) Borneo Tree Seeds and Seedlings Supplies Sdn, Bhd.(BTS) field trial site at Bintulu, Sarawak, and(3) Asiaprima RCF field trial site at Lancang, Pahang. During field planting, mislabeling was reported at Segamat, Johor, and a similar problem was suspected for Bintulu, Sarawak. Early screening with two isozymes effectively selected hybrid progenies, and these hybrids were subsequently further confirmed by using species-specific SNPs. During field planting, clonal mislabeling was reported and later confirmed by using a small set of STMS markers. A large set of SNPs were also used to screen all ramets in both populations. A total of 65.36% mislabeled ramets were encountered in the wood density population and 60.34% in the fibre length mapping population. No interpopulation pollen contamination was detected because all ramets found their match within the same population in question.However, mislabeling was detected among ramets of the same population. Mislabeled individuals were identified and grouped as they originated from 93 pods for wood density and 53 pods for fibre length mapping populations.On average 2 meiotically unique seeds per pod(179 seeds/93 pods) for wood density and 3 meiotically unique seeds per pod(174 seeds/53 pods) for fibre length mapping population were found. A single step statistical method was used to evaluate the most informative set of SNPs that could subsequently be used for routine checks for mislabeling in multi-location field trials and for labelling superior clones to protect breeder’s rights. A preliminary set of SNPs with a high degree of informativeness was selected for the mislabeling analysis in conjunction with an assignment test. Two subsets were successfully identified,i.e., 51 SNPs for wood density and 64 SNPs for fibre length mapping populations to identify all mislabeled ramets which had been previously identified. Mislabeling seems to be a common problem due to the complexity involved in the production of mapping populations. Therefore, checking for mislabeling is imperative for breeding activities and for analyses such as linkage mapping in which a correlation between genotypic and phenotypic data is determined. 展开更多
关键词 tree breeding SNP markers Mislabeling Linkage mapping Quantitative trait loci(QTL) mapping
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Changes in Tree Frog (<i>Hyla savignyi</i>) Coloration in Unstable Habitats at the Southern Border of Its Distribution
3
作者 Gad Degani 《Open Journal of Animal Sciences》 2022年第1期68-75,共8页
<span style="font-family:Verdana;">This study examined the relationship between tree frog</span> (<i><i><span style="font-family:Verdana;">Hyla</span></i>&... <span style="font-family:Verdana;">This study examined the relationship between tree frog</span> (<i><i><span style="font-family:Verdana;">Hyla</span></i><span> <i><span style="font-family:Verdana;">savignyi</span></i><span style="font-family:Verdana;"></span></span></i><span style="font-family:Verdana;">)</span><span style="font-family:Verdana;"> coloring and its different seasonal habitats at the southern border of its distribution. The results show that tree frog color is affected by the dominant colors in its habitat, which vary seasonally, especially between winter and summer. Tree frog colors were various shades of green, white, brown, and black. No genetic marker was found to characterize the color. The ability of a small frog to infer its own time with the help of color changes occurring in the habitat on the southern border of its distribution, which are relatively broad, gives this species an advantage.</span> 展开更多
关键词 tree Frog Hyla savignyi COLORS Genetic marker Winter Summer HABITATS
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果树分子标记辅助育种研究进展
4
作者 孙雨桐 刘德帅 +2 位作者 冯美 齐迅 姚文孔 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期183-192,共10页
随着分子生物学的不断发展,分子标记在果树育种中发挥的作用也愈发重要。本文主要对不同果树育种的分子标记类型及分子标记在果树种质资源鉴定、抗性育种、无核育种、早熟育种、品质改良育种、分子遗传图谱构建与数量性状座位(QTL)基因... 随着分子生物学的不断发展,分子标记在果树育种中发挥的作用也愈发重要。本文主要对不同果树育种的分子标记类型及分子标记在果树种质资源鉴定、抗性育种、无核育种、早熟育种、品质改良育种、分子遗传图谱构建与数量性状座位(QTL)基因定位等方面的应用进行了综述,为果树分子标记辅助育种提供参考。 展开更多
关键词 果树 分子标记 遗传图谱 QTL定位
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基于融合点云数据的马尾松林地单木分割算法研究
5
作者 李炜 王晓红 《林草资源研究》 北大核心 2024年第2期92-100,共9页
激光雷达技术在森林资源调查中具有较大优势,但单平台采集的数据往往存在扫描盲区,难以获取完整的森林结构信息。为此,以马尾松林作为研究对象,探究基于融合点云数据的马尾松林单木分割适宜性算法。首先提出一种针对森林样地点云数据融... 激光雷达技术在森林资源调查中具有较大优势,但单平台采集的数据往往存在扫描盲区,难以获取完整的森林结构信息。为此,以马尾松林作为研究对象,探究基于融合点云数据的马尾松林单木分割适宜性算法。首先提出一种针对森林样地点云数据融合的方法,然后采用标记控制分水岭算法、距离判别聚类算法和层堆叠算法对马尾松林进行单木分割,并对3种算法的关键参数的选取进行分析,最后提取树高验证融合点云估测森林结构参数的适用性。得出实验结果如下:1)提出的点云融合方法可以有效融合机载和手持激光雷达点云,配准误差为0.054 m;2)3种单木分割算法中,标记控制分水岭算法分割精度最高,总体精度为0.88,高于距离判别聚类算法和层堆叠算法;3)利用标记控制分水岭算法分割的单木提取树高,基于融合点云数据的R2值为0.983 7,RMSE为0.759 6 m,相较于单一点云数据,精度明显提高。研究结果可为多源激光雷达在林业领域的应用以及马尾松林地森林资源管理提供技术支持。 展开更多
关键词 单木分割 融合点云数据 单木树高 标记控制分水岭算法 马尾松
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林木遗传图谱构建的技术与策略 被引量:19
6
作者 何祯祥 施季森 +1 位作者 邱进清 肖石海 《浙江林学院学报》 CSCD 1998年第2期151-157,共7页
对林木遗传图谱构建中的有关概念、实验技术与策略及计算机分析软件等进行了系统阐述。全面总结了当前国内外林木遗传图谱构建研究的现状,指出了目前林木遗传图谱的应用价值及图谱构建中存在的主要问题,并对下一步的发展进行了一些探讨。
关键词 林木 遗传学图 基因组 树木育种 标记
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果树DNA分子标记及基因工程若干研究进展 被引量:33
7
作者 王凤华 赖钟雄 +2 位作者 陈桂信 吕柳新 郑金贵 《福建农业大学学报》 CSCD 北大核心 2001年第2期165-170,共6页
本文综述了近年来 DNA分子标记在果树品种 (系 )鉴定和分类、果树遗传图谱构建、果树基因标记等方面的应用 ,以及果树基因工程 ,包括果树目的基因 (片段 )的分离克隆、果树遗传转化等方面的研究状况 ,并对DNA分子标记及基因工程研究中... 本文综述了近年来 DNA分子标记在果树品种 (系 )鉴定和分类、果树遗传图谱构建、果树基因标记等方面的应用 ,以及果树基因工程 ,包括果树目的基因 (片段 )的分离克隆、果树遗传转化等方面的研究状况 ,并对DNA分子标记及基因工程研究中存在的问题进行了总结 。 展开更多
关键词 果树 DNA分子标记 基因克隆 遗传转化
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林木分子标记研究进展 被引量:19
8
作者 甘四明 施季森 +1 位作者 白嘉雨 徐建民 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1998年第4期428-434,共7页
分子标记技术大大促进了林木有关研究的发展。林木分子标记研究主要包括林木遗传连锁图谱构建、比较基因组研究、数量性状位点定位、标记辅助选择、系统演化及群体遗传变异和多样性等内容。迄今,已有近20个树种构建了基因组遗传连锁... 分子标记技术大大促进了林木有关研究的发展。林木分子标记研究主要包括林木遗传连锁图谱构建、比较基因组研究、数量性状位点定位、标记辅助选择、系统演化及群体遗传变异和多样性等内容。迄今,已有近20个树种构建了基因组遗传连锁图谱,少数树种还进行了比较基因组研究。定位了10余个与分子标记连锁的数量性状位点,分子标记辅助选择育种已在少数树种中开展。分子标记是研究林木群体遗传结构和多样性水平的有用工具,也可用以阐明物种的系统进化和亲缘关系。 展开更多
关键词 林木 分子标记 遗传连锁图谱 遗传多样性
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分子标记辅助选择在林木育种中的应用(英文) 被引量:6
9
作者 邬荣领 尹佟明 +1 位作者 黄敏仁 王明庥 《林业科学》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期102-103,共2页
历史上,数量遗传学被认为是指导林木育种的唯一有效工具,这有两个方面的原因:第一,在林木上具有重要经济价值的性状,如树干材积生长、木材纤维长度及适应性等,均是以数量方式遗传的性状,并且控制这些性状的每一个过程是假设受微... 历史上,数量遗传学被认为是指导林木育种的唯一有效工具,这有两个方面的原因:第一,在林木上具有重要经济价值的性状,如树干材积生长、木材纤维长度及适应性等,均是以数量方式遗传的性状,并且控制这些性状的每一个过程是假设受微效多基因所控制的;第二,林木具有很长的世代间隔,很高的遗传杂合性和很高的遗传负荷,这些特性限制了一些经典的遗传材料,如近交系,突变体及特异类型的产生。然而,传统的数量遗传学方法用于指导林木育种的实践并不是完美无缺的。林木个体高大,占地面积大,且大多栽植在非农用耕地上,这样的环境异质性在很大程度上影响性状遗传力的提高,有些林木树种人工杂交比较困难,很难获得足够大的家系,从而产生不平衡的交配设计。Namkoong 和Roberds(1976) 认为,不平衡的交配设计很难获得准确的遗传参数估计。到目前为止,大多数成功的林木育种方案往往都是基于对表型的简单选择。这种表型选择不能利用林木固有的非加性效应,以及对异质环境的反应潜能,因而育种效果是极为有限的。分子标记技术为现代数量遗传学的发展提供了新的方向。通过利用中性标记与影响数量性状的位点(QTL) 之间的连锁关系。 展开更多
关键词 分子标记 辅助选择 林木 育种
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基于“优选肿瘤标志群”建立的决策树模型对肺癌辅助诊断的价值 被引量:7
10
作者 何其栋 魏小玲 +2 位作者 张红巧 王威 吴拥军 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期37-40,共4页
目的:应用决策树技术联合肿瘤标志蛋白芯片建立基于"优选肿瘤标志群"的决策树模型,实现对肺癌的快速诊断。方法:运用肿瘤标志定量检测试剂盒测定201例肺部良性疾病及199例肺癌患者血清中9项肿瘤标志[癌胚抗原、糖原类抗原19-9... 目的:应用决策树技术联合肿瘤标志蛋白芯片建立基于"优选肿瘤标志群"的决策树模型,实现对肺癌的快速诊断。方法:运用肿瘤标志定量检测试剂盒测定201例肺部良性疾病及199例肺癌患者血清中9项肿瘤标志[癌胚抗原、糖原类抗原19-9(CA199)、神经元特异性烯醇化酶、CA242、铁蛋白、CA125、甲胎蛋白、人生长激素和CA153]水平,应用logistic回归对肿瘤标志进行筛选以获得"优选肿瘤标志群",分别于筛选前后建立决策树模型和Fisher判别分析模型。结果:肺癌组9项血清肿瘤标志水平均高于肺良性疾病组(P<0.05)。筛选前基于9项肿瘤标志分别建立的Fisher判别分析模型、决策树模型和筛选后基于6项肿瘤标志建立的Fisher判别分析模型、决策树模型,其预测准确度分别为86.0%、92.5%、84.5%、91.5%。筛选前和筛选后决策树模型ROC曲线的AUC分别为0.925和0.915,均高于Fisher判别分析的0.860和0.845(Z=4.462和4.575,P均<0.01);但决策树模型和Fisher判别分析筛选前后自身相比,差异均无统计学意义(Z=1.914和1.074,P均>0.05)。结论:基于6项肿瘤标志建立的决策树模型诊断肺癌的效果优于Fisher判别分析。 展开更多
关键词 决策树 肿瘤标志 肺肿瘤 辅助诊断
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滇杨优树遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
11
作者 纵丹 员涛 +4 位作者 周安佩 刘东玉 郑元 段安安 何承忠 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期103-108,213,共7页
以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条... 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。 展开更多
关键词 滇杨优树 AFLP 遗传多态性 遗传相似系数 UPGMA聚类分析
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分子标记在果树上的应用 被引量:37
12
作者 张开春 尹淑萍 +3 位作者 杨英军 林珂 侯义龙 过国南 《果树科学》 CSCD 北大核心 1999年第3期210-218,共9页
介绍了几种分子标记技术的原理和特点,综述了分子标记技术在果树上的研究进展,评述了它们的应用前景和存在的问题。
关键词 分子标记 果树 应用
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木荷优树无性系种质SSR标记的遗传多样性分析 被引量:8
13
作者 杨汉波 张蕊 +3 位作者 王帮顺 徐肇友 陈焕伟 周志春 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第5期43-53,共11页
【目的】利用SSR标记深入研究木荷优树无性系种质的遗传多样性,揭示其遗传多样性地理分布特点及种质间遗传关系,为木荷种质资源的保护和育种亲本的选择提供理论依据。【方法】利用10对SSR引物,分析我国5个省份24个地区的734份木荷优树... 【目的】利用SSR标记深入研究木荷优树无性系种质的遗传多样性,揭示其遗传多样性地理分布特点及种质间遗传关系,为木荷种质资源的保护和育种亲本的选择提供理论依据。【方法】利用10对SSR引物,分析我国5个省份24个地区的734份木荷优树无性系种质的遗传多样性和遗传结构。利用CERVUS、Gen AIEx 6.5、NTSYS、Arlequin和STRUCTURE 2.3软件进行无效等位基因检测、遗传参数估算、主坐标分析、聚类图构建、遗传变异分析及遗传结构分析。【结果】10对引物共检测到105个等位基因(Na),平均每个引物为10.5个,ss16引物检测到的等位基因数最多,为16个。Shannon’s信息指数(I)变化范围为1.121~1.908,平均值为1.473;多态信息指数(PIC)范围为0.557~0.807,平均值为0.668;平均期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为0.713和0.735。木荷优树无性系种质的主坐标(PCo A)和遗传结构分析基本可以保持一致,供试734份木荷优树无性系种质可被分为3个PCo A类群,而在遗传结构上可划分为5个群组。24个种质群体间遗传距离范围为0.030~0.804,平均为0.230,表明群体间的亲缘关系较近,但仍有部分种质群体间存在较远的亲缘关系,如HNSZ和GDSX,JXFY和FJSX等;不同种质群体Shannon’s信息指数(I)变化范围为0.980~1.431,遗传多样性与地理分布不完全相关。STRUCTURE分析表明,71.1%的木荷优树无性系种质遗传组分相对比较单一,28.9%的种质遗传背景比较复杂。分子方差分析(AMOVA)表明,供试的木荷优树无性系种质有5.91%的遗传变异存在于群体间,而94.09%的遗传变异来自于群体内。【结论】木荷优树无性系种质存在丰富的遗传多样性,各群体间遗传多样性水平相差较大。在木荷杂交育种亲本选配时不仅要考虑地理远缘,还应考虑亲本群体(个体)间的亲缘关系。 展开更多
关键词 木荷 优树 SSR标记 遗传多样性 遗传结构
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ISSR标记在茶树品种遗传多态性研究中的应用 被引量:17
14
作者 唐玉海 郭春芳 +2 位作者 张木清 陈常颂 陈荣冰 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第1期51-55,共5页
用筛选出的12个ISSR引物对17个茶树品种的基因组DNA进行扩增,共扩增出61个条带,其中多态性条带53条,占87.08%,平均每个引物组合扩增出5.08个条带.根据Nei-Li系数将17个茶树品种聚为2类.结果显示,ISSR是一种重复性好、效率高的分子标记,... 用筛选出的12个ISSR引物对17个茶树品种的基因组DNA进行扩增,共扩增出61个条带,其中多态性条带53条,占87.08%,平均每个引物组合扩增出5.08个条带.根据Nei-Li系数将17个茶树品种聚为2类.结果显示,ISSR是一种重复性好、效率高的分子标记,可以用于茶树品种的遗传多态性分析. 展开更多
关键词 ISSR 茶树 聚类分析 分子标记
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DNA分子标记在果树种质资源遗传多样性研究中的应用 被引量:10
15
作者 周蓓蓓 朱海军 +1 位作者 生静雅 刘广勤 《江西农业学报》 CAS 2011年第9期47-50,共4页
简要介绍了DNA分子标记的主要类型、原理及特点,重点综述了RFLP、RAPD、AFLP、SSR、EST-SSR和SNP标记技术在果树种质资源遗传多样性研究中的应用现状。
关键词 果树 DNA分子标记 遗传多样性 应用
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DNA分子标记在果树遗传学研究上的应用 被引量:41
16
作者 王倩 王斌 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期339-344,共6页
本文综述了近年来DNA分子标记在果树种质资源研究、分子遗传图谱构建、基因标记、辅助选择育种等方面研究的应用。
关键词 DNA分子标记 果树遗传 种质资源 遗传图谱
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应用RAPD分子标记鉴定野生茶树种质资源研究 被引量:44
17
作者 陈亮 王平盛 山口聪 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第10期1186-1191,共6页
应用RAPD标记对原产于云南等地的 2 4份野生茶树资源进行分子鉴定研究。结果表明 ,RAPD标记在鉴定茶树种质资源方面非常有效。有 3种独立的方法可以用于茶树种质资源的分子鉴定 :特殊的标记 ;特异的谱带类型 ;不同引物提供谱带类型的组... 应用RAPD标记对原产于云南等地的 2 4份野生茶树资源进行分子鉴定研究。结果表明 ,RAPD标记在鉴定茶树种质资源方面非常有效。有 3种独立的方法可以用于茶树种质资源的分子鉴定 :特殊的标记 ;特异的谱带类型 ;不同引物提供谱带类型的组合。 16个特异标记的存在和 3个特异标记的缺失可以鉴定 14份资源 ;OPO 13扩增的 13种谱带类型可以鉴定 10份资源。利用最少数量引物获得最大鉴定能力 ,对种质资源的分子鉴定尤为重要。OPO 13、OPO 18、OPG 12和OPA 13等 4个引物带型的组合则可以鉴定所有 2 4份资源 ,包括形态和生化成分上几乎没有差异的 展开更多
关键词 分子标记 鉴定 野生茶树 RAPD标记 种质资源
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遗传标记技术及其在林木遗传育种中的应用研究 被引量:7
18
作者 王晓丽 马祥庆 《世界林业研究》 CSCD 北大核心 2005年第5期37-41,共5页
论述了不同遗传标记技术的原理及特点,综述了遗传标记技术在林木遗传育种中的应用研究进展,为林木遗传学和育种学的研究提供参考。
关键词 遗传标记 林木 遗传育种 分子标记
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中缅树鼩微卫星分子标记的筛选 被引量:6
19
作者 李婧潇 王新兴 +2 位作者 王文广 孙晓梅 代解杰 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2011年第4期312-315,共4页
目的筛选中缅树鼩微卫星分子标记,逐步填补中缅树鼩特异性遗传标记的空白。方法建立中缅树鼩基因小片段插入文库,利用5’端地高辛标记的(CA)15探针从约1500个菌落中选出36个阳性克隆。对这些克隆进行测序,发现其中15个含有重复序列,其中... 目的筛选中缅树鼩微卫星分子标记,逐步填补中缅树鼩特异性遗传标记的空白。方法建立中缅树鼩基因小片段插入文库,利用5’端地高辛标记的(CA)15探针从约1500个菌落中选出36个阳性克隆。对这些克隆进行测序,发现其中15个含有重复序列,其中1个为重复克隆,1个因两端序列太短而不能设计引物。结果用Primer3软件设计13对引物。PCR结果,13对均有条带。退火温度分布在44~52℃之间。阳性克隆率为2.4%,微卫星克隆率为1%。结论利用地高辛标记探针筛选树鼩微卫星分子标记所得的微卫星克隆率,可达到传统放射性核素标记探针同等的效果,并可避免放射性危害。树鼩微卫星分子标记的筛选将为下一步进行基因组结构的分析、树鼩遗传连锁图谱的构建、分子进化和标记辅助选择等提供大量的微卫星标记。 展开更多
关键词 树鼩 微卫星 分子标记
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巴西橡胶树SSR遗传图谱的构建 被引量:15
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作者 冯素萍 李维国 +2 位作者 于飞 王静毅 武耀廷 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期857-863,共7页
以热研88-13×IAN873的94个F1群体为试材,利用简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,采用FsLinkage MAP 1.0软件,构建了巴西橡胶树热研88-13×IAN873的遗传连锁图谱。从441对SSR引物中筛选出160对具有多态信息的引物,... 以热研88-13×IAN873的94个F1群体为试材,利用简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记,采用FsLinkage MAP 1.0软件,构建了巴西橡胶树热研88-13×IAN873的遗传连锁图谱。从441对SSR引物中筛选出160对具有多态信息的引物,在分离群体中共检测到206个多态性位点,176个位点用于遗传图谱的构建;χ2检验结果显示,有147个位点符合1:1分离比例,有12个符合1:2:1分离比例,有17个符合1:1:1:1的分离比例,共有13个偏分离位点,偏分离率低(7.38%);91个SSR位点被分为18个连锁群,覆盖橡胶树基因组1 937.06 cM,每个连锁群包含2~16个位点,标记间的平均距离为21.29 cM。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 SSR标记 遗传图谱
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