基于psb A-trn H序列的秦艽分子鉴定及其药效分析

秦艽相近相似混伪品较多,且药效差异显著,为准确区分西北地区秦艽混伪品及药效,试验利用psb Atrn H基因作为条形码鉴定5种来自西藏、四川、青海地区相近秦艽的药材,基因测序后,在GenBank数据库中通过序列比对选取药材同源序列,利用MEGA 7.0软件计算双参数(K2P)遗传距离,并基于邻近法构建系统进化树,分析物种系统发育关系;另外,利用紫外分光光度法检测试验样本龙胆苦苷含量及DPPH清除率,评估不同地区药材龙胆苦苷含量及抗氧化能力。结果表明,结合K2P遗传距离、系统发育关系和psb A-trn H基因相似性确定试验样品中3种为粗茎秦艽(Gentiana crasicaulis),另外2种分别为麻花秦艽(G. straminea)和黄管秦艽(G.officinalis)。所有样品龙胆苦苷含量在8.56%~12.76%,其中大小表现为黄管秦艽>麻花秦艽>粗茎秦艽;DPPH清除率范围为66.49%~90.68%,其中麻花秦艽>黄管秦艽,而3个不同地区的粗茎秦艽DPPH清除率差异较大。综上,psb A-trn H基因序列在秦艽植物鉴定和系统分类研究上十分有效,不同地区试验样品中龙胆苦苷含量均较高,抗氧化能力较强。

基于叶绿体psbA-trnH序列和trnL-F序列的牡丹野生种间关系

对牡丹组全部9个野生种15个居群及凤丹的叶绿体psb A-trn H和trn L-F序列进行测序,并采用邻位相连法分别构建了psb A-trn H序列和trn L-F序列的系统发育树。结果显示:1)两段序列的基因树均支持牡丹组划分为两个亚组的分类方法,与前人的研究结果一致。2)psb A-trn H序列基因树表明大花黄牡丹与黄牡丹的亲缘关系最近,这与大花黄牡丹曾被确定为黄牡丹的一个变种的历史一致。3)革质花盘亚组内,基于psb A-trn H和trn L-F序列的研究结果大体一致,分歧主要在四川牡丹的地位问题。4)psb A-trn H序列和trn L-F序列基因树分别表明杨山牡丹与凤丹具有最近或较近的亲缘关系。

窄叶鲜卑花(Sibiraea angustata)nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列分子进化特点的分析

应用PCR产物直接测序法分析了窄叶鲜卑花居群间nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA(叶绿体DNA)trnL-F的碱基差异,并与cpDNAtrnS-G序列和rpl20-rps12序列进行比较,从而初步研究两套植物基因组的变异速率。采用改良的CTAB法从硅胶干燥的窄叶鲜卑花叶片中提取总DNA,并对nrDNA ITS和cpDNAtrnL-F区域进行扩增、纯化、测序。nrDNA ITS序列共有601 bp,有变异位点3处,变异位点百分率为0.05%,(G+C)含量为41.4%。cpDNAtrnL-F序列共有927 bp,有变异位点1处,变异位点百分率0.01%,(G+C)含量为32.6%,两种序列的核苷酸多样性非常低。比较发现,窄叶鲜卑花nrDNA ITS区域较cpDNAtrnS-G序列和rpl20-rps12序列保守,变异速率较慢,比cpDNAtrnL-F序列变异速率稍快。通过对ITS序列单倍型(haplotype)进行分析发现,窄叶鲜卑花现有分布范围经历了居群近期范围扩张,与叶绿体基因组(trnS-G和rpl20-rps12序列)得出的结论一致。因此,窄叶鲜卑花nrDNA ITS序列适合该种的谱系地理学研究。

利用ISSR和叶绿体trnL-trnF序列变异研究葡萄种质资源的遗传多样性和系统发育关系

利用ISSR标记和叶绿体DNA trn L-trn F非编码区分析36种葡萄种质的遗传多样性和系统发育关系.13个ISSR引物共产生了63条带,平均有效等位基因数、Nei's基因多样性和香农信息指数分别是1.5827,0.3463和0.5172.基于UPGMA的ISSR分析将葡萄种质材料分为6个主要的进化枝.葡萄在trn L-trn F区域有较高的遗传多样性水平(Hd=0.667,Pi=0.00206).由NJ,ML和贝叶斯分析得到的进化树都没有表现出不同地区葡萄品种与地域之间的地理相关性.中性检验葡萄的进化历史过程中发生过种群扩张事件.葡萄种质资源的保护应以就地保护为主.本研究为葡萄种质资源的理论和应用研究提供了有价值的信息.

GPS/INS/TRN组合导航系统信息融合技术研究

本文提出了一种基于信息融合技术的巡航导弹组合导航系统方案，并对系统组合方式、以及相关的信息融合技术进行了初步讨论。基于信息融合的组合导航方案可以充分地利用各种导航传感器的信息，有效地提高导航系统的精度。同时，系统的重构能力保证了系统的可靠性。

利用叶绿体DNAtrn L-F序列初步探讨菊科风毛菊属的系统发育

风毛菊属SaussureaDC .是菊科物种分化十分剧烈和分类处理十分困难的一个属。该属的单系起源性质、属下分类系统以及一些独特形态物种的系统位置尚不清楚 ,有待进一步验证。本文测定了代表该属 5个亚属 37种植物 43个样品和川木香属DolomiaeaDC .的 1种样品的叶绿体DNAtrnL_F序列 ,并调取菜蓟族CardueaeCass.与风毛菊属具有一定亲缘关系的 1 3属的该序列 ,一起进行了分支分析 ,重点验证该属的属下形态分类系统以及形态特殊、青藏高原地区特有的雪兔子亚属subgen .Eriocoryne中假雪兔子组sect.Pseudoeriocoryne的单系性质。研究结果表明 :( 1 )尽管风毛菊属 5个亚属形态变异极大 ,但种间的trnL_F碱基变异却非常小 ;( 2 )根据形态学划分的 5个亚属在分支图上没有得到分辨 ;( 3)根据无明显茎、叶呈莲座状包被头状花序等特征建立的假雪兔子组是一多系群 ,与其他雪兔子亚属的种类也没有密切的亲缘关系 ,其共同拥有的形态学特征分别起源了 4次 ;( 4 )雪莲亚属假雪莲组subgen.Amphi laenasect.Pseudoamphilaena中的多鞘雪莲S .polycolea变种尖苞雪莲S .polycoleavar.acutisquama与风毛菊亚属subgen .Saussurea的长毛风毛菊S.hieracioides、美丽风毛菊S .superba、打箭风毛菊S .tatsienensis和重齿风毛菊S .

棱果沙棘及其亲本cpDNA trnS-G片段的序列变异分析

对自然杂交种棱果沙棘(Hippophae goniocarpa)及其亲本中国沙棘(H.rhamnoides ssp.sinensis)和肋果沙棘(H.neurocarpa)的共6个个体的叶绿体基因组的trnS-G片段进行了序列测定.所测样品序列长度为646～654 bp,排序后为656 bp.所测序列共有51个变异位点,占整个序列长度的7.77%,其中有14个变异位点属于碱基的插入或缺失类型,37个变异位点属于碱基的替换类型,各占变异位点总数的27%、73%和序列总长度的2.13%、5.64%.分析序列结果表明,所测样品在trnS-G间隔区序列长度变化不大,但提供了较多的变异位点,并且碱基变换类型丰富,碱基变异位点来源于中国沙棘和肋果沙棘的种间序列的差异.棱果沙棘的2个个体分别与中国沙棘和肋果沙棘的其中1个个体的序列完全一致,说明在自然杂交种棱果沙棘的起源中,中国沙棘和肋果沙棘均可作为母本.

叶籽银杏trnS-trnG序列测定与分析

利用叶绿体基因trnS-trnG基因间隔区的通用引物,扩增并分析了不同地区的14个叶籽银杏和2个银杏的trnS-trnG基因间隔区序列,结果表明,14个叶籽银杏和2个银杏的trnS-trnG序列长度均为1005bp,A+T的含量为62.19%～62.39%。用DNASTAR软件对14个叶籽银杏和2个银杏的trnS-trnG基因间隔区序列进行同源性和差异性分析,建立了系统进化树。各样品之间变异小,14个叶籽银杏和2个银杏共有23个可变位点,1个信息位点,这些变异都以碱基的置换发生。除这些变异位点外的核苷酸序列完全相同,说明各样品序列之间具有高度同源性。YZ1变异位点较多,与其它样品的同源性较低。所测序列Blast检验后发现叶籽银杏trnS-trnG序列与银杏的相似度最高,苏铁类次之。

用叶绿体rbcL和rps4-trnS区序列确定亚洲特有单型属——篦齿蕨属的系统位置

篦齿蕨属MetapolypodiumChing是亚洲大陆特有植物,仅含篦齿蕨Metapolypodiummanmeiense(Christ)Ching1种,分布于中国西南及其邻近地区,其系统位置一直是一个有待解决的问题。本文用叶绿体rbcL和rps4-trnS区序列探讨篦齿蕨属的系统位置。我们对篦齿蕨及其近缘类群的叶绿体rbcL和rps4-trnS区进行PCR扩增和序列测定。用最大简约法、邻接法和贝叶斯推断法对自测序列结合由GenBank下载的rbcL和rps4-trnS区序列进行独立和联合的系统发育分析,所构建的系统发生树的拓扑结构基本一致。结果显示:篦齿蕨属与多足蕨属PolypodiumL.emend.Ching的关系较疏远,而与水龙骨属PolypodiodesChing和拟水龙骨属PolypodiastrumChing的成员聚成一个支系,与栗柄水龙骨Polypodiodesmicrorhizoma(C.B.ClarkeexBaker)Ching的关系最近。根据本文的研究结果,我们赞成秦仁昌1978年的分类系统,即分别承认多足蕨属、篦齿蕨属、水龙骨属、拟水龙骨属和棱脉蕨属SchellolepisJ.Sm.为独立的类群。根据分子系统学证据,宜将栗柄水龙骨转移到篦齿蕨属中。

基于叶绿体TrnL- F序列和联合数据分析木通科的分子系统发育(英文)

基于叶绿体trnL_F序列单独分析以及trnL_F和rbcL序列联合分析重建了木通科的分子系统发育。本研究的系统发育拓扑结构与覃海宁和塔赫他间的族划分系统非常一致。猫儿屎族和串果藤族在系统发育树上位于本科的基部。由分布于南美的勃奎拉藤属和拉氏藤属组成的拉氏藤族得到了trnL_F序列分析 (10 0 % )和联合序列分析 (99% )的很好支持。木通族在两个分析里都得到了 10 0 %的靴带支持率。新建立的长萼木通属在trnL_F树上嵌套在木通属内 ;然而 ,在联合分析的树上 ,它与木通属形成姐妹群并得到很高的支持率。在系统发育上关系密切的 3个属 :牛藤果属、八月瓜属和野木瓜属之间的关系仍未解决。牛藤果与八月瓜在两个分析里都形成姐妹群 ,但支持率低。小花鹰爪枫嵌套在野木瓜属内 ,并与西南野木瓜形成姐妹群。木通族内这 3个属可能都不是单系 ,它们的属间界限和属的界定需要更多的分子和形态数据的进一步研究。

高速铁路TRN高程网高差定权新方法研究

介绍了高速铁路无砟轨道TRN高程网的精度评定方法,提出利用回归分析模型构造TRN高程网相邻两TRP间高差的权函数,这是一种有别于传统经验定权的动态定权法。在某高速铁路试验场通过仿真试验将该动态定权法应用于TRN高程网的精度评定,并与应用传统定权方法评定结果进行对比,分析结果表明:用该定权方法评定的精度优于经验定权法评定的精度,且只有当相邻TRP高差较差≤0.4 mm时,才能达到精度要求。

基于ITS、rpl16和trnS-trnR DNA序列讨论锥形果属的系统位置

基于核基因ITS和叶绿体基因rpl16、trnS-trnR的DNA序列讨论了锥形果属的系统位置,3个基因片段独立以及联合的分析为锥形果属Gomphogyne的系统进化研究提供了足够的信息。结果表明:(1)锥形果属是一个自然属;(2)雪胆属Hemsleya的短柄雪胆H.delavayi和圆锥果雪胆H.macrocarpa曾经被作为锥形果属的种,分子证据表明它们确实隶属于雪胆属;(3)锥形果属单独构成雪胆属的姊妹群,而并非是与绞股蓝属Gynostemma共同构成。

线蕨属(水龙骨科)的系统发育研究:来自叶绿体rbcL和rps4-trnS序列的证据

线蕨属Colysis植物主要分布于亚洲热带和亚热带地区,少数种类分布至非洲、澳大利亚(昆士兰)及新几内亚地区。自1849年成立以来,线蕨属的分类范畴和系统位置一直有待确定。本文利用叶绿体基因组的rbcL、rps4基因和rps4-trnS基因间隔区序列,运用最大简约法和贝叶斯方法分析了线蕨属及其近缘类群的系统演化关系。研究结果显示:(1)线蕨属和薄唇蕨属Leptochilus(含似薄唇蕨属Paraleptochilus)组成一个支持率很高的单系分支(C-LClade),但是薄唇蕨属的成员位于线蕨属的不同支系内,支持线蕨属和薄唇蕨属合并为一个属;(2)瘤蕨属Phymatosorus单独形成一个单系分支;(3)星蕨属Microsorum是一个多系类群,除Microsorium linguiforme、M.varians和M.pustulatum与马来群岛的Lecanopteris聚在一起外,其他的星蕨属成员均位于不同的支系上。本文的系统发育分析结果为线蕨属和薄唇蕨属的分类处理提供了分子系统学的证据。

用cpDNA trnS-trnfM区域序列分析19个梨品种的亲缘关系

研究‘库尔勒香梨’等19个主要梨品种的cp DNA trn S-trnf M区域的系统发育。利用trn S-trnf M区域的通用引物对总DNA进行扩增,将扩增出的PCR产物进行克隆测序,获得了长度为1 272~1 642 bp的19条序列。序列分析结果表明,‘库尔勒香梨’与白梨系统的同源性为85.01%,与新疆梨系统的同源性为78.60%,与西洋梨系统的同源性为78.28%,与砂梨系统的同源性为77.47%,与秋子梨系统的同源性为77.91%;基于测定序列构建的系统进化树表明,19个梨梨品种分为两大组,一组是‘库尔勒香梨’‘黑酸梨’‘句句梨’‘金川雪梨’、杜梨、‘京白’‘身不知’‘伏茄’‘冬巴’‘慈梨’;另一组是‘鸭梨’‘苹果梨’‘锦丰’‘砀山酥’梨、‘新世纪’‘南果梨’‘早酥’‘翠伏’和‘象牙’。

基于FX-TRN-BEG-C的自动分配系统仿真教学

PLC是一门理论与实践并重的课程,然而在实际教学中,由于实训条件有限,PLC的课程教学并不能取得良好的教学效果。通过自动分配系统的教学实例,展示了三菱FX-TRN-BEG-C仿真软件在教学上的优势,结果显示,融合仿真软件的PLC课程教学,可以解决实际教学中实训设备不足的问题,培养学生的学习兴趣,有效提高教学效率。

FX-TRN软件在PLC教学中的应用

采用FX-TRN仿真软件作为多媒体教学的平台,把《可编程控制器》(PLC)课程的知识点,通过软件中各案例来进行讲解。在屏幕上以"动画"方式展现出PLC的控制过程及结果,把抽象的知识形象化,这样激发了学生的学习兴趣,提高了教学效果。文中选用了FX-TRN软件中的部件分配案例,来介绍该软件在PLC课程教学中的应用方法,这种方法对PLC以及其他课程的信息化教学具有较重要的参考价值。

基于叶绿体DNA序列atpI-rsp2和psbC-trnS的山药种质资源遗传多样性分析

【目的】基于叶绿体DNA(cpDNA)序列atpI-rsp2和psbC-trnS分析山药种质资源的遗传多样性,为山药种质资源鉴定、创新利用及新品种选育提供理论依据。【方法】以来自14个省(区)的64份山药种质为材料,对其atpI-rsp2和psbC-trnS序列进行多态性扩增并测序,经拼接、比对后,利用MEGA 7.0计算种质间的遗传距离并构建系统发育进化树,并利用DNAsp 5.0分析核苷酸多态性,采用NET Framework 4.6.1绘制单倍型间的中介邻接网络结构。【结果】atpI-rsp2和psbC-trnS序列合并序列长度为1938 bp,共有117个插入/缺失位点(I_(s))和14个变异位点(V_(s)),转换率(S_(i))为49.1%,总体转换/颠换偏倚率(R)为0.928,共产生30种单倍型,其中有21种为独享单倍型,9种为共享单倍型,单倍型多样性(H_(d))和核苷酸多样性(p)分别为0.9206和0.00139。atpI-rsp2序列和psbC-trnS序列及合并序列的Tajima’s D、Fu andLi’s D*和F*均为负值,其差异均未达显著水平(P>0.10),说明这2个序列在进化上符合中性进化模式。64份山药种质的遗传距离为0~0.003865,平均遗传距离均为0.001400。中介邻接网络结构分析结果显示,30种单倍型可分为3类,其中,H5为较原始单倍型。【结论】64份山药种质资源的遗传距离较近,遗传背景相似,可能是由于长期地区间引种导致,与地理距离不完全相关。atpI-rsp2和psbC-trnS序列可用于山药物种鉴定和系统进化分析等研究领域。

基于FX-TRN开展PLC课程教学的探讨

PLC课程特别强调实践动手,但是实验箱价格较贵,学生难以获得充足训练,学习效果不佳。为此,提出利用FX-TRN仿真软件开展教学的方案。FX-TRN具有零成本、直观形象、实验效率高等优点。通过理论课融合、实验课结合、设计项目超市、课外趣味题目的方式,让学生进行大量的实践训练,并在自由设计中不断提高实战能力。实践表明,利用FX-TRN开展PLC教学,学生能够随时随地学习,更好地理解和记忆PLC技术,学习效果良好。

高速铁路TRN平面网双线法测量的可行性研究

首先介绍了德国法进行TRN平面网外业测量的作业流程,指出了德国法作业效率低、精度不均匀等不足之处。针对这些不足之处,提出了双线法测量TRN平面网的方法。通过比较分析德国法与双线法具体的外业测量流程,并对两种方法实验数据的结果进行比较,证明双线法进行TRN平面网测量,不仅能够达到所要求的相关精度指标,同时可提高外业测量的工作效率。因此,认为双线法具有较强的可行性,且对于推出我国自主的TRN平面网测量方法有一定的参考价值。

基于rps4-trnS区序列的证据分析傅氏凤尾蕨和狭眼凤尾蕨的关系

对傅氏凤尾蕨(Pteris fauriei)和狭眼凤尾蕨(Pteris biaurita)的叶绿体rps4-trnS区序列进行PCR扩增和序列分析,再结合NCBI基因数据库中已发表的凤尾蕨科及其邻近类群的rps4-trnS区序列构建系统发育树来分析两者的亲缘关系。结果显示:傅氏凤尾蕨和狭眼凤尾蕨的rps4-trnS区序列未表现出明显差异。结合两者孢子体和配子体形态发育特征以及rps4-trnS区序列的证据,认为傅氏凤尾蕨和狭眼凤尾蕨为同种或为变种关系。