基于trnK基因的葱属植物分子系统研究

在形态和细胞分类研究的基础上选择产于中国的9组47种葱属植物(含外类群5种),运用PCR方法扩增叶绿体trnK基因,选择26种限制性内切酶对PCR扩增片段进行了RFLP分析.结果表明:trnK基因的PCR产物在各分类群间几乎不存在长度变异,约为2 520 bp,PCR扩增片段酶切后,共得到247个变异位点,其中信息位点201个.运用PAU P 4.0 B 10.0和M EGA 3.1软件进行分析,构建葱属系统发育的D o llo和W agner最简约(M P)树及邻接(N J)树.分析表明:(1)宽叶组类群组成比较自然的单系群,洋葱组和葱组也各自形成独立分枝,表明这3个组的划分是比较自然的.多籽组和合被组在本次分析中形成1个单系群,表明这2个组具有较密切的亲缘关系.而粗根组、根茎组和单生组的划分是不自然的,需进一步研究后作适当的调整.粗根组的类群在trnK基因的RFLP分析中,得到很好的分辨,可按其染色体基数分为3个大的类群.(2)中国葱属植物可以划分为6个亚属的新等级,在各亚属下可以再分组.(3)本文还对葱属的种间亲缘、进化关系等问题进行了讨论.

trnK基因5′端内含子区序列在榆科(广义)系统发育研究中的应用

本文测定了广义榆科Ulmaceaes.l.及其近缘类群的trnK基因 5′端内含子区序列。在尝试利用该内含子区进行榆科系统发育研究的同时 ,探讨了其在植物系统学研究中的应用前景。利用PAUP软件进行的系统发育分析仅得到 1棵最简约树。该简约树的树长为 6 6 5步 ,其一致性指数 (CI)和保持性指数(RI)分别为 0 .771 4和 0 .796 5。分析结果表明 :广义榆科为多系群 ;狭义榆科Ulmaceaes.str.为荨麻目Urticales其他类群的姊妹群 ;大麻科Cannabacea嵌在朴科Celtidacea中 ,即朴科为一并系群 ;系统位置有争议的 2个属———白颜树属Gironniera和糙叶树属Aphananthe与朴科类群聚为一支。本研究还表明trnK基因 5′端内含子区序列分析在植物较低分类等级 (如近缘属间 ,属下种间 )

6种川产姜黄属药用植物叶绿体trnK基因序列变异分析及其分子鉴定(英文)

目的 建立 6种川产姜黄属 (Curcuma)药用植物快速简单的分子鉴定方法。方法 采用叶绿体赖氨酸tRNA基因 (trnK)测序与序列变异分析方法。结果 6种姜黄属药用植物 (包括姜黄C .longa、莪术C .phaeocaulis、川郁金C .sichuanensis、川郁金C .chuanyujin、川黄姜C .chuanhuangjiang、川莪术C .chuanezhu)完整trnK基因长度在2 6 99～ 2 70 5bp。序列可变区包括matK基因编码区和trnK外显子与matK内含子之间区域 ,共有 6个单核苷酸多态性 (SNPs)位点、1个 9 bp的缺失重复序列和 2个 4 bp、14 bp插入重复序列。结论 trnK基因序列可变位点可以作为6种川产姜黄属药用植物快速简单的分子鉴定标记 。

中国葱属系统发育的PCR-RFLP分析

在综合形态分类和细胞分类的基础上，从国产葱属的全部９个组中，选择１８个代表种（含外类群）运用ＰＣＲ方法，分别扩增出ｔｒｎＫ和ｒｐＬ１６两个叶绿体基因片段．用２６种限制性内切酶对其进行酶切分析，共获得３０３个酶切变异位点，其中１６３个为信息位点．运用 ＰＡＵＰ（Ｖｅｒｓｉｏｎ ３．１．１）等软件对所得数据分析表明：葱属可以分为 ６个亚属级的分类阶元，宽叶组的划分是合理的；根茎组、单生组和洋葱组均是不自然的分类群，属下组的划分应作相应调整．对葱属属下分类系统进行了讨论。