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微管蛋白α-1B在泛癌中的表达及临床意义
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作者 刘艺 周晔禄 +3 位作者 贺文芳 卢瑗瑗 赵晓迪 吴开春 《空军军医大学学报》 CAS 2024年第3期282-291,共10页
目的利用生物信息学分析系统阐述微管蛋白α-1B(TUBA1B)与泛癌特征的关系。方法利用TCGA数据库中的肿瘤患者临床资料,从表达水平、疾病分期、预后、基因突变特征、免疫浸润水平和基因富集分析6个方面探讨TUBA1B与各种肿瘤类型的相关性... 目的利用生物信息学分析系统阐述微管蛋白α-1B(TUBA1B)与泛癌特征的关系。方法利用TCGA数据库中的肿瘤患者临床资料,从表达水平、疾病分期、预后、基因突变特征、免疫浸润水平和基因富集分析6个方面探讨TUBA1B与各种肿瘤类型的相关性。结果TUBA1B的表达水平在多数肿瘤中高于癌旁(P<0.05),在包括侵袭性乳腺癌等14种肿瘤中具有早期诊断价值(P<0.05),在肾上腺皮质癌等3种肾脏肿瘤中具有晚期进展监测价值(P<0.05),且高表达TUBA1B在多种肿瘤预示较差预后(P<0.05)。免疫浸润分析提示TUBA1B与泛癌中多数免疫浸润细胞及多种免疫相关基因表达呈正相关(P<0.05)。基因富集分析表明TUBA1B可能通过调控细胞周期、DNA损伤修复、有丝分裂等生物学过程参与肿瘤发生发展。结论TUBA1B参与了多种肿瘤的发生发展和免疫浸润,可作为泛癌的肿瘤标志物和潜在的药物靶点。 展开更多
关键词 微管蛋白α-1 泛癌 肿瘤免疫
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探索结直肠癌血清外泌体有效分子标志物 被引量:1
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作者 杨钊 邹鲁飞 《生物医学工程与临床》 CAS 2023年第6期785-795,共11页
目的基于血清外泌体数据结合加权基因共表达算法(WGCNA)和蛋白-蛋白互作分析(PPI)筛选结直肠癌(CRC)患者有效血清标志物,为预测CRC的发生提供帮助。方法从外泌体数据库(http://www.exorbase.org/)中下载健康人群和CRC患者血清外泌体基... 目的基于血清外泌体数据结合加权基因共表达算法(WGCNA)和蛋白-蛋白互作分析(PPI)筛选结直肠癌(CRC)患者有效血清标志物,为预测CRC的发生提供帮助。方法从外泌体数据库(http://www.exorbase.org/)中下载健康人群和CRC患者血清外泌体基因表达数据,采用WGCNA和PPI对由118例健康人群和35例CRC患者组成的数据集进行分析,并利用外部的癌症基因组图谱(TCGA)数据库、GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)数据库中GSE192667和GSE24549数据集、R2预后平台(https://hgserver1.amc.nl/cgi-bin/r2/main.cgi)、CancerSEA(http://biocc.hrbmu.edu.cn/CancerSEA/)单细胞数据集和TIMER(https://cistrome.shinyapps.io/timer/)网站分析和验证核心分子。结果外泌体数据库中CRC患者较健康人群上调基因有5078个,下调基因有13004个。基于WGCNA和PPI算法获得了甘油醛3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)和微管蛋白α-1B基因(TUBA1B)作为核心分子。并通过内部数据集验证GAPDH和TUBA1B表达与CRC发生相关,可以作为有效的血清外泌体分子标志物。同时,外部TCGA数据集中上述两个基因在肿瘤组织中均高表达,在R2生存平台中高表达GAPDH和TUBA1B患者预后更差。同时在GSE192667和GSE24549数据集也获得了相似的结果。基于GSE192667数据集构建并验证了生存风险模型[生存风险模型得分=GAPDH表达量×0.0015+TUBA1B表达量×(-0.0002)]。利用CancerSEA网站和TIMER网站并结合基因集富集分析(GSEA)发现核心分子涉及了多个肿瘤相关通路和功能。结论利用血清外泌体数据库结合WGCNA和PPI算法,筛选获得的GAPDH和TUBA1B可以作为CRC患者有效的血清外泌体分子标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 血清外泌体 基因加权共表达算法(WGCNA) 甘油醛3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH) 微管蛋白α-1b基因(TUbA1b)
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Therapeutic effect of combined use of interferon alpha-1b,interleukin-2 and thalidomide on reversing minimal residual disease in acute myeloid leukemia
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作者 米瑞华 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2019年第2期118-119,共2页
Objective To explore the effect of combination regimenof interferon alpha-1b,interleukin-2 and thalidomide(ITI regimen) on minimal residual disease (MRD)in patients with acute myeloid leukemia ( AML) whowere in hemato... Objective To explore the effect of combination regimenof interferon alpha-1b,interleukin-2 and thalidomide(ITI regimen) on minimal residual disease (MRD)in patients with acute myeloid leukemia ( AML) whowere in hematologic remission but MRD-positive. MethodsEighteen patients (17 from Tumor Hospital of ZhengzhouUniversity and 1 from the First People's Hospital ofPingdingshan City) with AML admitted from July 2016 toJune 2018,who were in hematologic remission but MRDpositivewere treated with different doses of ITI regimen,and the MRD levels were monitored. Results Among 18patients who received a conventional dose of ITI regimenfor 1 to 2 months,7 patients had undetectable MRD,3had significant decrease in MRD levels,3 had elevatedMRD level and had hematologic recurrence. Three patientswith elevated MRD level received a higher dose ofITI regimen,2 of them turned to MRD negative and theother 1 patient had decreased MRD level. 展开更多
关键词 AML ITI THERAPEUTIC effect INTERFERON alpha-1b
原文传递
联合肝癌患者病理和预后相关蛋白数据构建肝癌预后决策树模型 被引量:3
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作者 汪泓 阳霞 张红雁 《安徽医学》 2020年第3期261-268,共8页
目的利用肝癌患者临床病理信息和预后相关蛋白数据,采用决策树方法构建肝癌预后模型。方法从TCGA数据库中获得肝癌组织反相蛋白质阵列,使用LASSO逻辑回归筛选Tubulinα-1B、PAI-1和B-raf蛋白为肝癌候选预后标志物。采用免疫组化分析中... 目的利用肝癌患者临床病理信息和预后相关蛋白数据,采用决策树方法构建肝癌预后模型。方法从TCGA数据库中获得肝癌组织反相蛋白质阵列,使用LASSO逻辑回归筛选Tubulinα-1B、PAI-1和B-raf蛋白为肝癌候选预后标志物。采用免疫组化分析中山大学肿瘤防治中心775例肝癌患者癌组织中Tubulinα-1B、PAI-1和B-raf蛋白表达。使用决策树方法鉴定肝癌患者临床病理信息和预后相关蛋白表达数据在预测肝癌预后中的重要性并进行预后分层。结果决策树模型的分叉节点分别为TNM分期、Tubulinα-1B、肿瘤大小和血管浸润。该模型可进行肝癌预后高、中、低风险分层,其在544例肝癌患者的训练队列中特异度为72.8%,在231例肝癌患者的验证队列中特异度为74.1%。结论联合肝癌患者病理和预后相关蛋白数据,利用决策树方法构建的肝癌预后模型可区分肝癌患者预后风险,有助于临床制定个体化医疗方案。 展开更多
关键词 tubulinα-1b PAI-1 b-RAF 临床病理信息 决策树 预后模型 肝细胞癌
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