期刊文献+
共找到14篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
DMD基因c.2622+2T>C导致假肥大型肌营养不良的时空表达特异性分析
1
作者 张李钰 车凤玉 +3 位作者 王国霞 李本昌 莫丽党芝 杨颖 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期153-161,共9页
目的:对一例假肥大型肌营养不良(DMD)患儿进行基因变异分析,探究基因型和临床表型的相关性。方法:采集家系成员的临床数据和家族史,采用多重连接探针扩增技术(MLPA)检测目标基因拷贝数变异是否异常、全外显子组测序(WES)分析先证者致病... 目的:对一例假肥大型肌营养不良(DMD)患儿进行基因变异分析,探究基因型和临床表型的相关性。方法:采集家系成员的临床数据和家族史,采用多重连接探针扩增技术(MLPA)检测目标基因拷贝数变异是否异常、全外显子组测序(WES)分析先证者致病基因、Sanger测序验证可疑位点。针对发现的剪切位点突变构建mini-gene表达载体,采用mRNA体外剪接mini-gene实验验证变异对mRNA剪切的影响。结果:该家系先证者男,双下肢无明显受累,外周血肌酸激酶(CK)水平升高(700-1600U/L),肌电图示肌源性损害。MLPA检测未发现受检者DMD基因存在外显子拷贝数变异。测序结果显示先证者携带DMD基因(NM_004006.2)c.2622+2T>C母源剪切变异。体外mini-gene实验发现该变异影响剪切且产生多种新转录本。结合患儿临床表现及基因检测结果,推测受检者为DMD基因剪切变异导致的假肥大型肌营养不良。结论:本研究明确了DMD基因剪切变异为一例DMD患儿致病原因,进一步丰富了中国DMD突变谱,证实了DMD基因c.2622+2T>C变异可产生多种转录本导致不同的功能受损,对患者临床表现与基于时空表达相关联,有一定的基因型-表型对应关系的参考意义。 展开更多
关键词 肌营养不良蛋白基因 剪切变异 Mini-gene技术 假肥大型肌营养不良
下载PDF
uPA-uPAR拼接结合变化与肝硬化患者恶变趋势的相关性研究
2
作者 周英群 吕小平 +2 位作者 李山 覃锦耀 詹灵凌 《现代检验医学杂志》 CAS 2013年第5期75-76,80,共3页
目的 探讨引起尿激酶型纤溶酶原激活物及其可溶型受体比值(uPA/suPAR)及uPA-uPAR拼接结合的变化与肝硬化恶变趋势的相关性.方法 选择2008年8月~2010年4月肝硬化初诊患者133例,经3年随访后分为病情稳定组和恶变组,应用酶联免疫法(EL... 目的 探讨引起尿激酶型纤溶酶原激活物及其可溶型受体比值(uPA/suPAR)及uPA-uPAR拼接结合的变化与肝硬化恶变趋势的相关性.方法 选择2008年8月~2010年4月肝硬化初诊患者133例,经3年随访后分为病情稳定组和恶变组,应用酶联免疫法(ELISA)检测其血浆中uPA和suPAR水平,采用免疫组化法检测初诊患者、恶变组的uPA及其受体(uPAR)在组织中的表达.结果 肝硬化恶变组uPA/suPAR值较稳定组患者有显著升高,差异有统计学意义(t=5.626,P=0.00〈0.05);肝硬化初诊患者与稳定组比较差异无统计学显著性意义(t=1.19,P=0.24〉0.05).uPA和uPAR在恶变组患者组织中的阳性表达率比初诊患者明显增高,比较差异均有统计学意义(χ2=5.443~6.091,P值均〈0.05).结论 uPA/suPAR比值的变化可能存在uPA-uPAR拼接变异体结合的改变,其与肝硬化患者恶变趋势密切相关. 展开更多
关键词 肝硬化 尿激酶型纤溶酶原激活物 尿激酶型纤溶酶原激活物可溶型受体 upa-upar拼接变异
下载PDF
一个罕见智力发育障碍家系的临床特征及基因变异分析
3
作者 王舒月 杨文柯 +3 位作者 杨科 宋雅倩 郭正隆 廖世秀 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第4期511-515,共5页
目的:分析一个罕见智力发育障碍家系的临床特征和致病基因变异。方法:收集某智力发育障碍家系中4个成员的临床资料,提取各成员的外周血DNA和RNA,采用全外显子组测序和Sanger测序进行基因变异的筛查和验证。结果:该家系先证者表现为重度... 目的:分析一个罕见智力发育障碍家系的临床特征和致病基因变异。方法:收集某智力发育障碍家系中4个成员的临床资料,提取各成员的外周血DNA和RNA,采用全外显子组测序和Sanger测序进行基因变异的筛查和验证。结果:该家系先证者表现为重度智力发育障碍、语言运动发育迟缓、大头畸形、高额头和小下颌等,检测到TRIO基因c.4084T>C(p.Y1362H)新发变异;该变异可使高度保守的1362位上的氨基酸由酪氨酸变成组氨酸,导致蛋白质鸟嘌呤核苷酸交换因子1结构域的破坏。先证者姐姐表现为轻度智力发育障碍、小头畸形、眼距宽等,检测到TRIO基因c.2046+1G>T新发变异;该变异可导致剪接位点的破坏,使mRNA第11号外显子多出5个碱基,预测会产生一个含有724个氨基酸的截短蛋白。其父母表型正常,TRIO基因均为野生型。结论:TRIO基因c.4084T>C和c.2046+1G>T可能是该家系的潜在致病变异。 展开更多
关键词 智力发育障碍 TRIO基因 全外显子组测序 剪接变异 新发变异
下载PDF
小型猪肝脏细胞色素P450基因CYP3A29克隆与序列分析 被引量:8
4
作者 商海涛 杨家大 +1 位作者 魏泓 桂蓓 《畜牧与兽医》 北大核心 2008年第5期21-25,共5页
设计引物通过RT-PCR扩增巴马香猪和贵州小型猪香猪药物代谢关键P450基因CYP3A29基因的全长编码区,纯化并克隆入pMD 18-T载体,通过序列测定和比对分析其序列变异情况。17头小型猪共发现CYP3A29基因的5个单核苷酸变异位点,均表现为同义替... 设计引物通过RT-PCR扩增巴马香猪和贵州小型猪香猪药物代谢关键P450基因CYP3A29基因的全长编码区,纯化并克隆入pMD 18-T载体,通过序列测定和比对分析其序列变异情况。17头小型猪共发现CYP3A29基因的5个单核苷酸变异位点,均表现为同义替换,对编码的氨基酸序列无影响;猪CYP3A29的单核苷酸变异和品系相关,在不同品系中可表现出品系特有的单核苷酸变异;贵州小型香猪G3 a2902发现1个可变剪接,缺失89 bp并产生移码,改变编码蛋白。本研究克隆的巴马香猪和贵州小型香猪CYP3A29基因及其序列变异情况,可为其作为药物代谢模型的应用提供技术资料。 展开更多
关键词 细胞色素P450 小型猪 CYP3A29 变异 可变剪接
下载PDF
钢框架带悬臂梁段拼接节点非线性分析 被引量:4
5
作者 常鸿飞 夏军武 孙冬明 《结构工程师》 2011年第2期57-62,共6页
利用平面杆件结构变分方法,考虑材料的非线性,分别对拼接等强型和拼接削弱型带悬臂梁段拼接节点进行分析,得到两类节点的承载力及弹塑性变形的表达式。为了验证解析方程的可靠性,以某6层钢框架的边节点为原型,确定BASE节点的相关构造参... 利用平面杆件结构变分方法,考虑材料的非线性,分别对拼接等强型和拼接削弱型带悬臂梁段拼接节点进行分析,得到两类节点的承载力及弹塑性变形的表达式。为了验证解析方程的可靠性,以某6层钢框架的边节点为原型,确定BASE节点的相关构造参数,削弱其等强拼接进而得到WBS节点的设计参数。对两节点分别进行有限元分析和理论求解,对比发现理论解和有限元解吻合较好,表明所作非线性分析得到的方程可以用于该类型节点单向加载的分析。 展开更多
关键词 钢框架 带悬臂梁段拼接节点 非线性 变分 有限元
下载PDF
ACAD9基因新发变异致线粒体复合物Ⅰ缺乏症20型1例报告并文献复习
6
作者 崔清洋 曹银利 +3 位作者 唐成和 韩炜 王卫卫 贾倩芳 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期538-541,共4页
目的提高对线粒体复合物Ⅰ缺乏症20型(MC1DN20)临床表型及基因型的认识。方法回顾分析1例MC1DN20患儿的临床资料并复习相关文献。结果男性患儿,出生后即表现为精神及反应差,顽固性代谢性酸中毒及高乳酸血症和肝脏增大。全外显子基因测... 目的提高对线粒体复合物Ⅰ缺乏症20型(MC1DN20)临床表型及基因型的认识。方法回顾分析1例MC1DN20患儿的临床资料并复习相关文献。结果男性患儿,出生后即表现为精神及反应差,顽固性代谢性酸中毒及高乳酸血症和肝脏增大。全外显子基因测序发现ACAD9基因变异,c.1278+1G>A为母源性剪切变异,c.895 A>T为父源性错义变异;线粒体基因二代测序及MLPA未发现受检者有临床意义的线粒体基因变异及大片段变异。结论发现导致MC1DN20的新的线粒体核基因ACAD9的c.1278+1G>A剪切变异和c.895 A>T错义变异。 展开更多
关键词 线粒体复合物Ⅰ缺乏症20型 ACAD9基因 剪切变异 错义变异
下载PDF
F5基因复合杂合变异导致遗传性凝血因子Ⅴ缺陷症的家系分析 被引量:1
7
作者 程晓丽 杨婷 +4 位作者 杨柳 辛毅娟 何睦 朱琳 刘家云 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第17期1323-1327,共5页
目的对1个遗传性凝血因子Ⅴ(FⅤ)缺陷症家系进行基因变异分析,探讨其分子发病机制。方法先证者,女,32岁,自幼易鼻出血,通常自愈,2021年3月10日因摔伤致膝盖血肿到空军军医大学第一附属医院就诊。其家系成员均表示无出血等相关病史。采... 目的对1个遗传性凝血因子Ⅴ(FⅤ)缺陷症家系进行基因变异分析,探讨其分子发病机制。方法先证者,女,32岁,自幼易鼻出血,通常自愈,2021年3月10日因摔伤致膝盖血肿到空军军医大学第一附属医院就诊。其家系成员均表示无出血等相关病史。采用凝固法检测凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)和凝血因子Ⅴ活性(FⅤ:C)。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测FⅤ抗原(FⅤ:Ag)。采用Sanger测序法测定F5基因所有外显子及侧翼序列。采用ClustalX-2.1-win、PolyPhen-2及Swiss-PdbViewer软件分析错义变异位点的保守性、是否有害及其对蛋白质结构及功能的影响。采用MutationTaster及NetGene2软件分析剪切变异是否有害及其对剪切位点的影响。结果先证者PT和APTT延长为24.0 s和69.8 s,FⅤ:C和FⅤ:Ag分别降低为6%和9%;其F5基因存在复合杂合变异,分别为6号外显子c.911G>A杂合错义变异,导致p.Gly276Glu变异;15号内含子c.5208+1G>A杂合错义变异。先证者父亲和女儿携带p.Gly276Glu杂合变异;母亲和儿子携带c.5208+1G>A杂合变异。软件分析结果表明,p.Gly276Glu杂合变异的Gly276在同源物种间保守,该变异有害,会影响蛋白局部结构及功能;c.5208+1G>A杂合变异为有害变异,且变异导致剪切位点消失,从而影响蛋白功能。结论p.Gly276Glu和c.5208+1G>A复合杂合变异是与患者疾病相关的有害变异,可能是该家系遗传性FⅤ缺陷症的分子发病机制。 展开更多
关键词 凝血因子Ⅴ 错义变异 剪切位点变异 遗传性凝血因子Ⅴ缺陷症
原文传递
大鼠大脑中动脉阻塞模型皮层mRNAome、lncRNAome结构变异与表达分析
8
作者 袁珊 杨玉莹 +3 位作者 许梅梅 胡广泽 唐娟 高蕊 《山东大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2023年第11期27-37,共11页
目的通过深度测序技术获得响应脑缺氧、缺血应激的mRNAome与lncRNAome结构变异与基因表达的基础数据,为缺血性脑卒中临床应用研究提供可用的靶标基因以及分子标志物。方法采用线栓法构建大鼠缺氧、缺血以及再灌注损伤模型,脑切片TTC染... 目的通过深度测序技术获得响应脑缺氧、缺血应激的mRNAome与lncRNAome结构变异与基因表达的基础数据,为缺血性脑卒中临床应用研究提供可用的靶标基因以及分子标志物。方法采用线栓法构建大鼠缺氧、缺血以及再灌注损伤模型,脑切片TTC染色以及行为学评分法评估模型。采用深度测序技术对皮层样本全转录组进行测序,采用生物信息学方法分别鉴定与筛选转录本、转录本结构变异以及差异表达的基因,采用qRT⁃PCR方法验证差异基因的表达。结果应用Longa法构建大鼠MCAO模型。缺血缺氧处的脑组织在TTC染色后呈现苍白色,与非梗死区域的红润颜色形成鲜明的对比。高通量测序共产生108.54 G大小的测序数据,分别鉴定出30829个mRNA和31183个lncRNA转录本。MCAO组全转录组所产生的SNP、Indel总数显著低于对照Sham组,而mRNA的Indel数目则相对保守,在两组间差异并无统计学意义。mRNA可变剪切体数目显著多于ln⁃cRNA,但mRNA和lncRNA转录本的可变剪切体总数目在两组间差异无统计学意义。本研究筛选出2608个mRNA和551个lncRNA在两组间表达差异存在统计学意义,挑选了9个已被证明响应缺血缺氧而表达上升的已知基因作为双盲测试子,经检索后发现该9个上调基因全部落在2608个差异表达的基因数据集中,qRT⁃PCR结果进一步证实该9个基因表达量趋势亦同测序数据表达趋势,说明测序数据较为准确、可靠。结论一部分影响转录本加工与剪切的mRNA与lncRNA在缺氧缺血以及再灌注损伤后活化,可能抑制了部分转录本的转录以及RNA编辑与加工的能力,进而影响了缺血性脑卒中关键靶基因的表达。 展开更多
关键词 大脑中动脉阻塞 MRNA lncRNA 结构变异 可变剪切
原文传递
菜心BcFLC1的SNP变异与选择性剪接 被引量:1
9
作者 陶鹏 赵彦婷 +3 位作者 钟新民 岳智臣 雷娟利 李必元 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第22期7429-7435,共7页
为探讨菜心极易抽薹开花的分子机制,本研究以早熟类型的‘四九菜心’为研究材料,参考大白菜基因组分析了菜心开花抑制基因BcFLC1的转录组SNP情况,鉴定了3个纯合SNP位点。其中一个SNP定位在6号内含子(I6)的剪接供体位点"GT"上... 为探讨菜心极易抽薹开花的分子机制,本研究以早熟类型的‘四九菜心’为研究材料,参考大白菜基因组分析了菜心开花抑制基因BcFLC1的转录组SNP情况,鉴定了3个纯合SNP位点。其中一个SNP定位在6号内含子(I6)的剪接供体位点"GT"上,在菜心中突变为"AT"。研究发现菜心BcFLC1剪接位点变异导致其在pre-mRNA加工中发生了选择性剪接,产生了6种剪接异构体,并分析了每种剪接方式的频率。预测了菜心6种BcFLC1剪接异构体的蛋白产物,显示这些蛋白产物均异常,缺失6号或7号外显子以及氨基酸片段的插入。最后比较了大白菜、结球甘蓝以及菜心中FLC1的SNP变异与选择性剪接。本研究分析了菜心BcFLC1的SNP变异及其诱导的选择性剪接的特征,为阐释了菜心极易抽薹开花的分子机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 菜心(Brassica papachinensis) BcFLC1 SNP变异 选择性剪接
原文传递
菜心光敏色素B基因BcPHYB的鉴定与分析 被引量:1
10
作者 岳智臣 陶鹏 +2 位作者 赵彦婷 雷娟利 李必元 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第17期5570-5575,共6页
菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花,为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制,本研究以‘四九菜心’为材料,利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素B基因(BcPHYB)。通过构建系统树,发现菜心BcPHYB类似于早花大白菜BraPHYB2,并... 菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花,为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制,本研究以‘四九菜心’为材料,利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素B基因(BcPHYB)。通过构建系统树,发现菜心BcPHYB类似于早花大白菜BraPHYB2,并且在5’UTR中存在20 bp的InDel。菜心BcPHYB在pre-mRNA加工中存在着选择性剪接,一部分转录本会保留1号、2号或3号内含子,导致相应的BcPHYB蛋白产物中插入或者缺失部分氨基酸序列片段。本研究分析了菜心BcPHYB的InDel变异与选择性剪接情况,为阐释菜心对光周期不敏感的开花分子机制提供了帮助。 展开更多
关键词 菜心(Brassica parachinensis) BcPHYB InDel变异 选择性剪接
原文传递
Fine-Tuning of MiR528 Accumulation Modulates Flowering Time in Rice 被引量:15
11
作者 Rongxin Yang Pingchuan Li +9 位作者 Hailiang Mei Dong Wang Jing Sun Chao Yang Lili Hao Shouyun Cao Chengcai Chu Songnian Hu Xianwei Song Xiaofeng Cao 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2019年第8期1103-1113,共11页
In plants,microRNA (miRNA) functions in the post-transcriptional repression of target mRNAs have been well explored.However,the mechanisms regulating the accumulation of miRNAs remain poorly under.stood.Here,we report... In plants,microRNA (miRNA) functions in the post-transcriptional repression of target mRNAs have been well explored.However,the mechanisms regulating the accumulation of miRNAs remain poorly under.stood.Here,we report that distinct mechanisms regulate accumulation of a monocot-specific miRNA,rice (Oryza sativa) miR528.At the transcriptional level,miR528 accumulated to higher levels in older plants than in young seedlings and exhibited aging-modulated gradual accumulation and diurnal rhythms in leaves;at the post-transcriptional level,aging also modulated miR528 levels by enhancing pri-miR528 alter.native splicing.We found that miR528 promotes rice flowering under long-day conditions by targeting RED AND FAR-RED INSENSITIVE2 (OsRFI2).Moreover,natural variations in the MIR528 promoter region caused differences in miR528 expression among rice varieties,which are correlated with their different binding affinities with the transcription factor OsSPL9 that activates the expression of miR528.Taken together,our findings reveal rice plants have evolved sophisticated modes fine-tuning miR528 levels and provide insight into the mechanisms that regulate MIRNA expression in plants. 展开更多
关键词 miRNA OsSPL9 ALTERNATIVE splicing POST-TRANSCRIPTIONAL regulation Natural variation FLOWERING
原文传递
假肥大型肌营养不良症(DMD/BMD)遗传学诊断及剪接突变的致病性分析(英文) 被引量:4
12
作者 Yan-mei YANG Kai YAN +7 位作者 Bei LIU Min CHEN Li-ya WANG Ying-zhi HUANG Ye-qing QIAN Yi-xi SUN Hong-ge LI Min-yue DONG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2019年第9期753-771,共19页
目的:针对100例无亲缘关系的假肥大型肌营养不良症(DMD/BMD)患者,联合应用多种检测技术进行遗传学诊断,并且建立个体化产前诊断及胚胎植入前遗传学诊断方案,以最大限度地降低DMD/BMD患儿的出生。创新点:通过minigene剪接实验分析DMD:c.1... 目的:针对100例无亲缘关系的假肥大型肌营养不良症(DMD/BMD)患者,联合应用多种检测技术进行遗传学诊断,并且建立个体化产前诊断及胚胎植入前遗传学诊断方案,以最大限度地降低DMD/BMD患儿的出生。创新点:通过minigene剪接实验分析DMD:c.1149+1G>A和c.1150-2A>G突变是否导致剪接异常,并确定剪接方式。方法:收集100例无亲缘关系DMD/BMD患者的临床资料,应用多重连接依赖式探针扩增技术(MLPA)、第二代测序(NGS)、minigene剪接实验(HMSA)进行遗传学诊断,并通过单体型分析及性别鉴定进行胚胎植入前遗传学诊断。结论:联合应用多种检测技术可以尽早地对患者进行遗传学诊断,为临床遗传咨询和产前诊断及胚胎植入前遗传学诊断提供了科学依据。 展开更多
关键词 DMD基因 突变 遗传学诊断 剪接突变 Minigene剪接实验
原文传递
RNA剪接变异及致病机制——以单基因遗传疾病为例
13
作者 王佳佳 李茹 +2 位作者 任毅 王建红 杨静 《中国优生与遗传杂志》 2022年第1期9-13,共5页
RNA的正确剪接是基因正常表达的关键。近年来,随着第二代高通量测序技术的快速发展以及对变异解读的不断深入,发现相较于错义变异及无义变异,剪接变异的漏检率很高,并且越来越多的证据证实了剪接变异在遗传病发病机制中的重要性。本综... RNA的正确剪接是基因正常表达的关键。近年来,随着第二代高通量测序技术的快速发展以及对变异解读的不断深入,发现相较于错义变异及无义变异,剪接变异的漏检率很高,并且越来越多的证据证实了剪接变异在遗传病发病机制中的重要性。本综述简要概述了剪接的基础,并以几种单基因遗传病为例阐述剪接变异的致病机制,包括常见剪切变异类型及引起的mRNA效应,强调了剪接变异是引起单基因遗传病的重要机制,以期引起大家对剪接变异的关注,提高遗传病的诊断率。 展开更多
关键词 RNA剪接 单基因遗传病 剪接变异 选择性剪接
原文传递
一个COL11A1基因新剪接变异导致的先天性高度近视家系的遗传学分析
14
作者 余秀蓉 刘伊楚 +3 位作者 兰风华 李清琴 汤莹 王志红 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期893-896,共4页
目的 对1个先天性高度近视家系进行基因变异分析,探讨其致病原因.方法 对先证者进行全外显子组测序,应用Sanger测序验证可疑致病变异,并进行家系共分离分析.结果 基因测序显示先证者COL11A1基因存在c.2556+1G>A剪接位点杂合变异,家... 目的 对1个先天性高度近视家系进行基因变异分析,探讨其致病原因.方法 对先证者进行全外显子组测序,应用Sanger测序验证可疑致病变异,并进行家系共分离分析.结果 基因测序显示先证者COL11A1基因存在c.2556+1G>A剪接位点杂合变异,家系中另3例患者(先证者母亲和两个女儿)均存在c.2556+1G>A杂合变异,表型正常家系成员(先证者父亲、妹妹)均未发现该变异,表型与基因型在家系内共分离.经查阅OMIM、HGMD及Clinvar数据库,c.2556+1G>A变异为未报道过的新变异.根据ACMG遗传变异分类标准与指南,c.2556+1G>A变异符合PVS1+PM2,可以判定为可能致病性变异.结论 COL11A1基因c.2556+1G>A剪接变异可能是该家系患者的致病原因,致病性变异的检出为家系的遗传咨询和产前诊断提供了依据. 展开更多
关键词 COL11A1基因 剪接变异 先天性高度近视
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部