肾透明细胞癌组织VEPH1表达降低并与不良预后相关

目的:研究心室区表达PH域的蛋白质同源物1(ventricular zone-expressed PH domain-containing protein homolog 1,VEPH1)在肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)组织中的表达及其对患者预后的预测价值。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集KIRC数据集,下载VEPH1基因表达谱资料及临床信息资料。人类蛋白质图集数据库下载VEPH1免疫组化结果,比较肿瘤和正常组织中VEPH1蛋白表达。分析VEPH1表达与KIRC患者预后的关系。Cbioportal数据库分析VEPH1表达降低的原因。基因集富集分析(GSEA)方法预测KIRC组织中VEPH1 mRNA表达高低相关的通路。结果:KIRC肿瘤组织中VEPH1 mRNA与蛋白表达水平显著低于癌旁组织;且表达越低,患者总生存期越短。VEPH1 mRNA在KIRC患者肿瘤组织中表达降低,不是由基因的错译或者突变引起。高表达VEPH1的KIRC样本,在KEGG通路富集分析显示,VEPH1在多种氨基酸、糖以及脂肪代谢相关的通路上显著富集。结论:VEPH1在KIRC肿瘤组织中低表达,可能是通过影响肿瘤微环境多种代谢通路,进而影响患者的预后。