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High-Order Fully Discrete Energy Diminishing Evolving Surface Finite Element Methods for a Class of Geometric Curvature Flows
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作者 Beiping Duan Buyang Li Zhimin Zhang 《Annals of Applied Mathematics》 2021年第4期405-436,共32页
This article concerns the construction of high-order energy-decaying numerical methods for gradient flows of evolving surfaces with curvature-dependent energy functionals.The semidiscrete evolving surface finite eleme... This article concerns the construction of high-order energy-decaying numerical methods for gradient flows of evolving surfaces with curvature-dependent energy functionals.The semidiscrete evolving surface finite element method is derived based on the calculus of variation of the semidiscrete surface energy functional.This makes the semidiscrete problem naturally inherit the energy decay structure.With this property,the semidiscrete problem is furthermore formulated as a gradient flow system of ODEs.The averaged vector-field collocation method is used for time discretization of the ODEs to preserve energy decay at the fully discrete level while achieving high-order accuracy in time.Extensive numerical examples are provided to illustrate the accuracy and energy diminishing property of the proposed method,as well as the effectiveness of the method in capturing singularities in the evolution of closed surfaces. 展开更多
关键词 Gradient flow evolving surface curvature energy decay evolving surface finite element method averaged vector-field collocation
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高亏格膜泡形状(英文) 被引量:1
2
作者 解立强 郑飞 +1 位作者 朱杰西 张劭光 《现代生物医学进展》 CAS 2006年第9期66-68,共3页
溶液中流体相磷脂膜泡的平衡形状是由其弯曲弹性能决定的。我们用Surface Evolver软件找到了一个具体的模拟稳定膜泡形状的方法,对亏格为2的膜泡进行了研究。我们提供了具体的计算结果。
关键词 膜泡 亏格2 形状 surface evolver
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球形拓扑下对budding和multi-budding生物膜泡形状的研究 被引量:2
3
作者 王大艳 戴会利 +1 位作者 胡开福 张劭光 《现代生物医学进展》 CAS 2008年第1期172-173,共2页
流体相磷脂双分子层在水溶液中能自组织的形成球形拓扑的膜泡,膜泡的平衡形状是由其弯曲弹性能决定的。Budding是流体相磷脂双分子膜泡的一个显著的形状。从自发曲率(SC)模型的弯曲能量和双层(BC)模型的弯曲能量在参数替换情况下,我们... 流体相磷脂双分子层在水溶液中能自组织的形成球形拓扑的膜泡,膜泡的平衡形状是由其弯曲弹性能决定的。Budding是流体相磷脂双分子膜泡的一个显著的形状。从自发曲率(SC)模型的弯曲能量和双层(BC)模型的弯曲能量在参数替换情况下,我们看到自发曲率(SC)和双层(BC)模型具有相同的形状方程。本文从双层(BC)模型的相图出发,在双层(BC)模型下,通过建立一些与目标形状相近似的初始形状,在面积A,体积V和平均曲率的积分M的约束条件和使用约化量的情况下,经Surface Evolver软件的逐次细分并长时间演化,得到了一些budding和multi-budding型的生物膜泡形状。 展开更多
关键词 双层(BC)模型 surface evolver膜泡 形状
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基于自发曲率模型对几种极限形状膜泡及典型相变和分裂过程的研究 被引量:4
4
作者 周晓华 张劭光 +3 位作者 杨继庆 屈学民 刘渊声 王斯刚 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2007年第10期6137-6142,共6页
通过在SurfaceEvolver软件中建立一些具有多重对称性的初始形状,经逐次细分并长时间演化后,得到了几种能量很低的极限形budding形状,其参数与理论值一致.通过逐步调整参数并跟踪其演化途径,发现了一个不连续的相变和一个连续的可逆相变... 通过在SurfaceEvolver软件中建立一些具有多重对称性的初始形状,经逐次细分并长时间演化后,得到了几种能量很低的极限形budding形状,其参数与理论值一致.通过逐步调整参数并跟踪其演化途径,发现了一个不连续的相变和一个连续的可逆相变以及两种稳定的新形状,并且获得的海星形的两种分裂路径已被实验所证实. 展开更多
关键词 生物膜泡 曲率 surface evolver
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球形拓扑中复杂形状生物膜泡的获得及其稳定性分析 被引量:6
5
作者 周晓华 张劭光 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期5568-5574,共7页
通过在Surface Evolver软件中建立一些与目标形状相似的初始形状,经长时间演化后,得到了实验上已经观察到的具有D2h和D3h对称性的海星形生物膜泡.通过跟踪不同形状膜泡的Hessian矩阵的本征值,确定了双凹圆盘与海星形及哑铃形之间的相变... 通过在Surface Evolver软件中建立一些与目标形状相似的初始形状,经长时间演化后,得到了实验上已经观察到的具有D2h和D3h对称性的海星形生物膜泡.通过跟踪不同形状膜泡的Hessian矩阵的本征值,确定了双凹圆盘与海星形及哑铃形之间的相变是不连续的,其间所经历的三角扁盘及椭圆扁盘形中间相在SC模型中通常是不稳定的. 展开更多
关键词 SC模型 生物膜泡 surface evolver
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A Simple, Fast and Stabilized Flowing Finite Volume Method for Solving General Curve Evolution Equations
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作者 Karol Mikula Daniel Sevcovic Martin Balazovjech 《Communications in Computational Physics》 SCIE 2010年第1期195-211,共17页
A new simple Lagrangian method with favorable stability and efficiencyproperties for computing general plane curve evolutions is presented. The methodis based on the flowing finite volume discretization of the intrins... A new simple Lagrangian method with favorable stability and efficiencyproperties for computing general plane curve evolutions is presented. The methodis based on the flowing finite volume discretization of the intrinsic partial differentialequation for updating the position vector of evolving family of plane curves. A curvecan be evolved in the normal direction by a combination of fourth order terms relatedto the intrinsic Laplacian of the curvature, second order terms related to the curva-ture, first order terms related to anisotropy and by a given external velocity field. Theevolution is numerically stabilized by an asymptotically uniform tangential redistri-bution of grid points yielding the first order intrinsic advective terms in the governingsystem of equations. By using a semi-implicit in time discretization it can be numer-ically approximated by a solution to linear penta-diagonal systems of equations (inpresence of the fourth order terms) or tri-diagonal systems (in the case of the secondorder terms). Various numerical experiments of plane curve evolutions, including, inparticular, nonlinear, anisotropic and regularized backward curvature flows, surfacediffusion and Willmore flows, are presented and discussed. 展开更多
关键词 Geometric partial differential equations evolving plane curves mean curvature flow anisotropy Willmore flow surface diffusion finite volume method semi-implicit scheme tangen-tial redistribution
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