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基于AutoDock Vina筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶有效组分的研究 被引量:1
1
作者 陈千姿 王晨 +3 位作者 黄旺香 陈曦雅 和七一 余晓东 《蛇志》 2023年第2期137-143,共7页
目的基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分。方法使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon acutus)蛇毒金属蛋白酶进行分子对接,采用ADMET对较... 目的基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分。方法使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon acutus)蛇毒金属蛋白酶进行分子对接,采用ADMET对较高结合能组分进行毒性分析,筛选有效抑制组分。结果与阳性对照穿心莲内酯的对接结合能比较,从徐长卿中筛选出17种具有较高结合能的化合物。通过SwissADME预测毒性,确定10种潜在的无毒性化合物,分别为Cinatratoside B、Paniculatumoside D、Glacoside A、Cynapanoside A、Paeonolide、Paniculatumoside A、Cynatratoside A、Paniculatumoside B、GreenOil、1,6-Dimethylnaphthalene。结论基于AutoDock Vina虚拟筛选,从徐长卿中筛选出10种具有潜在抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶活性的化合物。 展开更多
关键词 尖吻蝮蛇 蛇毒 徐长卿 穿心莲内酯 AutoDock vina 金属蛋白酶
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基于Auto Dock Vina软件的药物化学虚拟仿真实验构建与应用 被引量:1
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作者 李爱杰 姚祖福 +3 位作者 刘建新 马洁瑶 赵峰 蒲洪 《广东化工》 CAS 2023年第16期237-240,共4页
目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容。因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣。本研究... 目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容。因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣。本研究通过提前发布学习视频、靶蛋白的下载与预处理、靶分子的结构获取与预处理、AutoDock vina参数设置与对接、Py MOL软件分析结果与图片制作以及学生PPT汇报结果等实验内容。该实验的实施将帮助学生掌握分子对接的基本技能,深入理解立体化学结构对药物与靶蛋白相互作用的影响,提高学生学习药物化学的兴趣,为AutoDock vina软件在药物化学教学中的应用提供参考。 展开更多
关键词 药物化学 AutoDock vina 分子对接 Oseltamivir carboxylate 神经氨酸酶
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Autodock Vina与Discovery Studio在虚拟筛选耐药蛋白抑制剂中的比较 被引量:17
3
作者 黄勇 陈晨 +2 位作者 张志毅 童贻刚 赵勇 《生物信息学》 2012年第4期248-253,共6页
随着大量与细菌耐药相关的基因的发现和其表达蛋白结构的成功测定,从已有的化合物中通过计算机模拟方法筛选对耐药蛋白靶点有作用的候选化合物,成为了药物发现的一个标准途径。虚拟筛选在耐药基因抑制剂的发现中可以提高效率、降低实验... 随着大量与细菌耐药相关的基因的发现和其表达蛋白结构的成功测定,从已有的化合物中通过计算机模拟方法筛选对耐药蛋白靶点有作用的候选化合物,成为了药物发现的一个标准途径。虚拟筛选在耐药基因抑制剂的发现中可以提高效率、降低实验成本。本文介绍了Autodock Vina和Discovery Studio在基于分子对接法的虚拟筛选中的使用,并对比分析其对β-内酰胺酶活性位点的筛选结果。希望通过这种比较促进虚拟筛选在药物设计领域中的应用,提高耐药基因抑制剂的发现速度。 展开更多
关键词 虚拟筛选 分子对接 AUTODOCK vina DISCOVERY STUDIO 抑制剂
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基于AutoDock vina软件的药物设计学课程教学案例设计——以虚拟筛选细菌RNA聚合酶抑制剂为例 被引量:5
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作者 谭相端 吕良 《广东化工》 CAS 2022年第11期222-224,共3页
在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDock vina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用PyMOL和LigPlot软件进行结果分析。该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物虚拟筛... 在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDock vina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用PyMOL和LigPlot软件进行结果分析。该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物虚拟筛选方法,认识小分子抑制剂与靶蛋白的作用机制,帮助学生更好理解药物分子设计,有效调动学生的学习积极性,达到了提高教学质量的目的。 展开更多
关键词 教学改革 分子对接 AutoDock vina软件 虚拟筛选 药物化学
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Vinaya School
5
作者 HUANG Chanhua 《The Voice of Dharma》 2021年第1期18-26,共9页
The Vinaya School is a school of Buddhism in China, of which the main object was the study, the propagation and the observance of the Vinaya rules. Its basic scripture was the Four-division-vinaya(or the Dharmaguptaka... The Vinaya School is a school of Buddhism in China, of which the main object was the study, the propagation and the observance of the Vinaya rules. Its basic scripture was the Four-division-vinaya(or the Dharmaguptaka-vinaya Sifenlü 四分律), one of the five classes of the Vinaya works, and so it was also known as the School of the Four-division-vinaya. 展开更多
关键词 四分律 vina SCHOOL
原文传递
烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接 被引量:1
6
作者 常延斌 王桂瑶 +5 位作者 奚家勤 杨萌萌 郭建华 李玉娥 梁伟 宋纪真 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期688-697,共10页
[目的]本文旨在利用分子对接技术研究烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接,以研发烟草甲新型驱避剂。[方法]利用AlphaFold2软件预测11个烟草甲气味结合蛋白(LserOBP)的三维结构,并以11个LserOBP为受体和文献报道的对烟草甲具有驱避... [目的]本文旨在利用分子对接技术研究烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接,以研发烟草甲新型驱避剂。[方法]利用AlphaFold2软件预测11个烟草甲气味结合蛋白(LserOBP)的三维结构,并以11个LserOBP为受体和文献报道的对烟草甲具有驱避作用的14种分子为配体,利用Autodock Vina软件进行分子对接研究。[结果]通过AlphaFold2构建的11个LserOBP的三维结构中,LserOBP2、LserOBP4、LserOBP5、LserOBP6、LserOBP8和LserOBP9与配体芦丁的结合位点位于α-螺旋形成的疏水腔中,与其他物种已解析出的OBP和配体间的结合位点相似。LserOBP1、LserOBP3、LserOBP5、LserOBP6和LserOBP8与茴香烯、对甲基苯异丙醇、3-蒈烯、肉桂酸甲酯、肉桂酸乙酯、避蚊胺、乙酸松油酯和芦丁均有较好的结合能力,这几种化合物具有开发为新型烟草甲驱避剂的应用前景。LserOBP与配体的结合能力可能与LserOBP的三维结构、配体的相对分子质量和其所含有的官能团有关。在一定的范围内,LserOBP与相对分子质量较大的配体结合能力更强。LserOBP可以与配体间形成疏水相互作用力、氢键、盐桥、π-π堆积和π-阳离子堆积,其中起主要作用的是疏水相互作用力和氢键,且苯丙氨酸、酪氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸、色氨酸、赖氨酸和丙氨酸可能在LserOBP行使识别、结合气味分子中发挥着重要作用。[结论]利用分子对接技术明确了烟草甲11个气味结合蛋白和14个驱避气味分子的相互作用关系,为开发烟草甲新型驱避剂奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草甲 气味结合蛋白 AlphaFold2 Autodock vina 分子对接
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计算机辅助药物筛选平台及应用 被引量:3
7
作者 宋新蕊 李达 +1 位作者 陈洁 赵勇 《生物信息学》 2014年第4期300-304,共5页
先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了Auto Dock Vina... 先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了Auto Dock Vina和多个小分子库,具有数据安全、计算与存储的负载均衡以及实时监控的特点。应用平台进行先导化合物筛选,在较短时间发现了有针对性的活性小分子化合物,命中率高,大大缩短先导化合物发现周期。该平台具有很好的实用性和良好的扩展性。 展开更多
关键词 虚拟筛选 超算平台 AUTO DOCK vina 化合物库 先导化合物发现
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实时荧光定量PCR检测宫颈癌患者血浆HPV的临床意义 被引量:6
8
作者 邵佳 陈曾燕 +1 位作者 王洁 马蓉 《中国肿瘤外科杂志》 CAS 2010年第5期288-291,共4页
目的分析实时荧光定量PCR检测血浆中人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16、18的可行性,并探讨其对宫颈癌诊断和预后评估的价值。方法收集2008年6月至2009年5月确诊的宫颈癌患者140例,癌前病变10例,以及正常对照者35例。采用改良... 目的分析实时荧光定量PCR检测血浆中人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)16、18的可行性,并探讨其对宫颈癌诊断和预后评估的价值。方法收集2008年6月至2009年5月确诊的宫颈癌患者140例,癌前病变10例,以及正常对照者35例。采用改良通用引物PGMY和PCR-反向点杂交法对宫颈活检组织进行HPV基因扩增与分型。应用real-time PCR方法检测血浆HPV16、18 DNA水平,观察HPV DNA的感染率和病毒含量,分析其与宫颈癌临床分期的相关性。结果在宫颈组织HPV16、18阳性患者中,血浆HPV感染率分别为57.9%和23.8%。随着宫颈癌临床病期的发展,血浆HPV16 DNA检出率逐渐增加(P<0.001),但病毒含量的变化无统计学意义(P=0.277)。血浆HPV18病毒检出率和病毒拷贝数与宫颈癌临床分期均无相关(P=0.609,P=0.512)。结论血浆HPV DNA定量检测是一种可靠的实验方法,对宫颈癌的诊断和预后监测具有重要价值。 展开更多
关键词 宫颈癌 人乳头瘤病毒 血浆DNA 实时荧光定量PCR
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张仲景辨治腹痛用药规律 被引量:1
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作者 马继征 刘绍能 +2 位作者 白宇宁 张秋云 姚乃礼 《吉林中医药》 2014年第6期565-567,共3页
《伤寒论》和《金匮要略》大量条文涉及腹痛的论治,根据腹痛的病因病机、疼痛性质、腹痛部位等特点,在选方用药、配伍禁忌、煎煮炮制、将养调理各环节,章法鲜明,进退有度。强调痛之部位,治有侧重,上腹多用清法,中腹多用温法、清泻法或... 《伤寒论》和《金匮要略》大量条文涉及腹痛的论治,根据腹痛的病因病机、疼痛性质、腹痛部位等特点,在选方用药、配伍禁忌、煎煮炮制、将养调理各环节,章法鲜明,进退有度。强调痛之部位,治有侧重,上腹多用清法,中腹多用温法、清泻法或清温并用,下腹(少腹)多用温补法、消法。同时重视甘药如饴糖、大枣、甘草等的应用,善用酒剂、虫类药及"毒"药,发挥其引经通络、破消积、除偏救弊的功用,临证时重视服药方式及药后调理可达事半功倍之效。充分体现了"用药如用兵"的艺术性。 展开更多
关键词 腹痛 《伤寒论》 《金匮要略》 张仲景 虫类药 酒剂
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反向虚拟筛选平台及应用
10
作者 张媛 刘雨桐 +3 位作者 李达 宋新蕊 周雪松 赵勇 《生物信息学》 2015年第4期251-256,共6页
靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法 Auto Dock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了... 靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法 Auto Dock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了平台的实用性和准确性。 展开更多
关键词 老药新用 毒副作用 反向虚拟筛选 AUTO DOCK vina
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汉传佛经中的“琉璃琴”初探——兼以云冈石窟第六窟“耶输陀罗入梦图”为例 被引量:2
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作者 李美燕 《艺术百家》 CSSCI 北大核心 2015年第6期161-165,共5页
佛教自东汉时期传入中国以后,汉传佛经的译述流行,其中有关于"琉璃琴"的记载,前人多以为佛教经文中的"琉璃琴"即是古印度的维那(vīnā),同时,在丝绸之路上的佛教洞窟所见的凤首箜篌,也是得自古印度维那的传承。文... 佛教自东汉时期传入中国以后,汉传佛经的译述流行,其中有关于"琉璃琴"的记载,前人多以为佛教经文中的"琉璃琴"即是古印度的维那(vīnā),同时,在丝绸之路上的佛教洞窟所见的凤首箜篌,也是得自古印度维那的传承。文章结合古印度佛教洞窟遗址图像,对照古印度维那及丝绸之路的佛教洞窟中的凤首箜篌来加以考察,并以云冈石窟第六窟的"耶输陀罗入梦图"为例,重新省思汉传佛经中"琉璃琴"与维那、凤首箜篌之间的关系。 展开更多
关键词 音乐艺术 佛教 琉璃琴 维那(vina) 凤首箜篌 音乐图像 音乐考古
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白藜芦醇酒剂对老龄小鼠MDA、SOD和GSH-P_X的影响 被引量:3
12
作者 周玲芝 《湖南中医药大学学报》 CAS 2010年第7期45-46,共2页
目的探讨白藜芦醇酒剂对老龄小鼠丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活力的影响。方法将60只昆明种老龄小鼠按4%溶血液MDA水平随机分为空白对照组,酒基对照组,白藜芦醇酒剂低、中、高剂量组,分别连续给药30d... 目的探讨白藜芦醇酒剂对老龄小鼠丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活力的影响。方法将60只昆明种老龄小鼠按4%溶血液MDA水平随机分为空白对照组,酒基对照组,白藜芦醇酒剂低、中、高剂量组,分别连续给药30d后,分别测定MDA含量、SOD和GSH-PX活力。结果与酒基对照组比较,高剂量组能显著降低血中MDA含量,差异具有统计学意义(P<0.05);能显著提高血清SOD活力,差异具有统计学意义(P<0.05);各剂量组对血清GSH-PX活力无明显影响(P>0.05)。结论白藜芦醇酒剂具有降低血液MDA含量,提高血清SOD活力的作用。 展开更多
关键词 白藜芦醇酒剂 老龄小鼠 丙二醛 超氧化物歧化酶 谷胱甘肽过氧化物酶
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基于分子对接研究甜菊醇、异甜菊醇对赤霉素受体GID1的作用机制
13
作者 张军 王杭 +2 位作者 于宁康 张珂 韩文龙 《中州大学学报》 2021年第6期117-121,共5页
开发安全的类赤霉素分子,用分子对接的方法分析甜菊醇、异甜菊醇与赤霉素受体GID1作用分子机制,阐明其结合自由能和相互作用关系,为进一步开发利用提供理论依据。通过检索文献确定赤霉素受体为GID1蛋白,以GA_(3)为对照物,利用AutoDock v... 开发安全的类赤霉素分子,用分子对接的方法分析甜菊醇、异甜菊醇与赤霉素受体GID1作用分子机制,阐明其结合自由能和相互作用关系,为进一步开发利用提供理论依据。通过检索文献确定赤霉素受体为GID1蛋白,以GA_(3)为对照物,利用AutoDock vina软件进行分子对接。结果表明,GA_(3)、甜菊醇、异甜菊醇与GID1蛋白的结合自由能分别为-11.10 kcal/mol,-10.81 kcal/mol,-11.26 kcal/mol,说明甜菊醇和异甜菊醇两种小分子都能与赤霉素受体GID1蛋白形成稳定结合,且异甜菊醇的作用效果强于赤霉素GA_(3)。 展开更多
关键词 赤霉素GA_(3) 甜菊醇 异甜菊醇 GID1蛋白 AutoDock vina
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Molecular Docking of the Inhibitory Activities of Triterpenoids of <i>Lonchocarpus cyanescens</i>against Ulcer
14
作者 Isaiah A. Adejoro Sodiq O. Waheed +1 位作者 Omolara O. Adeboye Frederick U. Akhigbe 《Journal of Biophysical Chemistry》 2017年第1期1-11,共11页
Ulcer is one of the life threatening diseases. It is an open sore on an external or internal surface of the body caused by a break in the skin or mucous membrane which fails to heal. In this work, specific ligands tha... Ulcer is one of the life threatening diseases. It is an open sore on an external or internal surface of the body caused by a break in the skin or mucous membrane which fails to heal. In this work, specific ligands that are suitable for ulcer have been studied computationally. Docking of the triterpenoids of Lonchocarpus cyanescens with target proteins of PDB codes 1AFC, 1AXM and 2AXM were performed using AutoDock Vina and Pymol for docking and post-docking analysis, respectively. In this study, the triterpenoid ligands with binding affinity/inhibitory constants -7.2/5.21, -6.5/16.99 and -6.2/28.20 for OH, and -6.7/12.12, -6.3/23.82 and -6.1/33.40 for OCH3 were compared with the standard ligands. Our study indicates that the results corresponding to triterpenoid ligands are close to standard ligands. 展开更多
关键词 ULCER Molecular Docking AUTODOCK vina Pymol Binding Affinity
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Apparent Densities of Stomoxys Species (Diptera, Muscidae) of Different Physiological Ages Caught with Vavoua Trap Differ With Landscape and Trapping Period
15
作者 Sevidzem S.Lendzele Koumba A.Aubin +2 位作者 Zinga-Koumba C.Roland Mintsa-Nguema Rodrigue Jacques F.Mavoungou 《Journal of Zoological Research》 2021年第1期9-14,共6页
Stable flies(Stomoxys spp.)are common pests of livestock in the peri-urban rangelands of Vina Division of the Adamawa Plateau.No documented information is available on their diurnal dynamics in relation to physiologic... Stable flies(Stomoxys spp.)are common pests of livestock in the peri-urban rangelands of Vina Division of the Adamawa Plateau.No documented information is available on their diurnal dynamics in relation to physiological age and landscape.The main aim of this study was to determine the trap apparent density(ADT)of Stomoxys and associate it to their diurnal activity rhythm and landscape.Vavoua traps(n=12)were used for Stomoxys collection.Trapping was carried out for seven days i.e.three days consecutively in August and four days consecutively in October,2016.Three traps were pitched in each of the three biotopes(river,cattle corral and gallery forest)of the four study sites(Galim,Mbidjoro,Velambai and Soukourwo).All female Stomoxys captured underwent ovarian dissection for the determination of their physiological ages(parous or nulliparous).A total of 218 Stomoxys were caught and identified into four species(S.niger niger,S.omega,S.calcitrans,and S.xanthomelas)with an overall ADT of 2.59 flies per trap per day and Stomoxys niger niger(1.13 s.n.n.per trap per day)recorded the highest ADT.Species richness was study site dependent.Higher catches of females 113(51.83%)were made than that of their male 105(48.17%)counterparts.Galim recorded the highest Stomoxys apparent density(4.90)as compared to other sites with a statistically significant difference(P<0.05).The proportion of parous 87(59.30%)was higher than that of their nulliparous 46(40.71%)counterparts.Parity differed with landscape and capture periods.S.n.niger was the most frequent in all biotopes and Galim recorded the highest ADT.The population of female flies was made up of adults(parous)with a bimodal diurnal activity rhythm whereas males had a unimodal activity rhythm. 展开更多
关键词 Abundance Parity LANDSCAPE Trapping period Stomoxys vina Cameroon
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基于网络药理学、分子对接及分子动力学探讨秦艽-桑枝治疗类风湿关节炎的机制 被引量:8
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作者 肖剑伟 蔡旭 +3 位作者 郭粉莲 黄新民 尹志华 汪荣盛 《湖南中医药大学学报》 CAS 2021年第6期859-868,共10页
目的通过网络药理学及分子对接、分子动力学探讨秦艽-桑枝治疗类风湿关节炎(RA)的活性成分、作用靶点及作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索秦艽、桑枝的成分及作用靶点基因;将药对的作用靶点与GeneCards数据库检索所... 目的通过网络药理学及分子对接、分子动力学探讨秦艽-桑枝治疗类风湿关节炎(RA)的活性成分、作用靶点及作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索秦艽、桑枝的成分及作用靶点基因;将药对的作用靶点与GeneCards数据库检索所得的疾病靶基因取交集;根据交集结果进行GO功能富集和KEGG通路分析;通过Cytoscape得出核心基因;并选择PTGS2、CASP3、RELA等靶基因与秦艽、桑枝的活性成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷运用AutoDock Vina进行分子对接;通过Gromacs软件进行分子动力学模拟。结果共筛选出秦艽-桑枝与RA共同靶基因90个。GO功能富集分析主要集中于对肿瘤坏死因子的反应、细胞调亡的调节、类固醇激素受体活性、肿瘤坏死因子受体超家族结合等。KEGG分析显示主要富集于TNF信号通路、调亡通路、IL-17信号通路、破骨细胞分化、类风湿关节炎等信号通路。分子对接及分子动力学结果显示药对的活性成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷能够与PTGS2、CASP3、RELA等靶基因紧密对接,形成稳定作用。结论秦艽、桑枝的有效成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷可能通过作用于PTGS2、CASP3等靶基因,影响炎症因子释放及RA滑膜成纤维细胞的凋亡而发挥治疗RA的作用。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 分子对接 秦艽 桑枝 分子动力学 信号通路
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酒剂和酊剂的常见质量问题及解决方法 被引量:1
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作者 邵金治 《河南中医学院学报》 2007年第5期21-22,共2页
从沉淀、浓度、色泽、固体等方面论述了质量问题及解决办法。
关键词 酒剂 酊剂 质量控制
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基于主成分分析、正交偏最小二乘判别分析及加权逼近理想解排序-灰色关联度融合模型评价不同产地珠子参质量
18
作者 李海燕 王慧然 +2 位作者 那丽莎 金春花 王加良 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3116-3126,共11页
目的采用HPLC法对珠子参Panax japonicus中多指标成分进行定量检测,建立主成分分析(principal component analysis,PCA)、正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)及加权逼近理想解... 目的采用HPLC法对珠子参Panax japonicus中多指标成分进行定量检测,建立主成分分析(principal component analysis,PCA)、正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)及加权逼近理想解排序-灰色关联度(technique for order preference by similarity to an ideal solution-grey relation analysis,TOPSIS-GRA)融合模型对不同产地珠子参进行质量评价,以提高珠子参药材整体质量控制水平。方法采用外标法测定珠子参中三七皂苷R1、人参皂苷Rg1、人参皂苷Re、人参皂苷Rb2、人参皂苷Rd2、竹节参皂苷V、楤木皂苷A、竹节参皂苷IVa、越南参皂苷R4、齐墩果酸、镰叶芹醇、豆甾醇和β-谷甾醇含量,定量检测条件为Agilent Eclipse Plus C18色谱柱,流动相乙腈-0.2%磷酸梯度洗脱,检测波长205 nm,柱温30℃。以珠子参中13种成分含量为变量,通过PCA降维获得主成分并实现对样品分组,在样品分组基础上采用OPLS-DA挖掘影响珠子参质量的差异性标志物。建立加权TOPSIS-GRA融合模型对不同产地珠子参综合质量进行评价。结果珠子参中13种成分在各自范围内线性关系良好(r>0.999),平均加样回收率为96.76%~100.06%(RSD<2.0%),精密度、稳定性和重复性试验结果符合《中国药典》2020年版规定。PCA结果显示前2个主成分特征值分别为9.757和1.976,累积方差贡献率为90.255%,15批珠子参聚为3组,呈现一定产地差异;OPLS-DA结果显示竹节参皂苷IVa、竹节参皂苷V、人参皂苷Rd2、β-谷甾醇、楤木皂苷A和人参皂苷Re是影响珠子参质量的差异性标志物。加权TOPSIS-GRA融合模型结果显示15批珠子参样品的平均相对贴近度(γi)为0.2613~0.7432,珠子参产品质量存在一定产地差异,同一产地差异较小,不同产地产品质量差异较大,同时聚类结果与PCA结果一致。结论建立的HPLC多指标成分定量控制方法操作便捷、结果准确,可用于珠子参中13种成分的同步检测;PCA、OPLS-DA及加权TOPSIS-GRA融合模型合理可靠,可用于不同产地珠子参质量评价。 展开更多
关键词 珠子参 高效液相色谱法 主成分分析 OPLS-DA 加权TOPSIS 灰色关联度分析 质量评价 三七皂苷R1 人参皂苷Rg1 人参皂苷RE 人参皂苷Rb2 人参皂苷Rd2 竹节参皂苷V 楤木皂苷A 竹节参皂苷IVa 越南参皂苷R4 齐墩果酸 镰叶芹醇 豆甾醇 β-谷甾醇
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UPLC-MS/MS法同时测定绞股蓝中16个皂苷类成分的含量 被引量:5
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作者 温秀萍 翁艳鸿 +6 位作者 陈祖倩 许少华 许文 林青青 徐伟 林羽 陈在敏 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期198-210,共13页
目的:建立超高效液相色谱串联三重四极杆质谱法(UPLC-MS/MS),在12 min内完成对绞股蓝药材中16个皂苷类成分(人参皂苷CK、F_(2)、Rb_(1)、Rb_(3)、Rd、Rg_(2)、Rg_(3)、Rg_(5)、Rg_(6)、Rh_(4)、Rh_(8),绞股蓝皂苷A、XLVI、XLIX,三七皂... 目的:建立超高效液相色谱串联三重四极杆质谱法(UPLC-MS/MS),在12 min内完成对绞股蓝药材中16个皂苷类成分(人参皂苷CK、F_(2)、Rb_(1)、Rb_(3)、Rd、Rg_(2)、Rg_(3)、Rg_(5)、Rg_(6)、Rh_(4)、Rh_(8),绞股蓝皂苷A、XLVI、XLIX,三七皂苷Fd和越南人参皂苷R_(8))的含量测定。方法:采用UPLC-MS/MS法,正离子多反应监测(MRM)模式进行含量测定。色谱条件:采用Waters CORTECS C_(18)色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.6μm),流动相为0.1%甲酸水(A)-乙腈(B),梯度洗脱,流速为0.25 mL·min^(-1),柱温为45℃。结果:在所设定的色谱条件下,12 min内完成对绞股蓝药材中上述16个成分的含量测定,在考察的浓度范围内均呈良好的线性关系(r>0.9976),回收率和RSD分别在96.2%~104.0%和1.5%~2.9%,精密度、重复性、稳定性考察均符合分析要求。含量测定结果发现,16个皂苷中,绞股蓝皂苷XLVI、A、XLIX和人参皂苷Rb_(3)含量较高,含量均值分别达到7.083、5.599、1.657、1.283 mg·g^(-1),且不同产地的绞股蓝药材中皂苷类成分存在较大差异,聚类分析可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3类。统计发现,越南人参皂苷R_(8),人参皂苷Rb_(1)、Rb_(3)、Rd、Rg_(3)、Rg_(5)、Rg_(6)、Rh_(8)、F_(2)、CK,绞股蓝皂苷XLVI和三七皂苷Fd成分含量在类型Ⅱ中高于类型Ⅰ和Ⅲ,而绞股蓝皂苷A与XLIX成分含量在Ⅲ类型中高于类型Ⅰ和Ⅱ。结论:本研究所建立的在12 min内完成对绞股蓝中16个皂苷类成分的UPLC-MS/MS定量分析方法简便、快捷、准确,分离效果较好,可为完善绞股蓝中皂苷类成分的质量标准评价提供依据。 展开更多
关键词 绞股蓝 含量测定 超高效液相色谱串联三重四极杆质谱 人参皂苷 绞股蓝皂苷 三七皂苷 越南人参皂苷R_(8)
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三七药性菌质正丁醇部位化学成分研究(Ⅱ)
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作者 刘晓莉 王新闻 +2 位作者 丁彩凤 邱智东 徐伟 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期93-95,共3页
目的:通过生物转化技术发酵三七获得三七药性菌质,对正丁醇部位化学成分进行研究。方法:采用系统溶剂萃取、D101大孔吸附树脂、硅胶柱色谱、开放式ODS柱色谱、半制备液相色谱等方法进行分离纯化,结合化合物理化性质和波谱数据鉴定其化... 目的:通过生物转化技术发酵三七获得三七药性菌质,对正丁醇部位化学成分进行研究。方法:采用系统溶剂萃取、D101大孔吸附树脂、硅胶柱色谱、开放式ODS柱色谱、半制备液相色谱等方法进行分离纯化,结合化合物理化性质和波谱数据鉴定其化合物结构。结果:从三七药性菌质正丁醇部位分离得到6个化合物,分别为24(R)-假人参皂苷RT5(1),人参皂苷SG1(2),人参皂苷Rh12(3),人参皂苷Rb1(4),vina-ginsenoside R8(5),vina-ginsenoside R9(6)。结论:化合物1,2,5,6为首次从三七植物中分离得到,所有化合物均为首次从三七药性菌质中分离得到。 展开更多
关键词 三七药性菌质 正丁醇部位 24(R)-假人参皂苷RT5 人参皂苷SG1 vina-ginsenoside R8 vina-ginsenoside R9
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