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马铃薯纺锤块茎类病毒山西分离物侵染性克隆的构建
被引量:
6
1
作者
白云凤
闫建俊
+3 位作者
张耀
张忠梁
冯瑞云
张维锋
《山西农业科学》
2012年第7期701-704,共4页
马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viriod,PSTVd)侵染马铃薯会严重影响薯块的产量和品质。根据PSTVd的同源序列设计引物,以山西省马铃薯感病块茎中提取的总RNA为模板,经RT-PCR方法扩增出全长cDNA片段,将其克隆到质粒pBS-T载体...
马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viriod,PSTVd)侵染马铃薯会严重影响薯块的产量和品质。根据PSTVd的同源序列设计引物,以山西省马铃薯感病块茎中提取的总RNA为模板,经RT-PCR方法扩增出全长cDNA片段,将其克隆到质粒pBS-T载体上,进行序列分析。结果表明,该类病毒全长359 nt,能通过分子内序列互补形成致密的二级结构。以该序列作为种子序列进行Blast搜索,该序列与PSTVd荷兰分离物(GenBank登陆号:AY372400.1)的序列一致性为100%。将该序列与东北株系、河北株系及已公布的弱株系(GenBank登陆号:M14814.1)、强株系(GenBank登陆号:U23058.1)、中间株系(GenBank登陆号:AY937179.1)比对,有12个核苷酸具有多态性,其中有5个发生在致病区。将线性化的质粒pBS-PSTVd及其PSTVd的体外转录产物接种番茄矮红宝的无毒苗,20 d后接种株轻微显症,RT-PCR检测均呈阳性。将RT-PCR产物测序,其结果与接种的PSTVd原序列完全一致,证实构建的PSTVd山西分离物的克隆具有侵染性。
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关键词
马铃薯纺锤块茎类病毒
山西分离物
序列分析
体外转录
侵染性克隆
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职称材料
4种葡萄类病毒检测及序列分析
被引量:
5
2
作者
范旭东
董雅凤
+1 位作者
张尊平
任芳
《中外葡萄与葡萄酒》
2011年第3期13-17,共5页
采用苹果锈果类病毒属(Apscaviroid)保守区域设计的通用引物和4种葡萄类病毒特异引物,对采自辽宁、山东、新疆、甘肃和宁夏的48个葡萄样品进行RT-PCR检测及序列分析。结果表明,葡萄黄斑类病毒1(Grapevine yellow speckle viroid 1,GYSV...
采用苹果锈果类病毒属(Apscaviroid)保守区域设计的通用引物和4种葡萄类病毒特异引物,对采自辽宁、山东、新疆、甘肃和宁夏的48个葡萄样品进行RT-PCR检测及序列分析。结果表明,葡萄黄斑类病毒1(Grapevine yellow speckle viroid 1,GYSVd1)、葡萄黄斑类病毒2(Grapevine yellow speckle viroid 2,GYSVd2)、澳大利亚葡萄类病毒(Australian grapevine viroid,AGVd)和啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)检出率分别为41.7%、22.9%、75%和83.3%。通用引物能够检测出大部分样品中的GYSVd1、GYSVd2、AGVd。序列分析结果显示,中国辽宁兴城GYSVd1分离物(GU170805)属于TypeⅠ,与澳大利亚TypeⅠ分离物同源性为99%,与澳大利亚及日本TypeⅡ分离物同源性为97%,与中国GYSVd3分离物及美国、日本TypeⅢ分离物同源性仅为89%,而与GYSVd2分离物同源性均在80%以下。GYSVd2扩增产物(HM211853)与其余分离物的相似性在97%以上,与两个北京分离物DQ377131和DQ377129最为相似,相似性为99%。辽宁AGVd分离物(HM211854)与其他分离物同源性都在97%以上。山东HSVd分离物(HM357802)与北京、日本葡萄分离物的同源性均在98%以上,与德国葡萄分离物同源性为97%,与马铃薯、啤酒花、柑橘等其他作物上的分离物同源性为97%以下。
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关键词
葡萄类病毒
RT-PCR检测
序列分析
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职称材料
用CEV直接感染柑桔愈伤组织的接种方法的研究
3
作者
陈纯贤
万蜀渊
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
1995年第6期331-334,共4页
根据CEV机械传染及高温诱导发病的特性,用三种方法直接接种柑桔愈伤组织,结合形态学观察、增殖率比较和电泳检测,结果表明,带毒切伤浸泡是CEV离体感染柑桔愈伤组织的有效方法。30℃培养条件下,感染CEV的愈伤组织大约在...
根据CEV机械传染及高温诱导发病的特性,用三种方法直接接种柑桔愈伤组织,结合形态学观察、增殖率比较和电泳检测,结果表明,带毒切伤浸泡是CEV离体感染柑桔愈伤组织的有效方法。30℃培养条件下,感染CEV的愈伤组织大约在8d后发生明显褐变,并会逐渐加深,同时,感染后的愈伤组织的质地也趋坚硬,且表现出特殊的病理生长特性,前期(0—20d)显著地较健康对照生长快,后期(20—40d)则明显减缓甚至停止生长。
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关键词
柑桔
裂皮病
类病毒
柑桔
愈伤组织
接种
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职称材料
引起葡萄黄化类症状的病毒和类病毒RT-PCR检测
被引量:
3
4
作者
赵静静
乾义柯
+3 位作者
颉超
郭庆元
胡白石
陆平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1099-1104,共6页
【目的】明确引起新疆葡萄黄化类症状的病毒及类病毒种类,分析其单病毒和复合感染情况,为葡萄病毒及类病毒的防治提供重要的理论依据和有效的检测技术。【方法】利用已报道的6对特异性引物(GRSPa V-RSP48/49、GFKV-L630/U279、GLRav2-V2...
【目的】明确引起新疆葡萄黄化类症状的病毒及类病毒种类,分析其单病毒和复合感染情况,为葡萄病毒及类病毒的防治提供重要的理论依据和有效的检测技术。【方法】利用已报道的6对特异性引物(GRSPa V-RSP48/49、GFKV-L630/U279、GLRav2-V2d CPf2/V2CPr1、HSVd-f/r、GYSVd1-f1/r1和GYSVd2-f2/r2)分别对新疆不同地区黄化类症状的葡萄病样进行RT-PCR检测,并对各引物的扩增产物进行序列分析。【结果】3种病毒及3种类病毒(GRSPa V、GFk V、GLRa V-2、GYSVd2、GYSVd1和HSVd)在新疆葡萄中均有不同程度的感染,其感染率分别为36.1%、51.4%、48.6%、37.5%、37.5%、94.4%;72个病样中,2种以上病毒或类病毒复合感染率约为75%,6种病毒或类病毒复合感染率为10%以上。【结论】可侵染新疆葡萄引起黄化类症状的病毒和类病毒可达6种,且复合感染较为普遍。
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关键词
葡萄
病毒
类病毒
RT-PCR检测
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职称材料
我国苹果主要类病毒的研究现状
被引量:
3
5
作者
吴然
徐秋良
《河北科技师范学院学报》
CAS
2017年第4期27-30,55,共5页
概述了我国发生在苹果上且已明确鉴定的3种类病毒的特性,这些类病毒包括苹果锈果类病毒(ASSVd)、苹果凹果类病毒(ADFVd)和苹果皱果类病毒(AFCVd)。阐述了鉴定这些苹果类病毒病所需的检测方法,包括指示植物法和分子生物学技术等。
关键词
苹果
类病毒
检测技术
研究现状
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职称材料
枸杞马铃薯纺锤块茎类病毒的鉴定
6
作者
樊云芳
董雅凤
+4 位作者
黄婷
秦小雅
梁晓婕
秦垦
范旭东
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期748-752,共5页
0 引言枸杞(Lycium Linn.)属于茄科枸杞属落叶灌木,为药食兼用植物,具较高的药用和食用价值,是我国传统中药材和重要的经济作物[1]。随着枸杞产业的快速发展,需求量逐年增加,人们对枸杞品质的要求也越来越高。病毒是植物常见病原物的一...
0 引言枸杞(Lycium Linn.)属于茄科枸杞属落叶灌木,为药食兼用植物,具较高的药用和食用价值,是我国传统中药材和重要的经济作物[1]。随着枸杞产业的快速发展,需求量逐年增加,人们对枸杞品质的要求也越来越高。病毒是植物常见病原物的一种,病毒感染寄主后会利用寄主成分进行复制,通常会引起寄主生长缓慢、树势衰退、果实品质下降等问题。
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关键词
Lycium
Linn.
viriod
GENOME
genetic
variation
原文传递
啤酒花潜隐类病毒RNA提取方法及检测技术的研究
被引量:
1
7
作者
连海燕
李建光
+4 位作者
赵晓丽
吕玉峰
孙宁
邓丛良
许志春
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期288-296,共9页
本研究采用纳米磁珠提取法(Magnetic Nanoparticles,MNP)、改良的Li Cl沉淀法、CTAB法、TRIzol法和RNeasy Plant M ini Kit 5种方法提取感染啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)的啤酒花叶片总RNA,结果显示Li Cl沉淀法、CTAB法和M...
本研究采用纳米磁珠提取法(Magnetic Nanoparticles,MNP)、改良的Li Cl沉淀法、CTAB法、TRIzol法和RNeasy Plant M ini Kit 5种方法提取感染啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)的啤酒花叶片总RNA,结果显示Li Cl沉淀法、CTAB法和M NP法提取的RNA的质量较好,而M NP法具有提取时间短、操作简便,环境友好和批量提取的优势,适用于啤酒花潜隐类病毒RNA的快速提取。体外转录制备HLVd RNA标准品,利用实时荧光定量RT-PCR绘制标准曲线,并对其特异性、灵敏度进行评估。应用纳米磁珠提取啤酒花总RNA,结合实时荧光RT-PCR技术,建立了HLVd的快速、高效的M NP-RT-q PCR定量检测方法。
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关键词
类病毒
提取方法
实时荧光定量RT-PCR
原文传递
题名
马铃薯纺锤块茎类病毒山西分离物侵染性克隆的构建
被引量:
6
1
作者
白云凤
闫建俊
张耀
张忠梁
冯瑞云
张维锋
机构
山西省农业科学院作物科学研究所
出处
《山西农业科学》
2012年第7期701-704,共4页
基金
国家自然科学基金项目(30971838)
山西省国际科技合作项目(2011081005)
山西省回国留学人员科研资助项目(200986)
文摘
马铃薯纺锤块茎类病毒(Potato spindle tuber viriod,PSTVd)侵染马铃薯会严重影响薯块的产量和品质。根据PSTVd的同源序列设计引物,以山西省马铃薯感病块茎中提取的总RNA为模板,经RT-PCR方法扩增出全长cDNA片段,将其克隆到质粒pBS-T载体上,进行序列分析。结果表明,该类病毒全长359 nt,能通过分子内序列互补形成致密的二级结构。以该序列作为种子序列进行Blast搜索,该序列与PSTVd荷兰分离物(GenBank登陆号:AY372400.1)的序列一致性为100%。将该序列与东北株系、河北株系及已公布的弱株系(GenBank登陆号:M14814.1)、强株系(GenBank登陆号:U23058.1)、中间株系(GenBank登陆号:AY937179.1)比对,有12个核苷酸具有多态性,其中有5个发生在致病区。将线性化的质粒pBS-PSTVd及其PSTVd的体外转录产物接种番茄矮红宝的无毒苗,20 d后接种株轻微显症,RT-PCR检测均呈阳性。将RT-PCR产物测序,其结果与接种的PSTVd原序列完全一致,证实构建的PSTVd山西分离物的克隆具有侵染性。
关键词
马铃薯纺锤块茎类病毒
山西分离物
序列分析
体外转录
侵染性克隆
Keywords
potato spindle tuber
viriod
Shanxi isolate
nucleotide sequence analysis
external transcription
infectious clone
分类号
S532 [农业科学—作物学]
S432.41 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
4种葡萄类病毒检测及序列分析
被引量:
5
2
作者
范旭东
董雅凤
张尊平
任芳
机构
中国农业科学院果树研究所国家落叶果树脱毒中心
出处
《中外葡萄与葡萄酒》
2011年第3期13-17,共5页
基金
现代农业产业技术体系专项资金资助(CARS-30)
文摘
采用苹果锈果类病毒属(Apscaviroid)保守区域设计的通用引物和4种葡萄类病毒特异引物,对采自辽宁、山东、新疆、甘肃和宁夏的48个葡萄样品进行RT-PCR检测及序列分析。结果表明,葡萄黄斑类病毒1(Grapevine yellow speckle viroid 1,GYSVd1)、葡萄黄斑类病毒2(Grapevine yellow speckle viroid 2,GYSVd2)、澳大利亚葡萄类病毒(Australian grapevine viroid,AGVd)和啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)检出率分别为41.7%、22.9%、75%和83.3%。通用引物能够检测出大部分样品中的GYSVd1、GYSVd2、AGVd。序列分析结果显示,中国辽宁兴城GYSVd1分离物(GU170805)属于TypeⅠ,与澳大利亚TypeⅠ分离物同源性为99%,与澳大利亚及日本TypeⅡ分离物同源性为97%,与中国GYSVd3分离物及美国、日本TypeⅢ分离物同源性仅为89%,而与GYSVd2分离物同源性均在80%以下。GYSVd2扩增产物(HM211853)与其余分离物的相似性在97%以上,与两个北京分离物DQ377131和DQ377129最为相似,相似性为99%。辽宁AGVd分离物(HM211854)与其他分离物同源性都在97%以上。山东HSVd分离物(HM357802)与北京、日本葡萄分离物的同源性均在98%以上,与德国葡萄分离物同源性为97%,与马铃薯、啤酒花、柑橘等其他作物上的分离物同源性为97%以下。
关键词
葡萄类病毒
RT-PCR检测
序列分析
Keywords
grapevine
viriod
s
RT-PCR detection
sequence analysis
分类号
S436.631.19 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
用CEV直接感染柑桔愈伤组织的接种方法的研究
3
作者
陈纯贤
万蜀渊
机构
华中农业大学柑桔研究所
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
1995年第6期331-334,共4页
文摘
根据CEV机械传染及高温诱导发病的特性,用三种方法直接接种柑桔愈伤组织,结合形态学观察、增殖率比较和电泳检测,结果表明,带毒切伤浸泡是CEV离体感染柑桔愈伤组织的有效方法。30℃培养条件下,感染CEV的愈伤组织大约在8d后发生明显褐变,并会逐渐加深,同时,感染后的愈伤组织的质地也趋坚硬,且表现出特殊的病理生长特性,前期(0—20d)显著地较健康对照生长快,后期(20—40d)则明显减缓甚至停止生长。
关键词
柑桔
裂皮病
类病毒
柑桔
愈伤组织
接种
Keywords
CEV(citrus exocortis
viriod
), citrus calli, inoculation through cuttingand soaking
分类号
S436.661.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
引起葡萄黄化类症状的病毒和类病毒RT-PCR检测
被引量:
3
4
作者
赵静静
乾义柯
颉超
郭庆元
胡白石
陆平
机构
新疆农业大学农学院
伊犁出入境检验检疫局
南京农业大学
出处
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第6期1099-1104,共6页
基金
新疆维吾尔自治区科技支疆项目(2013911090)
国家公益性行业(质检)科研项目(201310091)
文摘
【目的】明确引起新疆葡萄黄化类症状的病毒及类病毒种类,分析其单病毒和复合感染情况,为葡萄病毒及类病毒的防治提供重要的理论依据和有效的检测技术。【方法】利用已报道的6对特异性引物(GRSPa V-RSP48/49、GFKV-L630/U279、GLRav2-V2d CPf2/V2CPr1、HSVd-f/r、GYSVd1-f1/r1和GYSVd2-f2/r2)分别对新疆不同地区黄化类症状的葡萄病样进行RT-PCR检测,并对各引物的扩增产物进行序列分析。【结果】3种病毒及3种类病毒(GRSPa V、GFk V、GLRa V-2、GYSVd2、GYSVd1和HSVd)在新疆葡萄中均有不同程度的感染,其感染率分别为36.1%、51.4%、48.6%、37.5%、37.5%、94.4%;72个病样中,2种以上病毒或类病毒复合感染率约为75%,6种病毒或类病毒复合感染率为10%以上。【结论】可侵染新疆葡萄引起黄化类症状的病毒和类病毒可达6种,且复合感染较为普遍。
关键词
葡萄
病毒
类病毒
RT-PCR检测
Keywords
grapevine
virus
viriod
RT-PCR
分类号
S41 [农业科学—植物保护]
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职称材料
题名
我国苹果主要类病毒的研究现状
被引量:
3
5
作者
吴然
徐秋良
机构
石家庄市农林科学研究院果树花卉研究中心
出处
《河北科技师范学院学报》
CAS
2017年第4期27-30,55,共5页
文摘
概述了我国发生在苹果上且已明确鉴定的3种类病毒的特性,这些类病毒包括苹果锈果类病毒(ASSVd)、苹果凹果类病毒(ADFVd)和苹果皱果类病毒(AFCVd)。阐述了鉴定这些苹果类病毒病所需的检测方法,包括指示植物法和分子生物学技术等。
关键词
苹果
类病毒
检测技术
研究现状
Keywords
apple
viriod
characteristics
detection technology
current situation
分类号
S661.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
枸杞马铃薯纺锤块茎类病毒的鉴定
6
作者
樊云芳
董雅凤
黄婷
秦小雅
梁晓婕
秦垦
范旭东
机构
宁夏农林科学院枸杞科学研究所/国家枸杞工程技术研究中心
中国农业科学院果树研究所国家落叶脱毒中心
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期748-752,共5页
基金
宁夏回族自治区农业高质量发展和生态保护科技创新示范课题(NGSB-2021-2-02)
宁夏区自然科学基金项目(2021AAC03263)。
文摘
0 引言枸杞(Lycium Linn.)属于茄科枸杞属落叶灌木,为药食兼用植物,具较高的药用和食用价值,是我国传统中药材和重要的经济作物[1]。随着枸杞产业的快速发展,需求量逐年增加,人们对枸杞品质的要求也越来越高。病毒是植物常见病原物的一种,病毒感染寄主后会利用寄主成分进行复制,通常会引起寄主生长缓慢、树势衰退、果实品质下降等问题。
关键词
Lycium
Linn.
viriod
GENOME
genetic
variation
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
啤酒花潜隐类病毒RNA提取方法及检测技术的研究
被引量:
1
7
作者
连海燕
李建光
赵晓丽
吕玉峰
孙宁
邓丛良
许志春
机构
北京林业大学
北京出入境检验检疫局
东南大学生物科学与医学工程学院
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期288-296,共9页
基金
公益性行业(质检)科研专项(201110035)
国家973课题(2011CB932800)
质检总局课题(2013IK267)
文摘
本研究采用纳米磁珠提取法(Magnetic Nanoparticles,MNP)、改良的Li Cl沉淀法、CTAB法、TRIzol法和RNeasy Plant M ini Kit 5种方法提取感染啤酒花潜隐类病毒(Hop latent viroid,HLVd)的啤酒花叶片总RNA,结果显示Li Cl沉淀法、CTAB法和M NP法提取的RNA的质量较好,而M NP法具有提取时间短、操作简便,环境友好和批量提取的优势,适用于啤酒花潜隐类病毒RNA的快速提取。体外转录制备HLVd RNA标准品,利用实时荧光定量RT-PCR绘制标准曲线,并对其特异性、灵敏度进行评估。应用纳米磁珠提取啤酒花总RNA,结合实时荧光RT-PCR技术,建立了HLVd的快速、高效的M NP-RT-q PCR定量检测方法。
关键词
类病毒
提取方法
实时荧光定量RT-PCR
Keywords
viriod
extraction method real-time quantitative RT-PCR
分类号
S432 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯纺锤块茎类病毒山西分离物侵染性克隆的构建
白云凤
闫建俊
张耀
张忠梁
冯瑞云
张维锋
《山西农业科学》
2012
6
下载PDF
职称材料
2
4种葡萄类病毒检测及序列分析
范旭东
董雅凤
张尊平
任芳
《中外葡萄与葡萄酒》
2011
5
下载PDF
职称材料
3
用CEV直接感染柑桔愈伤组织的接种方法的研究
陈纯贤
万蜀渊
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
1995
0
下载PDF
职称材料
4
引起葡萄黄化类症状的病毒和类病毒RT-PCR检测
赵静静
乾义柯
颉超
郭庆元
胡白石
陆平
《新疆农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
下载PDF
职称材料
5
我国苹果主要类病毒的研究现状
吴然
徐秋良
《河北科技师范学院学报》
CAS
2017
3
下载PDF
职称材料
6
枸杞马铃薯纺锤块茎类病毒的鉴定
樊云芳
董雅凤
黄婷
秦小雅
梁晓婕
秦垦
范旭东
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
7
啤酒花潜隐类病毒RNA提取方法及检测技术的研究
连海燕
李建光
赵晓丽
吕玉峰
孙宁
邓丛良
许志春
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
原文传递
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