须弥葛叶绿体基因组密码子使用偏好性分析

[目的]揭示须弥葛叶绿体基因组中影响其密码子使用偏好和模式的因素。[方法]利用CUSP在线程序、Codon W 1.4.2、Microsoft Excel、SPSS 24.0等软件,计算并分析须弥葛叶绿体基因组中52条蛋白质编码基因序列(coding sequences,CDS)的密码子使用偏性指标和碱基组成。[结果]须弥葛密码子更偏好A/U结尾的密码子。52条CDS的有效密码子数(effective number of codon,ENC)以及各项偏性指标分析结果均提示密码子偏好性较弱。相关性分析显示,ENC与GC_(1)、GC_(2)的相关性均不显著,但与GC_(3)相关性极显著,表明须弥葛密码子第3位碱基组成对其密码子偏好性影响较大。通过ENC-plot、中性绘图、PR2-plot分析发现,须弥葛叶绿体基因组同义密码子使用偏好性的主要影响因素是自然选择;最后筛选出10个最优密码子UUG、CUU、UCC、UCA、CCA、ACA、GCA、UAU、CAU、AGA。[结论]该结果可为须弥葛叶绿体基因组密码子优化、遗传修饰及系统进化的相关研究提供理论依据。

瓦氏葛藤的价值及研究进展

本综述通过查阅大量有关瓦氏葛藤方面的文献,结合作者近四十年在相关方面的试验研究,总结出瓦氏葛藤具有生长萌发快、繁殖栽培容易、生产紫胶性能好产量高、种子和枝叶蛋白含量高营养丰富等特点,归纳了国内外研究进展及利用情况,进一步验证瓦氏葛藤是集水土保持、食品、饲料、薪炭材、紫胶优良灌木寄主植物等于一身的多功能、多效益、多用途的树种,具有广阔的应用前景。同时,针对瓦氏葛藤研究的不足,为今后良种选育、抗逆机理及新的利用方式等方面的研究提供科学依据。