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双孢蘑菇中一种4R型MYB转录因子的基因克隆和生物信息学分析
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作者 刘翔 赵紫璇 +5 位作者 赵月盈 赵诗睿 贾子怡 姜含越 袁帅 孟德梅 《食品研究与开发》 CAS 2024年第2期185-194,共10页
MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)... MYB转录因子广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、逆境胁迫等过程中发挥重要作用。与植物相比,对食用菌中MYB转录因子的研究有限。为探究MYB转录因子在食用菌中的生物学功能,对前期转录组发现的一个编码双孢蘑菇(Agaricus bisporus)MYB转录因子的基因进行克隆和生物信息学分析。结果表明,该基因编码区长1209 bp,翻译402个氨基酸;编码的蛋白分子量为45.95 kDa,等电点9.17,是一种不存在跨膜结构、不含信号肽的亲水性蛋白,具有4个高度保守的SANT结构域,属于4R型MYB转录因子,与白环蘑(Leucoagaricus)中的4RMYB转录因子亲缘关系最近;二级结构预测显示以无规则卷曲和α-螺旋结构为主;亚细胞定位分析显示该转录因子位于细胞核中;此外启动子序列分析表明,该基因启动子区域含有多个与生物抗逆应答、激素响应等相关的顺式作用元件。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 myb转录因子 基因克隆 生物信息学分析 保守结构域
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草地早熟禾PpMYB2基因的克隆、生物信息学及亚细胞定位分析
2
作者 苏浩天 刘曼 尹淑霞 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期3071-3079,共9页
MYB(MYB transcription factors)是一类在植物生长发育及抗逆方面起重要作用的转录因子,其功能包含抗盐胁迫、抗干旱胁迫、抗重金属胁迫及抗病害胁迫等,它的基因家族属于植物最大的转录因子家族之一。本研究基于草地早熟禾‘巴润’(Poa ... MYB(MYB transcription factors)是一类在植物生长发育及抗逆方面起重要作用的转录因子,其功能包含抗盐胁迫、抗干旱胁迫、抗重金属胁迫及抗病害胁迫等,它的基因家族属于植物最大的转录因子家族之一。本研究基于草地早熟禾‘巴润’(Poa pratensis‘Baron’)前期转录组数据,利用同源克隆及染色体步移技术,获得了PpMYB2的705 bp的编码序列(Coding sequence,CDS)及1115 bp的启动子序列。qRT-PCR结果显示,PpMYB2在根中具有最高的表达量,其次是叶片在叶鞘中的表达量最低,同时,PpMYB2的表达可以响应植物激素GA及ABA,并在干旱胁迫(15%PEG6000)及高盐胁迫(150 mmol·L^(-1) NaCl)下,呈现出表达量显著上调的变化趋势。亚细胞定位结果表明,该基因定位于细胞核中。启动子分析表明,该基因启动子区域含有生长素、赤霉素等植物激素响应元件及低温、干旱等逆境响应元件。由此表明,PpMYB2在植物响应胁迫中起到重要作用,对其的进一步研究对探索草地早熟禾抗逆机理具有指导意义。 展开更多
关键词 myb基因 转录因子 基因克隆 表达模式 亚细胞定位
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月季RhMYB25基因的克隆和非生物胁迫下的检测分析
3
作者 魏春海 陈叶妮 +1 位作者 沈晓霞 罗平 《延边大学农学学报》 2024年第3期13-18,共6页
该文研究RhMYB25转录因子在月季(Rosa hybrida)非生物胁迫下的表达模式,为进一步揭示RhMYB25基因的功能奠定基础。利用月季全基因组数据,采用RT-PCR从月季叶片中分离得到1个MYB转录因子,命名为RhMYB25,并对其进行生物信息学分析;采用烟... 该文研究RhMYB25转录因子在月季(Rosa hybrida)非生物胁迫下的表达模式,为进一步揭示RhMYB25基因的功能奠定基础。利用月季全基因组数据,采用RT-PCR从月季叶片中分离得到1个MYB转录因子,命名为RhMYB25,并对其进行生物信息学分析;采用烟草瞬时表达技术,明确RhMYB25转录因子的亚细胞定位;利用实时荧光定量PCR技术分析RhMYB25在不同组织及其不同非生物胁迫下的表达模式。RhMYB25基因编码区长度为1032bp,编码343个氨基酸,包含1个R2R3-MYB结构域,其属于典型的MYB转录因子。亚细胞定位显示RhMYB25定位于细胞核。实时荧光定量PCR结果表明,RhMYB25基因在月季叶片中的表达最高;高温与脱水胁迫可以显著诱导RhMYB25基因的表达,但外源盐处理不能诱导RhMYB25基因的表达。RhMYB25基因可能在月季响应高温与脱水胁迫过程中发挥调控作用。 展开更多
关键词 月季 myb转录因子 基因克隆 表达分析
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小麦转录因子TaMyb2s的克隆及表达 被引量:12
4
作者 贾东升 毛新国 +2 位作者 景蕊莲 张晓科 昌小平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1323-1329,共7页
利用小麦TaMyb2基因特异引物,克隆了3种类型TaMyb2的cDNA序列,分别命名为TaMyb2-Ⅰ、TaMyb2-Ⅱ和TaMyb2-Ⅲ。氨基酸序列比对结果表明,TaMyb2s的序列高度相似。系统进化树分析显示,TaMyb2s与来自大麦、水稻等的直系同源基因编码蛋白的亲... 利用小麦TaMyb2基因特异引物,克隆了3种类型TaMyb2的cDNA序列,分别命名为TaMyb2-Ⅰ、TaMyb2-Ⅱ和TaMyb2-Ⅲ。氨基酸序列比对结果表明,TaMyb2s的序列高度相似。系统进化树分析显示,TaMyb2s与来自大麦、水稻等的直系同源基因编码蛋白的亲缘关系较近;TaMyb2s的3种类型与小麦基因组没有明显的对应关系。实时定量PCR检测结果表明,小麦幼苗中的TaMyb2s均参与对渗透胁迫的应答反应,但表达模式不尽相同,TaMyb2-Ⅲ对渗透胁迫的应答最迅速,TaMyb2-Ⅰ次之,TaMyb2-Ⅱ最迟缓。从小麦不同发育时期幼嫩组织中TaMyb2s的表达情况推测,TaMyb2-Ⅰ和TaMyb2-Ⅲ可能主要在生长发育的前期调控下游基因,而TaMyb2-Ⅱ主要在发育后期发挥作用。 展开更多
关键词 小麦 myb转录因子 基因克隆 非生物胁迫 基因表达
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糜子抗旱节水相关基因PmMYB的克隆及表达分析 被引量:20
5
作者 胡银岗 林凡云 +1 位作者 王士强 何蓓如 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期373-379,共7页
根据在糜子抗旱节水分子基础研究中获得的一个糜子MYB基因的EST序列,以其序列及水稻MYB18基因的序列为基础设计引物,扩增得到1739bp的全长基因组序列。序列分析表明,其包含121bp(347~467bp)和93bp(599~691bp)的两个内含子,3个外显... 根据在糜子抗旱节水分子基础研究中获得的一个糜子MYB基因的EST序列,以其序列及水稻MYB18基因的序列为基础设计引物,扩增得到1739bp的全长基因组序列。序列分析表明,其包含121bp(347~467bp)和93bp(599~691bp)的两个内含子,3个外显子;全长cDNA序列为1525bp,其中3′非翻译区为212bp,5′非翻译区为41bp,编码区为1272bp,共编码424个氨基酸,C-端存在一个丝氨酸(Ser,S)丰富区。该基因具有两个典型的MYB类转录因子基因的DNA结合区(DNA-binding domain),分别为13~63、66~114位氨基酸,属于典型的R2R3-MYB转录因子。对其与水稻、玉米、火炬松、拟南芥、辣椒、陆地棉、大麦及茄子等9种植物的MYB基因的R2、R3重复区的氨基酸序列多重比较,表明R2R3重复序列在植物中具有较高的保守性;基于氨基酸序列的编码区系统进化树分析表明,不同植物的MYB基因遗传分化很大,序列相似性为32%~84%,其中糜子MYB基因与水稻的MYB18相似程度最高(84%),与大麦和玉米的相似性分别为46%和41%。通过半定量RT-PCR对其表达模式分析表明,该基因在水分胁迫和干旱后复水条件下上调表达,与糜子抗旱节水紧密相关。该基因的克隆为进一步探讨利用该基因改良其他植物的抗旱节水性奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 糜子 myb转录因子 基因克隆 表达模式 进化分析
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茶树2个MYB转录因子基因的克隆及表达分析 被引量:13
6
作者 马春雷 姚明哲 +2 位作者 王新超 金基强 陈亮 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第3期31-37,共7页
MYB类转录因子是一类包含一段保守的DNA结合结构域的基因家族,广泛地参与植物发育和植物次生代谢的调节。根据前期芯片杂交和文库筛选得到的2个MYB转录因子的部分序列,采用RT-PCR和RACE技术分离得到它们的全长基因:CsMYB1和CsMYB2,在Gen... MYB类转录因子是一类包含一段保守的DNA结合结构域的基因家族,广泛地参与植物发育和植物次生代谢的调节。根据前期芯片杂交和文库筛选得到的2个MYB转录因子的部分序列,采用RT-PCR和RACE技术分离得到它们的全长基因:CsMYB1和CsMYB2,在GenBank的登录号分别为HQ660373和HQ660374。序列分析表明:CsMYB1基因全长1132bp,开放阅读框长879bp,编码292个氨基酸,推测的蛋白分子量约为32.9ku,理论等电点为8.13;CsMYB2基因全长1020bp,其中开放阅读框长675bp,编码224个氨基酸,推测的蛋白分子量约为25.4ku,理论等电点为9.05。2个基因编码的蛋白均具有明显的R2R3MYB结构域,且在R3结构域的下游都含有1个相对保守的C1(LIXXGIDPXTHR)基序。同源性分析表明:茶树CsMYB1和CsMYB2编码的氨基酸序列与其他植物的MYB类转录因子具有较高的相似性,其中CsMYB1编码的氨基酸序列与陆地棉MYB1的相似性为57%,CsMYB2编码的氨基酸序列与葡萄MYBC2的相似性为75%。利用荧光定量PCR技术检测2个转录因子基因在遮荫处理条件下的表达规律,及其在茶树不同组织中的表达特性,结果表明:CsMYB1和CsMYB2在不同组织中均有表达,但表达量具有明显区别,其中CsMYB2在叶片中的相对表达量是根中的100多倍;而遮荫处理能明显降低叶片中的花青素含量,并提高CsMYB1的表达,但对转录因子CsMYB2的影响不大。 展开更多
关键词 茶树 myb转录因子 基因克隆 表达分析
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杜梨2个MYB转录因子基因的克隆及序列分析 被引量:9
7
作者 冉昆 王少敏 +3 位作者 董放 魏树伟 张勇 王宏伟 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第S1期52-58,共7页
【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核... 【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、TMHMM、Signal P、Plant-m Ploc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等软件对氨基酸序列进行分析。【结果】克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全长,Gen Bank登录号分别为KX272614和KX272615。2者均含有MYB保守结构域,二级结构均以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-折叠为主,亚细胞定位分析表明2者均定位于细胞核中。其中,Pb3RMYB属于3R-MYB亚家族,全长2 355 bp,ORF长1 710bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为62 077.3 Da,等电点为7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB与已报道的其他物种3RMYB具有较高的相似度。Pb4RMYB属于4R-MYB亚家族,全长3 625 bp,ORF长2 913 bp,编码970个氨基酸,蛋白分子质量约为109 600.6 Da,等电点为7.41。【结论】获得了2个杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分别属于3RMYB和4R-MYB亚家族。 展开更多
关键词 杜梨 myb转录因子 基因克隆 序列分析
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葡萄风信子转录因子MaMYB2的克隆及表达模式分析 被引量:5
8
作者 李志根 刘雅莉 +1 位作者 杨慧萍 刘妮妮 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2015年第2期15-21,共7页
试验从葡萄风信子"亚美尼亚"中利用RACE技术克隆了一个MYB类转录因子,命名为MaMYB2,Genebank登陆号为KJ744038。克隆到的MaMYB2全长711bp,开放阅读框为600bp,编码199个氨基酸,推测的蛋白分子量约为22.34ku,理论等电点为5.46,... 试验从葡萄风信子"亚美尼亚"中利用RACE技术克隆了一个MYB类转录因子,命名为MaMYB2,Genebank登陆号为KJ744038。克隆到的MaMYB2全长711bp,开放阅读框为600bp,编码199个氨基酸,推测的蛋白分子量约为22.34ku,理论等电点为5.46,保守域具有DNA结合位点;与矮牵牛(AAF66730.1)关系最近;核定位试验表明MaMYB2蛋白定位在细胞核中;实时定量PCR分析了MaMYB2在葡萄风信子"亚美尼亚"不同组织部位中的表达模式,结果不同组织中均有表达,在花中表达量最高,且随着花色变深表达量逐渐升高。结果表明,MaMYB2有可能参与了葡萄风信子中花青素积累的转录调控。 展开更多
关键词 葡萄风信子 myb转录因子 基因克隆 表达模式分析
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苦荞转录因子基因FtMYB1的克隆及序列分析 被引量:3
9
作者 白悦辰 陶亮 +3 位作者 蒙华 李成磊 陈惠 吴琦 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2011年第1期16-21,共6页
采用RACE-PCR技术,从苦荞花蕾克隆得到一个MYB基因(FtMYB1)。结果表明,FtMYB1基因DNA序列全长863bp(GenBank,JF313344),含两个内含子,内含子1长度为78bp(134~211bp),内含子2长度为74bp(342~415bp);cDNA序列全长711bp(GenBank,JF31334... 采用RACE-PCR技术,从苦荞花蕾克隆得到一个MYB基因(FtMYB1)。结果表明,FtMYB1基因DNA序列全长863bp(GenBank,JF313344),含两个内含子,内含子1长度为78bp(134~211bp),内含子2长度为74bp(342~415bp);cDNA序列全长711bp(GenBank,JF313345);开放阅读框(ORF)编码236个氨基酸,理论分子量26.9kDa,等电点6.33。序列比对及同源建模分析表明,FtMYB1蛋白与其他植物MYB结合域有高度的同源性,具有MYB同源蛋白的典型特征。 展开更多
关键词 苦荞 myb转录因子 基因克隆 序列分析
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多年生黑麦草MYB转录因子基因的克隆及序列分析 被引量:2
10
作者 凌瑶 李成磊 吴琦 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第8期171-176,共6页
为进一步研究MYB类基因在多年生黑麦草抗逆和发育中的功能,以多年生黑麦草为材料,采用同源克隆的方法对其抗逆和发育相关MYB转录因子的保守区进行PCR扩增和克隆,并进行了序列分析和功能预测。测序结果表明,获得了3个不同的MYB转录因子... 为进一步研究MYB类基因在多年生黑麦草抗逆和发育中的功能,以多年生黑麦草为材料,采用同源克隆的方法对其抗逆和发育相关MYB转录因子的保守区进行PCR扩增和克隆,并进行了序列分析和功能预测。测序结果表明,获得了3个不同的MYB转录因子基因片段,分别命名为LpMYB1、LpMYB2和LpMYB3。LpMYB1和LpMYB2长度均为221bp,内含子为103bp,编码39个氨基酸;LpMYB3长度为202bp,内含子为84bp,编码39个氨基酸;同源比对结果表明,所得3个MYB基因可能参与多年生黑麦草对逆境的应答和植株的形态建成;进化树分析表明,3个MYB基因的系统发育符合单子叶植物的进化模式。由此可见,3个MYB基因参与了多年生黑麦草抗逆性和发育的表达,为进一步研究多年生黑麦草MYB转录因子基因的功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 多年生黑麦草 myb转录因子 基因克隆 序列分析
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葡萄风信子MaMYB1基因的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 姜玲 刘雅莉 +2 位作者 娄倩 焦淑珍 权永辉 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2014年第11期156-162,共7页
【目的】克隆葡萄风信子MYB转录因子基因(MaMYB1),并对其进行生物信息学和表达模式的分析。【方法】以开蓝色花的葡萄风信子品种"亚美尼亚"为材料,利用RACE技术得到其MaMYB1基因cDNA全长,对其进行生物信息学分析,利用酵母单... 【目的】克隆葡萄风信子MYB转录因子基因(MaMYB1),并对其进行生物信息学和表达模式的分析。【方法】以开蓝色花的葡萄风信子品种"亚美尼亚"为材料,利用RACE技术得到其MaMYB1基因cDNA全长,对其进行生物信息学分析,利用酵母单杂交方法检测其转录激活活性,并用实时定量PCR方法分析该基因在根、茎、叶及不同发育时期花中的表达特性。【结果】通过RACE-PCR,克隆得到953bp的MaMYB1基因,其开放阅读框长750bp,编码249个氨基酸,推测的蛋白分子质量约为27.7ku,理论等电点为9.3。MaMYB1基因编码的蛋白序列中具有2个典型的MYB结构域R2和R3,且在R3结构域下游含有与BHLH蛋白结合的[D/E]Lx2[R/K]x3Lx6Lx3R结构域。MaMYB1与玉米ZmP1及拟南芥MYB12的关系较近。酵母单杂交检测表明:MaMYB1具有转录激活活性。实时定量PCR分析结果表明:MaMYB1在不同组织中均有表达,以在花中表达量较高,且在花不同发育时期表达量差异显著。【结论】从葡萄风信子中克隆到1个新的MYB基因MaMYB1;推测该基因可能参与了葡萄风信子花发育过程的调控。 展开更多
关键词 葡萄风信子 myb转录因子 基因克隆 表达分析
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Cloning and Expression of Two MYB Transcription Factors in Tea Plant(Camellia sinensis)
12
作者 Ma Chunlei Yao Mingzhe +2 位作者 Wang Xinchao Jin Jiqiang Chen Liang 《Chinese Forestry Science and Technology》 2012年第3期47-47,共1页
MYB transcription factors represent a family of genes that include the conserved MYB DNA-binding domain,and they are widely involved in the regulation of plant development and secondary metabolism.In this study,Part o... MYB transcription factors represent a family of genes that include the conserved MYB DNA-binding domain,and they are widely involved in the regulation of plant development and secondary metabolism.In this study,Part of sequences of two MYB transcription factors was determined through the cDNA microarray hybridization and selection of cDNA library derived from tender shoots.The full-length cDNAs of the genes were obtained with RT-PCR and RACE,and they were 1 132 bp and 1 020 bp,named as CsMYB1 and CsMYB2 (GenBank accession No.HQ660373 and HQ660374), and contained ORFs of 879 bp and 675 bp encoding 292 and 224 amino acids,respectively.Sequences analysis showed that the deduced protein molecular weight of the two genes were 32.9 ku and 25.4 ku, and the proteins contained two conserved MYB domains near the N-terminus and a conserved C1 motif near the R3 domains.The deduced amino acid sequence of CsMYB1 and CsMYB2 from tea plant showed high identity with that of other plants,for instance CsMYB1 shared 57%homology with MYB1 of Gossypium hirsutum and CsMYB2 shared 75% homology with MYBC2 of Vitis vinifera.The result of real time-PCR analysis showed the two genes were expressed constitutively in all tissues with different expression levels,e.g.the relative expression level of CsMYB2 in leaf was hundred times higher than that in root.Additionally,shading enhanced CsMYB1 expression,while the treatment did not alter the expression level of CsMYB2. 展开更多
关键词 tea plant(Camellia sinensis) myb transcription factors gene cloning expression
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龙眼体胚Myb转录因子基因的克隆及序列分析 被引量:1
13
作者 冯新 方智振 赖钟雄 《亚热带农业研究》 2011年第1期53-56,共4页
以龙眼同步化调控的鱼雷形胚为材料,设计特异上下游引物,采用RT-PCR法,获得了797 bp的基因序列。通过NC-BI的BLAST软件进行核苷酸序列和氨基酸序列的同源性搜索及相似度分析,结果表明,所获得的核苷酸序列和翻译的氨基酸序列与其他物种的... 以龙眼同步化调控的鱼雷形胚为材料,设计特异上下游引物,采用RT-PCR法,获得了797 bp的基因序列。通过NC-BI的BLAST软件进行核苷酸序列和氨基酸序列的同源性搜索及相似度分析,结果表明,所获得的核苷酸序列和翻译的氨基酸序列与其他物种的Myb转录因子有较高的同源性,推断该基因序列属于龙眼Myb转录因子基因。已在GenBank登录,登录号为HQ661039。 展开更多
关键词 龙眼 myb转录因子 基因克隆 序列分析
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谷子MYB类转录因子SiMYB42提高转基因拟南芥低氮胁迫耐性 被引量:16
14
作者 丁庆倩 王小婷 +10 位作者 胡利琴 齐欣 葛林豪 徐伟亚 徐兆师 周永斌 贾冠清 刁现民 闵东红 马有志 陈明 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期327-338,共12页
Myeloblastosis(MYB)类转录因子是高等植物中最大的转录因子家族之一,在植物发育及防御反应过程中发挥重要作用,还参与植物对干旱等非生物胁迫的响应。谷子(Setaria italica L.)起源于中国,具有抗旱、耐瘠薄的特性,是研究单子叶作物非... Myeloblastosis(MYB)类转录因子是高等植物中最大的转录因子家族之一,在植物发育及防御反应过程中发挥重要作用,还参与植物对干旱等非生物胁迫的响应。谷子(Setaria italica L.)起源于中国,具有抗旱、耐瘠薄的特性,是研究单子叶作物非生物胁迫抗性的理想材料。本研究对耐低氮胁迫谷子品种郑204经低氮处理后进行转录组分析,鉴定出一个在低氮胁迫条件下明显上调的MYB类转录因子SiMYB42。系统发育树结果表明,SiMYB42属于R2R3-MYB亚族,具有2个MYB保守域;表达模式分析显示,SiMYB42在低氮、高盐、干旱和ABA胁迫条件下表达量显著上调;亚细胞定位、quantitative real-time PCR及转录激活活性分析结果表明,SiMYB42蛋白定位于植物的细胞核和细胞膜中,主要在谷子的叶部或根部表达,具有转录激活活性;基因功能分析结果表明,在正常条件下,转SiMYB42基因拟南芥与野生型Columbia-0拟南芥(WT)无明显差异,但在低氮条件下,转SiMYB42基因拟南芥的主根长、根系表面积及鲜重均显著高于WT,结果证明SiMYB42基因可以提高转基因植物对低氮胁迫的耐性;下游基因表达分析结果显示,在转SiMYB42基因拟南芥中,参与植物氮素转运的硝酸盐转运基因NRT2.1、NRT2.4和NRT2.5的表达水平均高于WT,启动子分析结果显示NRT2.1、NRT2.4和NRT2.5基因启动子序列中均具有MYB结合位点。以上结果证明,SiMYB42可以通过调控下游硝酸盐转运体基因的表达提高植物在低氮条件下的耐性。本研究揭示了SiMYB42基因在低氮胁迫反应途径中的作用,为进一步了解谷子低氮胁迫响应的调控网络奠定了基础。 展开更多
关键词 谷子(Setaria ITALICA L.) myb类转录因子 低氮胁迫 基因表达分析 基因功能分析
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西瓜抗枯萎病相关基因ClMYB转录因子的克隆及表达分析 被引量:6
15
作者 韩金桓 王丽霞 +1 位作者 高洪波 吕桂云 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第17期3359-3369,共11页
【目的】克隆西瓜抗枯萎病相关基因CIMYB转录因子,进行生物信息学及表达模式分析,为进一步解析CIMYB在西瓜抗枯萎病机制中的作用提供理论依据。【方法】根据西瓜与枯萎病菌不亲和互作的抑制差减文库和Microarray数据分析,获得与西瓜抗... 【目的】克隆西瓜抗枯萎病相关基因CIMYB转录因子,进行生物信息学及表达模式分析,为进一步解析CIMYB在西瓜抗枯萎病机制中的作用提供理论依据。【方法】根据西瓜与枯萎病菌不亲和互作的抑制差减文库和Microarray数据分析,获得与西瓜抗枯萎病相关的基因CIMYB,采用RT-PCR技术分离克隆CIMYB c DNA全长序列;应用生物信息学方法分析该基因的保守结构域及序列特征;使用MEGA5.0对CIMYB蛋白序列及其同源序列进行多序列比对,并构建同源物种间系统进化树;采用GFP标记的方法进行亚细胞定位,分析编码蛋白表达位置;将该基因片段通过Nde I和Xba I双酶切连接至原核表达载体p Czn1,重组质粒转化至大肠杆菌Arctic Express,经终浓度为0.5 mmol·L^(-1) IPTG诱导4 h,用SDS-PAGE分析融合蛋白的表达;利用实时荧光定量PCR方法检测目的基因在西瓜与枯萎病菌互作中及在茉莉酸(jasmonate,JA)诱导下的表达情况。【结果】利用RT-PCR方法从西瓜野生材料PI296341-FR根系组织中克隆该基因片段(Gen Bank:KT751229),序列比对及生物信息学分析表明,其基因编码的氨基酸序列具有MYB转录因子R2R3型的典型特征,其N端具有R2、R3两个MYB结构域,C端高度变异。多序列比对及进化树分析表明,该基因编码的蛋白与甜瓜MYB(Gen Bank:XM_008440304)和黄瓜MYB(Gen Bank:XM_011652633)同源性最高,其编码的氨基酸一致性达到86%,这与它们同属葫芦科植物有关;亚细胞定位显示CIMYB定位于细胞核,为典型的转录因子;成功构建了该基因的原核表达载体p Czn1-CIMYB,转化至大肠杆菌得到36 k D左右蛋白;CIMYB受枯萎病菌诱导,在高抗枯萎病菌材料PI296341-FR中,相对感病品种表达量高峰出现的早,且表达量高。50μmol·L^(-1)的Me JA处理可以显著提高感病材料Black diamond对枯萎病的抗病水平,同时诱导CIMYB表达,与抗病材料PI296341-FR相比表达趋势一致,但表达量更高。【结论】CIMYB为典型的R2R3-MYB转录因子,亚细胞定位于细胞核中;基因的原核表达得到36 k D的融合蛋白,在西瓜中的表达受枯萎病菌和茉莉酸诱导,推测CIMYB可能参与JA介导的西瓜抗枯萎病防卫反应的信号通路,在西瓜抗病中起一定的作用。 展开更多
关键词 西瓜 枯萎病 CImyb转录因子 基因克隆 表达分析
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马尾松PmMYB169基因的克隆及表达分析 被引量:6
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作者 刘沛宇 刘小翠 +3 位作者 杨鹍 彭磊 乔光 文晓鹏 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期48-54,共7页
MYB基因家族在植物生长发育和应答逆境胁迫中有重要作用.通过RT-PCR和RACE技术从马尾松中克隆获得了PmMYB169全长cDNA序列,分析了其在低磷胁迫下的表达特性.PmMYB169全长为1 407bp,开放阅读框为927bp,编码308个氨基酸.生物信息学分析表... MYB基因家族在植物生长发育和应答逆境胁迫中有重要作用.通过RT-PCR和RACE技术从马尾松中克隆获得了PmMYB169全长cDNA序列,分析了其在低磷胁迫下的表达特性.PmMYB169全长为1 407bp,开放阅读框为927bp,编码308个氨基酸.生物信息学分析表明,PmMYB169蛋白序列中存在MYB家族结构区域,属于R2R3类MYB转录因子;同源性分析表明,PmMYB169在MYB家族保守区域上同源性较高,它与北美云杉亲缘关系最近.荧光定量PCR对低磷胁迫下PmMYB169的表达分析结果表明,PmMYB169的表达量随低磷胁迫时间延长呈上调趋势,说明PmMYB169参与了低磷胁迫应答;对不同组织的表达分析发现,PmMYB169为组成型表达,在马尾松根茎叶中均有表达,以叶的表达量最高. 展开更多
关键词 马尾松 低磷胁迫 myb转录因子 基因克隆 表达分析
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青杄MYB转录因子基因PwMYB20的克隆及表达分析 被引量:5
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作者 游韩莉 袁义杭 +1 位作者 李长江 张凌云 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第5期23-32,共10页
【目的】MYB转录因子家族是植物中最大的一类转录因子,在植物生长发育及抗逆调控网络中发挥重要作用。对青杄中MYB同源基因Pw MYB20的克隆与分析,有利于进一步探究Pw MYB20在植物生长发育及逆境响应中的功能,挖掘与利用青杄中的优质基... 【目的】MYB转录因子家族是植物中最大的一类转录因子,在植物生长发育及抗逆调控网络中发挥重要作用。对青杄中MYB同源基因Pw MYB20的克隆与分析,有利于进一步探究Pw MYB20在植物生长发育及逆境响应中的功能,挖掘与利用青杄中的优质基因。【方法】采用RACE-PCR技术,从青杄c DNA文库中克隆得到Pw MYB20基因,并通过PCR技术克隆验证。利用Prot Param、Prot Scale、Fold Index等生物信息学软件对Pw MYB20理化性质进行分析预测。通过BLAST在线工具得到植物同源蛋白,并对其进行比对分析和进化树分析。采用实时荧光定量PCR技术分析Pw MYB20基因在不同组织中的表达性,以及干旱、低温、盐、ABA等非生物逆境胁迫处理后的表达变化。通过亚细胞定位及转录激活活性验证试验,揭示其生物学特性。【结果】通过RACE-PCR克隆得到Pw MYB20 c DNA全长966 bp,含675 bp的完整开放阅读框,编码225个氨基酸。Prot Param工具计算蛋白分子式为C1104H1740N340O330S8,分子质量为25.3 k Da,等电点为9.11;Protscale工具疏水性分析发现,Pw MYB20的疏水位点与亲水位点均匀分布,推测该蛋白为亲水蛋白;Signal P工具预测发现该蛋白没有信号肽结构域;利用Fold Index工具对蛋白质固有无序化进行分析,结果表明该蛋白固有无序化序列较多,推测在生理环境下蛋白的动态活性较大;TMHMM工具预测发现该蛋白没有跨膜结构域。通过对比分析发现Pw MYB20属于MYB家族基因,编码1个R2R3-MYB蛋白。进化树分析结果显示,青杄Pw MYB20与白云杉Pg MYB20聚为一簇。实时荧光定量PCR结果表明,Pw MYB20在种子中的表达量最高,其次是在针叶中,在花粉中的表达相对较少。Pw MYB20对干旱、4℃和ABA处理均有响应,而对Na Cl处理响应相对较弱。在干旱处理下,Pw MYB20表达量先上升后下降;4℃低温处理3 h和12 h时Pw MYB20的表达量上升,在4℃处理6 h时存在波动,呈现上升—下降—上升的趋势;Pw MYB20的表达受ABA处理持续诱导。亚细胞定位分析表明,Pw MYB20是一个主要定位于细胞核中的蛋白质。转录激活活性分析结果显示,Pw MYB20的C端存在转录激活活性,而Pw MYB20全长及其N端没有转录激活活性。【结论】青杄Pw MYB20,作为一个转录因子发挥作用,其转录激活活性位于C端;受干旱、低温和ABA诱导,普遍参与了植物应对逆境胁迫的响应过程。 展开更多
关键词 青杄 myb转录因子 基因克隆 胁迫响应 基因表达
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小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析 被引量:2
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作者 黄建国 张超群 +4 位作者 张驰 卞云迪 刘晓颖 范宝莉 王振英 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2021年第5期38-45,共8页
为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关... 为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关系较近的MYB转录因子的基因结构和保守结构域基本一致.顺式作用元件分析结果表明,小麦中MYB转录因子家族包含多个顺式作用元件,如脱落酸、赤霉素、厌氧诱导、干旱诱导等相关元件,参与激素调控、逆境响应等生长发育过程.与大麦和二穗短柄草的种间共线性分析中,发现了28个在进化上更为保守的转录因子.种内的共线性分析发现53个基因呈现家族内共线性. 展开更多
关键词 小麦全基因组鉴定 myb转录因子家族 基因结构 顺式作用元件 共线性分析
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茶树CsMYB123转录因子的克隆及表达特性研究 被引量:5
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作者 郭亚飞 马煜明 +2 位作者 水刘媛 郭飞 倪德江 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期9-16,共8页
该实验以茶树品种‘紫娟’为试验材料,利用RT-PCR方法,从茶树cDNA中克隆得到一个R2R3-MYB型基因(CsMYB123)。生物信息学分析显示,CsMYB123基因的开放阅读框为915bp,编码304个氨基酸,蛋白分子量约34.07kD,理论等电点为8.69,含有2个保守的... 该实验以茶树品种‘紫娟’为试验材料,利用RT-PCR方法,从茶树cDNA中克隆得到一个R2R3-MYB型基因(CsMYB123)。生物信息学分析显示,CsMYB123基因的开放阅读框为915bp,编码304个氨基酸,蛋白分子量约34.07kD,理论等电点为8.69,含有2个保守的MYB结构域,编码1个R2R3-MYB蛋白;CsMYB123蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)MYB转录因子家族第五亚组的AtMYB123亲缘关系最近;CsMYB123属于亲水性蛋白,无N端信号肽,可能定位于细胞核上。荧光定量PCR分析表明,CsMYB123基因在茶树各组织的表达量大小依次为:一芽一叶>第二叶>第三叶>第四叶>老茎>嫩茎,且在一芽一叶中的表达量是嫩茎的15.68倍;但CsMYB123的表达受IAA、ABA、ETH和GA3的抑制。花青素含量检测显示,茶树‘紫娟’各组织中花青素的含量高低依次为:第二叶>一芽一叶>第三叶>第四叶>嫩茎>老茎,且第二叶和一芽一叶的含量分别为老茎的15倍和11倍。研究发现,CsMYB123基因在茶树‘紫娟’的新稍中高水平表达,且其表达模式与不同组织中的花青素含量呈较好的正相关关系,推测CsMYB123基因与茶树花青素合成的调控相关。 展开更多
关键词 茶树 myb转录因子 基因克隆 进化分析 表达分析
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苎麻转录因子基因BnMYB3的克隆及表达分析 被引量:6
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作者 朱守晶 史文娟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期422-429,共8页
该研究采用RACE技术,从苎麻中克隆到1个MYB转录因子基因(BnMYB3)的全长cDNA序列(GenBank登录号为MF741320.1)。生物信息学分析表明,BnMYB3基因cDNA全长为1 216bp,包括900bp编码区序列,编码含有299个氨基酸的蛋白,其分子量约为33.63kD,... 该研究采用RACE技术,从苎麻中克隆到1个MYB转录因子基因(BnMYB3)的全长cDNA序列(GenBank登录号为MF741320.1)。生物信息学分析表明,BnMYB3基因cDNA全长为1 216bp,包括900bp编码区序列,编码含有299个氨基酸的蛋白,其分子量约为33.63kD,理论等电点为9.16;该蛋白质含有2个典型的MYB结构域,属于R2R3-MYB。从苎麻基因组中克隆了BnMYB3基因1 681bp启动子序列,该序列包含ABRE、GARE-motif、CGTCA-motif和TGACG-motif等多个逆境相关的顺式作用元件。实时荧光定量PCR分析表明,BnMYB3为组成型表达基因,在茎和叶中的表达量显著高于根;BnMYB3基因能够响应镉胁迫,且表达量随镉胁迫处理时间和处理浓度的增加而显著上升。 展开更多
关键词 苎麻 myb转录因子 克隆 表达
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